MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009512	CTT	2	6	62430	62435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545315
1002	NC_009512	TCA	2	6	62447	62452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545315
1003	NC_009512	GGC	2	6	62464	62469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545315
1004	NC_009512	CTTT	2	8	62478	62485	0 %	75 %	0 %	25 %	148545315
1005	NC_009512	TCG	2	6	62486	62491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545315
1006	NC_009512	GGC	2	6	62527	62532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545315
1007	NC_009512	CTG	2	6	62533	62538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545315
1008	NC_009512	TGT	2	6	62547	62552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545315
1009	NC_009512	CGG	2	6	62705	62710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545316
1010	NC_009512	CGC	2	6	62760	62765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545316
1011	NC_009512	CGA	2	6	62795	62800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1012	NC_009512	TTG	2	6	62880	62885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545316
1013	NC_009512	CCT	2	6	62921	62926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545316
1014	NC_009512	GCGCAG	2	12	62970	62981	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148545316
1015	NC_009512	ACG	2	6	63018	63023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1016	NC_009512	CTAC	2	8	63124	63131	25 %	25 %	0 %	50 %	148545316
1017	NC_009512	CGAG	2	8	63173	63180	25 %	0 %	50 %	25 %	148545316
1018	NC_009512	CAC	2	6	63201	63206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545316
1019	NC_009512	CTG	2	6	63221	63226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1020	NC_009512	CAG	2	6	63243	63248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1021	NC_009512	GAGC	2	8	63332	63339	25 %	0 %	50 %	25 %	148545316
1022	NC_009512	GAC	2	6	63433	63438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1023	NC_009512	CGA	2	6	63461	63466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1024	NC_009512	TCAG	2	8	63481	63488	25 %	25 %	25 %	25 %	148545316
1025	NC_009512	GA	3	6	63492	63497	50 %	0 %	50 %	0 %	148545316
1026	NC_009512	GAC	2	6	63552	63557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1027	NC_009512	GCG	2	6	63601	63606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545316
1028	NC_009512	C	6	6	63638	63643	0 %	0 %	0 %	100 %	148545316
1029	NC_009512	GA	4	8	63672	63679	50 %	0 %	50 %	0 %	148545316
1030	NC_009512	GTC	2	6	63682	63687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1031	NC_009512	ACG	2	6	63699	63704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545316
1032	NC_009512	GGC	2	6	64395	64400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545317
1033	NC_009512	GCTAT	2	10	64421	64430	20 %	40 %	20 %	20 %	148545317
1034	NC_009512	AGA	2	6	64443	64448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545317
1035	NC_009512	GCA	2	6	64472	64477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1036	NC_009512	ATC	2	6	64597	64602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545317
1037	NC_009512	CGG	2	6	64701	64706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545317
1038	NC_009512	CGA	2	6	64755	64760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1039	NC_009512	CGG	2	6	64773	64778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545317
1040	NC_009512	CTG	2	6	64867	64872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1041	NC_009512	GTC	2	6	64937	64942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1042	NC_009512	AGCC	2	8	64954	64961	25 %	0 %	25 %	50 %	148545317
1043	NC_009512	CGG	2	6	65001	65006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545317
1044	NC_009512	ACT	2	6	65045	65050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545317
1045	NC_009512	GCCA	2	8	65083	65090	25 %	0 %	25 %	50 %	148545317
1046	NC_009512	TAC	2	6	65113	65118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545317
1047	NC_009512	CGA	2	6	65148	65153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1048	NC_009512	ACT	2	6	65177	65182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545317
1049	NC_009512	AAG	2	6	65203	65208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545317
1050	NC_009512	ACA	3	9	65225	65233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545317
1051	NC_009512	GCGT	2	8	65252	65259	0 %	25 %	50 %	25 %	148545317
1052	NC_009512	CAA	2	6	65295	65300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545317
1053	NC_009512	CGA	3	9	65304	65312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1054	NC_009512	TCG	2	6	65345	65350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1055	NC_009512	TCCA	2	8	65356	65363	25 %	25 %	0 %	50 %	148545317
1056	NC_009512	TGC	2	6	65402	65407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545317
1057	NC_009512	TGA	2	6	65520	65525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545317
1058	NC_009512	ATT	2	6	66308	66313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545318
1059	NC_009512	AGC	2	6	66322	66327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545318
1060	NC_009512	GTT	2	6	66392	66397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545318
1061	NC_009512	CGT	2	6	66399	66404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545318
1062	NC_009512	ATG	2	6	66426	66431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545318
1063	NC_009512	GCT	2	6	66521	66526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545318
1064	NC_009512	TGACC	2	10	66647	66656	20 %	20 %	20 %	40 %	148545318
1065	NC_009512	GTG	2	6	66702	66707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545318
1066	NC_009512	ATT	2	6	66723	66728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545318
1067	NC_009512	AGAT	2	8	66802	66809	50 %	25 %	25 %	0 %	148545318
1068	NC_009512	ATAC	2	8	66831	66838	50 %	25 %	0 %	25 %	148545318
1069	NC_009512	CAG	2	6	67014	67019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545319
1070	NC_009512	CGG	2	6	67138	67143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545319
1071	NC_009512	AAG	2	6	67147	67152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545319
1072	NC_009512	GAG	2	6	67236	67241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545319
1073	NC_009512	GCTC	2	8	67296	67303	0 %	25 %	25 %	50 %	148545319
1074	NC_009512	CTT	2	6	67306	67311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545319
1075	NC_009512	CTG	2	6	67429	67434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545320
1076	NC_009512	T	6	6	67459	67464	0 %	100 %	0 %	0 %	148545320
1077	NC_009512	GCA	2	6	67477	67482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545320
1078	NC_009512	ATA	2	6	67587	67592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148545320
1079	NC_009512	GTACA	2	10	67599	67608	40 %	20 %	20 %	20 %	148545320
1080	NC_009512	A	6	6	67632	67637	100 %	0 %	0 %	0 %	148545320
1081	NC_009512	CGA	2	6	67742	67747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545320
1082	NC_009512	GAT	2	6	67817	67822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545320
1083	NC_009512	AAT	2	6	67829	67834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148545320
1084	NC_009512	CAT	2	6	67886	67891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545320
1085	NC_009512	TTC	2	6	67948	67953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545320
1086	NC_009512	TGT	2	6	67975	67980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545320
1087	NC_009512	AG	3	6	68012	68017	50 %	0 %	50 %	0 %	148545320
1088	NC_009512	GGA	2	6	68145	68150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545321
1089	NC_009512	GCT	2	6	68154	68159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545321
1090	NC_009512	AAAG	2	8	68237	68244	75 %	0 %	25 %	0 %	148545321
1091	NC_009512	TC	3	6	68271	68276	0 %	50 %	0 %	50 %	148545321
1092	NC_009512	CAG	2	6	68350	68355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545321
1093	NC_009512	TCC	2	6	68631	68636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545321
1094	NC_009512	TGA	2	6	68698	68703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545321
1095	NC_009512	G	6	6	68880	68885	0 %	0 %	100 %	0 %	148545321
1096	NC_009512	TCTG	2	8	69098	69105	0 %	50 %	25 %	25 %	148545321
1097	NC_009512	CGG	2	6	69153	69158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545321
1098	NC_009512	CGT	3	9	69225	69233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545321
1099	NC_009512	GTG	2	6	69312	69317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545321
1100	NC_009512	GAG	2	6	69332	69337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545321
1101	NC_009512	ACG	2	6	69356	69361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545321
1102	NC_009512	GCA	2	6	69516	69521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545321
1103	NC_009512	TTTC	2	8	69523	69530	0 %	75 %	0 %	25 %	148545321
1104	NC_009512	CCG	2	6	69586	69591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545321
1105	NC_009512	GAA	2	6	69619	69624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545322
1106	NC_009512	CCA	2	6	69637	69642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545322
1107	NC_009512	TCC	2	6	69783	69788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545322
1108	NC_009512	CCA	2	6	69789	69794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545322
1109	NC_009512	TTC	2	6	69795	69800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545322
1110	NC_009512	GAT	2	6	69815	69820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545322
1111	NC_009512	GA	4	8	69833	69840	50 %	0 %	50 %	0 %	148545322
1112	NC_009512	CTTCT	2	10	69851	69860	0 %	60 %	0 %	40 %	148545322
1113	NC_009512	CTC	2	6	69914	69919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545322
1114	NC_009512	CAG	2	6	69995	70000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545322
1115	NC_009512	GGA	2	6	70016	70021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545322
1116	NC_009512	CCA	2	6	70798	70803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545323
1117	NC_009512	GAT	2	6	70834	70839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545323
1118	NC_009512	GC	3	6	70862	70867	0 %	0 %	50 %	50 %	148545323
1119	NC_009512	CAGT	2	8	70872	70879	25 %	25 %	25 %	25 %	148545323
1120	NC_009512	TTG	2	6	70958	70963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545323
1121	NC_009512	GCC	2	6	71063	71068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545323
1122	NC_009512	GCG	2	6	71130	71135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545323
1123	NC_009512	TTC	2	6	71154	71159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545323
1124	NC_009512	TTCAG	2	10	71292	71301	20 %	40 %	20 %	20 %	148545324
1125	NC_009512	GCG	2	6	71317	71322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545324
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1498	NC_009512	AGC	2	6	88416	88421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339
1499	NC_009512	GCC	2	6	88424	88429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545339
1500	NC_009512	AGC	2	6	88458	88463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545339

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