MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009512	TGT	2	6	693792	693797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545865
13003	NC_009512	GCT	2	6	693802	693807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545865
13004	NC_009512	GCT	2	6	693910	693915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545865
13005	NC_009512	GGC	2	6	693992	693997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545865
13006	NC_009512	CTG	2	6	694022	694027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545865
13007	NC_009512	GCAG	2	8	694043	694050	25 %	0 %	50 %	25 %	148545865
13008	NC_009512	ATG	2	6	694092	694097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545865
13009	NC_009512	GGA	2	6	694120	694125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545866
13010	NC_009512	TTCGCG	2	12	694167	694178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
13011	NC_009512	TTG	2	6	694189	694194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545866
13012	NC_009512	CTG	2	6	694195	694200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
13013	NC_009512	GGCGCT	2	12	694206	694217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545866
13014	NC_009512	CGT	2	6	694241	694246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
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13017	NC_009512	C	7	7	694346	694352	0 %	0 %	0 %	100 %	148545866
13018	NC_009512	GTA	2	6	694368	694373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545866
13019	NC_009512	CCAGCT	2	12	694563	694574	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545866
13020	NC_009512	GGT	2	6	694626	694631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545866
13021	NC_009512	GCC	2	6	694633	694638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545866
13022	NC_009512	TGG	2	6	694650	694655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545866
13023	NC_009512	GCT	2	6	694665	694670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
13024	NC_009512	TGC	2	6	694685	694690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545866
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13026	NC_009512	GCA	2	6	694715	694720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545866
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13028	NC_009512	GGTGG	2	10	694819	694828	0 %	20 %	80 %	0 %	148545867
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13032	NC_009512	AACC	2	8	695102	695109	50 %	0 %	0 %	50 %	148545867
13033	NC_009512	GCA	2	6	695130	695135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545867
13034	NC_009512	GCCA	2	8	695159	695166	25 %	0 %	25 %	50 %	148545867
13035	NC_009512	GGCC	2	8	695259	695266	0 %	0 %	50 %	50 %	148545867
13036	NC_009512	GC	3	6	695275	695280	0 %	0 %	50 %	50 %	148545867
13037	NC_009512	TGG	2	6	695327	695332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545867
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13039	NC_009512	GCGG	2	8	695394	695401	0 %	0 %	75 %	25 %	148545867
13040	NC_009512	GCA	2	6	695430	695435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545867
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13052	NC_009512	GCCG	2	8	696197	696204	0 %	0 %	50 %	50 %	148545869
13053	NC_009512	CGG	2	6	696260	696265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545869
13054	NC_009512	GCA	2	6	696446	696451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545869
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13059	NC_009512	CAT	2	6	696572	696577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545869
13060	NC_009512	CGC	2	6	696665	696670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545869
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13062	NC_009512	GCGG	2	8	696711	696718	0 %	0 %	75 %	25 %	148545869
13063	NC_009512	GCA	2	6	696787	696792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545870
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13065	NC_009512	CTGG	2	8	696817	696824	0 %	25 %	50 %	25 %	148545870
13066	NC_009512	TGC	2	6	696967	696972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545870
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13091	NC_009512	CAG	2	6	698486	698491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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13095	NC_009512	TGC	2	6	698631	698636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545871
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13101	NC_009512	ACA	2	6	698904	698909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545871
13102	NC_009512	GGGCA	2	10	698972	698981	20 %	0 %	60 %	20 %	148545871
13103	NC_009512	CGG	2	6	698988	698993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545871
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13117	NC_009512	AC	3	6	699752	699757	50 %	0 %	0 %	50 %	148545872
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13119	NC_009512	TGCCGA	2	12	699804	699815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545872
13120	NC_009512	TGCC	2	8	699873	699880	0 %	25 %	25 %	50 %	148545872
13121	NC_009512	CGC	2	6	699917	699922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545872
13122	NC_009512	GC	3	6	699925	699930	0 %	0 %	50 %	50 %	148545872
13123	NC_009512	GAC	2	6	699976	699981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545872
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13125	NC_009512	TGC	2	6	700007	700012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545872
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13130	NC_009512	GGC	2	6	700278	700283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545872
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13143	NC_009512	CTG	3	9	701067	701075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545873
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13148	NC_009512	TCG	2	6	701332	701337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545873
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13223	NC_009512	CAG	2	6	704983	704988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545875
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13235	NC_009512	GGCGCA	2	12	705556	705567	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148545876
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13343	NC_009512	TGC	2	6	711616	711621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545884
13344	NC_009512	GCA	2	6	711696	711701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545884
13345	NC_009512	CAGG	2	8	711746	711753	25 %	0 %	50 %	25 %	148545884
13346	NC_009512	GTC	2	6	711857	711862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545884
13347	NC_009512	GAT	2	6	711902	711907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545884
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13349	NC_009512	AGT	2	6	711949	711954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545884
13350	NC_009512	GGCG	2	8	712024	712031	0 %	0 %	75 %	25 %	148545884
13351	NC_009512	CGG	2	6	712042	712047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545884
13352	NC_009512	GTTC	2	8	712063	712070	0 %	50 %	25 %	25 %	148545884
13353	NC_009512	GCTCAG	2	12	712304	712315	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545885
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13473	NC_009512	GTGG	2	8	727034	727041	0 %	25 %	75 %	0 %	148545892
13474	NC_009512	ACC	2	6	727092	727097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545892
13475	NC_009512	TA	3	6	727122	727127	50 %	50 %	0 %	0 %	148545892
13476	NC_009512	GAT	2	6	727223	727228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545892
13477	NC_009512	GAA	2	6	727337	727342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545892
13478	NC_009512	GT	3	6	727387	727392	0 %	50 %	50 %	0 %	148545892
13479	NC_009512	TGC	2	6	727411	727416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545892
13480	NC_009512	ATC	2	6	727455	727460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545892
13481	NC_009512	CCT	2	6	727474	727479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545892
13482	NC_009512	TGG	2	6	727483	727488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545892
13483	NC_009512	TAC	2	6	727509	727514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545892
13484	NC_009512	GT	3	6	727543	727548	0 %	50 %	50 %	0 %	148545892
13485	NC_009512	CTG	2	6	727572	727577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545892
13486	NC_009512	CAA	2	6	727601	727606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545892
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13488	NC_009512	CTG	2	6	727659	727664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545892
13489	NC_009512	TGC	2	6	727666	727671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545892
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13491	NC_009512	CCTTG	2	10	727907	727916	0 %	40 %	20 %	40 %	148545892
13492	NC_009512	CAG	2	6	728007	728012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545892
13493	NC_009512	CTGG	2	8	728029	728036	0 %	25 %	50 %	25 %	148545892
13494	NC_009512	GGCG	2	8	728171	728178	0 %	0 %	75 %	25 %	148545892
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13496	NC_009512	TCGC	2	8	728230	728237	0 %	25 %	25 %	50 %	148545892
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13499	NC_009512	CCA	2	6	728460	728465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545893
13500	NC_009512	GC	3	6	728476	728481	0 %	0 %	50 %	50 %	148545893

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