MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_009512	CTG	2	6	644750	644755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545828
12005	NC_009512	TCA	2	6	644772	644777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545828
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12009	NC_009512	CTG	2	6	644924	644929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545828
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12118	NC_009512	GAA	2	6	649786	649791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545833
12119	NC_009512	GCT	2	6	649846	649851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545833
12120	NC_009512	GGC	2	6	649942	649947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545833
12121	NC_009512	TGA	3	9	649956	649964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545833
12122	NC_009512	TGA	2	6	650007	650012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545833
12123	NC_009512	ATC	2	6	650036	650041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545833
12124	NC_009512	GCC	2	6	650044	650049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545833
12125	NC_009512	GGC	2	6	650095	650100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545833
12126	NC_009512	GCC	2	6	650146	650151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545833
12127	NC_009512	ATC	2	6	650204	650209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545833
12128	NC_009512	GAC	2	6	650210	650215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545833
12129	NC_009512	GCC	2	6	650281	650286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545833
12130	NC_009512	GCC	2	6	650290	650295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545833
12131	NC_009512	ACGCC	2	10	650343	650352	20 %	0 %	20 %	60 %	148545833
12132	NC_009512	CAG	2	6	650362	650367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545833
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12134	NC_009512	T	6	6	650386	650391	0 %	100 %	0 %	0 %	148545833
12135	NC_009512	GGA	2	6	650440	650445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545833
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12138	NC_009512	CAG	2	6	650745	650750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
12139	NC_009512	CTG	2	6	650760	650765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
12140	NC_009512	CAT	2	6	650778	650783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545834
12141	NC_009512	CTT	2	6	650811	650816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
12142	NC_009512	CCG	2	6	650821	650826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
12143	NC_009512	GGT	2	6	650849	650854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545834
12144	NC_009512	CA	3	6	650866	650871	50 %	0 %	0 %	50 %	148545834
12145	NC_009512	GCTTCG	2	12	650974	650985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
12146	NC_009512	GGT	2	6	650994	650999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545834
12147	NC_009512	ACC	2	6	651007	651012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545834
12148	NC_009512	TTC	2	6	651024	651029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
12149	NC_009512	TTG	3	9	651046	651054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545834
12150	NC_009512	GTA	2	6	651078	651083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
12151	NC_009512	GCC	2	6	651120	651125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
12152	NC_009512	CTG	3	9	651186	651194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545834
12153	NC_009512	GGTGTC	2	12	651216	651227	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148545834
12154	NC_009512	CGC	2	6	651236	651241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
12155	NC_009512	GCA	2	6	651251	651256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
12156	NC_009512	CTT	2	6	651258	651263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545834
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12158	NC_009512	GAA	2	6	651345	651350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545834
12159	NC_009512	GCC	2	6	651370	651375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545834
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12162	NC_009512	CGG	2	6	651470	651475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545834
12163	NC_009512	ATG	2	6	651484	651489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545834
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12172	NC_009512	CAGC	2	8	651838	651845	25 %	0 %	25 %	50 %	148545834
12173	NC_009512	CAG	2	6	651975	651980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545834
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12181	NC_009512	GGA	2	6	652597	652602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
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12187	NC_009512	ATGAA	2	10	652707	652716	60 %	20 %	20 %	0 %	148545835
12188	NC_009512	CAG	2	6	652727	652732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12189	NC_009512	TGC	2	6	652755	652760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
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12192	NC_009512	CCTG	2	8	652890	652897	0 %	25 %	25 %	50 %	148545835
12193	NC_009512	CCAT	2	8	652917	652924	25 %	25 %	0 %	50 %	148545835
12194	NC_009512	CTG	2	6	653000	653005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12195	NC_009512	GC	3	6	653027	653032	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
12196	NC_009512	GAT	2	6	653092	653097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545835
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12200	NC_009512	CCAA	2	8	653226	653233	50 %	0 %	0 %	50 %	148545835
12201	NC_009512	CTG	2	6	653246	653251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
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12205	NC_009512	GTCT	2	8	653474	653481	0 %	50 %	25 %	25 %	148545835
12206	NC_009512	CCG	2	6	653509	653514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545835
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12211	NC_009512	TCG	2	6	653631	653636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12212	NC_009512	CGG	2	6	653695	653700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
12213	NC_009512	GC	4	8	653712	653719	0 %	0 %	50 %	50 %	148545835
12214	NC_009512	AGG	2	6	653721	653726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
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12219	NC_009512	CTG	2	6	653906	653911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12220	NC_009512	CGG	2	6	653982	653987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
12221	NC_009512	GCT	2	6	654085	654090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12222	NC_009512	TGC	2	6	654132	654137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545835
12223	NC_009512	TGG	2	6	654144	654149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545835
12224	NC_009512	GGGC	2	8	654222	654229	0 %	0 %	75 %	25 %	148545835
12225	NC_009512	AGGGCG	2	12	654261	654272	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148545835
12226	NC_009512	CGG	2	6	654310	654315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545835
12227	NC_009512	AGG	2	6	654384	654389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545835
12228	NC_009512	TGG	2	6	654756	654761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
12229	NC_009512	CG	3	6	654780	654785	0 %	0 %	50 %	50 %	148545836
12230	NC_009512	TGGC	2	8	654845	654852	0 %	25 %	50 %	25 %	148545836
12231	NC_009512	TGC	2	6	654861	654866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545836
12232	NC_009512	ACC	2	6	654908	654913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545836
12233	NC_009512	AGC	2	6	654917	654922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545836
12234	NC_009512	TGG	2	6	654973	654978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
12235	NC_009512	TGG	2	6	655032	655037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545836
12236	NC_009512	CGA	2	6	655042	655047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545836
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12238	NC_009512	CAA	2	6	655114	655119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545836
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12269	NC_009512	CAA	2	6	656612	656617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545838
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12272	NC_009512	TGC	2	6	656746	656751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545838
12273	NC_009512	CTG	3	9	656760	656768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545838
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12322	NC_009512	GGC	2	6	659293	659298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545840
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12326	NC_009512	ATCCG	2	10	659640	659649	20 %	20 %	20 %	40 %	148545841
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12328	NC_009512	GCAC	2	8	659808	659815	25 %	0 %	25 %	50 %	148545841
12329	NC_009512	TGTT	2	8	659858	659865	0 %	75 %	25 %	0 %	148545841
12330	NC_009512	CAGT	2	8	659904	659911	25 %	25 %	25 %	25 %	148545841
12331	NC_009512	CTGG	2	8	659938	659945	0 %	25 %	50 %	25 %	148545841
12332	NC_009512	CAC	2	6	659953	659958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545841
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12334	NC_009512	CA	3	6	660042	660047	50 %	0 %	0 %	50 %	148545841
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12341	NC_009512	CG	3	6	660607	660612	0 %	0 %	50 %	50 %	148545841
12342	NC_009512	TCAT	2	8	660632	660639	25 %	50 %	0 %	25 %	148545841
12343	NC_009512	GCC	2	6	660714	660719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545842
12344	NC_009512	GGCC	2	8	660736	660743	0 %	0 %	50 %	50 %	148545842
12345	NC_009512	GCA	2	6	660748	660753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545842
12346	NC_009512	TGGC	2	8	660783	660790	0 %	25 %	50 %	25 %	148545842
12347	NC_009512	GAT	2	6	660794	660799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545842
12348	NC_009512	CAC	2	6	660818	660823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545842
12349	NC_009512	GCT	2	6	660898	660903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545842
12350	NC_009512	TCC	2	6	660948	660953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545842
12351	NC_009512	CCA	2	6	661087	661092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545842
12352	NC_009512	GC	3	6	661124	661129	0 %	0 %	50 %	50 %	148545842
12353	NC_009512	GGCC	2	8	661162	661169	0 %	0 %	50 %	50 %	148545842
12354	NC_009512	GGT	2	6	661192	661197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545842
12355	NC_009512	CGC	2	6	661296	661301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545842
12356	NC_009512	CAGC	2	8	661306	661313	25 %	0 %	25 %	50 %	148545842
12357	NC_009512	GGT	2	6	661318	661323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545842
12358	NC_009512	GTT	2	6	661334	661339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545842
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12364	NC_009512	GCC	2	6	661463	661468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545842
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12371	NC_009512	GCT	3	9	661628	661636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545842
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12460	NC_009512	CCGC	2	8	665773	665780	0 %	0 %	25 %	75 %	148545846
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12463	NC_009512	CTG	2	6	665877	665882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545846
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12465	NC_009512	CGT	2	6	666013	666018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545846
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12467	NC_009512	GCA	2	6	666071	666076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545846
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12469	NC_009512	CGCC	2	8	666212	666219	0 %	0 %	25 %	75 %	148545846
12470	NC_009512	CGTT	2	8	666253	666260	0 %	50 %	25 %	25 %	148545846
12471	NC_009512	GTT	2	6	666305	666310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545846
12472	NC_009512	GCA	2	6	666368	666373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545846
12473	NC_009512	GGC	2	6	666381	666386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545846
12474	NC_009512	CGA	2	6	666398	666403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545846
12475	NC_009512	CTG	2	6	666438	666443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545846
12476	NC_009512	GCG	2	6	666480	666485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545846
12477	NC_009512	CGG	2	6	666486	666491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545846
12478	NC_009512	GGC	2	6	666536	666541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545846
12479	NC_009512	TGG	2	6	666544	666549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545846
12480	NC_009512	C	6	6	666609	666614	0 %	0 %	0 %	100 %	148545846
12481	NC_009512	GCGTGA	2	12	666617	666628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545846
12482	NC_009512	GGT	2	6	666689	666694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545846
12483	NC_009512	GCT	2	6	666719	666724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545846
12484	NC_009512	GTGA	2	8	666786	666793	25 %	25 %	50 %	0 %	148545846
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12486	NC_009512	CGGCA	2	10	666877	666886	20 %	0 %	40 %	40 %	148545846
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12488	NC_009512	GCATC	2	10	666986	666995	20 %	20 %	20 %	40 %	148545846
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12492	NC_009512	GC	3	6	667357	667362	0 %	0 %	50 %	50 %	148545847
12493	NC_009512	TCG	2	6	667370	667375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545847
12494	NC_009512	CGG	2	6	667423	667428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545847
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12497	NC_009512	TTG	2	6	667601	667606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545847
12498	NC_009512	GCG	2	6	667610	667615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545847
12499	NC_009512	CAC	2	6	667746	667751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545847
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