MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009512	GCG	2	6	616041	616046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545799
11502	NC_009512	CGTT	2	8	616145	616152	0 %	50 %	25 %	25 %	148545799
11503	NC_009512	GTG	2	6	616199	616204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545799
11504	NC_009512	CCGGC	2	10	616220	616229	0 %	0 %	40 %	60 %	148545799
11505	NC_009512	CG	3	6	616230	616235	0 %	0 %	50 %	50 %	148545799
11506	NC_009512	GC	3	6	616254	616259	0 %	0 %	50 %	50 %	148545799
11507	NC_009512	GTG	2	6	616270	616275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545799
11508	NC_009512	GCC	2	6	616285	616290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545799
11509	NC_009512	ACGC	2	8	616307	616314	25 %	0 %	25 %	50 %	148545799
11510	NC_009512	CGTG	2	8	616320	616327	0 %	25 %	50 %	25 %	148545799
11511	NC_009512	GCC	2	6	616357	616362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545799
11512	NC_009512	GCC	2	6	616403	616408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545799
11513	NC_009512	GGC	2	6	616422	616427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545799
11514	NC_009512	TTC	2	6	616432	616437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545799
11515	NC_009512	TGG	2	6	616454	616459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545799
11516	NC_009512	CTG	2	6	616463	616468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545799
11517	NC_009512	GCT	2	6	616551	616556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545799
11518	NC_009512	GCC	2	6	616567	616572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545799
11519	NC_009512	CTG	2	6	616591	616596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545799
11520	NC_009512	CGA	2	6	616644	616649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545799
11521	NC_009512	TCG	2	6	616661	616666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545799
11522	NC_009512	GCT	2	6	616698	616703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545799
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11524	NC_009512	CAT	2	6	616872	616877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545800
11525	NC_009512	GTG	2	6	616916	616921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545800
11526	NC_009512	GCA	2	6	617096	617101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545800
11527	NC_009512	CAC	2	6	617130	617135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545800
11528	NC_009512	GGGC	2	8	617142	617149	0 %	0 %	75 %	25 %	148545800
11529	NC_009512	CGTG	2	8	617226	617233	0 %	25 %	50 %	25 %	148545800
11530	NC_009512	CAT	2	6	617364	617369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545800
11531	NC_009512	CTG	2	6	617413	617418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545800
11532	NC_009512	TGC	2	6	617438	617443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545800
11533	NC_009512	GCC	2	6	617455	617460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545800
11534	NC_009512	GCC	2	6	617500	617505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545800
11535	NC_009512	CTT	2	6	617511	617516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545800
11536	NC_009512	GAA	2	6	617563	617568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545801
11537	NC_009512	GATG	2	8	617607	617614	25 %	25 %	50 %	0 %	148545801
11538	NC_009512	GGC	2	6	617649	617654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545801
11539	NC_009512	TGC	2	6	617659	617664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545801
11540	NC_009512	TCGA	2	8	617806	617813	25 %	25 %	25 %	25 %	148545801
11541	NC_009512	GCC	2	6	617815	617820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545801
11542	NC_009512	CAC	2	6	617829	617834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545801
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11544	NC_009512	GCTGCC	2	12	617872	617883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148545801
11545	NC_009512	CCAG	2	8	617940	617947	25 %	0 %	25 %	50 %	148545801
11546	NC_009512	GCC	2	6	617980	617985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545801
11547	NC_009512	GC	3	6	617995	618000	0 %	0 %	50 %	50 %	148545801
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11551	NC_009512	CGCGC	2	10	618062	618071	0 %	0 %	40 %	60 %	148545801
11552	NC_009512	CGC	2	6	618087	618092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545801
11553	NC_009512	GAGC	2	8	618189	618196	25 %	0 %	50 %	25 %	148545801
11554	NC_009512	CTG	3	9	618328	618336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545801
11555	NC_009512	AGC	2	6	618341	618346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545801
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11557	NC_009512	GTG	2	6	618403	618408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545801
11558	NC_009512	CTG	3	9	618409	618417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545801
11559	NC_009512	TGC	2	6	618440	618445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545801
11560	NC_009512	CTAC	2	8	618494	618501	25 %	25 %	0 %	50 %	148545801
11561	NC_009512	TGA	2	6	618560	618565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545801
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11564	NC_009512	TGG	2	6	618915	618920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545802
11565	NC_009512	ACG	2	6	618948	618953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545802
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11567	NC_009512	GGCG	2	8	619009	619016	0 %	0 %	75 %	25 %	148545802
11568	NC_009512	CAA	2	6	619132	619137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545802
11569	NC_009512	CTG	2	6	619178	619183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545802
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11572	NC_009512	TGC	2	6	619517	619522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545803
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11578	NC_009512	CGAC	2	8	619853	619860	25 %	0 %	25 %	50 %	148545804
11579	NC_009512	CTG	2	6	619886	619891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545804
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11587	NC_009512	TCACCG	2	12	620108	620119	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545804
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11590	NC_009512	CGG	2	6	620190	620195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545804
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11593	NC_009512	CTG	2	6	620320	620325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545804
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11598	NC_009512	CGA	2	6	620502	620507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545804
11599	NC_009512	GTCG	2	8	620584	620591	0 %	25 %	50 %	25 %	148545804
11600	NC_009512	GA	3	6	620677	620682	50 %	0 %	50 %	0 %	148545804
11601	NC_009512	GTTC	2	8	620717	620724	0 %	50 %	25 %	25 %	148545805
11602	NC_009512	TGG	2	6	620815	620820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545805
11603	NC_009512	CTGG	2	8	620993	621000	0 %	25 %	50 %	25 %	148545805
11604	NC_009512	CTT	2	6	621047	621052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545805
11605	NC_009512	GATC	2	8	621083	621090	25 %	25 %	25 %	25 %	148545805
11606	NC_009512	CAT	2	6	621113	621118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545805
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11609	NC_009512	CTG	2	6	621223	621228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545806
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11614	NC_009512	GC	3	6	621401	621406	0 %	0 %	50 %	50 %	148545806
11615	NC_009512	GCG	2	6	621437	621442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545806
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11619	NC_009512	GCG	2	6	621875	621880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545806
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11621	NC_009512	GCC	2	6	622148	622153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545807
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11739	NC_009512	GGC	2	6	628359	628364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545812
11740	NC_009512	CAG	2	6	628374	628379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545812
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11743	NC_009512	CTG	2	6	628620	628625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545812
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11974	NC_009512	TTTGC	2	10	642021	642030	0 %	60 %	20 %	20 %	148545824
11975	NC_009512	TGC	2	6	642363	642368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545825
11976	NC_009512	TTC	2	6	642399	642404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545825
11977	NC_009512	AGA	2	6	642448	642453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545825
11978	NC_009512	GCT	2	6	643001	643006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545826
11979	NC_009512	GTT	2	6	643149	643154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545826
11980	NC_009512	GCA	2	6	643175	643180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545826
11981	NC_009512	ACC	2	6	643201	643206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545826
11982	NC_009512	TGCT	2	8	643345	643352	0 %	50 %	25 %	25 %	148545826
11983	NC_009512	GTA	2	6	643386	643391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545826
11984	NC_009512	CA	3	6	643527	643532	50 %	0 %	0 %	50 %	148545826
11985	NC_009512	GTT	2	6	643587	643592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545826
11986	NC_009512	GTGCT	2	10	643596	643605	0 %	40 %	40 %	20 %	148545826
11987	NC_009512	CGCTG	2	10	643610	643619	0 %	20 %	40 %	40 %	148545826
11988	NC_009512	GGC	2	6	643620	643625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545826
11989	NC_009512	GCG	2	6	643921	643926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545827
11990	NC_009512	AAG	2	6	643990	643995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545827
11991	NC_009512	CTG	2	6	644004	644009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545827
11992	NC_009512	CAG	2	6	644013	644018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545827
11993	NC_009512	CGC	2	6	644099	644104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545827
11994	NC_009512	CGT	2	6	644108	644113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545827
11995	NC_009512	ACC	2	6	644182	644187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545827
11996	NC_009512	CGT	2	6	644207	644212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545827
11997	NC_009512	CGA	2	6	644279	644284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545827
11998	NC_009512	CCG	2	6	644381	644386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545827
11999	NC_009512	GC	3	6	644549	644554	0 %	0 %	50 %	50 %	148545828
12000	NC_009512	TGG	2	6	644586	644591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545828

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