MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_009512	TCA	2	6	5895055	5895060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550451
113002	NC_009512	GTG	2	6	5895163	5895168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550451
113003	NC_009512	CCA	2	6	5895199	5895204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550451
113004	NC_009512	CAGCC	2	10	5895248	5895257	20 %	0 %	20 %	60 %	148550451
113005	NC_009512	CGC	2	6	5895321	5895326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550451
113006	NC_009512	GCC	2	6	5895333	5895338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550451
113007	NC_009512	CGG	2	6	5895348	5895353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550451
113008	NC_009512	ACTG	2	8	5895400	5895407	25 %	25 %	25 %	25 %	148550451
113009	NC_009512	CCCG	2	8	5895538	5895545	0 %	0 %	25 %	75 %	148550451
113010	NC_009512	CGT	2	6	5895601	5895606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
113011	NC_009512	GTC	2	6	5895608	5895613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
113012	NC_009512	GAT	2	6	5895617	5895622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550451
113013	NC_009512	CA	3	6	5895787	5895792	50 %	0 %	0 %	50 %	148550451
113014	NC_009512	GCC	2	6	5895797	5895802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550451
113015	NC_009512	GCC	2	6	5895825	5895830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550451
113016	NC_009512	GCA	3	9	5895871	5895879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550451
113017	NC_009512	CTG	2	6	5895902	5895907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
113018	NC_009512	GCG	2	6	5895959	5895964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550451
113019	NC_009512	GTT	2	6	5896154	5896159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550451
113020	NC_009512	TTC	2	6	5896217	5896222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550451
113021	NC_009512	TG	3	6	5896275	5896280	0 %	50 %	50 %	0 %	148550451
113022	NC_009512	GC	3	6	5896362	5896367	0 %	0 %	50 %	50 %	148550451
113023	NC_009512	CG	3	6	5896408	5896413	0 %	0 %	50 %	50 %	148550451
113024	NC_009512	GCT	2	6	5896480	5896485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550451
113025	NC_009512	ACA	2	6	5896652	5896657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550452
113026	NC_009512	CCG	2	6	5896784	5896789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550452
113027	NC_009512	GCA	2	6	5896851	5896856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550452
113028	NC_009512	CGG	2	6	5896857	5896862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550452
113029	NC_009512	CAAG	2	8	5896919	5896926	50 %	0 %	25 %	25 %	148550452
113030	NC_009512	GGT	2	6	5896941	5896946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550452
113031	NC_009512	GCC	2	6	5897030	5897035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550452
113032	NC_009512	GACC	2	8	5897037	5897044	25 %	0 %	25 %	50 %	148550452
113033	NC_009512	TCG	2	6	5897123	5897128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550452
113034	NC_009512	CG	3	6	5897145	5897150	0 %	0 %	50 %	50 %	148550452
113035	NC_009512	GC	3	6	5897161	5897166	0 %	0 %	50 %	50 %	148550452
113036	NC_009512	CAG	2	6	5897685	5897690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550453
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113038	NC_009512	TGC	2	6	5897861	5897866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550454
113039	NC_009512	GCC	2	6	5897929	5897934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550454
113040	NC_009512	GCTG	2	8	5897942	5897949	0 %	25 %	50 %	25 %	148550454
113041	NC_009512	GCT	2	6	5897959	5897964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550454
113042	NC_009512	GCC	2	6	5898088	5898093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550454
113043	NC_009512	CTG	2	6	5898130	5898135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550454
113044	NC_009512	TGG	2	6	5898260	5898265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550454
113045	NC_009512	GAT	2	6	5898307	5898312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550454
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113048	NC_009512	CAG	2	6	5898364	5898369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550454
113049	NC_009512	GCC	2	6	5898401	5898406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550454
113050	NC_009512	CTCGAT	2	12	5898582	5898593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550455
113051	NC_009512	ATGG	2	8	5898633	5898640	25 %	25 %	50 %	0 %	148550455
113052	NC_009512	GCC	2	6	5898661	5898666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550455
113053	NC_009512	GGCC	2	8	5898713	5898720	0 %	0 %	50 %	50 %	148550455
113054	NC_009512	CCTT	2	8	5898733	5898740	0 %	50 %	0 %	50 %	148550455
113055	NC_009512	TGG	2	6	5898770	5898775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550455
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113057	NC_009512	TGC	2	6	5898812	5898817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550455
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113059	NC_009512	TCGA	2	8	5898874	5898881	25 %	25 %	25 %	25 %	148550455
113060	NC_009512	TCGG	2	8	5898970	5898977	0 %	25 %	50 %	25 %	148550455
113061	NC_009512	GCA	2	6	5899025	5899030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550455
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113115	NC_009512	GGA	2	6	5902087	5902092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550457
113116	NC_009512	CCG	2	6	5902110	5902115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550457
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113119	NC_009512	GGC	2	6	5902198	5902203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550457
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113121	NC_009512	CGC	2	6	5902348	5902353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550457
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113124	NC_009512	CCG	2	6	5902417	5902422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550457
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113126	NC_009512	ATC	2	6	5902448	5902453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550457
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113142	NC_009512	CTGG	2	8	5903567	5903574	0 %	25 %	50 %	25 %	148550458
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113200	NC_009512	CTG	2	6	5906545	5906550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550460
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113217	NC_009512	CG	3	6	5907050	5907055	0 %	0 %	50 %	50 %	148550460
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113221	NC_009512	GC	3	6	5907123	5907128	0 %	0 %	50 %	50 %	148550460
113222	NC_009512	GCC	2	6	5907210	5907215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550460
113223	NC_009512	A	6	6	5907230	5907235	100 %	0 %	0 %	0 %	148550460
113224	NC_009512	CAGC	2	8	5907267	5907274	25 %	0 %	25 %	50 %	148550460
113225	NC_009512	GCT	2	6	5907300	5907305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550460
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113338	NC_009512	GCG	2	6	5912796	5912801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550465
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113451	NC_009512	GGT	2	6	5919252	5919257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550472
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113453	NC_009512	ATG	2	6	5919266	5919271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550472
113454	NC_009512	CTG	2	6	5919337	5919342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550472
113455	NC_009512	CG	3	6	5919402	5919407	0 %	0 %	50 %	50 %	148550472
113456	NC_009512	AGA	2	6	5919420	5919425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550472
113457	NC_009512	ATG	2	6	5919604	5919609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550473
113458	NC_009512	TCT	2	6	5919714	5919719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550473
113459	NC_009512	GCC	2	6	5919734	5919739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550473
113460	NC_009512	GTG	2	6	5919772	5919777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550473
113461	NC_009512	GCAGGC	2	12	5919795	5919806	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148550473
113462	NC_009512	CCA	2	6	5919816	5919821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550473
113463	NC_009512	ATC	2	6	5919854	5919859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550473
113464	NC_009512	CGAT	2	8	5919896	5919903	25 %	25 %	25 %	25 %	148550473
113465	NC_009512	CCCGC	2	10	5919911	5919920	0 %	0 %	20 %	80 %	148550473
113466	NC_009512	TCA	2	6	5919966	5919971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550473
113467	NC_009512	C	6	6	5919976	5919981	0 %	0 %	0 %	100 %	148550473
113468	NC_009512	GCCC	2	8	5920236	5920243	0 %	0 %	25 %	75 %	148550473
113469	NC_009512	CAGCCA	2	12	5920244	5920255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148550473
113470	NC_009512	GGT	2	6	5920302	5920307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550473
113471	NC_009512	CTG	2	6	5920318	5920323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550473
113472	NC_009512	AC	3	6	5920464	5920469	50 %	0 %	0 %	50 %	148550473
113473	NC_009512	GGC	3	9	5920472	5920480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550473
113474	NC_009512	TCATCC	2	12	5920484	5920495	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148550473
113475	NC_009512	CAG	2	6	5920498	5920503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550473
113476	NC_009512	TCG	2	6	5920517	5920522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550473
113477	NC_009512	TCCAGC	2	12	5920553	5920564	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550473
113478	NC_009512	CGA	2	6	5920572	5920577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550473
113479	NC_009512	TGGG	2	8	5920603	5920610	0 %	25 %	75 %	0 %	148550473
113480	NC_009512	AGCA	2	8	5920744	5920751	50 %	0 %	25 %	25 %	148550473
113481	NC_009512	CCT	2	6	5920761	5920766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550473
113482	NC_009512	ACG	2	6	5920781	5920786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550473
113483	NC_009512	AGT	2	6	5920815	5920820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550473
113484	NC_009512	GTG	2	6	5920975	5920980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550474
113485	NC_009512	ATC	2	6	5920981	5920986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550474
113486	NC_009512	GGC	2	6	5920999	5921004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550474
113487	NC_009512	CCTG	2	8	5921081	5921088	0 %	25 %	25 %	50 %	148550474
113488	NC_009512	GCT	2	6	5921115	5921120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550474
113489	NC_009512	GAT	2	6	5921208	5921213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550474
113490	NC_009512	GCC	2	6	5921303	5921308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550474
113491	NC_009512	CAT	2	6	5921439	5921444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550474
113492	NC_009512	GC	3	6	5921456	5921461	0 %	0 %	50 %	50 %	148550474
113493	NC_009512	GTC	2	6	5921491	5921496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550474
113494	NC_009512	GCC	2	6	5921540	5921545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550474
113495	NC_009512	CAAG	2	8	5921637	5921644	50 %	0 %	25 %	25 %	148550474
113496	NC_009512	GCC	2	6	5921722	5921727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550474
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113498	NC_009512	TGG	2	6	5921765	5921770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550474
113499	NC_009512	GCC	3	9	5921777	5921785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550474
113500	NC_009512	CAC	2	6	5921857	5921862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550474

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