MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
108001	NC_009512	CTG	2	6	5628518	5628523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108002	NC_009512	TGAT	2	8	5628546	5628553	25 %	50 %	25 %	0 %	148550209
108003	NC_009512	GC	3	6	5628554	5628559	0 %	0 %	50 %	50 %	148550209
108004	NC_009512	CGA	2	6	5628583	5628588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108005	NC_009512	TGC	2	6	5628621	5628626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108006	NC_009512	TCG	2	6	5628639	5628644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108007	NC_009512	CAG	2	6	5628646	5628651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108008	NC_009512	CCG	2	6	5628731	5628736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550209
108009	NC_009512	GCT	3	9	5628772	5628780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108010	NC_009512	CGCC	2	8	5628787	5628794	0 %	0 %	25 %	75 %	148550209
108011	NC_009512	CGA	2	6	5628814	5628819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108012	NC_009512	CAG	2	6	5628821	5628826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108013	NC_009512	CTG	2	6	5628875	5628880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108014	NC_009512	CGG	2	6	5628921	5628926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550209
108015	NC_009512	AAC	2	6	5628975	5628980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550209
108016	NC_009512	CCG	2	6	5629015	5629020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550209
108017	NC_009512	GAT	2	6	5629070	5629075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550209
108018	NC_009512	CTG	2	6	5629100	5629105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108019	NC_009512	GGC	2	6	5629129	5629134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550209
108020	NC_009512	TGC	2	6	5629138	5629143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108021	NC_009512	TGGT	2	8	5629167	5629174	0 %	50 %	50 %	0 %	148550209
108022	NC_009512	GCG	2	6	5629193	5629198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550209
108023	NC_009512	GC	3	6	5629221	5629226	0 %	0 %	50 %	50 %	148550209
108024	NC_009512	GC	3	6	5629235	5629240	0 %	0 %	50 %	50 %	148550209
108025	NC_009512	GAC	2	6	5629295	5629300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108026	NC_009512	CAG	3	9	5629328	5629336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550209
108027	NC_009512	TGG	2	6	5629341	5629346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550209
108028	NC_009512	CTG	2	6	5629824	5629829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550210
108029	NC_009512	GCT	2	6	5629928	5629933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550210
108030	NC_009512	CCG	2	6	5629940	5629945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550210
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108032	NC_009512	GCTG	2	8	5630025	5630032	0 %	25 %	50 %	25 %	148550210
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108034	NC_009512	GC	3	6	5630141	5630146	0 %	0 %	50 %	50 %	148550210
108035	NC_009512	CGAA	2	8	5630177	5630184	50 %	0 %	25 %	25 %	148550210
108036	NC_009512	CGCC	2	8	5630201	5630208	0 %	0 %	25 %	75 %	148550210
108037	NC_009512	GCC	3	9	5630206	5630214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550210
108038	NC_009512	TGG	2	6	5630459	5630464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550210
108039	NC_009512	GGC	2	6	5630502	5630507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550210
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108041	NC_009512	CA	3	6	5630608	5630613	50 %	0 %	0 %	50 %	148550210
108042	NC_009512	TGA	2	6	5630657	5630662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550210
108043	NC_009512	GCT	2	6	5630738	5630743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550210
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108048	NC_009512	CAG	2	6	5630907	5630912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550211
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108050	NC_009512	CAGC	2	8	5630927	5630934	25 %	0 %	25 %	50 %	148550211
108051	NC_009512	CAG	2	6	5630958	5630963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550211
108052	NC_009512	GGC	3	9	5630979	5630987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550211
108053	NC_009512	CGT	2	6	5631005	5631010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550211
108054	NC_009512	ACGGCA	2	12	5631022	5631033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550211
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108057	NC_009512	GAT	2	6	5631108	5631113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550211
108058	NC_009512	CAG	2	6	5631117	5631122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550211
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108108	NC_009512	CATGG	2	10	5633647	5633656	20 %	20 %	40 %	20 %	148550212
108109	NC_009512	GCA	2	6	5634066	5634071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550213
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108111	NC_009512	CAT	2	6	5634139	5634144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550213
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108113	NC_009512	ACC	2	6	5634206	5634211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550213
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108123	NC_009512	CTG	2	6	5634529	5634534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550213
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108219	NC_009512	TC	4	8	5639050	5639057	0 %	50 %	0 %	50 %	148550217
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108222	NC_009512	TA	3	6	5639270	5639275	50 %	50 %	0 %	0 %	148550217
108223	NC_009512	CCG	2	6	5639292	5639297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550217
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108342	NC_009512	CGA	2	6	5646022	5646027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550219
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108346	NC_009512	CTG	2	6	5646684	5646689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550220
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108451	NC_009512	CAACCC	2	12	5654315	5654326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
108452	NC_009512	AC	3	6	5654393	5654398	50 %	0 %	0 %	50 %	148550228
108453	NC_009512	GCA	2	6	5654457	5654462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
108454	NC_009512	ATT	2	6	5654471	5654476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148550228
108455	NC_009512	AGCT	2	8	5654482	5654489	25 %	25 %	25 %	25 %	148550228
108456	NC_009512	CAC	3	9	5654573	5654581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
108457	NC_009512	GAT	2	6	5654666	5654671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550228
108458	NC_009512	CAC	2	6	5654678	5654683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550228
108459	NC_009512	CTC	2	6	5654699	5654704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
108460	NC_009512	TCC	2	6	5654751	5654756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
108461	NC_009512	GAT	2	6	5654768	5654773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550228
108462	NC_009512	ACCT	2	8	5654828	5654835	25 %	25 %	0 %	50 %	148550228
108463	NC_009512	GTG	2	6	5654876	5654881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550228
108464	NC_009512	CAG	3	9	5654896	5654904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
108465	NC_009512	CCT	2	6	5654953	5654958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148550228
108466	NC_009512	AGC	2	6	5654981	5654986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550228
108467	NC_009512	CCTC	2	8	5655001	5655008	0 %	25 %	0 %	75 %	148550228
108468	NC_009512	GCT	2	6	5655088	5655093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550228
108469	NC_009512	GCTCCA	2	12	5655367	5655378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148550229
108470	NC_009512	GGT	3	9	5655445	5655453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550229
108471	NC_009512	ATGCC	2	10	5655521	5655530	20 %	20 %	20 %	40 %	148550230
108472	NC_009512	AGC	2	6	5655547	5655552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550230
108473	NC_009512	GAA	2	6	5655577	5655582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550230
108474	NC_009512	CCA	2	6	5655630	5655635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550230
108475	NC_009512	GAC	2	6	5655658	5655663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550230
108476	NC_009512	GCTC	2	8	5655687	5655694	0 %	25 %	25 %	50 %	148550230
108477	NC_009512	GCC	2	6	5655747	5655752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550230
108478	NC_009512	TGA	3	9	5655766	5655774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550230
108479	NC_009512	ACC	2	6	5655778	5655783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550230
108480	NC_009512	A	7	7	5655797	5655803	100 %	0 %	0 %	0 %	148550230
108481	NC_009512	TCA	2	6	5656017	5656022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550231
108482	NC_009512	CTG	2	6	5656039	5656044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108483	NC_009512	GTC	2	6	5656071	5656076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108484	NC_009512	GCC	2	6	5656098	5656103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550231
108485	NC_009512	CTG	2	6	5656133	5656138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108486	NC_009512	TGCA	2	8	5656205	5656212	25 %	25 %	25 %	25 %	148550231
108487	NC_009512	AGC	2	6	5656217	5656222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108488	NC_009512	TTC	2	6	5656235	5656240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550231
108489	NC_009512	GCA	2	6	5656309	5656314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108490	NC_009512	TGAC	2	8	5656447	5656454	25 %	25 %	25 %	25 %	148550231
108491	NC_009512	AAG	2	6	5656535	5656540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550231
108492	NC_009512	TCAACC	2	12	5656611	5656622	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148550231
108493	NC_009512	GCA	2	6	5656636	5656641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108494	NC_009512	CTT	2	6	5656667	5656672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550231
108495	NC_009512	GGTAGA	2	12	5656681	5656692	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148550231
108496	NC_009512	CAG	2	6	5656735	5656740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108497	NC_009512	GCTG	2	8	5656763	5656770	0 %	25 %	50 %	25 %	148550231
108498	NC_009512	AGG	2	6	5656829	5656834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550231
108499	NC_009512	GTC	2	6	5656889	5656894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550231
108500	NC_009512	CAG	2	6	5656910	5656915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550231

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