MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
107501	NC_009512	GCA	2	6	5602265	5602270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550186
107502	NC_009512	GCC	2	6	5602321	5602326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550186
107503	NC_009512	CCA	2	6	5602364	5602369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550186
107504	NC_009512	GCCGG	2	10	5602457	5602466	0 %	0 %	60 %	40 %	148550186
107505	NC_009512	GCG	2	6	5602468	5602473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550186
107506	NC_009512	CAGC	2	8	5602487	5602494	25 %	0 %	25 %	50 %	148550186
107507	NC_009512	GCA	2	6	5602501	5602506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550186
107508	NC_009512	CGG	2	6	5602541	5602546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550186
107509	NC_009512	G	6	6	5602587	5602592	0 %	0 %	100 %	0 %	148550186
107510	NC_009512	CTT	2	6	5602632	5602637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550186
107511	NC_009512	TCT	2	6	5602661	5602666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550186
107512	NC_009512	CGGC	2	8	5602676	5602683	0 %	0 %	50 %	50 %	148550186
107513	NC_009512	T	6	6	5602686	5602691	0 %	100 %	0 %	0 %	148550186
107514	NC_009512	GTC	2	6	5602692	5602697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550186
107515	NC_009512	CGC	2	6	5602959	5602964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107516	NC_009512	CTGC	2	8	5602991	5602998	0 %	25 %	25 %	50 %	148550187
107517	NC_009512	CGC	2	6	5603012	5603017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107518	NC_009512	ACCC	2	8	5603027	5603034	25 %	0 %	0 %	75 %	148550187
107519	NC_009512	GGT	3	9	5603093	5603101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550187
107520	NC_009512	ATG	2	6	5603178	5603183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550187
107521	NC_009512	CGA	2	6	5603267	5603272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107522	NC_009512	GCCTGC	2	12	5603350	5603361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148550187
107523	NC_009512	CGA	2	6	5603366	5603371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107524	NC_009512	TCA	2	6	5603392	5603397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550187
107525	NC_009512	GAA	2	6	5603400	5603405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550187
107526	NC_009512	CGC	2	6	5603406	5603411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107527	NC_009512	CGA	2	6	5603420	5603425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107528	NC_009512	CAA	2	6	5603573	5603578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550187
107529	NC_009512	TGG	3	9	5603587	5603595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550187
107530	NC_009512	CCG	3	9	5603608	5603616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107531	NC_009512	GC	3	6	5603660	5603665	0 %	0 %	50 %	50 %	148550187
107532	NC_009512	GCCA	2	8	5603672	5603679	25 %	0 %	25 %	50 %	148550187
107533	NC_009512	CGG	2	6	5603840	5603845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550187
107534	NC_009512	TGG	2	6	5603890	5603895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550187
107535	NC_009512	CGT	2	6	5603902	5603907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107536	NC_009512	GCAGAA	2	12	5603969	5603980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148550187
107537	NC_009512	GCT	2	6	5604014	5604019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107538	NC_009512	GAA	2	6	5604021	5604026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550187
107539	NC_009512	CGC	2	6	5604037	5604042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107540	NC_009512	CAG	2	6	5604113	5604118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550187
107541	NC_009512	CCA	3	9	5604124	5604132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550187
107542	NC_009512	CGC	2	6	5604224	5604229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550187
107543	NC_009512	GC	3	6	5604228	5604233	0 %	0 %	50 %	50 %	148550187
107544	NC_009512	GAG	2	6	5604279	5604284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550187
107545	NC_009512	CGC	2	6	5604301	5604306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550188
107546	NC_009512	CAC	2	6	5604308	5604313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550188
107547	NC_009512	CTG	2	6	5604322	5604327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
107548	NC_009512	CTGGCG	2	12	5604346	5604357	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148550188
107549	NC_009512	CAG	2	6	5604405	5604410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550188
107550	NC_009512	GCCC	2	8	5604415	5604422	0 %	0 %	25 %	75 %	148550188
107551	NC_009512	CCG	2	6	5604503	5604508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550188
107552	NC_009512	TCG	2	6	5604527	5604532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
107553	NC_009512	GCA	2	6	5604581	5604586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550188
107554	NC_009512	CGG	2	6	5604594	5604599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550188
107555	NC_009512	GCTG	2	8	5604855	5604862	0 %	25 %	50 %	25 %	148550188
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107557	NC_009512	CCCA	2	8	5604944	5604951	25 %	0 %	0 %	75 %	148550188
107558	NC_009512	AG	3	6	5604966	5604971	50 %	0 %	50 %	0 %	148550188
107559	NC_009512	GC	3	6	5604999	5605004	0 %	0 %	50 %	50 %	148550188
107560	NC_009512	CGG	2	6	5605026	5605031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550188
107561	NC_009512	TCG	2	6	5605049	5605054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
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107564	NC_009512	TGA	2	6	5605301	5605306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550188
107565	NC_009512	GA	3	6	5605316	5605321	50 %	0 %	50 %	0 %	148550188
107566	NC_009512	TCG	2	6	5605550	5605555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550188
107567	NC_009512	AACA	2	8	5605660	5605667	75 %	0 %	0 %	25 %	148550188
107568	NC_009512	CCCG	3	12	5605800	5605811	0 %	0 %	25 %	75 %	148550189
107569	NC_009512	AGGGCC	2	12	5605828	5605839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148550189
107570	NC_009512	GCC	3	9	5605870	5605878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550189
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107572	NC_009512	CTGG	2	8	5605943	5605950	0 %	25 %	50 %	25 %	148550189
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107576	NC_009512	CTG	2	6	5606211	5606216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550189
107577	NC_009512	AGC	2	6	5606239	5606244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550189
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107584	NC_009512	GCA	3	9	5606674	5606682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550190
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107586	NC_009512	GCG	2	6	5606888	5606893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550190
107587	NC_009512	ACA	2	6	5606905	5606910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550190
107588	NC_009512	CTG	2	6	5606943	5606948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
107589	NC_009512	CAA	2	6	5607056	5607061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550190
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107599	NC_009512	CTG	2	6	5607555	5607560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550190
107600	NC_009512	GAC	2	6	5607582	5607587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550190
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107603	NC_009512	TTCACG	2	12	5607738	5607749	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148550190
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107608	NC_009512	GCT	2	6	5607825	5607830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550191
107609	NC_009512	CT	3	6	5607829	5607834	0 %	50 %	0 %	50 %	148550191
107610	NC_009512	CCAT	2	8	5607866	5607873	25 %	25 %	0 %	50 %	148550191
107611	NC_009512	GAC	2	6	5607894	5607899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550191
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107951	NC_009512	ATCAGC	2	12	5626427	5626438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148550207
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