MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
106001	NC_009512	AGCA	2	8	5526170	5526177	50 %	0 %	25 %	25 %	148550124
106002	NC_009512	ACC	2	6	5526182	5526187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550124
106003	NC_009512	GGC	2	6	5526233	5526238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550124
106004	NC_009512	ATC	2	6	5526308	5526313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550124
106005	NC_009512	CAA	2	6	5526361	5526366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550124
106006	NC_009512	GAT	2	6	5526508	5526513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550124
106007	NC_009512	ATC	2	6	5526662	5526667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550124
106008	NC_009512	CCG	2	6	5526686	5526691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550124
106009	NC_009512	GCC	2	6	5526729	5526734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550124
106010	NC_009512	CAT	2	6	5526772	5526777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550124
106011	NC_009512	CAGC	2	8	5526778	5526785	25 %	0 %	25 %	50 %	148550124
106012	NC_009512	TCG	2	6	5526896	5526901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106013	NC_009512	GAT	2	6	5526904	5526909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550125
106014	NC_009512	ACC	2	6	5526958	5526963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550125
106015	NC_009512	CTG	2	6	5527066	5527071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106016	NC_009512	TCA	3	9	5527106	5527114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550125
106017	NC_009512	TCGACG	2	12	5527190	5527201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106018	NC_009512	GC	3	6	5527221	5527226	0 %	0 %	50 %	50 %	148550125
106019	NC_009512	AGC	2	6	5527244	5527249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106020	NC_009512	GC	3	6	5527276	5527281	0 %	0 %	50 %	50 %	148550125
106021	NC_009512	AGG	2	6	5527316	5527321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148550125
106022	NC_009512	GCC	2	6	5527337	5527342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106023	NC_009512	CCGGCA	2	12	5527382	5527393	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550125
106024	NC_009512	TGG	2	6	5527400	5527405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550125
106025	NC_009512	GCA	2	6	5527435	5527440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106026	NC_009512	GCC	2	6	5527465	5527470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106027	NC_009512	TGC	2	6	5527530	5527535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106028	NC_009512	TGG	2	6	5527569	5527574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550125
106029	NC_009512	CGA	2	6	5527587	5527592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106030	NC_009512	TGCC	2	8	5527604	5527611	0 %	25 %	25 %	50 %	148550125
106031	NC_009512	CTG	2	6	5527627	5527632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106032	NC_009512	GGC	2	6	5527666	5527671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550125
106033	NC_009512	CAT	2	6	5527698	5527703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550125
106034	NC_009512	CGC	2	6	5527704	5527709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106035	NC_009512	CACC	2	8	5527710	5527717	25 %	0 %	0 %	75 %	148550125
106036	NC_009512	CCG	2	6	5527812	5527817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106037	NC_009512	CGCC	2	8	5527836	5527843	0 %	0 %	25 %	75 %	148550125
106038	NC_009512	GGC	2	6	5527857	5527862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550125
106039	NC_009512	CTG	2	6	5528026	5528031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106040	NC_009512	CGC	2	6	5528046	5528051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106041	NC_009512	GC	3	6	5528104	5528109	0 %	0 %	50 %	50 %	148550125
106042	NC_009512	CTG	2	6	5528122	5528127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550125
106043	NC_009512	CAGTG	2	10	5528130	5528139	20 %	20 %	40 %	20 %	148550125
106044	NC_009512	CCG	2	6	5528183	5528188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106045	NC_009512	GCC	2	6	5528189	5528194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550125
106046	NC_009512	G	7	7	5528275	5528281	0 %	0 %	100 %	0 %	148550125
106047	NC_009512	ATG	2	6	5528282	5528287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550125
106048	NC_009512	TGA	2	6	5528295	5528300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550125
106049	NC_009512	GC	3	6	5528839	5528844	0 %	0 %	50 %	50 %	148550126
106050	NC_009512	CCA	2	6	5528847	5528852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550126
106051	NC_009512	CAA	3	9	5528857	5528865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550126
106052	NC_009512	CCTT	2	8	5528867	5528874	0 %	50 %	0 %	50 %	148550126
106053	NC_009512	GCTGT	2	10	5528875	5528884	0 %	40 %	40 %	20 %	148550126
106054	NC_009512	CTG	2	6	5529043	5529048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550126
106055	NC_009512	ATC	2	6	5529083	5529088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550126
106056	NC_009512	CCG	2	6	5529236	5529241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550127
106057	NC_009512	CAT	2	6	5529253	5529258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550127
106058	NC_009512	GTT	2	6	5529424	5529429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550127
106059	NC_009512	ACC	2	6	5529437	5529442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550127
106060	NC_009512	CTT	2	6	5529490	5529495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550127
106061	NC_009512	AG	3	6	5529505	5529510	50 %	0 %	50 %	0 %	148550127
106062	NC_009512	GCCG	2	8	5529520	5529527	0 %	0 %	50 %	50 %	148550127
106063	NC_009512	GCCG	2	8	5529544	5529551	0 %	0 %	50 %	50 %	148550127
106064	NC_009512	GGC	2	6	5529636	5529641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550127
106065	NC_009512	GAAC	2	8	5529913	5529920	50 %	0 %	25 %	25 %	148550128
106066	NC_009512	CTG	2	6	5530042	5530047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550128
106067	NC_009512	TCA	2	6	5530070	5530075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550128
106068	NC_009512	TGT	2	6	5530260	5530265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550128
106069	NC_009512	GCA	2	6	5530271	5530276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550128
106070	NC_009512	GTCA	2	8	5530294	5530301	25 %	25 %	25 %	25 %	148550128
106071	NC_009512	GCC	2	6	5530346	5530351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550129
106072	NC_009512	CG	3	6	5530372	5530377	0 %	0 %	50 %	50 %	148550129
106073	NC_009512	CGGC	2	8	5530448	5530455	0 %	0 %	50 %	50 %	148550129
106074	NC_009512	AGT	2	6	5530563	5530568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550129
106075	NC_009512	GGC	2	6	5530655	5530660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550130
106076	NC_009512	AGC	2	6	5530677	5530682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550130
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106078	NC_009512	CGA	3	9	5530720	5530728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550130
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106080	NC_009512	CGA	2	6	5530804	5530809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550130
106081	NC_009512	CGG	2	6	5530816	5530821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550130
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106083	NC_009512	AGC	2	6	5530932	5530937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550130
106084	NC_009512	CAG	2	6	5530943	5530948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550130
106085	NC_009512	TGAT	2	8	5531213	5531220	25 %	50 %	25 %	0 %	148550131
106086	NC_009512	GCC	2	6	5531303	5531308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550131
106087	NC_009512	CGT	2	6	5531443	5531448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106088	NC_009512	TTC	2	6	5531495	5531500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550131
106089	NC_009512	CTG	2	6	5531570	5531575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
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106094	NC_009512	GC	3	6	5531700	5531705	0 %	0 %	50 %	50 %	148550131
106095	NC_009512	GTC	2	6	5531707	5531712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106096	NC_009512	CTA	2	6	5531779	5531784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550131
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106098	NC_009512	TCG	2	6	5531838	5531843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106099	NC_009512	CGA	2	6	5531905	5531910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106100	NC_009512	CGA	2	6	5531914	5531919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106101	NC_009512	GC	3	6	5532059	5532064	0 %	0 %	50 %	50 %	148550131
106102	NC_009512	GGC	2	6	5532076	5532081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550131
106103	NC_009512	CCGGCA	2	12	5532116	5532127	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148550131
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106105	NC_009512	CTT	3	9	5532232	5532240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550131
106106	NC_009512	TCG	2	6	5532357	5532362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
106107	NC_009512	CAG	2	6	5532374	5532379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550131
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106110	NC_009512	GGC	2	6	5532656	5532661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550131
106111	NC_009512	GCT	2	6	5532694	5532699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550131
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106113	NC_009512	CAG	2	6	5532970	5532975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550132
106114	NC_009512	GAA	2	6	5533036	5533041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550132
106115	NC_009512	GCA	2	6	5533116	5533121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550132
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106117	NC_009512	A	9	9	5533168	5533176	100 %	0 %	0 %	0 %	148550132
106118	NC_009512	AAC	3	9	5533196	5533204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550132
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106220	NC_009512	CTG	2	6	5538267	5538272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550135
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106339	NC_009512	GAC	2	6	5544100	5544105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550137
106340	NC_009512	CG	3	6	5544110	5544115	0 %	0 %	50 %	50 %	148550137
106341	NC_009512	ATC	2	6	5544130	5544135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550137
106342	NC_009512	GCCA	2	8	5544151	5544158	25 %	0 %	25 %	50 %	148550137
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106344	NC_009512	TGC	2	6	5544271	5544276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550137
106345	NC_009512	CCG	2	6	5544282	5544287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550137
106346	NC_009512	GC	3	6	5544307	5544312	0 %	0 %	50 %	50 %	148550137
106347	NC_009512	AGC	2	6	5544440	5544445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550137
106348	NC_009512	GC	3	6	5544481	5544486	0 %	0 %	50 %	50 %	148550137
106349	NC_009512	GCGCC	2	10	5544771	5544780	0 %	0 %	40 %	60 %	148550138
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106351	NC_009512	TAC	2	6	5544898	5544903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550138
106352	NC_009512	CGC	2	6	5544970	5544975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550138
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106355	NC_009512	CGG	2	6	5545239	5545244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550138
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106358	NC_009512	TCG	2	6	5545285	5545290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550138
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106362	NC_009512	GCC	2	6	5545363	5545368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550138
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106367	NC_009512	TGA	2	6	5545730	5545735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550138
106368	NC_009512	GAA	3	9	5545756	5545764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550138
106369	NC_009512	CCG	2	6	5545770	5545775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550138
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106403	NC_009512	CGA	2	6	5547557	5547562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550139
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106408	NC_009512	TAC	2	6	5547741	5547746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550139
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106433	NC_009512	CGT	2	6	5549211	5549216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550140
106434	NC_009512	GGC	2	6	5549217	5549222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550140
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106441	NC_009512	TCG	2	6	5549653	5549658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550140
106442	NC_009512	TGGC	2	8	5549668	5549675	0 %	25 %	50 %	25 %	148550140
106443	NC_009512	CCA	2	6	5549692	5549697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550140
106444	NC_009512	CTG	3	9	5549724	5549732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550140
106445	NC_009512	CGT	2	6	5549776	5549781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550140
106446	NC_009512	GGC	2	6	5549782	5549787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550140
106447	NC_009512	CTG	2	6	5549821	5549826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550140
106448	NC_009512	GCC	2	6	5549827	5549832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550140
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106450	NC_009512	GGC	2	6	5549885	5549890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550140
106451	NC_009512	CGC	2	6	5549904	5549909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550140
106452	NC_009512	GC	3	6	5549913	5549918	0 %	0 %	50 %	50 %	148550140
106453	NC_009512	GA	3	6	5549970	5549975	50 %	0 %	50 %	0 %	148550140
106454	NC_009512	TGG	2	6	5550220	5550225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550141
106455	NC_009512	TCG	2	6	5550252	5550257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
106456	NC_009512	TCA	2	6	5550280	5550285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550141
106457	NC_009512	TGG	2	6	5550317	5550322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550141
106458	NC_009512	CAT	2	6	5550326	5550331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550141
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106460	NC_009512	TGG	2	6	5550358	5550363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550141
106461	NC_009512	TGA	2	6	5550469	5550474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550141
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106465	NC_009512	GCT	2	6	5550587	5550592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
106466	NC_009512	CGG	2	6	5550593	5550598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550141
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106472	NC_009512	GCG	2	6	5550781	5550786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550141
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106480	NC_009512	CTG	2	6	5551053	5551058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
106481	NC_009512	GAT	2	6	5551094	5551099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550141
106482	NC_009512	TGG	2	6	5551102	5551107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550141
106483	NC_009512	GGT	2	6	5551121	5551126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550141
106484	NC_009512	CTG	2	6	5551134	5551139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
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106488	NC_009512	CTG	2	6	5551296	5551301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
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106492	NC_009512	GCC	2	6	5551458	5551463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550141
106493	NC_009512	CTG	2	6	5551524	5551529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550141
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106498	NC_009512	CTTT	2	8	5552003	5552010	0 %	75 %	0 %	25 %	148550142
106499	NC_009512	ACC	2	6	5552036	5552041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550142
106500	NC_009512	GCA	2	6	5552110	5552115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550142

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