MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
104001	NC_009512	CCA	2	6	5428330	5428335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550041
104002	NC_009512	CTT	2	6	5428343	5428348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550041
104003	NC_009512	CAG	2	6	5428377	5428382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550041
104004	NC_009512	CTG	2	6	5428419	5428424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550041
104005	NC_009512	GCT	2	6	5428427	5428432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550041
104006	NC_009512	GCC	2	6	5428455	5428460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550041
104007	NC_009512	GC	3	6	5428462	5428467	0 %	0 %	50 %	50 %	148550041
104008	NC_009512	ACA	2	6	5428540	5428545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550041
104009	NC_009512	GC	3	6	5428566	5428571	0 %	0 %	50 %	50 %	148550041
104010	NC_009512	GCC	2	6	5428644	5428649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550041
104011	NC_009512	TGC	2	6	5428672	5428677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550041
104012	NC_009512	AGGC	2	8	5428729	5428736	25 %	0 %	50 %	25 %	148550041
104013	NC_009512	CTG	2	6	5428743	5428748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550041
104014	NC_009512	GC	3	6	5428782	5428787	0 %	0 %	50 %	50 %	148550041
104015	NC_009512	GCG	2	6	5428795	5428800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550041
104016	NC_009512	CTGG	2	8	5428805	5428812	0 %	25 %	50 %	25 %	148550041
104017	NC_009512	GC	3	6	5428833	5428838	0 %	0 %	50 %	50 %	148550041
104018	NC_009512	CAT	2	6	5429066	5429071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104019	NC_009512	CAT	2	6	5429129	5429134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104020	NC_009512	CAC	2	6	5429147	5429152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550042
104021	NC_009512	TCA	2	6	5429191	5429196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104022	NC_009512	ACA	2	6	5429209	5429214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550042
104023	NC_009512	TGA	2	6	5429251	5429256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550042
104024	NC_009512	CAT	2	6	5429258	5429263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104025	NC_009512	CTG	2	6	5429445	5429450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104026	NC_009512	GTG	2	6	5429526	5429531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550042
104027	NC_009512	AAG	2	6	5429575	5429580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148550042
104028	NC_009512	CTGC	2	8	5429610	5429617	0 %	25 %	25 %	50 %	148550042
104029	NC_009512	CTG	2	6	5429622	5429627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104030	NC_009512	TCA	2	6	5429668	5429673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104031	NC_009512	GGTG	2	8	5429684	5429691	0 %	25 %	75 %	0 %	148550042
104032	NC_009512	ATC	2	6	5429715	5429720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104033	NC_009512	CGG	2	6	5429732	5429737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550042
104034	NC_009512	GGT	3	9	5429751	5429759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550042
104035	NC_009512	CCG	2	6	5429797	5429802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550042
104036	NC_009512	GCCG	2	8	5429808	5429815	0 %	0 %	50 %	50 %	148550042
104037	NC_009512	TCG	2	6	5429833	5429838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104038	NC_009512	CCG	2	6	5429839	5429844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550042
104039	NC_009512	CGA	2	6	5429942	5429947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104040	NC_009512	ATC	2	6	5429952	5429957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148550042
104041	NC_009512	CAC	2	6	5429999	5430004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550042
104042	NC_009512	CTG	2	6	5430015	5430020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104043	NC_009512	GCA	2	6	5430071	5430076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104044	NC_009512	CGA	2	6	5430089	5430094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550042
104045	NC_009512	CAC	2	6	5430101	5430106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550042
104046	NC_009512	ACCG	2	8	5430123	5430130	25 %	0 %	25 %	50 %	148550042
104047	NC_009512	TGT	3	9	5430404	5430412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148550043
104048	NC_009512	TGG	2	6	5430560	5430565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550043
104049	NC_009512	CGA	2	6	5430567	5430572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104050	NC_009512	ACC	2	6	5430602	5430607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550043
104051	NC_009512	GCA	2	6	5430609	5430614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104052	NC_009512	CCCCT	2	10	5430636	5430645	0 %	20 %	0 %	80 %	148550043
104053	NC_009512	GATG	2	8	5430728	5430735	25 %	25 %	50 %	0 %	148550043
104054	NC_009512	GCG	2	6	5430746	5430751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550043
104055	NC_009512	G	6	6	5430830	5430835	0 %	0 %	100 %	0 %	148550043
104056	NC_009512	AGGC	2	8	5430968	5430975	25 %	0 %	50 %	25 %	148550043
104057	NC_009512	GCT	2	6	5431005	5431010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104058	NC_009512	CGCA	2	8	5431011	5431018	25 %	0 %	25 %	50 %	148550043
104059	NC_009512	ACTG	2	8	5431023	5431030	25 %	25 %	25 %	25 %	148550043
104060	NC_009512	CAGC	2	8	5431134	5431141	25 %	0 %	25 %	50 %	148550043
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104062	NC_009512	GCA	2	6	5431174	5431179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104063	NC_009512	GCTCT	2	10	5431202	5431211	0 %	40 %	20 %	40 %	148550043
104064	NC_009512	TGC	2	6	5431394	5431399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550043
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104067	NC_009512	GTG	2	6	5431534	5431539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550043
104068	NC_009512	CGC	2	6	5431566	5431571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550043
104069	NC_009512	GCT	2	6	5431601	5431606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104070	NC_009512	TGA	2	6	5431626	5431631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550043
104071	NC_009512	GGCCT	2	10	5431672	5431681	0 %	20 %	40 %	40 %	148550043
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104073	NC_009512	CAG	2	6	5431794	5431799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104074	NC_009512	CTG	2	6	5431816	5431821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550043
104075	NC_009512	CGA	2	6	5431830	5431835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550043
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104088	NC_009512	CAC	2	6	5433002	5433007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148550045
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104101	NC_009512	CAGC	2	8	5433636	5433643	25 %	0 %	25 %	50 %	148550046
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104103	NC_009512	CCTT	2	8	5433660	5433667	0 %	50 %	0 %	50 %	148550046
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104106	NC_009512	TGA	2	6	5433805	5433810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148550046
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104109	NC_009512	GACC	2	8	5433958	5433965	25 %	0 %	25 %	50 %	148550046
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104112	NC_009512	A	6	6	5434109	5434114	100 %	0 %	0 %	0 %	148550046
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104114	NC_009512	TTC	2	6	5434205	5434210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550046
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104219	NC_009512	AAAG	2	8	5439399	5439406	75 %	0 %	25 %	0 %	148550051
104220	NC_009512	TGC	2	6	5439428	5439433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550051
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104226	NC_009512	TTC	2	6	5439770	5439775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550052
104227	NC_009512	CCAA	2	8	5439776	5439783	50 %	0 %	0 %	50 %	148550052
104228	NC_009512	CGCC	2	8	5439817	5439824	0 %	0 %	25 %	75 %	148550052
104229	NC_009512	CTT	2	6	5439847	5439852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550052
104230	NC_009512	TGC	2	6	5439906	5439911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550052
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104238	NC_009512	GTG	2	6	5440071	5440076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550052
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104254	NC_009512	GCA	2	6	5440957	5440962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550053
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104327	NC_009512	CAA	2	6	5444584	5444589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148550055
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104329	NC_009512	GGC	2	6	5444612	5444617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148550055
104330	NC_009512	TGC	2	6	5444647	5444652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550055
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104332	NC_009512	GCC	2	6	5444769	5444774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148550055
104333	NC_009512	GCT	2	6	5444794	5444799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550055
104334	NC_009512	TCCAGG	2	12	5444987	5444998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148550056
104335	NC_009512	GTTCAG	2	12	5445037	5445048	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148550056
104336	NC_009512	TGG	2	6	5445054	5445059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550056
104337	NC_009512	GC	3	6	5445071	5445076	0 %	0 %	50 %	50 %	148550056
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104339	NC_009512	CAG	2	6	5445171	5445176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550056
104340	NC_009512	TGG	2	6	5445201	5445206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550056
104341	NC_009512	CTT	2	6	5445229	5445234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148550056
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104344	NC_009512	TGGCC	2	10	5445471	5445480	0 %	20 %	40 %	40 %	148550056
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104446	NC_009512	GCA	2	6	5451143	5451148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550061
104447	NC_009512	CG	3	6	5451159	5451164	0 %	0 %	50 %	50 %	148550061
104448	NC_009512	TGC	2	6	5451165	5451170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148550061
104449	NC_009512	GGT	2	6	5451187	5451192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148550061
104450	NC_009512	CAG	2	6	5451209	5451214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148550061
104451	NC_009512	ATGCC	2	10	5451300	5451309	20 %	20 %	20 %	40 %	148550062
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