MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009512	TGA	2	6	29156	29161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545283
502	NC_009512	ATG	2	6	29203	29208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545283
503	NC_009512	CAA	2	6	29324	29329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545284
504	NC_009512	ACC	2	6	29403	29408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545284
505	NC_009512	TG	3	6	29440	29445	0 %	50 %	50 %	0 %	148545284
506	NC_009512	GCA	2	6	29512	29517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545285
507	NC_009512	CAT	3	9	29532	29540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
508	NC_009512	CAT	2	6	29544	29549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
509	NC_009512	CAT	2	6	29556	29561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
510	NC_009512	CAT	2	6	29577	29582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
511	NC_009512	TGG	2	6	29584	29589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545285
512	NC_009512	GGC	2	6	29592	29597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545285
513	NC_009512	GCC	2	6	29613	29618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545285
514	NC_009512	ATGC	2	8	29619	29626	25 %	25 %	25 %	25 %	148545285
515	NC_009512	C	6	6	29626	29631	0 %	0 %	0 %	100 %	148545285
516	NC_009512	TCA	2	6	29660	29665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
517	NC_009512	GCCAT	2	10	29668	29677	20 %	20 %	20 %	40 %	148545285
518	NC_009512	TCA	2	6	29681	29686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
519	NC_009512	CGC	2	6	29787	29792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545285
520	NC_009512	TCT	2	6	29825	29830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545285
521	NC_009512	GCC	2	6	29836	29841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545285
522	NC_009512	CAAA	2	8	29919	29926	75 %	0 %	0 %	25 %	148545285
523	NC_009512	GTT	2	6	29949	29954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545285
524	NC_009512	CAT	3	9	29955	29963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545285
525	NC_009512	TAT	2	6	30094	30099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148545286
526	NC_009512	CGG	2	6	30108	30113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545286
527	NC_009512	GCT	2	6	30171	30176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545286
528	NC_009512	GCT	2	6	30237	30242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545286
529	NC_009512	GGT	2	6	30270	30275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545286
530	NC_009512	GCT	2	6	30288	30293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545286
531	NC_009512	GTC	2	6	30324	30329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545286
532	NC_009512	CAT	2	6	30387	30392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545286
533	NC_009512	GAT	2	6	30450	30455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545286
534	NC_009512	GAC	2	6	30567	30572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545286
535	NC_009512	GCT	2	6	30689	30694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545286
536	NC_009512	GC	3	6	30818	30823	0 %	0 %	50 %	50 %	148545286
537	NC_009512	CAA	2	6	30893	30898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545286
538	NC_009512	AAGC	2	8	30903	30910	50 %	0 %	25 %	25 %	148545286
539	NC_009512	TCA	2	6	31112	31117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545286
540	NC_009512	GACT	2	8	31389	31396	25 %	25 %	25 %	25 %	148545287
541	NC_009512	TTGG	2	8	31397	31404	0 %	50 %	50 %	0 %	148545287
542	NC_009512	GCA	2	6	31475	31480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545287
543	NC_009512	TTG	2	6	31535	31540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545287
544	NC_009512	ATC	2	6	32001	32006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545288
545	NC_009512	GCC	2	6	32046	32051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545288
546	NC_009512	AGA	2	6	32074	32079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545288
547	NC_009512	TTC	2	6	32106	32111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545288
548	NC_009512	CCA	2	6	32308	32313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545288
549	NC_009512	GTT	2	6	32365	32370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545288
550	NC_009512	ATG	2	6	32412	32417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545288
551	NC_009512	TCT	2	6	32427	32432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545288
552	NC_009512	CCT	2	6	32452	32457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545288
553	NC_009512	GCT	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545288
554	NC_009512	GGC	2	6	32768	32773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545288
555	NC_009512	GGCC	2	8	32832	32839	0 %	0 %	50 %	50 %	148545288
556	NC_009512	CGA	2	6	32863	32868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545288
557	NC_009512	CTG	2	6	32928	32933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545288
558	NC_009512	GC	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	148545288
559	NC_009512	GGCA	2	8	32992	32999	25 %	0 %	50 %	25 %	148545288
560	NC_009512	GACCGC	2	12	33008	33019	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148545288
561	NC_009512	CCAG	2	8	33038	33045	25 %	0 %	25 %	50 %	148545288
562	NC_009512	CG	3	6	33168	33173	0 %	0 %	50 %	50 %	148545288
563	NC_009512	GCC	2	6	33222	33227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545288
564	NC_009512	TCA	2	6	33286	33291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545288
565	NC_009512	ACC	2	6	33348	33353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545288
566	NC_009512	GGT	2	6	33391	33396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545288
567	NC_009512	TCC	2	6	33429	33434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545288
568	NC_009512	GGC	2	6	33494	33499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545288
569	NC_009512	GC	3	6	33512	33517	0 %	0 %	50 %	50 %	148545288
570	NC_009512	GAT	2	6	33554	33559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545288
571	NC_009512	GTC	2	6	33609	33614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545288
572	NC_009512	CGC	2	6	33659	33664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545288
573	NC_009512	CACG	2	8	33727	33734	25 %	0 %	25 %	50 %	148545288
574	NC_009512	GCCA	2	8	33742	33749	25 %	0 %	25 %	50 %	148545288
575	NC_009512	TG	3	6	33795	33800	0 %	50 %	50 %	0 %	148545288
576	NC_009512	GCA	2	6	33808	33813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545288
577	NC_009512	TGG	2	6	33822	33827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545288
578	NC_009512	CCA	2	6	33872	33877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545288
579	NC_009512	GCG	2	6	33881	33886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545288
580	NC_009512	CCG	2	6	34024	34029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545288
581	NC_009512	TGGTCA	3	18	34257	34274	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148545288
582	NC_009512	CAT	2	6	34548	34553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545289
583	NC_009512	TGGG	2	8	34569	34576	0 %	25 %	75 %	0 %	148545289
584	NC_009512	ACA	2	6	34610	34615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545289
585	NC_009512	CAAT	2	8	34638	34645	50 %	25 %	0 %	25 %	148545289
586	NC_009512	TGCA	2	8	35444	35451	25 %	25 %	25 %	25 %	148545290
587	NC_009512	TTC	2	6	35478	35483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545290
588	NC_009512	TG	3	6	35524	35529	0 %	50 %	50 %	0 %	148545290
589	NC_009512	GTT	2	6	35620	35625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545290
590	NC_009512	GACCT	2	10	35675	35684	20 %	20 %	20 %	40 %	148545290
591	NC_009512	GGAT	2	8	35697	35704	25 %	25 %	50 %	0 %	148545290
592	NC_009512	T	6	6	35704	35709	0 %	100 %	0 %	0 %	148545290
593	NC_009512	TGG	2	6	35778	35783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545290
594	NC_009512	CTCGC	2	10	35829	35838	0 %	20 %	20 %	60 %	148545290
595	NC_009512	CGA	2	6	35887	35892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545290
596	NC_009512	AG	3	6	35984	35989	50 %	0 %	50 %	0 %	148545290
597	NC_009512	GTG	2	6	35994	35999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545290
598	NC_009512	CGC	2	6	36001	36006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545290
599	NC_009512	TCG	2	6	36060	36065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545290
600	NC_009512	CGCA	2	8	36119	36126	25 %	0 %	25 %	50 %	148545290
601	NC_009512	GGC	2	6	36142	36147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545290
602	NC_009512	AAC	2	6	36223	36228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545290
603	NC_009512	CGG	2	6	36249	36254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545290
604	NC_009512	GGT	2	6	36257	36262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545290
605	NC_009512	ATC	2	6	36266	36271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545290
606	NC_009512	ATG	2	6	36324	36329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545290
607	NC_009512	ATCG	2	8	36346	36353	25 %	25 %	25 %	25 %	148545290
608	NC_009512	GCT	2	6	36373	36378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545290
609	NC_009512	CCA	2	6	36381	36386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545290
610	NC_009512	TGC	2	6	36402	36407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545290
611	NC_009512	GAC	2	6	36431	36436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545290
612	NC_009512	TACCG	2	10	36662	36671	20 %	20 %	20 %	40 %	148545291
613	NC_009512	CGCT	2	8	36680	36687	0 %	25 %	25 %	50 %	148545291
614	NC_009512	CAG	2	6	36688	36693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545291
615	NC_009512	TCG	2	6	36744	36749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545291
616	NC_009512	AGG	2	6	36777	36782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545291
617	NC_009512	GGT	2	6	36790	36795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545291
618	NC_009512	GCCTT	2	10	36801	36810	0 %	40 %	20 %	40 %	148545291
619	NC_009512	A	6	6	36879	36884	100 %	0 %	0 %	0 %	148545291
620	NC_009512	AC	3	6	37012	37017	50 %	0 %	0 %	50 %	148545291
621	NC_009512	GGT	2	6	37297	37302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545292
622	NC_009512	GC	3	6	37336	37341	0 %	0 %	50 %	50 %	148545292
623	NC_009512	TGAA	2	8	37362	37369	50 %	25 %	25 %	0 %	148545292
624	NC_009512	GATGAA	2	12	37511	37522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148545292
625	NC_009512	GAT	2	6	37532	37537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545292
626	NC_009512	CTGA	2	8	37539	37546	25 %	25 %	25 %	25 %	148545292
627	NC_009512	GATG	2	8	37856	37863	25 %	25 %	50 %	0 %	148545293
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994	NC_009512	CGACG	2	10	62124	62133	20 %	0 %	40 %	40 %	148545315
995	NC_009512	TGT	2	6	62144	62149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545315
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997	NC_009512	CAA	2	6	62241	62246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545315
998	NC_009512	TCG	2	6	62285	62290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545315
999	NC_009512	ACG	2	6	62315	62320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545315
1000	NC_009512	CTT	2	6	62403	62408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545315

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