MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_009512	CCG	2	6	324349	324354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537
6003	NC_009512	ACG	2	6	324418	324423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6004	NC_009512	TCA	2	6	324457	324462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545537
6005	NC_009512	GGC	2	6	324510	324515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545537
6006	NC_009512	CGG	2	6	324521	324526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545537
6007	NC_009512	CGA	2	6	324548	324553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6008	NC_009512	GCC	2	6	324561	324566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537
6009	NC_009512	GGT	2	6	324624	324629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545537
6010	NC_009512	CAC	2	6	324662	324667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545537
6011	NC_009512	CAACCG	2	12	324683	324694	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148545537
6012	NC_009512	TGC	2	6	324730	324735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6013	NC_009512	ACG	2	6	324787	324792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6014	NC_009512	CTG	2	6	324818	324823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6015	NC_009512	GAT	2	6	324861	324866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545537
6016	NC_009512	GC	3	6	324885	324890	0 %	0 %	50 %	50 %	148545537
6017	NC_009512	GAA	2	6	324914	324919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545537
6018	NC_009512	CCG	2	6	324988	324993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537
6019	NC_009512	CAT	2	6	325094	325099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545537
6020	NC_009512	CGA	2	6	325112	325117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6021	NC_009512	GGT	2	6	325172	325177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545537
6022	NC_009512	GAT	2	6	325178	325183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545537
6023	NC_009512	G	6	6	325205	325210	0 %	0 %	100 %	0 %	148545537
6024	NC_009512	CAG	2	6	325236	325241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545537
6025	NC_009512	GCA	2	6	325463	325468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545538
6026	NC_009512	GAC	2	6	325561	325566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545538
6027	NC_009512	ACG	2	6	325573	325578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545538
6028	NC_009512	TGAT	2	8	325652	325659	25 %	50 %	25 %	0 %	148545538
6029	NC_009512	CAC	2	6	325742	325747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545539
6030	NC_009512	GTA	2	6	325799	325804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545539
6031	NC_009512	GCC	2	6	325830	325835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545539
6032	NC_009512	GTG	2	6	325902	325907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545539
6033	NC_009512	CCA	2	6	325933	325938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545539
6034	NC_009512	CCAGC	2	10	325961	325970	20 %	0 %	20 %	60 %	148545539
6035	NC_009512	GCC	2	6	326081	326086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545539
6036	NC_009512	CGA	2	6	326104	326109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6038	NC_009512	GAT	2	6	326165	326170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545539
6039	NC_009512	GCG	2	6	326195	326200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545539
6040	NC_009512	GTG	2	6	326232	326237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545539
6041	NC_009512	TGCTGT	2	12	326440	326451	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148545539
6042	NC_009512	TTG	2	6	326475	326480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545539
6043	NC_009512	GTT	2	6	326591	326596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545539
6044	NC_009512	GGCT	2	8	326625	326632	0 %	25 %	50 %	25 %	148545539
6045	NC_009512	AGC	2	6	326676	326681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6050	NC_009512	GTC	2	6	326960	326965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545539
6051	NC_009512	GGC	2	6	327016	327021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545539
6052	NC_009512	CCAG	2	8	327082	327089	25 %	0 %	25 %	50 %	148545539
6053	NC_009512	GGC	2	6	327136	327141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545539
6054	NC_009512	TGT	3	9	327166	327174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545539
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6057	NC_009512	TGT	2	6	327391	327396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545539
6058	NC_009512	GTC	2	6	327419	327424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545539
6059	NC_009512	GCT	2	6	327503	327508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545539
6060	NC_009512	TGC	2	6	327547	327552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6063	NC_009512	CGG	2	6	327679	327684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545539
6064	NC_009512	CGA	2	6	327689	327694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6067	NC_009512	CAG	2	6	327740	327745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545539
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6120	NC_009512	CGC	2	6	330790	330795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545541
6121	NC_009512	GGT	2	6	330805	330810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545541
6122	NC_009512	GC	4	8	330857	330864	0 %	0 %	50 %	50 %	148545541
6123	NC_009512	CCG	2	6	330963	330968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545541
6124	NC_009512	ACG	2	6	330982	330987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545541
6125	NC_009512	TGA	2	6	331024	331029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545541
6126	NC_009512	CGT	2	6	331051	331056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545541
6127	NC_009512	AGCG	2	8	331110	331117	25 %	0 %	50 %	25 %	148545541
6128	NC_009512	GTC	3	9	331142	331150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545541
6129	NC_009512	TGG	2	6	331242	331247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545541
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6133	NC_009512	GCA	2	6	331659	331664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545542
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6135	NC_009512	CCG	2	6	331766	331771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545542
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6141	NC_009512	GC	3	6	332044	332049	0 %	0 %	50 %	50 %	148545542
6142	NC_009512	GGTCCA	2	12	332058	332069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148545542
6143	NC_009512	CTG	2	6	332071	332076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545542
6144	NC_009512	GCT	2	6	332085	332090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545542
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6146	NC_009512	CGG	2	6	332238	332243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545542
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6152	NC_009512	CGA	2	6	332451	332456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545542
6153	NC_009512	GCGCA	2	10	332458	332467	20 %	0 %	40 %	40 %	148545542
6154	NC_009512	GCA	2	6	332475	332480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545542
6155	NC_009512	CGC	2	6	332511	332516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545542
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6239	NC_009512	ACC	2	6	335677	335682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545544
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6360	NC_009512	CTT	2	6	344111	344116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545556
6361	NC_009512	TCG	2	6	344182	344187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545556
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6364	NC_009512	CAG	2	6	344304	344309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545556
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6467	NC_009512	GTA	2	6	349974	349979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545561
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6476	NC_009512	CGA	2	6	350482	350487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545562
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6478	NC_009512	GCT	2	6	350657	350662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6479	NC_009512	GCT	2	6	350701	350706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6480	NC_009512	GGTCAG	2	12	350816	350827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545562
6481	NC_009512	CGG	2	6	350840	350845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545562
6482	NC_009512	TGA	2	6	350869	350874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545562
6483	NC_009512	CAG	2	6	351002	351007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6484	NC_009512	GCC	2	6	351008	351013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545562
6485	NC_009512	GC	3	6	351102	351107	0 %	0 %	50 %	50 %	148545562
6486	NC_009512	GCA	2	6	351121	351126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6487	NC_009512	GTC	2	6	351131	351136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6488	NC_009512	GTG	2	6	351169	351174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545562
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6490	NC_009512	GC	3	6	351227	351232	0 %	0 %	50 %	50 %	148545562
6491	NC_009512	CTT	2	6	351250	351255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545562
6492	NC_009512	GTC	2	6	351365	351370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6493	NC_009512	GCT	2	6	351401	351406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545562
6494	NC_009512	CCAGCT	2	12	351430	351441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148545562
6495	NC_009512	GGC	2	6	351449	351454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545562
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6499	NC_009512	G	6	6	351544	351549	0 %	0 %	100 %	0 %	148545562
6500	NC_009512	GC	3	6	351585	351590	0 %	0 %	50 %	50 %	148545562

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