MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009512	CCTGG	2	10	299666	299675	0 %	20 %	40 %	40 %	148545513
5502	NC_009512	CTG	2	6	299676	299681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545513
5503	NC_009512	GC	3	6	299682	299687	0 %	0 %	50 %	50 %	148545513
5504	NC_009512	GTG	3	9	299700	299708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545513
5505	NC_009512	TCA	2	6	299713	299718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545513
5506	NC_009512	GCT	2	6	299719	299724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5507	NC_009512	CGA	2	6	299754	299759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5508	NC_009512	GCGA	2	8	299807	299814	25 %	0 %	50 %	25 %	148545514
5509	NC_009512	TGCT	2	8	299836	299843	0 %	50 %	25 %	25 %	148545514
5510	NC_009512	GTC	2	6	299977	299982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5511	NC_009512	CTG	2	6	299992	299997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5512	NC_009512	TCA	2	6	300020	300025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545514
5513	NC_009512	GAC	3	9	300138	300146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5514	NC_009512	CAG	2	6	300232	300237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5515	NC_009512	GC	3	6	300253	300258	0 %	0 %	50 %	50 %	148545514
5516	NC_009512	ACCG	2	8	300274	300281	25 %	0 %	25 %	50 %	148545514
5517	NC_009512	AGT	2	6	300396	300401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545514
5518	NC_009512	GTT	2	6	300532	300537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545514
5519	NC_009512	GGCC	2	8	300552	300559	0 %	0 %	50 %	50 %	148545514
5520	NC_009512	TGG	2	6	300600	300605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545514
5521	NC_009512	GCGG	2	8	300651	300658	0 %	0 %	75 %	25 %	148545514
5522	NC_009512	CAG	2	6	300709	300714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5523	NC_009512	GCG	2	6	300724	300729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545514
5524	NC_009512	CGA	2	6	300757	300762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5525	NC_009512	GCA	2	6	300804	300809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5526	NC_009512	TCC	2	6	300956	300961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545514
5527	NC_009512	CGGC	2	8	300963	300970	0 %	0 %	50 %	50 %	148545514
5528	NC_009512	TCG	2	6	301004	301009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5529	NC_009512	TGA	2	6	301086	301091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545514
5530	NC_009512	CAG	2	6	301096	301101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545514
5531	NC_009512	GGT	2	6	301117	301122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545514
5532	NC_009512	GGC	2	6	301269	301274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545514
5533	NC_009512	GAG	2	6	301279	301284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545514
5534	NC_009512	CCA	2	6	301479	301484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545515
5535	NC_009512	ACC	2	6	301514	301519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545515
5536	NC_009512	GCC	2	6	301527	301532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545515
5537	NC_009512	GCA	2	6	301539	301544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545515
5538	NC_009512	TGGC	2	8	301634	301641	0 %	25 %	50 %	25 %	148545515
5539	NC_009512	CAGGC	2	10	301646	301655	20 %	0 %	40 %	40 %	148545515
5540	NC_009512	CCA	2	6	301668	301673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545515
5541	NC_009512	CCG	2	6	301688	301693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545515
5542	NC_009512	CCAGCG	2	12	301728	301739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148545515
5543	NC_009512	GGC	2	6	301773	301778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545515
5544	NC_009512	CAG	2	6	301783	301788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545515
5545	NC_009512	CTT	3	9	301833	301841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545516
5546	NC_009512	TTGGCG	2	12	301849	301860	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148545516
5547	NC_009512	GTT	2	6	301878	301883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545516
5548	NC_009512	CTG	3	9	301923	301931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5549	NC_009512	CCA	2	6	301939	301944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5550	NC_009512	ACC	2	6	301956	301961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5551	NC_009512	TGACCT	2	12	302045	302056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148545516
5552	NC_009512	CGA	2	6	302156	302161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5553	NC_009512	CAC	2	6	302187	302192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5554	NC_009512	TCG	2	6	302338	302343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5555	NC_009512	GCT	2	6	302376	302381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5556	NC_009512	AGCG	2	8	302392	302399	25 %	0 %	50 %	25 %	148545516
5557	NC_009512	CGGT	2	8	302407	302414	0 %	25 %	50 %	25 %	148545516
5558	NC_009512	GCA	2	6	302419	302424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5559	NC_009512	TCA	2	6	302489	302494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545516
5560	NC_009512	CGG	2	6	302507	302512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5561	NC_009512	GGC	2	6	302537	302542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5562	NC_009512	CGA	2	6	302597	302602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5563	NC_009512	CAG	2	6	302643	302648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5564	NC_009512	CA	3	6	302688	302693	50 %	0 %	0 %	50 %	148545516
5565	NC_009512	ACC	2	6	302701	302706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5566	NC_009512	CGT	2	6	302741	302746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5567	NC_009512	GATT	2	8	302766	302773	25 %	50 %	25 %	0 %	148545516
5568	NC_009512	GATC	2	8	302777	302784	25 %	25 %	25 %	25 %	148545516
5569	NC_009512	GGC	2	6	302813	302818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5570	NC_009512	GGC	2	6	302871	302876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5571	NC_009512	CCA	2	6	302966	302971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5572	NC_009512	ATG	2	6	303049	303054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545516
5573	NC_009512	TTC	2	6	303076	303081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545516
5574	NC_009512	GTG	2	6	303100	303105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545516
5575	NC_009512	CAG	2	6	303111	303116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5576	NC_009512	GC	3	6	303184	303189	0 %	0 %	50 %	50 %	148545516
5577	NC_009512	CCGG	2	8	303193	303200	0 %	0 %	50 %	50 %	148545516
5578	NC_009512	GGC	2	6	303201	303206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5579	NC_009512	CAG	3	9	303207	303215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5580	NC_009512	TCGCC	2	10	303245	303254	0 %	20 %	20 %	60 %	148545516
5581	NC_009512	GGTG	2	8	303296	303303	0 %	25 %	75 %	0 %	148545516
5582	NC_009512	CAC	2	6	303330	303335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545516
5583	NC_009512	CGG	2	6	303353	303358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5584	NC_009512	ATC	2	6	303394	303399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545516
5585	NC_009512	TTC	2	6	303429	303434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545516
5586	NC_009512	GCA	2	6	303515	303520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5587	NC_009512	AGT	2	6	303536	303541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545516
5588	NC_009512	CTT	3	9	303557	303565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545516
5589	NC_009512	GCCA	2	8	303570	303577	25 %	0 %	25 %	50 %	148545516
5590	NC_009512	GCG	2	6	303637	303642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5591	NC_009512	GGGTC	2	10	303755	303764	0 %	20 %	60 %	20 %	148545516
5592	NC_009512	GCG	2	6	303825	303830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545516
5593	NC_009512	GGCGC	2	10	303948	303957	0 %	0 %	60 %	40 %	148545516
5594	NC_009512	TCG	2	6	303958	303963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5595	NC_009512	GTC	2	6	304011	304016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
5596	NC_009512	GCC	2	6	304090	304095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545516
5597	NC_009512	CTG	2	6	304101	304106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545516
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5599	NC_009512	ACG	2	6	304421	304426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545517
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5601	NC_009512	CTG	2	6	304444	304449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5602	NC_009512	TTC	2	6	304456	304461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545517
5603	NC_009512	CCGTGC	2	12	304476	304487	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148545517
5604	NC_009512	CTG	2	6	304516	304521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5605	NC_009512	TGG	2	6	304541	304546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545517
5606	NC_009512	TGC	2	6	304559	304564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5607	NC_009512	CAG	2	6	304603	304608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5608	NC_009512	AAC	2	6	304609	304614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545517
5609	NC_009512	ATC	2	6	304624	304629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545517
5610	NC_009512	CGA	2	6	304647	304652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5611	NC_009512	CGA	2	6	304686	304691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545517
5612	NC_009512	TGC	2	6	304745	304750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545517
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5616	NC_009512	CGGA	2	8	305090	305097	25 %	0 %	50 %	25 %	148545517
5617	NC_009512	ATG	2	6	305109	305114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545517
5618	NC_009512	TTC	2	6	305156	305161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545518
5619	NC_009512	TCG	2	6	305187	305192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545518
5620	NC_009512	CTG	2	6	305225	305230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545518
5621	NC_009512	GC	3	6	305287	305292	0 %	0 %	50 %	50 %	148545518
5622	NC_009512	GCC	2	6	305300	305305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545518
5623	NC_009512	GAA	2	6	305309	305314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545518
5624	NC_009512	GGC	2	6	305335	305340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545518
5625	NC_009512	AGC	2	6	305382	305387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545518
5626	NC_009512	GAC	2	6	305438	305443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545518
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5628	NC_009512	AGA	2	6	305553	305558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545518
5629	NC_009512	GCTGG	2	10	305569	305578	0 %	20 %	60 %	20 %	148545518
5630	NC_009512	TTG	2	6	305594	305599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545518
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5635	NC_009512	GGC	2	6	306287	306292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545518
5636	NC_009512	TGC	2	6	306331	306336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545518
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5640	NC_009512	TTC	2	6	306577	306582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545519
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5643	NC_009512	CGA	2	6	306651	306656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545519
5644	NC_009512	GCC	2	6	306733	306738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545519
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5652	NC_009512	ACA	2	6	307121	307126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545519
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5654	NC_009512	CAT	2	6	307194	307199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545519
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5732	NC_009512	CAA	2	6	310711	310716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545524
5733	NC_009512	ACC	2	6	310787	310792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545524
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5739	NC_009512	GAA	2	6	311084	311089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545524
5740	NC_009512	TTC	2	6	311105	311110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545524
5741	NC_009512	ACC	2	6	311132	311137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545524
5742	NC_009512	GAC	2	6	311171	311176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545524
5743	NC_009512	GGC	2	6	311216	311221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545524
5744	NC_009512	CGT	2	6	311305	311310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545524
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5766	NC_009512	GGCA	2	8	312707	312714	25 %	0 %	50 %	25 %	148545525
5767	NC_009512	A	6	6	312716	312721	100 %	0 %	0 %	0 %	148545525
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5847	NC_009512	CTG	2	6	316858	316863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545529
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5851	NC_009512	ATC	2	6	317008	317013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545529
5852	NC_009512	GGC	2	6	317016	317021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545529
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5855	NC_009512	AC	3	6	317117	317122	50 %	0 %	0 %	50 %	148545529
5856	NC_009512	ACA	2	6	317165	317170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545529
5857	NC_009512	CAA	2	6	317184	317189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545529
5858	NC_009512	TGC	2	6	317231	317236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545529
5859	NC_009512	CTGA	2	8	317243	317250	25 %	25 %	25 %	25 %	148545529
5860	NC_009512	CCG	2	6	317397	317402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545530
5861	NC_009512	CTGG	2	8	317439	317446	0 %	25 %	50 %	25 %	148545530
5862	NC_009512	CCG	2	6	317476	317481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545530
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5979	NC_009512	CGA	2	6	322896	322901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545535
5980	NC_009512	GGC	2	6	322927	322932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545535
5981	NC_009512	CATC	2	8	322950	322957	25 %	25 %	0 %	50 %	148545535
5982	NC_009512	CTG	2	6	322981	322986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545535
5983	NC_009512	CACGC	2	10	323050	323059	20 %	0 %	20 %	60 %	148545535
5984	NC_009512	TCC	2	6	323168	323173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545535
5985	NC_009512	CAG	2	6	323233	323238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545535
5986	NC_009512	ATC	2	6	323285	323290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545535
5987	NC_009512	GCA	2	6	323337	323342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545536
5988	NC_009512	CCTTGT	2	12	323370	323381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148545536
5989	NC_009512	ACA	2	6	323385	323390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545536
5990	NC_009512	GCT	2	6	323397	323402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545536
5991	NC_009512	GTC	2	6	323431	323436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545536
5992	NC_009512	GTA	2	6	323467	323472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
5993	NC_009512	GGT	2	6	323476	323481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545536
5994	NC_009512	TCA	2	6	323508	323513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545536
5995	NC_009512	CAC	2	6	323650	323655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545536
5996	NC_009512	GAA	2	6	323797	323802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545536
5997	NC_009512	A	6	6	323801	323806	100 %	0 %	0 %	0 %	148545536
5998	NC_009512	GAT	2	6	323836	323841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
5999	NC_009512	GAT	2	6	323866	323871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545536
6000	NC_009512	CCG	2	6	324202	324207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545537

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