MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas putida F1 chromosome

Total Repeats: 114169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009512	TCG	2	6	246890	246895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545463
4502	NC_009512	CTT	2	6	246955	246960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545463
4503	NC_009512	CGGT	2	8	246977	246984	0 %	25 %	50 %	25 %	148545463
4504	NC_009512	GAT	2	6	247081	247086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545463
4505	NC_009512	TGG	2	6	247131	247136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545463
4506	NC_009512	ATG	2	6	247154	247159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545463
4507	NC_009512	CGA	2	6	247209	247214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545463
4508	NC_009512	GCC	2	6	247240	247245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545463
4509	NC_009512	GAT	2	6	247315	247320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545463
4510	NC_009512	GCTG	2	8	247332	247339	0 %	25 %	50 %	25 %	148545463
4511	NC_009512	GA	3	6	247356	247361	50 %	0 %	50 %	0 %	148545463
4512	NC_009512	TGA	2	6	247590	247595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545464
4513	NC_009512	GCT	2	6	247626	247631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545464
4514	NC_009512	CCA	2	6	247670	247675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545464
4515	NC_009512	CTG	2	6	247726	247731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545464
4516	NC_009512	GCC	2	6	247794	247799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545464
4517	NC_009512	GGT	2	6	247803	247808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545464
4518	NC_009512	GAT	2	6	247822	247827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545464
4519	NC_009512	CCAGGC	2	12	247884	247895	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148545464
4520	NC_009512	GGC	2	6	247944	247949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545464
4521	NC_009512	CGGC	2	8	247957	247964	0 %	0 %	50 %	50 %	148545464
4522	NC_009512	GGC	3	9	247972	247980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545464
4523	NC_009512	TGC	2	6	248099	248104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545464
4524	NC_009512	GAT	2	6	248298	248303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148545464
4525	NC_009512	CGC	2	6	248586	248591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545465
4526	NC_009512	GGC	2	6	248603	248608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545465
4527	NC_009512	GGGCCT	2	12	248707	248718	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148545465
4528	NC_009512	CCG	2	6	248793	248798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545465
4529	NC_009512	TCG	2	6	248805	248810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545465
4530	NC_009512	GC	3	6	248846	248851	0 %	0 %	50 %	50 %	148545465
4531	NC_009512	ACG	2	6	248925	248930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545465
4532	NC_009512	CAT	2	6	248932	248937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545465
4533	NC_009512	CGC	2	6	248941	248946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545465
4534	NC_009512	CCA	2	6	248988	248993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545465
4535	NC_009512	GGT	2	6	249020	249025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545465
4536	NC_009512	CTG	2	6	249077	249082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545465
4537	NC_009512	GC	4	8	249127	249134	0 %	0 %	50 %	50 %	148545465
4538	NC_009512	TGG	2	6	249151	249156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545465
4539	NC_009512	GCG	2	6	249234	249239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545465
4540	NC_009512	TGG	2	6	249249	249254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545465
4541	NC_009512	TGC	3	9	249274	249282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545465
4542	NC_009512	CTG	2	6	249314	249319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545465
4543	NC_009512	GAAG	2	8	249343	249350	50 %	0 %	50 %	0 %	148545465
4544	NC_009512	GCG	2	6	249418	249423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545466
4545	NC_009512	GGC	2	6	249438	249443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545466
4546	NC_009512	GCA	2	6	249455	249460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4547	NC_009512	TGCC	2	8	249463	249470	0 %	25 %	25 %	50 %	148545466
4548	NC_009512	CTG	2	6	249472	249477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4549	NC_009512	GCCG	2	8	249564	249571	0 %	0 %	50 %	50 %	148545466
4550	NC_009512	TGC	2	6	249659	249664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4551	NC_009512	CCG	2	6	249691	249696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545466
4552	NC_009512	CTG	2	6	249802	249807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4553	NC_009512	TCG	2	6	249858	249863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4554	NC_009512	CTGC	2	8	249864	249871	0 %	25 %	25 %	50 %	148545466
4555	NC_009512	CGG	2	6	249881	249886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545466
4556	NC_009512	TGG	2	6	249929	249934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545466
4557	NC_009512	CAG	2	6	249936	249941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545466
4558	NC_009512	GCC	2	6	250048	250053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545466
4559	NC_009512	ACC	2	6	250249	250254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545467
4560	NC_009512	TGC	2	6	250298	250303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545467
4561	NC_009512	GC	3	6	250407	250412	0 %	0 %	50 %	50 %	148545467
4562	NC_009512	GCA	2	6	250422	250427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545467
4563	NC_009512	CAG	2	6	250435	250440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545467
4564	NC_009512	GCC	2	6	250468	250473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545467
4565	NC_009512	CCG	2	6	250488	250493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545467
4566	NC_009512	CAG	2	6	250522	250527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545467
4567	NC_009512	TCAG	2	8	250532	250539	25 %	25 %	25 %	25 %	148545467
4568	NC_009512	CCT	2	6	250599	250604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148545467
4569	NC_009512	CGA	2	6	250674	250679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545467
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4573	NC_009512	CAG	2	6	250819	250824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545467
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4591	NC_009512	TAC	2	6	251643	251648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545468
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4593	NC_009512	GCC	2	6	251664	251669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545468
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4601	NC_009512	AAC	2	6	251968	251973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148545468
4602	NC_009512	ACC	2	6	252003	252008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545468
4603	NC_009512	GC	3	6	252047	252052	0 %	0 %	50 %	50 %	148545468
4604	NC_009512	GCA	2	6	252056	252061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545468
4605	NC_009512	AGGT	2	8	252124	252131	25 %	25 %	50 %	0 %	148545468
4606	NC_009512	TGC	2	6	252154	252159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545468
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4620	NC_009512	GCT	2	6	252967	252972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545469
4621	NC_009512	GCA	2	6	252993	252998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545469
4622	NC_009512	GGC	2	6	253085	253090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545469
4623	NC_009512	CTG	3	9	253182	253190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545469
4624	NC_009512	TGC	2	6	253195	253200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545469
4625	NC_009512	CTG	2	6	253212	253217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545469
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4627	NC_009512	GGA	2	6	253550	253555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545470
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4633	NC_009512	GTGCA	2	10	253936	253945	20 %	20 %	40 %	20 %	148545470
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4642	NC_009512	GCTG	2	8	254876	254883	0 %	25 %	50 %	25 %	148545472
4643	NC_009512	CTG	2	6	254895	254900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545472
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4731	NC_009512	GC	3	6	258421	258426	0 %	0 %	50 %	50 %	148545475
4732	NC_009512	GTAGCG	2	12	258492	258503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148545475
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4740	NC_009512	GCG	2	6	258743	258748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545475
4741	NC_009512	CTGA	2	8	258799	258806	25 %	25 %	25 %	25 %	148545475
4742	NC_009512	CTT	2	6	259028	259033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545476
4743	NC_009512	GCC	2	6	259035	259040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545476
4744	NC_009512	CAT	2	6	259169	259174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545476
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4751	NC_009512	CTG	2	6	259485	259490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545476
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4766	NC_009512	GCG	2	6	260530	260535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545478
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4772	NC_009512	AAG	2	6	260841	260846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148545478
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4828	NC_009512	GC	3	6	263341	263346	0 %	0 %	50 %	50 %	148545481
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4837	NC_009512	TCGTTG	2	12	264056	264067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148545483
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4844	NC_009512	TGC	2	6	264683	264688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545483
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4846	NC_009512	TGGT	2	8	264779	264786	0 %	50 %	50 %	0 %	148545483
4847	NC_009512	GGCCA	2	10	264787	264796	20 %	0 %	40 %	40 %	148545483
4848	NC_009512	GCC	2	6	264898	264903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148545483
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4850	NC_009512	GGT	2	6	264979	264984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545483
4851	NC_009512	CAG	2	6	264991	264996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545483
4852	NC_009512	CCA	2	6	265056	265061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148545483
4853	NC_009512	GTC	2	6	265075	265080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545483
4854	NC_009512	CACC	2	8	265107	265114	25 %	0 %	0 %	75 %	148545483
4855	NC_009512	ACG	2	6	265181	265186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545483
4856	NC_009512	CTTC	2	8	265212	265219	0 %	50 %	0 %	50 %	148545483
4857	NC_009512	AGGCC	2	10	265266	265275	20 %	0 %	40 %	40 %	148545483
4858	NC_009512	TTG	2	6	265453	265458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545483
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4981	NC_009512	GAG	2	6	271755	271760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148545487
4982	NC_009512	TGC	2	6	271978	271983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545488
4983	NC_009512	CAGC	2	8	272043	272050	25 %	0 %	25 %	50 %	148545488
4984	NC_009512	GC	3	6	272074	272079	0 %	0 %	50 %	50 %	148545488
4985	NC_009512	CTG	2	6	272086	272091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148545488
4986	NC_009512	GTG	2	6	272161	272166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
4987	NC_009512	CAG	2	6	272176	272181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545488
4988	NC_009512	CG	3	6	272190	272195	0 %	0 %	50 %	50 %	148545488
4989	NC_009512	AGC	2	6	272198	272203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545488
4990	NC_009512	CGG	2	6	272213	272218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545488
4991	NC_009512	GTT	2	6	272314	272319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148545488
4992	NC_009512	GCCCA	2	10	272435	272444	20 %	0 %	20 %	60 %	148545488
4993	NC_009512	GTG	2	6	272494	272499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
4994	NC_009512	TTC	2	6	272512	272517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148545488
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4997	NC_009512	TGG	2	6	272550	272555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148545488
4998	NC_009512	CGG	2	6	272616	272621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148545488
4999	NC_009512	CAT	2	6	272638	272643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148545488
5000	NC_009512	CAG	3	9	272680	272688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148545488

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