MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009439	TGC	2	6	111026	111031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305149
2502	NC_009439	GA	3	6	111100	111105	50 %	0 %	50 %	0 %	146305149
2503	NC_009439	ACT	2	6	111242	111247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305149
2504	NC_009439	CAG	2	6	111322	111327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305149
2505	NC_009439	GAA	2	6	111492	111497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305149
2506	NC_009439	GA	3	6	111549	111554	50 %	0 %	50 %	0 %	146305149
2507	NC_009439	GGT	2	6	111634	111639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305149
2508	NC_009439	AGC	2	6	111693	111698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305149
2509	NC_009439	A	7	7	111704	111710	100 %	0 %	0 %	0 %	146305149
2510	NC_009439	AG	3	6	111713	111718	50 %	0 %	50 %	0 %	146305149
2511	NC_009439	AT	3	6	111742	111747	50 %	50 %	0 %	0 %	146305150
2512	NC_009439	TGA	2	6	111758	111763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305150
2513	NC_009439	GAA	2	6	111859	111864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305150
2514	NC_009439	AT	3	6	111869	111874	50 %	50 %	0 %	0 %	146305150
2515	NC_009439	ATT	2	6	112093	112098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146305150
2516	NC_009439	AAAAT	2	10	112118	112127	80 %	20 %	0 %	0 %	146305150
2517	NC_009439	ATT	2	6	112166	112171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146305150
2518	NC_009439	AAAAG	2	10	112214	112223	80 %	0 %	20 %	0 %	146305150
2519	NC_009439	CAG	2	6	112316	112321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305150
2520	NC_009439	AACG	2	8	112356	112363	50 %	0 %	25 %	25 %	146305150
2521	NC_009439	AGAA	2	8	112377	112384	75 %	0 %	25 %	0 %	146305150
2522	NC_009439	CTTC	2	8	112425	112432	0 %	50 %	0 %	50 %	146305150
2523	NC_009439	TAC	2	6	112450	112455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305150
2524	NC_009439	AAC	2	6	112471	112476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305150
2525	NC_009439	GAT	2	6	112479	112484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305150
2526	NC_009439	GGGT	2	8	112492	112499	0 %	25 %	75 %	0 %	146305150
2527	NC_009439	GAT	2	6	112620	112625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305151
2528	NC_009439	T	6	6	112633	112638	0 %	100 %	0 %	0 %	146305151
2529	NC_009439	ATA	2	6	112721	112726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146305151
2530	NC_009439	TGA	2	6	112907	112912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305151
2531	NC_009439	TAA	2	6	112920	112925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146305151
2532	NC_009439	A	7	7	112969	112975	100 %	0 %	0 %	0 %	146305151
2533	NC_009439	TA	3	6	112990	112995	50 %	50 %	0 %	0 %	146305151
2534	NC_009439	ATTT	2	8	113189	113196	25 %	75 %	0 %	0 %	146305152
2535	NC_009439	GAA	2	6	113251	113256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305152
2536	NC_009439	AC	3	6	113269	113274	50 %	0 %	0 %	50 %	146305152
2537	NC_009439	GGC	2	6	113384	113389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305152
2538	NC_009439	GC	3	6	113409	113414	0 %	0 %	50 %	50 %	146305152
2539	NC_009439	CGA	2	6	113425	113430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305152
2540	NC_009439	ACCTT	2	10	113643	113652	20 %	40 %	0 %	40 %	146305152
2541	NC_009439	GGCG	2	8	113656	113663	0 %	0 %	75 %	25 %	146305152
2542	NC_009439	AAT	2	6	113806	113811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146305153
2543	NC_009439	ATTC	2	8	113816	113823	25 %	50 %	0 %	25 %	146305153
2544	NC_009439	T	6	6	113833	113838	0 %	100 %	0 %	0 %	146305153
2545	NC_009439	CAA	2	6	113896	113901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305153
2546	NC_009439	CTG	2	6	114031	114036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305153
2547	NC_009439	AAC	2	6	114136	114141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305153
2548	NC_009439	ATT	2	6	114173	114178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146305153
2549	NC_009439	CCTC	2	8	114450	114457	0 %	25 %	0 %	75 %	146305154
2550	NC_009439	ACG	2	6	114546	114551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2551	NC_009439	CTG	2	6	114563	114568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2552	NC_009439	ACCG	2	8	114572	114579	25 %	0 %	25 %	50 %	146305154
2553	NC_009439	GAAT	2	8	114628	114635	50 %	25 %	25 %	0 %	146305154
2554	NC_009439	ACG	2	6	114651	114656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2555	NC_009439	GCT	2	6	114670	114675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2556	NC_009439	GCCAG	2	10	114684	114693	20 %	0 %	40 %	40 %	146305154
2557	NC_009439	CAC	2	6	114742	114747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305154
2558	NC_009439	CAGG	2	8	114749	114756	25 %	0 %	50 %	25 %	146305154
2559	NC_009439	CTG	2	6	114764	114769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2560	NC_009439	ACG	2	6	114825	114830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2561	NC_009439	CAC	2	6	114832	114837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305154
2562	NC_009439	GCT	2	6	114898	114903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2563	NC_009439	AGC	2	6	114905	114910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2564	NC_009439	CGG	2	6	115023	115028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305154
2565	NC_009439	CGC	2	6	115066	115071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305154
2566	NC_009439	TCG	2	6	115116	115121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2567	NC_009439	CGA	2	6	115138	115143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2568	NC_009439	TCG	2	6	115173	115178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2569	NC_009439	TAC	2	6	115184	115189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305154
2570	NC_009439	TGC	2	6	115269	115274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2571	NC_009439	GTC	2	6	115304	115309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305154
2572	NC_009439	CAACCT	2	12	115312	115323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	146305154
2573	NC_009439	CGC	2	6	115399	115404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305154
2574	NC_009439	CCG	2	6	115424	115429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305154
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2576	NC_009439	GC	3	6	115493	115498	0 %	0 %	50 %	50 %	146305155
2577	NC_009439	CTG	2	6	115515	115520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305155
2578	NC_009439	CAG	2	6	115524	115529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305155
2579	NC_009439	TCC	2	6	115537	115542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305155
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2582	NC_009439	CAG	2	6	115785	115790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305155
2583	NC_009439	TCG	2	6	115801	115806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305155
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2586	NC_009439	CAG	2	6	115893	115898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305155
2587	NC_009439	GGC	2	6	115914	115919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305155
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2589	NC_009439	GGC	2	6	116001	116006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305156
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2593	NC_009439	TCG	2	6	116194	116199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305156
2594	NC_009439	TGG	2	6	116264	116269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305156
2595	NC_009439	CGGC	2	8	116279	116286	0 %	0 %	50 %	50 %	146305156
2596	NC_009439	GGTCCT	2	12	116288	116299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305156
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2599	NC_009439	CAG	3	9	116454	116462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305156
2600	NC_009439	CAG	2	6	116602	116607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305157
2601	NC_009439	ACG	2	6	116609	116614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305157
2602	NC_009439	CACCG	2	10	116623	116632	20 %	0 %	20 %	60 %	146305157
2603	NC_009439	CGG	2	6	116640	116645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305157
2604	NC_009439	GCC	2	6	116677	116682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305157
2605	NC_009439	GGC	2	6	116689	116694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305157
2606	NC_009439	GCC	2	6	116701	116706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305157
2607	NC_009439	CGA	2	6	116769	116774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305157
2608	NC_009439	CGA	2	6	116778	116783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305157
2609	NC_009439	ATA	2	6	116807	116812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146305157
2610	NC_009439	GCA	2	6	116903	116908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305158
2611	NC_009439	TCG	2	6	116944	116949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305158
2612	NC_009439	CGG	2	6	116992	116997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305158
2613	NC_009439	CAT	2	6	117114	117119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305158
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2615	NC_009439	TCG	2	6	117208	117213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305158
2616	NC_009439	GA	3	6	117259	117264	50 %	0 %	50 %	0 %	146305158
2617	NC_009439	GAC	2	6	117312	117317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305158
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2621	NC_009439	CG	3	6	117395	117400	0 %	0 %	50 %	50 %	146305158
2622	NC_009439	GTC	2	6	117429	117434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305158
2623	NC_009439	TGCGC	2	10	117482	117491	0 %	20 %	40 %	40 %	146305158
2624	NC_009439	CG	3	6	117540	117545	0 %	0 %	50 %	50 %	146305158
2625	NC_009439	CCT	2	6	117584	117589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305158
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2635	NC_009439	GCACG	2	10	118279	118288	20 %	0 %	40 %	40 %	146305159
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2651	NC_009439	GAT	2	6	119094	119099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305160
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2739	NC_009439	GC	3	6	123499	123504	0 %	0 %	50 %	50 %	146305164
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2741	NC_009439	GCC	2	6	123528	123533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305164
2742	NC_009439	GCC	2	6	123607	123612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305164
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2863	NC_009439	GGC	2	6	128324	128329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305168
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2982	NC_009439	GC	3	6	134652	134657	0 %	0 %	50 %	50 %	146305174
2983	NC_009439	CGA	2	6	134666	134671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305174
2984	NC_009439	CGC	2	6	134682	134687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305174
2985	NC_009439	TGGAA	2	10	134689	134698	40 %	20 %	40 %	0 %	146305174
2986	NC_009439	CGCT	2	8	134718	134725	0 %	25 %	25 %	50 %	146305174
2987	NC_009439	GC	3	6	134726	134731	0 %	0 %	50 %	50 %	146305174
2988	NC_009439	GTT	2	6	134762	134767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305174
2989	NC_009439	CAT	2	6	134819	134824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305174
2990	NC_009439	CG	3	6	134858	134863	0 %	0 %	50 %	50 %	146305174
2991	NC_009439	CTGG	2	8	134864	134871	0 %	25 %	50 %	25 %	146305174
2992	NC_009439	CGG	2	6	134872	134877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305174
2993	NC_009439	GGCGG	2	10	134891	134900	0 %	0 %	80 %	20 %	146305174
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2996	NC_009439	GC	3	6	134970	134975	0 %	0 %	50 %	50 %	146305175
2997	NC_009439	GTC	3	9	134995	135003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305175
2998	NC_009439	GC	3	6	135007	135012	0 %	0 %	50 %	50 %	146305175
2999	NC_009439	GTC	2	6	135013	135018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305175
3000	NC_009439	CGC	2	6	135117	135122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305175

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