MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009439	GCA	2	6	21399	21404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
502	NC_009439	AATG	2	8	21432	21439	50 %	25 %	25 %	0 %	146305062
503	NC_009439	CGTT	2	8	21469	21476	0 %	50 %	25 %	25 %	146305062
504	NC_009439	CCG	2	6	21493	21498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305062
505	NC_009439	GC	4	8	21529	21536	0 %	0 %	50 %	50 %	146305062
506	NC_009439	TCG	2	6	21569	21574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305062
507	NC_009439	CGGTG	2	10	21603	21612	0 %	20 %	60 %	20 %	146305062
508	NC_009439	CGG	2	6	21641	21646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305062
509	NC_009439	TCG	2	6	21734	21739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305062
510	NC_009439	GC	3	6	21802	21807	0 %	0 %	50 %	50 %	146305062
511	NC_009439	CAG	2	6	21826	21831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
512	NC_009439	GCGAT	2	10	21857	21866	20 %	20 %	40 %	20 %	146305062
513	NC_009439	GGC	2	6	21894	21899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305062
514	NC_009439	CTG	2	6	21916	21921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305062
515	NC_009439	AGA	2	6	22016	22021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305062
516	NC_009439	AGG	2	6	22076	22081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305062
517	NC_009439	CGA	2	6	22124	22129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
518	NC_009439	ATG	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305062
519	NC_009439	ACA	2	6	22205	22210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305062
520	NC_009439	CGG	2	6	22251	22256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305062
521	NC_009439	CAA	2	6	22320	22325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305062
522	NC_009439	CGA	2	6	22335	22340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
523	NC_009439	GGCG	2	8	22347	22354	0 %	0 %	75 %	25 %	146305062
524	NC_009439	GCA	3	9	22590	22598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
525	NC_009439	GCG	2	6	22711	22716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305062
526	NC_009439	GCC	2	6	22719	22724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305062
527	NC_009439	GTC	2	6	23023	23028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305063
528	NC_009439	CTG	2	6	23083	23088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305063
529	NC_009439	GAGGAA	2	12	23095	23106	50 %	0 %	50 %	0 %	146305063
530	NC_009439	CGA	2	6	23130	23135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305063
531	NC_009439	GCG	2	6	23137	23142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305063
532	NC_009439	ACG	2	6	23341	23346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305064
533	NC_009439	CG	3	6	23356	23361	0 %	0 %	50 %	50 %	146305064
534	NC_009439	CCA	2	6	23400	23405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305064
535	NC_009439	AGC	2	6	23456	23461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305064
536	NC_009439	CAA	2	6	23484	23489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305064
537	NC_009439	TCA	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305064
538	NC_009439	GCA	2	6	23545	23550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305065
539	NC_009439	T	6	6	23572	23577	0 %	100 %	0 %	0 %	146305065
540	NC_009439	CTC	2	6	23618	23623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305065
541	NC_009439	AGC	2	6	23874	23879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305065
542	NC_009439	CGG	2	6	23928	23933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305065
543	NC_009439	TCG	2	6	23937	23942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305065
544	NC_009439	GC	3	6	23993	23998	0 %	0 %	50 %	50 %	146305065
545	NC_009439	TTG	2	6	24126	24131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305065
546	NC_009439	CCG	2	6	24162	24167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305065
547	NC_009439	GCT	2	6	24232	24237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305065
548	NC_009439	GAT	2	6	24257	24262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305065
549	NC_009439	CGA	2	6	24280	24285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305065
550	NC_009439	CGG	2	6	24349	24354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305065
551	NC_009439	GGC	2	6	24473	24478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305065
552	NC_009439	ACCG	2	8	24514	24521	25 %	0 %	25 %	50 %	146305065
553	NC_009439	GCC	2	6	24572	24577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305065
554	NC_009439	TCGATC	2	12	24657	24668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146305065
555	NC_009439	GTT	2	6	24749	24754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305065
556	NC_009439	GCGGCT	2	12	24785	24796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146305065
557	NC_009439	AGCC	2	8	24824	24831	25 %	0 %	25 %	50 %	146305065
558	NC_009439	GAG	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305065
559	NC_009439	GCC	2	6	24863	24868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305065
560	NC_009439	CGGG	2	8	24905	24912	0 %	0 %	75 %	25 %	146305065
561	NC_009439	CGC	2	6	24958	24963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305065
562	NC_009439	CAG	2	6	24992	24997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305065
563	NC_009439	TTC	2	6	25124	25129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305065
564	NC_009439	GTAC	2	8	25159	25166	25 %	25 %	25 %	25 %	146305065
565	NC_009439	GGGCC	2	10	25168	25177	0 %	0 %	60 %	40 %	146305065
566	NC_009439	CTT	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305065
567	NC_009439	CGA	2	6	25423	25428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305065
568	NC_009439	CCAT	2	8	25431	25438	25 %	25 %	0 %	50 %	146305065
569	NC_009439	GGC	2	6	25440	25445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305065
570	NC_009439	AAC	2	6	25584	25589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305065
571	NC_009439	GCC	2	6	25669	25674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305066
572	NC_009439	CAG	2	6	25743	25748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305066
573	NC_009439	CAGGC	2	10	25837	25846	20 %	0 %	40 %	40 %	146305066
574	NC_009439	GTT	2	6	25880	25885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305066
575	NC_009439	CGC	3	9	25931	25939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305066
576	NC_009439	GC	3	6	25953	25958	0 %	0 %	50 %	50 %	146305066
577	NC_009439	TCG	2	6	25966	25971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305066
578	NC_009439	CAG	2	6	25975	25980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305066
579	NC_009439	GAT	2	6	26047	26052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305067
580	NC_009439	GC	3	6	26075	26080	0 %	0 %	50 %	50 %	146305067
581	NC_009439	GC	3	6	26119	26124	0 %	0 %	50 %	50 %	146305067
582	NC_009439	CTGC	2	8	26169	26176	0 %	25 %	25 %	50 %	146305067
583	NC_009439	CGC	2	6	26457	26462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305068
584	NC_009439	ACG	2	6	26464	26469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305068
585	NC_009439	GGC	2	6	26597	26602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305068
586	NC_009439	CTTG	2	8	26633	26640	0 %	50 %	25 %	25 %	146305068
587	NC_009439	GCA	2	6	26662	26667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305068
588	NC_009439	TCC	2	6	26775	26780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305068
589	NC_009439	GCT	2	6	26851	26856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305068
590	NC_009439	CTG	2	6	26864	26869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305068
591	NC_009439	CG	3	6	26915	26920	0 %	0 %	50 %	50 %	146305068
592	NC_009439	AGC	2	6	26934	26939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305068
593	NC_009439	TTC	2	6	26957	26962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305068
594	NC_009439	GCG	2	6	26987	26992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305068
595	NC_009439	CCG	2	6	27038	27043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305069
596	NC_009439	CTGG	2	8	27064	27071	0 %	25 %	50 %	25 %	146305069
597	NC_009439	G	6	6	27079	27084	0 %	0 %	100 %	0 %	146305069
598	NC_009439	TTC	2	6	27087	27092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305069
599	NC_009439	GCAGGC	2	12	27113	27124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146305069
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601	NC_009439	TCGGCA	2	12	27235	27246	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146305069
602	NC_009439	TGC	2	6	27283	27288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305069
603	NC_009439	GCTGGC	2	12	27305	27316	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146305069
604	NC_009439	GCCA	2	8	27328	27335	25 %	0 %	25 %	50 %	146305069
605	NC_009439	GAT	2	6	27448	27453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305069
606	NC_009439	CGC	2	6	27454	27459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305069
607	NC_009439	CAC	2	6	27490	27495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305069
608	NC_009439	GCA	2	6	27514	27519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305069
609	NC_009439	TGGC	2	8	27558	27565	0 %	25 %	50 %	25 %	146305070
610	NC_009439	CAG	2	6	27620	27625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305070
611	NC_009439	AGC	2	6	27642	27647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305070
612	NC_009439	CGG	2	6	27754	27759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305070
613	NC_009439	GCT	2	6	27788	27793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305070
614	NC_009439	ACC	2	6	27831	27836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305070
615	NC_009439	CTG	2	6	27839	27844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305070
616	NC_009439	CGT	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305070
617	NC_009439	GGC	2	6	27878	27883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305070
618	NC_009439	TGA	2	6	27889	27894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305070
619	NC_009439	GCA	2	6	27946	27951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305070
620	NC_009439	CGA	2	6	27967	27972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305070
621	NC_009439	TTC	2	6	28040	28045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305070
622	NC_009439	GCG	2	6	28048	28053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305070
623	NC_009439	CCTT	2	8	28065	28072	0 %	50 %	0 %	50 %	146305070
624	NC_009439	GCT	2	6	28119	28124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305070
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626	NC_009439	CG	3	6	28190	28195	0 %	0 %	50 %	50 %	146305070
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