MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009439	TCA	2	6	217122	217127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305256
5002	NC_009439	CAG	2	6	217160	217165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5003	NC_009439	GC	3	6	217171	217176	0 %	0 %	50 %	50 %	146305256
5004	NC_009439	CAC	2	6	217177	217182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305256
5005	NC_009439	GCA	2	6	217207	217212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5006	NC_009439	TTC	2	6	217280	217285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305256
5007	NC_009439	GCC	2	6	217286	217291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305256
5008	NC_009439	CAG	2	6	217334	217339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5009	NC_009439	ATC	2	6	217340	217345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305256
5010	NC_009439	AGC	2	6	217422	217427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5011	NC_009439	CAA	2	6	217480	217485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305256
5012	NC_009439	TCG	2	6	217491	217496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5013	NC_009439	CTGCG	2	10	217524	217533	0 %	20 %	40 %	40 %	146305256
5014	NC_009439	TGG	2	6	217641	217646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305256
5015	NC_009439	CCG	2	6	217656	217661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305256
5016	NC_009439	GCG	2	6	217689	217694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305256
5017	NC_009439	CGG	2	6	217753	217758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305256
5018	NC_009439	GGT	2	6	217766	217771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305256
5019	NC_009439	CAG	2	6	217808	217813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5020	NC_009439	GCCA	2	8	217829	217836	25 %	0 %	25 %	50 %	146305256
5021	NC_009439	ACG	2	6	217854	217859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5022	NC_009439	CAC	2	6	217927	217932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305256
5023	NC_009439	CTG	2	6	217937	217942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5024	NC_009439	CCG	2	6	217959	217964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305256
5025	NC_009439	GCC	2	6	217985	217990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305256
5026	NC_009439	CAA	2	6	218002	218007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305256
5027	NC_009439	TGC	2	6	218013	218018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5028	NC_009439	GAA	2	6	218035	218040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305256
5029	NC_009439	ACG	2	6	218079	218084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5030	NC_009439	CCG	2	6	218154	218159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305256
5031	NC_009439	CAG	2	6	218165	218170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5032	NC_009439	GAG	2	6	218213	218218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305256
5033	NC_009439	TGA	2	6	218229	218234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305256
5034	NC_009439	CAG	2	6	218240	218245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5035	NC_009439	GTT	2	6	218287	218292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305256
5036	NC_009439	CGA	2	6	218293	218298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305256
5037	NC_009439	ATG	2	6	218341	218346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305257
5038	NC_009439	GAT	2	6	218373	218378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305257
5039	NC_009439	CCG	2	6	218402	218407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305257
5040	NC_009439	GCA	2	6	218424	218429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5041	NC_009439	CTG	2	6	218452	218457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5042	NC_009439	CGA	2	6	218463	218468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5043	NC_009439	TGC	2	6	218489	218494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5044	NC_009439	GAG	2	6	218506	218511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305257
5045	NC_009439	AGG	2	6	218570	218575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305257
5046	NC_009439	CTG	3	9	218620	218628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5047	NC_009439	GGC	2	6	218631	218636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305257
5048	NC_009439	GGC	2	6	218664	218669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305257
5049	NC_009439	ATC	2	6	218689	218694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305257
5050	NC_009439	CGC	2	6	218790	218795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305257
5051	NC_009439	GCC	2	6	218839	218844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305257
5052	NC_009439	TGG	2	6	218861	218866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305257
5053	NC_009439	CAG	2	6	218986	218991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5054	NC_009439	TCG	2	6	218993	218998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5055	NC_009439	GCTCG	2	10	219036	219045	0 %	20 %	40 %	40 %	146305257
5056	NC_009439	CGGC	2	8	219060	219067	0 %	0 %	50 %	50 %	146305257
5057	NC_009439	AGA	2	6	219122	219127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305257
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5060	NC_009439	AGA	2	6	219209	219214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305257
5061	NC_009439	GTT	2	6	219240	219245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305257
5062	NC_009439	CTG	2	6	219250	219255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305257
5063	NC_009439	GTC	2	6	219298	219303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305258
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5067	NC_009439	AGCTCA	2	12	219500	219511	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146305258
5068	NC_009439	GCC	2	6	219700	219705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305258
5069	NC_009439	CAG	2	6	219709	219714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305258
5070	NC_009439	CTG	2	6	219730	219735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305258
5071	NC_009439	GGT	2	6	219771	219776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305258
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5080	NC_009439	TGC	2	6	219992	219997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305258
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5084	NC_009439	GCG	2	6	220063	220068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305258
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5086	NC_009439	AGC	2	6	220094	220099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305258
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5088	NC_009439	GAAC	2	8	220152	220159	50 %	0 %	25 %	25 %	146305258
5089	NC_009439	GC	3	6	220168	220173	0 %	0 %	50 %	50 %	146305258
5090	NC_009439	CAG	2	6	220215	220220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305258
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5093	NC_009439	CTG	2	6	220285	220290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305258
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5112	NC_009439	TGT	2	6	220968	220973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305259
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5114	NC_009439	GCA	2	6	220989	220994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305259
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5360	NC_009439	CGA	2	6	230690	230695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305266
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5481	NC_009439	TGG	2	6	235504	235509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305270
5482	NC_009439	CTGG	2	8	235535	235542	0 %	25 %	50 %	25 %	146305270
5483	NC_009439	GCT	2	6	235581	235586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305270
5484	NC_009439	GC	3	6	235608	235613	0 %	0 %	50 %	50 %	146305270
5485	NC_009439	CTG	2	6	235620	235625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305270
5486	NC_009439	GGC	2	6	235631	235636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305270
5487	NC_009439	GGC	2	6	235658	235663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305270
5488	NC_009439	GCT	2	6	235697	235702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305270
5489	NC_009439	CGG	2	6	235766	235771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305270
5490	NC_009439	CTG	2	6	235875	235880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305270
5491	NC_009439	CTGGC	2	10	235890	235899	0 %	20 %	40 %	40 %	146305270
5492	NC_009439	GC	3	6	235925	235930	0 %	0 %	50 %	50 %	146305270
5493	NC_009439	GCC	2	6	235950	235955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305270
5494	NC_009439	AGCG	2	8	236076	236083	25 %	0 %	50 %	25 %	146305270
5495	NC_009439	CAG	2	6	236108	236113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305270
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5498	NC_009439	CG	4	8	236212	236219	0 %	0 %	50 %	50 %	146305270
5499	NC_009439	GCG	3	9	236217	236225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305270
5500	NC_009439	CTC	2	6	236441	236446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305271

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