MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas mendocina ymp chromosome

Total Repeats: 113949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009439	GTCAGT	2	12	72	83	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146305043
2	NC_009439	GCA	2	6	93	98	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
3	NC_009439	CGA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
4	NC_009439	CGA	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
5	NC_009439	GCC	2	6	245	250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
6	NC_009439	GC	3	6	270	275	0 %	0 %	50 %	50 %	146305043
7	NC_009439	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
8	NC_009439	AGCG	2	8	317	324	25 %	0 %	50 %	25 %	146305043
9	NC_009439	TGCC	2	8	356	363	0 %	25 %	25 %	50 %	146305043
10	NC_009439	GCG	2	6	373	378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
11	NC_009439	GCC	2	6	391	396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
12	NC_009439	ACC	2	6	414	419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
13	NC_009439	GCCC	2	8	420	427	0 %	0 %	25 %	75 %	146305043
14	NC_009439	GAA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305043
15	NC_009439	CG	3	6	440	445	0 %	0 %	50 %	50 %	146305043
16	NC_009439	GCGCC	2	10	467	476	0 %	0 %	40 %	60 %	146305043
17	NC_009439	CCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
18	NC_009439	GGGC	2	8	531	538	0 %	0 %	75 %	25 %	146305043
19	NC_009439	CACCTT	2	12	564	575	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146305043
20	NC_009439	TCG	2	6	584	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
21	NC_009439	GC	4	8	610	617	0 %	0 %	50 %	50 %	146305043
22	NC_009439	GGC	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
23	NC_009439	ACC	2	6	722	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
24	NC_009439	GAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305043
25	NC_009439	GGT	2	6	753	758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305043
26	NC_009439	TCG	2	6	779	784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
27	NC_009439	GCT	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
28	NC_009439	CGA	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305043
29	NC_009439	TTC	2	6	877	882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
30	NC_009439	AAGA	2	8	886	893	75 %	0 %	25 %	0 %	146305043
31	NC_009439	TTC	2	6	910	915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
32	NC_009439	GGC	2	6	940	945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
33	NC_009439	GCC	2	6	1047	1052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305043
34	NC_009439	TGA	2	6	1079	1084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305043
35	NC_009439	TTC	2	6	1129	1134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305043
36	NC_009439	CGTG	2	8	1158	1165	0 %	25 %	50 %	25 %	146305043
37	NC_009439	CTG	2	6	1258	1263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
38	NC_009439	CAC	2	6	1305	1310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
39	NC_009439	TAC	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305043
40	NC_009439	CTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
41	NC_009439	ACCA	2	8	1414	1421	50 %	0 %	0 %	50 %	146305043
42	NC_009439	CGG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305043
43	NC_009439	CAC	2	6	1464	1469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305043
44	NC_009439	CTG	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305043
45	NC_009439	ACG	2	6	1666	1671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
46	NC_009439	CTG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
47	NC_009439	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
48	NC_009439	GC	3	6	1814	1819	0 %	0 %	50 %	50 %	146305044
49	NC_009439	GCT	2	6	1888	1893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
50	NC_009439	CAG	2	6	2042	2047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
51	NC_009439	CTA	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305044
52	NC_009439	TGC	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
53	NC_009439	TGC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
54	NC_009439	GC	3	6	2101	2106	0 %	0 %	50 %	50 %	146305044
55	NC_009439	GGC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305044
56	NC_009439	CAG	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
57	NC_009439	GCA	2	6	2260	2265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
58	NC_009439	TTCACC	2	12	2291	2302	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146305044
59	NC_009439	TGG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305044
60	NC_009439	TGC	2	6	2343	2348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
61	NC_009439	CTG	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
62	NC_009439	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305044
63	NC_009439	TCG	3	9	2520	2528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
64	NC_009439	GGC	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305044
65	NC_009439	CTG	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
66	NC_009439	CAG	2	6	2635	2640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305044
67	NC_009439	CTG	2	6	2645	2650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
68	NC_009439	GAT	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305044
69	NC_009439	GTC	2	6	2681	2686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305044
70	NC_009439	CAT	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305045
71	NC_009439	CTCCCC	2	12	2768	2779	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	146305045
72	NC_009439	C	6	6	2776	2781	0 %	0 %	0 %	100 %	146305045
73	NC_009439	GCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305045
74	NC_009439	AAC	2	6	2902	2907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305045
75	NC_009439	CTG	2	6	3084	3089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305045
76	NC_009439	GCAG	2	8	3109	3116	25 %	0 %	50 %	25 %	146305045
77	NC_009439	G	6	6	3127	3132	0 %	0 %	100 %	0 %	146305045
78	NC_009439	CTG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305045
79	NC_009439	TGAGC	2	10	3401	3410	20 %	20 %	40 %	20 %	146305045
80	NC_009439	TC	3	6	3426	3431	0 %	50 %	0 %	50 %	146305045
81	NC_009439	GC	3	6	3473	3478	0 %	0 %	50 %	50 %	146305045
82	NC_009439	TCTGCG	2	12	3482	3493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305045
83	NC_009439	CGG	2	6	3511	3516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305045
84	NC_009439	ACA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305045
85	NC_009439	TGG	2	6	3544	3549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305045
86	NC_009439	TG	3	6	3550	3555	0 %	50 %	50 %	0 %	146305045
87	NC_009439	TATC	2	8	3608	3615	25 %	50 %	0 %	25 %	146305045
88	NC_009439	TGG	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305045
89	NC_009439	AGC	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305045
90	NC_009439	TCA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305045
91	NC_009439	TG	3	6	3708	3713	0 %	50 %	50 %	0 %	146305045
92	NC_009439	TTG	2	6	3723	3728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146305045
93	NC_009439	CTC	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305046
94	NC_009439	CAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
95	NC_009439	GGT	2	6	3951	3956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
96	NC_009439	CGA	2	6	3969	3974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305046
97	NC_009439	TCA	2	6	4004	4009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
98	NC_009439	GAA	2	6	4078	4083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
99	NC_009439	TCA	2	6	4103	4108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
100	NC_009439	TGC	2	6	4115	4120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
101	NC_009439	CGG	2	6	4125	4130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
102	NC_009439	ACA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
103	NC_009439	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
104	NC_009439	GGT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
105	NC_009439	CCG	2	6	4227	4232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
106	NC_009439	CAC	2	6	4261	4266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
107	NC_009439	CTG	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
108	NC_009439	TCG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
109	NC_009439	CAA	2	6	4515	4520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
110	NC_009439	GTG	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
111	NC_009439	CAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
112	NC_009439	GGT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305046
113	NC_009439	AAC	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
114	NC_009439	GAA	2	6	4734	4739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
115	NC_009439	CCA	2	6	4751	4756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305046
116	NC_009439	ATC	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
117	NC_009439	CTG	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
118	NC_009439	GAT	2	6	4947	4952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305046
119	NC_009439	CGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
120	NC_009439	GCG	2	6	4975	4980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
121	NC_009439	CGC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
122	NC_009439	GC	3	6	5191	5196	0 %	0 %	50 %	50 %	146305046
123	NC_009439	CTC	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305046
124	NC_009439	GAG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305046
125	NC_009439	ACA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146305046
126	NC_009439	CAT	4	12	5301	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146305046
127	NC_009439	CTG	3	9	5350	5358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305046
128	NC_009439	CTT	3	9	5361	5369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146305046
129	NC_009439	GCC	2	6	5418	5423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305046
130	NC_009439	AAG	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305046
131	NC_009439	GAC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305046
132	NC_009439	CGG	2	6	5553	5558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305046
133	NC_009439	TGGT	2	8	5573	5580	0 %	50 %	50 %	0 %	146305046
134	NC_009439	TGA	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305046
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246	NC_009439	CAGCG	2	10	10158	10167	20 %	0 %	40 %	40 %	146305051
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254	NC_009439	GC	3	6	10493	10498	0 %	0 %	50 %	50 %	146305051
255	NC_009439	TGC	2	6	10538	10543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305051
256	NC_009439	GCG	2	6	10658	10663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305051
257	NC_009439	GCTTCG	2	12	10672	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305051
258	NC_009439	AGC	2	6	10714	10719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305051
259	NC_009439	CTC	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305051
260	NC_009439	CG	4	8	10765	10772	0 %	0 %	50 %	50 %	146305051
261	NC_009439	GAA	2	6	10815	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305051
262	NC_009439	GCA	2	6	10826	10831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305051
263	NC_009439	GAA	2	6	10866	10871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305051
264	NC_009439	TCC	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305051
265	NC_009439	GAC	2	6	10893	10898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305051
266	NC_009439	CAG	2	6	10917	10922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305051
267	NC_009439	CGA	2	6	10955	10960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305051
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275	NC_009439	CCA	2	6	11255	11260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305051
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279	NC_009439	GAA	2	6	11400	11405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146305051
280	NC_009439	CAGCTC	2	12	11418	11429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146305051
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282	NC_009439	CAC	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305051
283	NC_009439	CCG	2	6	11504	11509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305051
284	NC_009439	GTG	2	6	11557	11562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146305051
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290	NC_009439	CAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305052
291	NC_009439	GCG	2	6	11874	11879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305052
292	NC_009439	GCA	2	6	11889	11894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305052
293	NC_009439	CTG	2	6	11968	11973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305052
294	NC_009439	CG	4	8	11982	11989	0 %	0 %	50 %	50 %	146305052
295	NC_009439	GCA	3	9	12021	12029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305052
296	NC_009439	GAC	2	6	12058	12063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305052
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301	NC_009439	GCA	2	6	12174	12179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305052
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303	NC_009439	CTC	2	6	12463	12468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305053
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374	NC_009439	CCGAG	2	10	14800	14809	20 %	0 %	40 %	40 %	146305055
375	NC_009439	GCTTCT	2	12	14857	14868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146305055
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379	NC_009439	GCAG	2	8	15010	15017	25 %	0 %	50 %	25 %	146305055
380	NC_009439	CCT	2	6	15055	15060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305055
381	NC_009439	CTC	2	6	15080	15085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146305055
382	NC_009439	CCA	2	6	15115	15120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146305055
383	NC_009439	CAG	2	6	15137	15142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305055
384	NC_009439	CGG	3	9	15172	15180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305055
385	NC_009439	TCG	2	6	15186	15191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146305055
386	NC_009439	CGG	2	6	15195	15200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305055
387	NC_009439	TGA	2	6	15202	15207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146305055
388	NC_009439	GCG	2	6	15212	15217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305055
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391	NC_009439	GGC	2	6	15422	15427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146305055
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497	NC_009439	GCA	2	6	21171	21176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146305062
498	NC_009439	GGA	2	6	21207	21212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146305062
499	NC_009439	GCC	2	6	21257	21262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146305062
500	NC_009439	GC	3	6	21353	21358	0 %	0 %	50 %	50 %	146305062

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