MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas stutzeri A1501 chromosome

Total Repeats: 97882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009434	GCC	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
2	NC_009434	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280398
3	NC_009434	GT	3	6	487	492	0 %	50 %	50 %	0 %	146280398
4	NC_009434	CTGC	2	8	512	519	0 %	25 %	25 %	50 %	146280398
5	NC_009434	GCT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
6	NC_009434	CTT	2	6	689	694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280398
7	NC_009434	CCG	3	9	714	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
8	NC_009434	GCC	3	9	734	742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
9	NC_009434	CAGC	2	8	761	768	25 %	0 %	25 %	50 %	146280398
10	NC_009434	GCG	2	6	794	799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280398
11	NC_009434	ACA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280398
12	NC_009434	C	6	6	813	818	0 %	0 %	0 %	100 %	146280398
13	NC_009434	CCGGAG	2	12	845	856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280398
14	NC_009434	CCG	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
15	NC_009434	CACCTT	2	12	922	933	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146280398
16	NC_009434	TCG	2	6	942	947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
17	NC_009434	GCC	2	6	977	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
18	NC_009434	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280398
19	NC_009434	ATGC	2	8	1064	1071	25 %	25 %	25 %	25 %	146280398
20	NC_009434	CTG	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
21	NC_009434	AAG	2	6	1091	1096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280398
22	NC_009434	GGT	2	6	1111	1116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280398
23	NC_009434	TCG	2	6	1137	1142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
24	NC_009434	GCT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
25	NC_009434	TTC	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280398
26	NC_009434	GAA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280398
27	NC_009434	TTC	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280398
28	NC_009434	GCT	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
29	NC_009434	GGC	2	6	1298	1303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280398
30	NC_009434	CAG	2	6	1304	1309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280398
31	NC_009434	GAG	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280398
32	NC_009434	GCC	2	6	1405	1410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280398
33	NC_009434	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280398
34	NC_009434	ATG	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280398
35	NC_009434	CTT	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280398
36	NC_009434	CTG	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
37	NC_009434	TAC	2	6	1676	1681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280398
38	NC_009434	CTG	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
39	NC_009434	GCG	2	6	1711	1716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280398
40	NC_009434	CG	3	6	1729	1734	0 %	0 %	50 %	50 %	146280398
41	NC_009434	ACCA	2	8	1772	1779	50 %	0 %	0 %	50 %	146280398
42	NC_009434	CAC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280398
43	NC_009434	TGC	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
44	NC_009434	TGC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280398
45	NC_009434	GACCA	2	10	1949	1958	40 %	0 %	20 %	40 %	146280399
46	NC_009434	CGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
47	NC_009434	TTC	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280399
48	NC_009434	TCG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
49	NC_009434	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280399
50	NC_009434	TGG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280399
51	NC_009434	GCC	2	6	2141	2146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280399
52	NC_009434	GC	3	6	2171	2176	0 %	0 %	50 %	50 %	146280399
53	NC_009434	GTC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
54	NC_009434	GAA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280399
55	NC_009434	AGCGC	2	10	2376	2385	20 %	0 %	40 %	40 %	146280399
56	NC_009434	CAG	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280399
57	NC_009434	CCA	2	6	2530	2535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280399
58	NC_009434	GC	3	6	2570	2575	0 %	0 %	50 %	50 %	146280399
59	NC_009434	CCA	2	6	2634	2639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280399
60	NC_009434	TTCACC	2	12	2648	2659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	146280399
61	NC_009434	TGG	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280399
62	NC_009434	TGC	2	6	2700	2705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
63	NC_009434	TGG	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280399
64	NC_009434	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
65	NC_009434	CAA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280399
66	NC_009434	AGG	2	6	2856	2861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280399
67	NC_009434	GAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280399
68	NC_009434	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280399
69	NC_009434	TGA	2	6	2949	2954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280399
70	NC_009434	TC	3	6	2977	2982	0 %	50 %	0 %	50 %	146280399
71	NC_009434	CAG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280399
72	NC_009434	ACG	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280399
73	NC_009434	CGT	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280399
74	NC_009434	TC	3	6	3085	3090	0 %	50 %	0 %	50 %	146280400
75	NC_009434	CTG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280400
76	NC_009434	CCAT	2	8	3195	3202	25 %	25 %	0 %	50 %	146280400
77	NC_009434	GCC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280400
78	NC_009434	GCAG	2	8	3468	3475	25 %	0 %	50 %	25 %	146280400
79	NC_009434	G	6	6	3486	3491	0 %	0 %	100 %	0 %	146280400
80	NC_009434	GCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280400
81	NC_009434	CGA	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280400
82	NC_009434	GC	3	6	3832	3837	0 %	0 %	50 %	50 %	146280400
83	NC_009434	TGG	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280400
84	NC_009434	TG	3	6	3909	3914	0 %	50 %	50 %	0 %	146280400
85	NC_009434	CGA	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280400
86	NC_009434	GCA	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280400
87	NC_009434	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280400
88	NC_009434	AAG	2	6	4089	4094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280400
89	NC_009434	TGAG	2	8	4181	4188	25 %	25 %	50 %	0 %	146280400
90	NC_009434	CAC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280401
91	NC_009434	GTC	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
92	NC_009434	TCGA	2	8	4324	4331	25 %	25 %	25 %	25 %	146280401
93	NC_009434	CCAT	2	8	4370	4377	25 %	25 %	0 %	50 %	146280401
94	NC_009434	GAA	2	6	4435	4440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280401
95	NC_009434	TCA	2	6	4460	4465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280401
96	NC_009434	TGC	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
97	NC_009434	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280401
98	NC_009434	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280401
99	NC_009434	GAG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280401
100	NC_009434	CTG	3	9	4570	4578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
101	NC_009434	CCG	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280401
102	NC_009434	GGGT	2	8	4778	4785	0 %	25 %	75 %	0 %	146280401
103	NC_009434	CGA	2	6	4797	4802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280401
104	NC_009434	GAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280401
105	NC_009434	TCG	2	6	4853	4858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
106	NC_009434	CAA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280401
107	NC_009434	GGCGTC	2	12	4924	4935	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146280401
108	NC_009434	CAA	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280401
109	NC_009434	CGG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280401
110	NC_009434	TCCGC	2	10	5033	5042	0 %	20 %	20 %	60 %	146280401
111	NC_009434	AAC	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280401
112	NC_009434	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280401
113	NC_009434	CCA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280401
114	NC_009434	GAC	2	6	5116	5121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280401
115	NC_009434	ATC	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280401
116	NC_009434	AGTTC	2	10	5171	5180	20 %	40 %	20 %	20 %	146280401
117	NC_009434	TCC	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280401
118	NC_009434	CTG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
119	NC_009434	GAT	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280401
120	NC_009434	TGC	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
121	NC_009434	GC	3	6	5332	5337	0 %	0 %	50 %	50 %	146280401
122	NC_009434	GC	3	6	5366	5371	0 %	0 %	50 %	50 %	146280401
123	NC_009434	CCGCAA	2	12	5484	5495	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146280401
124	NC_009434	TCC	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280401
125	NC_009434	ACA	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280401
126	NC_009434	CAT	4	12	5655	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280401
127	NC_009434	CTG	3	9	5704	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280401
128	NC_009434	TTC	2	6	5719	5724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280401
129	NC_009434	CCG	2	6	5773	5778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280401
130	NC_009434	GAC	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280401
131	NC_009434	GGA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280401
132	NC_009434	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280401
133	NC_009434	ATCT	2	8	6007	6014	25 %	50 %	0 %	25 %	146280401
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140	NC_009434	TGA	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280401
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250	NC_009434	CTG	2	6	11355	11360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
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253	NC_009434	GCACG	2	10	11558	11567	20 %	0 %	40 %	40 %	146280406
254	NC_009434	GGC	2	6	11580	11585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280406
255	NC_009434	CGCA	2	8	11613	11620	25 %	0 %	25 %	50 %	146280406
256	NC_009434	GGCC	2	8	11657	11664	0 %	0 %	50 %	50 %	146280406
257	NC_009434	GCT	2	6	11729	11734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
258	NC_009434	GCA	2	6	11750	11755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
259	NC_009434	GCG	2	6	11769	11774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280406
260	NC_009434	GCA	2	6	11804	11809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
261	NC_009434	TGCCGA	2	12	11810	11821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280406
262	NC_009434	GTA	3	9	11967	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280406
263	NC_009434	CAG	2	6	12039	12044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
264	NC_009434	GC	4	8	12058	12065	0 %	0 %	50 %	50 %	146280406
265	NC_009434	CGC	2	6	12071	12076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280406
266	NC_009434	TTC	2	6	12163	12168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280406
267	NC_009434	GCT	2	6	12194	12199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
268	NC_009434	GAA	3	9	12213	12221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280406
269	NC_009434	TTCGA	2	10	12286	12295	20 %	40 %	20 %	20 %	146280406
270	NC_009434	TGA	2	6	12308	12313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280406
271	NC_009434	GCA	2	6	12320	12325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
272	NC_009434	CAG	2	6	12342	12347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
273	NC_009434	TGG	2	6	12374	12379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280406
274	NC_009434	CCT	2	6	12389	12394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280406
275	NC_009434	CTC	2	6	12414	12419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280406
276	NC_009434	CCA	2	6	12449	12454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280406
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279	NC_009434	GCT	2	6	12518	12523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
280	NC_009434	GC	3	6	12667	12672	0 %	0 %	50 %	50 %	146280406
281	NC_009434	CGGA	2	8	12732	12739	25 %	0 %	50 %	25 %	146280406
282	NC_009434	TGCG	2	8	12752	12759	0 %	25 %	50 %	25 %	146280406
283	NC_009434	CGA	2	6	12806	12811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
284	NC_009434	GCA	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
285	NC_009434	GC	3	6	12912	12917	0 %	0 %	50 %	50 %	146280406
286	NC_009434	GGC	2	6	12960	12965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280406
287	NC_009434	CGG	2	6	12972	12977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280406
288	NC_009434	TGC	2	6	12992	12997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
289	NC_009434	GCT	2	6	13004	13009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
290	NC_009434	GCT	2	6	13019	13024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280406
291	NC_009434	GCG	2	6	13051	13056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280406
292	NC_009434	TTC	2	6	13158	13163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280406
293	NC_009434	CGA	2	6	13175	13180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280406
294	NC_009434	CAG	2	6	13277	13282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280407
295	NC_009434	CTG	2	6	13331	13336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280407
296	NC_009434	GC	3	6	13337	13342	0 %	0 %	50 %	50 %	146280407
297	NC_009434	ACC	2	6	13398	13403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280407
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299	NC_009434	CGG	2	6	13429	13434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280407
300	NC_009434	TGG	2	6	13536	13541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280407
301	NC_009434	CGC	2	6	13678	13683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280407
302	NC_009434	CTG	2	6	13688	13693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280407
303	NC_009434	CCCAG	2	10	13738	13747	20 %	0 %	20 %	60 %	146280407
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344	NC_009434	T	7	7	15513	15519	0 %	100 %	0 %	0 %	162139469
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353	NC_009434	CCG	2	6	15770	15775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162139469
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373	NC_009434	CAG	2	6	16942	16947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280411
374	NC_009434	CTC	2	6	16948	16953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280411
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376	NC_009434	CGT	2	6	17172	17177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280411
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380	NC_009434	CCT	2	6	17259	17264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280411
381	NC_009434	GCC	2	6	17357	17362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280411
382	NC_009434	TTC	2	6	17380	17385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280411
383	NC_009434	TGG	2	6	17388	17393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280411
384	NC_009434	GGC	2	6	17435	17440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280412
385	NC_009434	GCAC	2	8	17441	17448	25 %	0 %	25 %	50 %	146280412
386	NC_009434	CGAGGC	2	12	17453	17464	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280412
387	NC_009434	GAA	2	6	17475	17480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280412
388	NC_009434	CCA	2	6	17555	17560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280412
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393	NC_009434	CCGA	2	8	17931	17938	25 %	0 %	25 %	50 %	146280412
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423	NC_009434	GC	3	6	19195	19200	0 %	0 %	50 %	50 %	146280414
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500	NC_009434	GAG	2	6	22467	22472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280416

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