MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514 chromosome

Total Repeats: 41064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009376	GTC	2	6	26	31	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590268
2	NC_009376	TA	3	6	72	77	50 %	50 %	0 %	0 %	145590268
3	NC_009376	GAG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590268
4	NC_009376	CG	3	6	106	111	0 %	0 %	50 %	50 %	145590268
5	NC_009376	CTC	2	6	141	146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145590268
6	NC_009376	GTT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145590268
7	NC_009376	GAG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590268
8	NC_009376	AT	3	6	200	205	50 %	50 %	0 %	0 %	145590268
9	NC_009376	AGA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590268
10	NC_009376	ATG	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590268
11	NC_009376	GAAA	2	8	331	338	75 %	0 %	25 %	0 %	145590268
12	NC_009376	ACA	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590268
13	NC_009376	TAC	2	6	381	386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590268
14	NC_009376	TAT	2	6	425	430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145590268
15	NC_009376	AGA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590268
16	NC_009376	GGC	2	6	471	476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145590268
17	NC_009376	GGC	2	6	514	519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145590268
18	NC_009376	TAA	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590268
19	NC_009376	GAG	2	6	588	593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590268
20	NC_009376	CGC	3	9	614	622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590268
21	NC_009376	GAA	2	6	660	665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590268
22	NC_009376	AGC	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145590268
23	NC_009376	TGA	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590269
24	NC_009376	GGT	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145590269
25	NC_009376	GAG	2	6	788	793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590269
26	NC_009376	CCT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145590269
27	NC_009376	ACA	2	6	1056	1061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590269
28	NC_009376	CAA	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590269
29	NC_009376	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590269
30	NC_009376	TAC	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590269
31	NC_009376	TAT	2	6	1153	1158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145590269
32	NC_009376	ATA	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590269
33	NC_009376	GAT	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590269
34	NC_009376	GGC	3	9	1339	1347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145590269
35	NC_009376	CCA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145590269
36	NC_009376	GAT	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590269
37	NC_009376	CGG	2	6	1404	1409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145590269
38	NC_009376	ATGT	2	8	1481	1488	25 %	50 %	25 %	0 %	145590269
39	NC_009376	AG	4	8	1527	1534	50 %	0 %	50 %	0 %	145590269
40	NC_009376	CGA	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145590269
41	NC_009376	GTT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145590269
42	NC_009376	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145590269
43	NC_009376	AG	3	6	1674	1679	50 %	0 %	50 %	0 %	145590269
44	NC_009376	AGAC	2	8	1682	1689	50 %	0 %	25 %	25 %	145590269
45	NC_009376	GCC	2	6	1690	1695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590269
46	NC_009376	AGG	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590269
47	NC_009376	GTA	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590270
48	NC_009376	AGG	2	6	1776	1781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
49	NC_009376	A	6	6	1856	1861	100 %	0 %	0 %	0 %	145590270
50	NC_009376	TCC	2	6	1890	1895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145590270
51	NC_009376	GCC	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590270
52	NC_009376	GA	3	6	1947	1952	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
53	NC_009376	GA	3	6	2000	2005	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
54	NC_009376	AGG	2	6	2010	2015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
55	NC_009376	GA	3	6	2032	2037	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
56	NC_009376	AGA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590270
57	NC_009376	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590270
58	NC_009376	GA	3	6	2209	2214	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
59	NC_009376	TC	3	6	2219	2224	0 %	50 %	0 %	50 %	145590270
60	NC_009376	GAG	3	9	2249	2257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
61	NC_009376	GAG	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
62	NC_009376	AGG	2	6	2310	2315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
63	NC_009376	GTC	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590270
64	NC_009376	GCGG	2	8	2353	2360	0 %	0 %	75 %	25 %	145590270
65	NC_009376	CT	3	6	2384	2389	0 %	50 %	0 %	50 %	145590270
66	NC_009376	GGA	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590270
67	NC_009376	CTAT	2	8	2450	2457	25 %	50 %	0 %	25 %	145590270
68	NC_009376	TA	3	6	2478	2483	50 %	50 %	0 %	0 %	145590270
69	NC_009376	TGA	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590270
70	NC_009376	CGT	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590270
71	NC_009376	CGG	2	6	2704	2709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145590270
72	NC_009376	GA	3	6	2794	2799	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
73	NC_009376	GA	3	6	2812	2817	50 %	0 %	50 %	0 %	145590270
74	NC_009376	ATT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145590271
75	NC_009376	GAA	2	6	3020	3025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590271
76	NC_009376	TAG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590271
77	NC_009376	ACG	2	6	3196	3201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145590271
78	NC_009376	TCG	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590271
79	NC_009376	CGTA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	25 %	25 %	145590271
80	NC_009376	TGA	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590272
81	NC_009376	AAC	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590272
82	NC_009376	CTG	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590272
83	NC_009376	TAG	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590272
84	NC_009376	TTTA	2	8	3586	3593	25 %	75 %	0 %	0 %	145590272
85	NC_009376	CTT	2	6	3703	3708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145590272
86	NC_009376	GAC	2	6	3754	3759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145590272
87	NC_009376	TTA	2	6	3794	3799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145590272
88	NC_009376	TGT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145590272
89	NC_009376	GTT	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145590272
90	NC_009376	AAC	2	6	3877	3882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590272
91	NC_009376	AAT	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590272
92	NC_009376	GAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590272
93	NC_009376	GAT	2	6	4023	4028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590272
94	NC_009376	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590272
95	NC_009376	GCGG	2	8	4130	4137	0 %	0 %	75 %	25 %	145590272
96	NC_009376	GAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590272
97	NC_009376	AGA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590272
98	NC_009376	AC	3	6	4481	4486	50 %	0 %	0 %	50 %	145590272
99	NC_009376	ATA	2	6	4507	4512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590272
100	NC_009376	GAG	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145590272
101	NC_009376	CT	3	6	4576	4581	0 %	50 %	0 %	50 %	145590273
102	NC_009376	AACT	2	8	4628	4635	50 %	25 %	0 %	25 %	145590273
103	NC_009376	TAG	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590273
104	NC_009376	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590273
105	NC_009376	GTA	2	6	4737	4742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590273
106	NC_009376	TAG	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145590273
107	NC_009376	A	6	6	4777	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	145590273
108	NC_009376	A	6	6	4795	4800	100 %	0 %	0 %	0 %	145590273
109	NC_009376	TAAA	2	8	4804	4811	75 %	25 %	0 %	0 %	145590273
110	NC_009376	GTGGGC	2	12	4874	4885	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	145590274
111	NC_009376	GAC	2	6	4942	4947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145590274
112	NC_009376	AGGC	2	8	5069	5076	25 %	0 %	50 %	25 %	145590274
113	NC_009376	TTC	2	6	5252	5257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145590274
114	NC_009376	TA	3	6	5274	5279	50 %	50 %	0 %	0 %	145590274
115	NC_009376	A	7	7	5339	5345	100 %	0 %	0 %	0 %	145590274
116	NC_009376	ATT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145590274
117	NC_009376	A	6	6	5366	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	145590274
118	NC_009376	AAG	2	6	5379	5384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590274
119	NC_009376	TCC	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145590275
120	NC_009376	AGA	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590275
121	NC_009376	ACA	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590275
122	NC_009376	CCG	2	6	5806	5811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590275
123	NC_009376	CAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590275
124	NC_009376	TAGCC	2	10	5855	5864	20 %	20 %	20 %	40 %	145590275
125	NC_009376	TCA	2	6	5874	5879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590275
126	NC_009376	AG	3	6	5892	5897	50 %	0 %	50 %	0 %	145590275
127	NC_009376	CTA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590275
128	NC_009376	GGT	2	6	6018	6023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145590275
129	NC_009376	GAGAC	2	10	6111	6120	40 %	0 %	40 %	20 %	145590275
130	NC_009376	CAA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145590275
131	NC_009376	ACCA	2	8	6350	6357	50 %	0 %	0 %	50 %	145590275
132	NC_009376	AGA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590275
133	NC_009376	CTC	2	6	6502	6507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145590275
134	NC_009376	AAT	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145590275
135	NC_009376	CT	3	6	6556	6561	0 %	50 %	0 %	50 %	145590275
136	NC_009376	GCT	2	6	6710	6715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145590276
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399	NC_009376	CTT	2	6	18744	18749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145590292
400	NC_009376	CAC	2	6	18765	18770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145590292
401	NC_009376	GCCG	2	8	18771	18778	0 %	0 %	50 %	50 %	145590292
402	NC_009376	GA	3	6	18802	18807	50 %	0 %	50 %	0 %	145590292
403	NC_009376	CGC	2	6	18875	18880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590292
404	NC_009376	ATC	2	6	19006	19011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590292
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452	NC_009376	CTT	2	6	21461	21466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145590295
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455	NC_009376	GCC	2	6	21648	21653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145590295
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462	NC_009376	AAG	2	6	22086	22091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145590295
463	NC_009376	TAC	2	6	22102	22107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590295
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483	NC_009376	CT	4	8	23279	23286	0 %	50 %	0 %	50 %	145590297
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500	NC_009376	CTA	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145590297

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