MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrobaculum calidifontis JCM 11548 chromosome

Total Repeats: 42587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009073	ATT	2	6	143465	143470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126458776
3003	NC_009073	GTC	2	6	143527	143532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3004	NC_009073	GA	3	6	143587	143592	50 %	0 %	50 %	0 %	126458776
3005	NC_009073	GTC	2	6	143608	143613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3006	NC_009073	CT	3	6	143623	143628	0 %	50 %	0 %	50 %	126458776
3007	NC_009073	GCC	2	6	143666	143671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458776
3008	NC_009073	TCG	2	6	143699	143704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3009	NC_009073	CCT	2	6	143769	143774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458776
3010	NC_009073	CGA	2	6	143799	143804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3011	NC_009073	GGC	2	6	143809	143814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458776
3012	NC_009073	GAT	2	6	143872	143877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458776
3013	NC_009073	GTC	2	6	143878	143883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3014	NC_009073	AGT	2	6	143895	143900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458776
3015	NC_009073	GCC	2	6	143921	143926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458776
3016	NC_009073	GGCC	2	8	143935	143942	0 %	0 %	50 %	50 %	126458776
3017	NC_009073	GCC	3	9	143966	143974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458776
3018	NC_009073	GAG	2	6	143980	143985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458776
3019	NC_009073	C	6	6	144001	144006	0 %	0 %	0 %	100 %	126458776
3020	NC_009073	ACA	2	6	144021	144026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126458776
3021	NC_009073	CT	3	6	144031	144036	0 %	50 %	0 %	50 %	126458776
3022	NC_009073	ACG	2	6	144119	144124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458776
3023	NC_009073	C	6	6	144243	144248	0 %	0 %	0 %	100 %	126458777
3024	NC_009073	GCG	2	6	144249	144254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458777
3025	NC_009073	CCG	2	6	144261	144266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458777
3026	NC_009073	GCC	2	6	144287	144292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458777
3027	NC_009073	AGCCTC	2	12	144296	144307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126458777
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3029	NC_009073	TCG	2	6	144338	144343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458777
3030	NC_009073	GTC	2	6	144419	144424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458777
3031	NC_009073	CCT	2	6	144484	144489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458777
3032	NC_009073	CCG	3	9	144492	144500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458777
3033	NC_009073	GTGGCC	2	12	144509	144520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126458777
3034	NC_009073	CGG	2	6	144559	144564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458777
3035	NC_009073	GGA	2	6	144591	144596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458777
3036	NC_009073	GCG	2	6	144618	144623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458777
3037	NC_009073	GCC	2	6	144638	144643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458777
3038	NC_009073	CCT	2	6	144673	144678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458777
3039	NC_009073	CTC	2	6	144719	144724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458777
3040	NC_009073	CCCG	2	8	144810	144817	0 %	0 %	25 %	75 %	126458777
3041	NC_009073	GTA	2	6	145382	145387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458778
3042	NC_009073	CGT	2	6	145400	145405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126458778
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3048	NC_009073	GGC	2	6	145657	145662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458778
3049	NC_009073	CTC	2	6	145666	145671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458778
3050	NC_009073	GGA	2	6	145705	145710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458778
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3052	NC_009073	ACG	2	6	145828	145833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458778
3053	NC_009073	ATG	2	6	145842	145847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458778
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3055	NC_009073	ACC	2	6	145923	145928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458778
3056	NC_009073	CCT	2	6	145939	145944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458778
3057	NC_009073	GAG	2	6	145994	145999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458778
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3059	NC_009073	GAC	2	6	146117	146122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458778
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3064	NC_009073	CAG	2	6	146273	146278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458778
3065	NC_009073	CGTTG	2	10	146303	146312	0 %	40 %	40 %	20 %	126458778
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3104	NC_009073	GA	3	6	148127	148132	50 %	0 %	50 %	0 %	126458779
3105	NC_009073	TGT	2	6	148164	148169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126458779
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3110	NC_009073	C	6	6	148362	148367	0 %	0 %	0 %	100 %	126458779
3111	NC_009073	CCG	2	6	148455	148460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458779
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3119	NC_009073	TGG	2	6	148804	148809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126458780
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3121	NC_009073	TCC	2	6	148936	148941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458780
3122	NC_009073	CT	4	8	148958	148965	0 %	50 %	0 %	50 %	126458780
3123	NC_009073	CTC	2	6	148970	148975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458780
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3127	NC_009073	CAC	2	6	149048	149053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126458780
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3130	NC_009073	CTC	2	6	149171	149176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458780
3131	NC_009073	GTA	2	6	149201	149206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126458780
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3239	NC_009073	GC	3	6	154547	154552	0 %	0 %	50 %	50 %	126458786
3240	NC_009073	CCT	2	6	154583	154588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126458786
3241	NC_009073	GGTA	2	8	154644	154651	25 %	25 %	50 %	0 %	126458786
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3488	NC_009073	GCG	2	6	166666	166671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126458795
3489	NC_009073	GGCT	2	8	166708	166715	0 %	25 %	50 %	25 %	126458795
3490	NC_009073	GCC	3	9	166741	166749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126458795
3491	NC_009073	GAG	3	9	166801	166809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126458795
3492	NC_009073	AG	3	6	166808	166813	50 %	0 %	50 %	0 %	126458795
3493	NC_009073	AG	3	6	166967	166972	50 %	0 %	50 %	0 %	126458795
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3497	NC_009073	ACT	2	6	167177	167182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126458796
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3500	NC_009073	GCA	2	6	167300	167305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126458796

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