MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus str. MIT 9303 chromosome

Total Repeats: 45581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008820	GCTA	2	8	291	298	25 %	25 %	25 %	25 %	124021715
2	NC_008820	CTG	2	6	311	316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021715
3	NC_008820	GTG	2	6	401	406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021715
4	NC_008820	GC	3	6	421	426	0 %	0 %	50 %	50 %	124021715
5	NC_008820	TGA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021715
6	NC_008820	CTG	2	6	548	553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021715
7	NC_008820	TTG	2	6	575	580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021715
8	NC_008820	AGC	2	6	717	722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021715
9	NC_008820	GAT	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021715
10	NC_008820	CTTC	2	8	832	839	0 %	50 %	0 %	50 %	124021715
11	NC_008820	TGA	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021715
12	NC_008820	GTTT	2	8	899	906	0 %	75 %	25 %	0 %	124021715
13	NC_008820	GGT	2	6	921	926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021715
14	NC_008820	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021715
15	NC_008820	TGT	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021715
16	NC_008820	GTG	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021715
17	NC_008820	ATT	2	6	1303	1308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021715
18	NC_008820	GAT	3	9	1318	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021715
19	NC_008820	CAT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021716
20	NC_008820	TCC	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124021716
21	NC_008820	TTGG	2	8	1496	1503	0 %	50 %	50 %	0 %	124021716
22	NC_008820	GTC	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021716
23	NC_008820	GATCA	2	10	1612	1621	40 %	20 %	20 %	20 %	124021716
24	NC_008820	TTG	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021716
25	NC_008820	TTGGT	2	10	1682	1691	0 %	60 %	40 %	0 %	124021716
26	NC_008820	TTC	2	6	1727	1732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021716
27	NC_008820	ATT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021716
28	NC_008820	TC	3	6	1742	1747	0 %	50 %	0 %	50 %	124021716
29	NC_008820	GCA	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021716
30	NC_008820	AAC	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124021716
31	NC_008820	TTG	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021716
32	NC_008820	GAT	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021716
33	NC_008820	GGTT	2	8	1960	1967	0 %	50 %	50 %	0 %	124021716
34	NC_008820	GGA	2	6	1968	1973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021716
35	NC_008820	TCC	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124021716
36	NC_008820	GAA	2	6	1984	1989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124021716
37	NC_008820	TCT	2	6	2011	2016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021716
38	NC_008820	GAT	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021716
39	NC_008820	CGC	2	6	2095	2100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124021716
40	NC_008820	GAT	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021716
41	NC_008820	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
42	NC_008820	ACG	2	6	2270	2275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021717
43	NC_008820	GTC	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
44	NC_008820	TGT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
45	NC_008820	CAG	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021717
46	NC_008820	TGGT	2	8	2411	2418	0 %	50 %	50 %	0 %	124021717
47	NC_008820	ATC	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021717
48	NC_008820	GCT	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
49	NC_008820	GA	3	6	2547	2552	50 %	0 %	50 %	0 %	124021717
50	NC_008820	CTT	2	6	2584	2589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021717
51	NC_008820	TG	3	6	2677	2682	0 %	50 %	50 %	0 %	124021717
52	NC_008820	TGG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
53	NC_008820	GTTA	2	8	2739	2746	25 %	50 %	25 %	0 %	124021717
54	NC_008820	GGT	2	6	2817	2822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
55	NC_008820	GTA	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
56	NC_008820	GTG	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
57	NC_008820	GAT	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
58	NC_008820	TGT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
59	NC_008820	TGC	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
60	NC_008820	GCT	2	6	3046	3051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
61	NC_008820	GGT	2	6	3055	3060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
62	NC_008820	CTTGAT	2	12	3073	3084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	124021717
63	NC_008820	AG	3	6	3144	3149	50 %	0 %	50 %	0 %	124021717
64	NC_008820	GA	3	6	3193	3198	50 %	0 %	50 %	0 %	124021717
65	NC_008820	AGC	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021717
66	NC_008820	TTG	2	6	3227	3232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
67	NC_008820	GGT	2	6	3252	3257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
68	NC_008820	GTT	2	6	3280	3285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
69	NC_008820	TGA	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
70	NC_008820	TTAG	2	8	3340	3347	25 %	50 %	25 %	0 %	124021717
71	NC_008820	TCC	2	6	3351	3356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124021717
72	NC_008820	AGG	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021717
73	NC_008820	GTT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
74	NC_008820	GTA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
75	NC_008820	TGA	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
76	NC_008820	ATC	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021717
77	NC_008820	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
78	NC_008820	TGT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
79	NC_008820	GTT	2	6	3655	3660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
80	NC_008820	GTG	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
81	NC_008820	CGC	2	6	3708	3713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124021717
82	NC_008820	GGA	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021717
83	NC_008820	TA	3	6	3896	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	124021717
84	NC_008820	GTT	2	6	3952	3957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
85	NC_008820	TG	4	8	3990	3997	0 %	50 %	50 %	0 %	124021717
86	NC_008820	GGCTT	2	10	4002	4011	0 %	40 %	40 %	20 %	124021717
87	NC_008820	TGATT	2	10	4020	4029	20 %	60 %	20 %	0 %	124021717
88	NC_008820	ACA	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124021717
89	NC_008820	GTA	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
90	NC_008820	TTGCAG	2	12	4241	4252	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	124021717
91	NC_008820	GTT	2	6	4326	4331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
92	NC_008820	GGT	2	6	4342	4347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021717
93	NC_008820	GTT	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021717
94	NC_008820	TGA	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021717
95	NC_008820	TCG	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021717
96	NC_008820	TC	3	6	4575	4580	0 %	50 %	0 %	50 %	124021717
97	NC_008820	TTG	2	6	4663	4668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021718
98	NC_008820	CAG	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021718
99	NC_008820	TGC	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021718
100	NC_008820	CCA	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124021718
101	NC_008820	TTGGTC	2	12	4852	4863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	124021718
102	NC_008820	GAA	3	9	4899	4907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124021718
103	NC_008820	TCG	2	6	5009	5014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021718
104	NC_008820	TCT	2	6	5189	5194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021718
105	NC_008820	TGA	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021718
106	NC_008820	TTA	2	6	5350	5355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021718
107	NC_008820	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124021718
108	NC_008820	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021718
109	NC_008820	TGT	2	6	5546	5551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021718
110	NC_008820	CTG	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021718
111	NC_008820	T	6	6	5628	5633	0 %	100 %	0 %	0 %	124021718
112	NC_008820	TAT	2	6	5660	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021718
113	NC_008820	GAT	2	6	5754	5759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021718
114	NC_008820	GCA	2	6	5841	5846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021718
115	NC_008820	CCA	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124021718
116	NC_008820	TCT	2	6	5934	5939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021718
117	NC_008820	AGC	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021718
118	NC_008820	TTG	2	6	5995	6000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021718
119	NC_008820	CA	3	6	6095	6100	50 %	0 %	0 %	50 %	124021718
120	NC_008820	TAA	2	6	6108	6113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124021718
121	NC_008820	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021719
122	NC_008820	TTC	2	6	6194	6199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021719
123	NC_008820	CAGTTC	2	12	6248	6259	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124021719
124	NC_008820	TACT	2	8	6292	6299	25 %	50 %	0 %	25 %	124021719
125	NC_008820	CT	3	6	6394	6399	0 %	50 %	0 %	50 %	124021719
126	NC_008820	TGG	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021719
127	NC_008820	TCT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021719
128	NC_008820	TTA	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021719
129	NC_008820	CAT	3	9	6625	6633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021719
130	NC_008820	AATG	2	8	6644	6651	50 %	25 %	25 %	0 %	124021719
131	NC_008820	ACA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124021719
132	NC_008820	TTTAA	2	10	6675	6684	40 %	60 %	0 %	0 %	124021719
133	NC_008820	TGC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
134	NC_008820	CTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021719
135	NC_008820	GCT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
136	NC_008820	TCC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124021719
137	NC_008820	GTT	2	6	6859	6864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
138	NC_008820	TTGT	2	8	6903	6910	0 %	75 %	25 %	0 %	124021719
139	NC_008820	CTGG	2	8	6954	6961	0 %	25 %	50 %	25 %	124021719
140	NC_008820	TTG	2	6	7046	7051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
141	NC_008820	TTG	2	6	7091	7096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
142	NC_008820	CGCT	2	8	7130	7137	0 %	25 %	25 %	50 %	124021719
143	NC_008820	ATC	2	6	7148	7153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021719
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145	NC_008820	GTT	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
146	NC_008820	GTT	2	6	7267	7272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
147	NC_008820	CTT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021719
148	NC_008820	GTC	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
149	NC_008820	GCTT	2	8	7365	7372	0 %	50 %	25 %	25 %	124021719
150	NC_008820	GCA	4	12	7410	7421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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153	NC_008820	TGGT	2	8	7524	7531	0 %	50 %	50 %	0 %	124021719
154	NC_008820	GTT	2	6	7594	7599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021719
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156	NC_008820	CCA	2	6	7711	7716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124021719
157	NC_008820	TCG	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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159	NC_008820	GAC	2	6	7844	7849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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161	NC_008820	TTC	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021719
162	NC_008820	GCCAC	2	10	7902	7911	20 %	0 %	20 %	60 %	124021719
163	NC_008820	TGC	2	6	7921	7926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
164	NC_008820	AGGT	2	8	7938	7945	25 %	25 %	50 %	0 %	124021719
165	NC_008820	CAG	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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167	NC_008820	GTC	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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169	NC_008820	AAC	2	6	8125	8130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124021719
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174	NC_008820	CGT	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021719
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244	NC_008820	TGA	2	6	12054	12059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021723
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247	NC_008820	GA	3	6	12279	12284	50 %	0 %	50 %	0 %	124021724
248	NC_008820	TTA	2	6	12422	12427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124021724
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253	NC_008820	GTC	2	6	12713	12718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021724
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256	NC_008820	TAA	2	6	12881	12886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124021725
257	NC_008820	TCT	2	6	12897	12902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021725
258	NC_008820	AGG	2	6	12913	12918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021725
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260	NC_008820	CAA	2	6	13128	13133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124021725
261	NC_008820	GAG	2	6	13152	13157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021725
262	NC_008820	A	6	6	13282	13287	100 %	0 %	0 %	0 %	124021725
263	NC_008820	GATT	2	8	13301	13308	25 %	50 %	25 %	0 %	124021725
264	NC_008820	TGA	2	6	13409	13414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021725
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282	NC_008820	GTG	2	6	14098	14103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021725
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370	NC_008820	AGCGG	2	10	18151	18160	20 %	0 %	60 %	20 %	124021729
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376	NC_008820	TTTG	2	8	18325	18332	0 %	75 %	25 %	0 %	124021729
377	NC_008820	TGCA	2	8	18362	18369	25 %	25 %	25 %	25 %	124021729
378	NC_008820	ATC	2	6	18440	18445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021729
379	NC_008820	TCGCCA	2	12	18484	18495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	124021729
380	NC_008820	AGGC	2	8	18537	18544	25 %	0 %	50 %	25 %	124021729
381	NC_008820	TCG	2	6	18600	18605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021729
382	NC_008820	GC	3	6	18626	18631	0 %	0 %	50 %	50 %	124021729
383	NC_008820	ATC	2	6	18653	18658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124021729
384	NC_008820	GAT	2	6	18689	18694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021729
385	NC_008820	GAT	2	6	18709	18714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021729
386	NC_008820	CAAC	2	8	18745	18752	50 %	0 %	0 %	50 %	124021729
387	NC_008820	GTC	2	6	18981	18986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021730
388	NC_008820	CTG	2	6	18992	18997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021730
389	NC_008820	GCA	2	6	19040	19045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021730
390	NC_008820	TGC	2	6	19051	19056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021730
391	NC_008820	CTTG	2	8	19073	19080	0 %	50 %	25 %	25 %	124021730
392	NC_008820	GAG	2	6	19142	19147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124021730
393	NC_008820	TC	3	6	19172	19177	0 %	50 %	0 %	50 %	124021730
394	NC_008820	GTT	2	6	19228	19233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021730
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401	NC_008820	ATG	2	6	19389	19394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124021730
402	NC_008820	TTGAT	2	10	19459	19468	20 %	60 %	20 %	0 %	124021730
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404	NC_008820	GGT	3	9	19476	19484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124021731
405	NC_008820	T	7	7	19493	19499	0 %	100 %	0 %	0 %	124021731
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482	NC_008820	CAGT	2	8	23678	23685	25 %	25 %	25 %	25 %	124021734
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497	NC_008820	TCT	2	6	24442	24447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124021734
498	NC_008820	CAG	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124021734
499	NC_008820	TTG	2	6	24509	24514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124021734
500	NC_008820	TGC	2	6	24541	24546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124021734

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