MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 97707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008781	ATG	2	6	67969	67974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602982
1502	NC_008781	GGC	2	6	67998	68003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602982
1503	NC_008781	GTG	2	6	68095	68100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602982
1504	NC_008781	CTG	2	6	68109	68114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602982
1505	NC_008781	TCA	2	6	68165	68170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602982
1506	NC_008781	GGC	2	6	68175	68180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602982
1507	NC_008781	GCTG	2	8	68277	68284	0 %	25 %	50 %	25 %	121602982
1508	NC_008781	CCG	2	6	68300	68305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602982
1509	NC_008781	GC	3	6	68306	68311	0 %	0 %	50 %	50 %	121602982
1510	NC_008781	CTG	2	6	68365	68370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602982
1511	NC_008781	AAC	2	6	68405	68410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602982
1512	NC_008781	TCGT	2	8	68508	68515	0 %	50 %	25 %	25 %	121602983
1513	NC_008781	TGT	2	6	68540	68545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602983
1514	NC_008781	CCCGGC	2	12	68571	68582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602983
1515	NC_008781	GGC	2	6	68613	68618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602983
1516	NC_008781	CGG	2	6	68624	68629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602983
1517	NC_008781	TGC	2	6	68668	68673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602983
1518	NC_008781	GGCG	2	8	68687	68694	0 %	0 %	75 %	25 %	121602983
1519	NC_008781	GGC	2	6	68708	68713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602983
1520	NC_008781	CCTGG	2	10	68759	68768	0 %	20 %	40 %	40 %	121602983
1521	NC_008781	TGC	2	6	68782	68787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602983
1522	NC_008781	ACT	2	6	68833	68838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602983
1523	NC_008781	GGCA	2	8	68842	68849	25 %	0 %	50 %	25 %	121602983
1524	NC_008781	T	7	7	68897	68903	0 %	100 %	0 %	0 %	121602983
1525	NC_008781	GCA	2	6	68924	68929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602983
1526	NC_008781	T	6	6	68981	68986	0 %	100 %	0 %	0 %	121602983
1527	NC_008781	TGC	2	6	69004	69009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602983
1528	NC_008781	CG	3	6	69026	69031	0 %	0 %	50 %	50 %	121602983
1529	NC_008781	GCC	2	6	69072	69077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602983
1530	NC_008781	CCAA	2	8	69202	69209	50 %	0 %	0 %	50 %	121602984
1531	NC_008781	GCG	2	6	69214	69219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602984
1532	NC_008781	ACC	4	12	69228	69239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602984
1533	NC_008781	GCC	2	6	69249	69254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602984
1534	NC_008781	TGG	2	6	69286	69291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602984
1535	NC_008781	CCA	2	6	69313	69318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602984
1536	NC_008781	CATC	2	8	69382	69389	25 %	25 %	0 %	50 %	121602984
1537	NC_008781	GCCC	2	8	69556	69563	0 %	0 %	25 %	75 %	121602984
1538	NC_008781	GCG	2	6	69597	69602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602984
1539	NC_008781	GACC	2	8	69653	69660	25 %	0 %	25 %	50 %	121602984
1540	NC_008781	ATC	2	6	69711	69716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602984
1541	NC_008781	CTG	2	6	69720	69725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602984
1542	NC_008781	GCA	3	9	69755	69763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602984
1543	NC_008781	AGC	2	6	69772	69777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602984
1544	NC_008781	CGT	2	6	69880	69885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602984
1545	NC_008781	GC	3	6	69892	69897	0 %	0 %	50 %	50 %	121602984
1546	NC_008781	CTG	2	6	69936	69941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602984
1547	NC_008781	TTC	2	6	70092	70097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121602985
1548	NC_008781	GC	3	6	70144	70149	0 %	0 %	50 %	50 %	121602985
1549	NC_008781	GCG	2	6	70197	70202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602985
1550	NC_008781	TGC	2	6	70227	70232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602985
1551	NC_008781	CGA	2	6	70240	70245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602985
1552	NC_008781	CCG	2	6	70248	70253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602985
1553	NC_008781	GCC	2	6	70289	70294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602985
1554	NC_008781	GGC	2	6	70330	70335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602985
1555	NC_008781	GCT	2	6	70336	70341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602985
1556	NC_008781	CGCCC	2	10	70345	70354	0 %	0 %	20 %	80 %	121602985
1557	NC_008781	GC	3	6	70375	70380	0 %	0 %	50 %	50 %	121602985
1558	NC_008781	CAG	2	6	70444	70449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602985
1559	NC_008781	GC	3	6	70474	70479	0 %	0 %	50 %	50 %	121602985
1560	NC_008781	CG	3	6	70527	70532	0 %	0 %	50 %	50 %	121602985
1561	NC_008781	GCA	2	6	70588	70593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602985
1562	NC_008781	A	6	6	70691	70696	100 %	0 %	0 %	0 %	121602986
1563	NC_008781	GCT	2	6	70726	70731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602986
1564	NC_008781	GCC	2	6	70760	70765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602986
1565	NC_008781	CGC	2	6	70777	70782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602986
1566	NC_008781	CAG	2	6	70783	70788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602986
1567	NC_008781	GCT	3	9	70807	70815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602986
1568	NC_008781	CGA	2	6	70816	70821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602986
1569	NC_008781	GC	3	6	70866	70871	0 %	0 %	50 %	50 %	121602986
1570	NC_008781	CAT	2	6	70906	70911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602986
1571	NC_008781	GCG	2	6	70927	70932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602986
1572	NC_008781	ATC	2	6	70967	70972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602986
1573	NC_008781	GCC	2	6	70994	70999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602986
1574	NC_008781	CGA	2	6	71047	71052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602986
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1580	NC_008781	GC	5	10	71282	71291	0 %	0 %	50 %	50 %	121602986
1581	NC_008781	CCG	2	6	71322	71327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602986
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1591	NC_008781	GC	3	6	71721	71726	0 %	0 %	50 %	50 %	121602987
1592	NC_008781	CGC	3	9	71740	71748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602987
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1598	NC_008781	GTCG	2	8	72020	72027	0 %	25 %	50 %	25 %	121602987
1599	NC_008781	GC	3	6	72080	72085	0 %	0 %	50 %	50 %	121602987
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1602	NC_008781	CAG	2	6	72215	72220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602987
1603	NC_008781	CTC	2	6	72227	72232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121602987
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1609	NC_008781	CTT	2	6	72488	72493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121602987
1610	NC_008781	GC	3	6	72495	72500	0 %	0 %	50 %	50 %	121602987
1611	NC_008781	GAT	2	6	72512	72517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602987
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1617	NC_008781	CACCGT	2	12	72710	72721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121602987
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1620	NC_008781	GGCC	2	8	72853	72860	0 %	0 %	50 %	50 %	121602987
1621	NC_008781	CGG	2	6	72907	72912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602987
1622	NC_008781	CGG	3	9	72914	72922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602987
1623	NC_008781	TCG	2	6	72939	72944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602987
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1998	NC_008781	TGG	2	6	88908	88913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603003
1999	NC_008781	TGG	2	6	88923	88928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603003
2000	NC_008781	ATGC	2	8	89356	89363	25 %	25 %	25 %	25 %	121603004

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