MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 97707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008781	CGA	2	6	217817	217822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603125
5002	NC_008781	CG	4	8	217877	217884	0 %	0 %	50 %	50 %	121603125
5003	NC_008781	A	6	6	217969	217974	100 %	0 %	0 %	0 %	121603126
5004	NC_008781	CAACC	2	10	217976	217985	40 %	0 %	0 %	60 %	121603126
5005	NC_008781	CAA	2	6	218033	218038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603126
5006	NC_008781	GAA	3	9	218090	218098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5007	NC_008781	CG	3	6	218119	218124	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5008	NC_008781	CGT	2	6	218183	218188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5009	NC_008781	A	6	6	218196	218201	100 %	0 %	0 %	0 %	121603126
5010	NC_008781	AAG	2	6	218223	218228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5011	NC_008781	GCC	2	6	218236	218241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603126
5012	NC_008781	GAA	2	6	218271	218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603126
5013	NC_008781	CAG	2	6	218325	218330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5014	NC_008781	CAT	2	6	218342	218347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603126
5015	NC_008781	CCG	2	6	218351	218356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603126
5016	NC_008781	GC	3	6	218366	218371	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5017	NC_008781	GTC	2	6	218417	218422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5018	NC_008781	GC	3	6	218495	218500	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5019	NC_008781	ACC	2	6	218532	218537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603126
5020	NC_008781	CAT	2	6	218543	218548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603126
5021	NC_008781	GAT	2	6	218612	218617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603126
5022	NC_008781	CGA	2	6	218627	218632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5023	NC_008781	CG	3	6	218644	218649	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5024	NC_008781	GC	3	6	218692	218697	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5025	NC_008781	CG	3	6	218710	218715	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5026	NC_008781	CG	3	6	218719	218724	0 %	0 %	50 %	50 %	121603126
5027	NC_008781	ACA	3	9	218779	218787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603126
5028	NC_008781	GCA	2	6	218820	218825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603126
5029	NC_008781	TGC	2	6	218875	218880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5030	NC_008781	ACCG	2	8	218982	218989	25 %	0 %	25 %	50 %	121603127
5031	NC_008781	CGTCA	2	10	219039	219048	20 %	20 %	20 %	40 %	121603127
5032	NC_008781	GGC	2	6	219054	219059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603127
5033	NC_008781	CTG	2	6	219106	219111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5034	NC_008781	TAC	2	6	219147	219152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603127
5035	NC_008781	GAA	2	6	219204	219209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121603127
5036	NC_008781	ACG	2	6	219258	219263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603127
5037	NC_008781	ACT	2	6	219313	219318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603128
5038	NC_008781	GCA	2	6	219408	219413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603128
5039	NC_008781	CAAG	2	8	219492	219499	50 %	0 %	25 %	25 %	121603128
5040	NC_008781	AAT	2	6	219506	219511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121603128
5041	NC_008781	A	6	6	219522	219527	100 %	0 %	0 %	0 %	121603129
5042	NC_008781	GGT	2	6	219554	219559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603129
5043	NC_008781	GC	3	6	219569	219574	0 %	0 %	50 %	50 %	121603129
5044	NC_008781	CGC	2	6	219600	219605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603129
5045	NC_008781	CCAAGA	2	12	219724	219735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	121603129
5046	NC_008781	GTCGAA	2	12	220011	220022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	121603130
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5048	NC_008781	GCA	2	6	220351	220356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603130
5049	NC_008781	GCT	2	6	220445	220450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603130
5050	NC_008781	GTA	2	6	220584	220589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121603131
5051	NC_008781	GTC	2	6	220644	220649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5052	NC_008781	AGC	2	6	220660	220665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5053	NC_008781	GC	3	6	220686	220691	0 %	0 %	50 %	50 %	121603131
5054	NC_008781	TGC	2	6	220701	220706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5055	NC_008781	CAGC	2	8	220709	220716	25 %	0 %	25 %	50 %	121603131
5056	NC_008781	GCG	2	6	220734	220739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
5057	NC_008781	TTTCA	2	10	220764	220773	20 %	60 %	0 %	20 %	121603131
5058	NC_008781	GCG	2	6	220774	220779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
5059	NC_008781	GC	4	8	220802	220809	0 %	0 %	50 %	50 %	121603131
5060	NC_008781	GCA	2	6	220815	220820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603131
5061	NC_008781	CCA	2	6	220838	220843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603131
5062	NC_008781	CCG	2	6	220861	220866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603131
5063	NC_008781	CAGCT	2	10	220896	220905	20 %	20 %	20 %	40 %	121603131
5064	NC_008781	GGC	2	6	220971	220976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603131
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5069	NC_008781	AGGC	2	8	221186	221193	25 %	0 %	50 %	25 %	121603132
5070	NC_008781	CAC	2	6	221199	221204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603132
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5073	NC_008781	GCA	2	6	221252	221257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
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5077	NC_008781	CAG	3	9	221601	221609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603132
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5103	NC_008781	GC	3	6	223113	223118	0 %	0 %	50 %	50 %	121603135
5104	NC_008781	CCATGC	2	12	223147	223158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121603135
5105	NC_008781	CAG	2	6	223192	223197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603135
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5107	NC_008781	CGA	2	6	223357	223362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603135
5108	NC_008781	GAC	2	6	223366	223371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603135
5109	NC_008781	CGC	2	6	223384	223389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603135
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5119	NC_008781	CCCGA	2	10	223925	223934	20 %	0 %	20 %	60 %	121603136
5120	NC_008781	CCA	2	6	223935	223940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121603136
5121	NC_008781	ACA	2	6	223986	223991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603136
5122	NC_008781	CAT	2	6	224047	224052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603136
5123	NC_008781	GC	3	6	224078	224083	0 %	0 %	50 %	50 %	121603136
5124	NC_008781	GGC	2	6	224099	224104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
5125	NC_008781	GC	3	6	224109	224114	0 %	0 %	50 %	50 %	121603136
5126	NC_008781	GGC	2	6	224134	224139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
5127	NC_008781	ACA	2	6	224178	224183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121603136
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5129	NC_008781	TCG	2	6	224192	224197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603136
5130	NC_008781	CG	3	6	224274	224279	0 %	0 %	50 %	50 %	121603136
5131	NC_008781	CGC	2	6	224295	224300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603136
5132	NC_008781	TGAC	2	8	224361	224368	25 %	25 %	25 %	25 %	121603136
5133	NC_008781	TGC	2	6	224371	224376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603136
5134	NC_008781	GGC	2	6	224399	224404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
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5136	NC_008781	TCG	2	6	224475	224480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603136
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5141	NC_008781	GTG	2	6	224618	224623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603136
5142	NC_008781	GCC	2	6	224645	224650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603136
5143	NC_008781	GC	3	6	224663	224668	0 %	0 %	50 %	50 %	121603136
5144	NC_008781	GTG	2	6	224669	224674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603136
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5147	NC_008781	GGC	2	6	224882	224887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
5148	NC_008781	CAT	2	6	224899	224904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603136
5149	NC_008781	CGATG	2	10	224929	224938	20 %	20 %	40 %	20 %	121603136
5150	NC_008781	GCG	2	6	224939	224944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603136
5151	NC_008781	GTCG	2	8	225100	225107	0 %	25 %	50 %	25 %	121603136
5152	NC_008781	CGA	2	6	225121	225126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603136
5153	NC_008781	CTG	2	6	225128	225133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603136
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5157	NC_008781	CGC	3	9	225362	225370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603137
5158	NC_008781	TGT	2	6	225385	225390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121603137
5159	NC_008781	GTGC	2	8	225435	225442	0 %	25 %	50 %	25 %	121603137
5160	NC_008781	GGCCTG	2	12	225483	225494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121603137
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5183	NC_008781	CTG	2	6	226607	226612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603138
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5234	NC_008781	T	6	6	228802	228807	0 %	100 %	0 %	0 %	121603140
5235	NC_008781	GGC	2	6	228821	228826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603140
5236	NC_008781	TCA	2	6	228856	228861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603140
5237	NC_008781	GCC	3	9	228893	228901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603140
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5239	NC_008781	TCA	2	6	228928	228933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121603140
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5241	NC_008781	CAG	2	6	229034	229039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121603140
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5483	NC_008781	GC	3	6	241975	241980	0 %	0 %	50 %	50 %	121603152
5484	NC_008781	ACGGC	2	10	241983	241992	20 %	0 %	40 %	40 %	121603152
5485	NC_008781	GGT	2	6	242041	242046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121603152
5486	NC_008781	TGAA	2	8	242107	242114	50 %	25 %	25 %	0 %	121603152
5487	NC_008781	GCC	2	6	242193	242198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603153
5488	NC_008781	GCT	2	6	242216	242221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603153
5489	NC_008781	GC	3	6	242222	242227	0 %	0 %	50 %	50 %	121603153
5490	NC_008781	GCT	2	6	242291	242296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603153
5491	NC_008781	GGCG	2	8	242297	242304	0 %	0 %	75 %	25 %	121603153
5492	NC_008781	GCC	2	6	242322	242327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121603153
5493	NC_008781	CGGC	2	8	242428	242435	0 %	0 %	50 %	50 %	121603153
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5497	NC_008781	TGCC	2	8	242486	242493	0 %	25 %	25 %	50 %	121603153
5498	NC_008781	GGC	2	6	242498	242503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121603153
5499	NC_008781	GCT	2	6	242540	242545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121603153
5500	NC_008781	GC	3	6	242546	242551	0 %	0 %	50 %	50 %	121603153

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