MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 chromosome

Total Repeats: 97707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008781	GAA	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602920
2	NC_008781	TCG	2	6	2857	2862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
3	NC_008781	CAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602920
4	NC_008781	GCTG	2	8	2929	2936	0 %	25 %	50 %	25 %	121602920
5	NC_008781	TGC	2	6	3116	3121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
6	NC_008781	GGC	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602920
7	NC_008781	GCA	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
8	NC_008781	CGT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602920
9	NC_008781	ACCC	2	8	3152	3159	25 %	0 %	0 %	75 %	121602920
10	NC_008781	A	6	6	3195	3200	100 %	0 %	0 %	0 %	121602920
11	NC_008781	GGA	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121602920
12	NC_008781	TGT	2	6	3311	3316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
13	NC_008781	TTG	2	6	3337	3342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121602920
14	NC_008781	ACG	2	6	3412	3417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602920
15	NC_008781	ACC	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602920
16	NC_008781	TTTCG	2	10	3494	3503	0 %	60 %	20 %	20 %	121602920
17	NC_008781	GTCG	2	8	3724	3731	0 %	25 %	50 %	25 %	121602921
18	NC_008781	CG	3	6	3730	3735	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
19	NC_008781	GCT	2	6	3745	3750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
20	NC_008781	GC	3	6	3772	3777	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
21	NC_008781	GC	3	6	3788	3793	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
22	NC_008781	T	7	7	3841	3847	0 %	100 %	0 %	0 %	121602921
23	NC_008781	CGT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
24	NC_008781	GTTGCA	2	12	3900	3911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121602921
25	NC_008781	CGG	2	6	3928	3933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
26	NC_008781	GCC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602921
27	NC_008781	GTG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602921
28	NC_008781	GCT	2	6	3986	3991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
29	NC_008781	GATC	2	8	3992	3999	25 %	25 %	25 %	25 %	121602921
30	NC_008781	GCG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
31	NC_008781	CAC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602921
32	NC_008781	GCTG	2	8	4140	4147	0 %	25 %	50 %	25 %	121602921
33	NC_008781	A	6	6	4217	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	121602921
34	NC_008781	CAG	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602921
35	NC_008781	GCG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602921
36	NC_008781	CATG	2	8	4315	4322	25 %	25 %	25 %	25 %	121602921
37	NC_008781	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602921
38	NC_008781	AAGC	2	8	4369	4376	50 %	0 %	25 %	25 %	121602921
39	NC_008781	GCCG	2	8	4442	4449	0 %	0 %	50 %	50 %	121602921
40	NC_008781	T	6	6	4482	4487	0 %	100 %	0 %	0 %	121602921
41	NC_008781	ATC	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602921
42	NC_008781	A	7	7	4494	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	121602921
43	NC_008781	CAT	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602922
44	NC_008781	CAA	2	6	4756	4761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
45	NC_008781	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602922
46	NC_008781	CAA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602922
47	NC_008781	GCA	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602922
48	NC_008781	CAGTCG	2	12	4909	4920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121602922
49	NC_008781	TGGC	2	8	5098	5105	0 %	25 %	50 %	25 %	121602923
50	NC_008781	TGGT	2	8	5169	5176	0 %	50 %	50 %	0 %	121602923
51	NC_008781	GCA	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602923
52	NC_008781	GTG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602923
53	NC_008781	GCC	2	6	5236	5241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
54	NC_008781	CTGGC	2	10	5258	5267	0 %	20 %	40 %	40 %	121602923
55	NC_008781	GGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
56	NC_008781	CTG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
57	NC_008781	TGC	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602923
58	NC_008781	CG	3	6	5456	5461	0 %	0 %	50 %	50 %	121602923
59	NC_008781	CGG	2	6	5499	5504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602923
60	NC_008781	GCC	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602923
61	NC_008781	TCCC	2	8	5879	5886	0 %	25 %	0 %	75 %	121602924
62	NC_008781	AGC	3	9	5898	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
63	NC_008781	TTCC	2	8	5922	5929	0 %	50 %	0 %	50 %	121602924
64	NC_008781	CGG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
65	NC_008781	GGCGTG	2	12	6059	6070	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	121602924
66	NC_008781	GGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
67	NC_008781	GCAG	2	8	6122	6129	25 %	0 %	50 %	25 %	121602924
68	NC_008781	AGC	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602924
69	NC_008781	GGC	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
70	NC_008781	GGTG	2	8	6190	6197	0 %	25 %	75 %	0 %	121602924
71	NC_008781	GGC	2	6	6257	6262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
72	NC_008781	CGG	2	6	6286	6291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
73	NC_008781	GCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
74	NC_008781	GC	3	6	6313	6318	0 %	0 %	50 %	50 %	121602924
75	NC_008781	GCG	2	6	6360	6365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
76	NC_008781	GCC	2	6	6371	6376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602924
77	NC_008781	GCG	2	6	6390	6395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602924
78	NC_008781	GGCC	2	8	6475	6482	0 %	0 %	50 %	50 %	121602924
79	NC_008781	TTGATG	2	12	6735	6746	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	121602925
80	NC_008781	GAT	2	6	6836	6841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602925
81	NC_008781	T	7	7	6871	6877	0 %	100 %	0 %	0 %	121602925
82	NC_008781	AGGA	2	8	6891	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	121602925
83	NC_008781	T	6	6	6916	6921	0 %	100 %	0 %	0 %	121602926
84	NC_008781	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121602926
85	NC_008781	CCG	2	6	7054	7059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
86	NC_008781	GCA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602926
87	NC_008781	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602926
88	NC_008781	CGC	2	6	7222	7227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
89	NC_008781	GC	3	6	7236	7241	0 %	0 %	50 %	50 %	121602926
90	NC_008781	GAC	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602926
91	NC_008781	TCG	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602926
92	NC_008781	GC	3	6	7348	7353	0 %	0 %	50 %	50 %	121602926
93	NC_008781	CGG	2	6	7366	7371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
94	NC_008781	CGC	2	6	7403	7408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
95	NC_008781	GGC	2	6	7472	7477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
96	NC_008781	TGA	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602926
97	NC_008781	CGG	2	6	7630	7635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602926
98	NC_008781	TGG	3	9	7678	7686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602926
99	NC_008781	CGC	2	6	7696	7701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602926
100	NC_008781	CCA	2	6	7915	7920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602927
101	NC_008781	GGC	2	6	7953	7958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
102	NC_008781	CAG	2	6	7997	8002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
103	NC_008781	GC	3	6	8030	8035	0 %	0 %	50 %	50 %	121602927
104	NC_008781	CG	4	8	8047	8054	0 %	0 %	50 %	50 %	121602927
105	NC_008781	CTG	2	6	8171	8176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602927
106	NC_008781	GC	3	6	8206	8211	0 %	0 %	50 %	50 %	121602927
107	NC_008781	GCG	3	9	8215	8223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
108	NC_008781	TGC	3	9	8238	8246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602927
109	NC_008781	GCGGG	2	10	8254	8263	0 %	0 %	80 %	20 %	121602927
110	NC_008781	GCG	2	6	8277	8282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
111	NC_008781	CGGG	2	8	8285	8292	0 %	0 %	75 %	25 %	121602927
112	NC_008781	CAG	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
113	NC_008781	GCG	2	6	8340	8345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
114	NC_008781	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602927
115	NC_008781	GCA	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
116	NC_008781	AATC	2	8	8425	8432	50 %	25 %	0 %	25 %	121602927
117	NC_008781	GCG	2	6	8464	8469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602927
118	NC_008781	A	6	6	8499	8504	100 %	0 %	0 %	0 %	121602927
119	NC_008781	CG	3	6	8536	8541	0 %	0 %	50 %	50 %	121602927
120	NC_008781	GCC	2	6	8547	8552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602927
121	NC_008781	AGC	3	9	8568	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
122	NC_008781	GGT	2	6	8612	8617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602927
123	NC_008781	GCA	2	6	8625	8630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602927
124	NC_008781	GTCATG	2	12	8631	8642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	121602927
125	NC_008781	TTGT	2	8	8878	8885	0 %	75 %	25 %	0 %	121602928
126	NC_008781	CGGC	2	8	8906	8913	0 %	0 %	50 %	50 %	121602928
127	NC_008781	CCG	2	6	8946	8951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602928
128	NC_008781	GC	3	6	8987	8992	0 %	0 %	50 %	50 %	121602928
129	NC_008781	CCTG	2	8	9005	9012	0 %	25 %	25 %	50 %	121602928
130	NC_008781	TGG	2	6	9017	9022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602928
131	NC_008781	AAC	2	6	9143	9148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121602929
132	NC_008781	CCAT	2	8	9156	9163	25 %	25 %	0 %	50 %	121602929
133	NC_008781	CGA	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602929
134	NC_008781	GC	3	6	9193	9198	0 %	0 %	50 %	50 %	121602929
135	NC_008781	GCC	2	6	9245	9250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602929
136	NC_008781	CG	3	6	9279	9284	0 %	0 %	50 %	50 %	121602929
137	NC_008781	TGC	2	6	9288	9293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602929
138	NC_008781	TCA	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121602929
139	NC_008781	GCG	2	6	9420	9425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602929
140	NC_008781	GTCAT	2	10	9426	9435	20 %	40 %	20 %	20 %	121602929
141	NC_008781	CAC	2	6	9454	9459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602929
142	NC_008781	GCT	2	6	9478	9483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602929
143	NC_008781	CG	3	6	9503	9508	0 %	0 %	50 %	50 %	121602929
144	NC_008781	GAT	2	6	9512	9517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602929
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148	NC_008781	GCCT	2	8	9643	9650	0 %	25 %	25 %	50 %	121602930
149	NC_008781	CGG	2	6	9688	9693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
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151	NC_008781	GCA	2	6	9706	9711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
152	NC_008781	TAA	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121602930
153	NC_008781	ACG	2	6	9720	9725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
154	NC_008781	CCA	2	6	9733	9738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
155	NC_008781	CAG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
156	NC_008781	CAG	2	6	9776	9781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
157	NC_008781	CAG	3	9	9851	9859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
158	NC_008781	GCT	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121602930
159	NC_008781	GCA	2	6	9895	9900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
160	NC_008781	CAG	2	6	9923	9928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
161	NC_008781	CGCAGG	2	12	9999	10010	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121602930
162	NC_008781	AGGCGC	2	12	10027	10038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	121602930
163	NC_008781	CAG	2	6	10061	10066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
164	NC_008781	GGC	2	6	10125	10130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602930
165	NC_008781	CAG	3	9	10154	10162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602930
166	NC_008781	ATG	2	6	10197	10202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602930
167	NC_008781	CGC	2	6	10261	10266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602930
168	NC_008781	ACC	2	6	10269	10274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602930
169	NC_008781	GAGGTT	2	12	10280	10291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	121602930
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244	NC_008781	GAG	2	6	13521	13526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121602933
245	NC_008781	CATT	2	8	13597	13604	25 %	50 %	0 %	25 %	121602934
246	NC_008781	GC	3	6	13652	13657	0 %	0 %	50 %	50 %	121602934
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248	NC_008781	TGG	2	6	13743	13748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121602934
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251	NC_008781	CAC	2	6	13876	13881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121602934
252	NC_008781	CGGC	2	8	13895	13902	0 %	0 %	50 %	50 %	121602934
253	NC_008781	CCG	2	6	13925	13930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602934
254	NC_008781	TCC	2	6	13949	13954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121602934
255	NC_008781	GCC	2	6	13990	13995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602934
256	NC_008781	GAT	2	6	14068	14073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121602934
257	NC_008781	GCG	2	6	14084	14089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602934
258	NC_008781	AGC	2	6	14151	14156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602934
259	NC_008781	GATG	2	8	14208	14215	25 %	25 %	50 %	0 %	121602934
260	NC_008781	CAG	2	6	14236	14241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121602934
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391	NC_008781	CCG	2	6	20816	20821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121602940
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394	NC_008781	GC	3	6	20916	20921	0 %	0 %	50 %	50 %	121602940
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498	NC_008781	CGCC	2	8	24639	24646	0 %	0 %	25 %	75 %	121602945
499	NC_008781	A	6	6	24650	24655	100 %	0 %	0 %	0 %	121602945
500	NC_008781	CGG	2	6	24666	24671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121602945

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