MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02

Total Repeats: 3101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008758	CAT	2	6	118580	118585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583125
2002	NC_008758	TCG	2	6	118608	118613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583125
2003	NC_008758	GGT	2	6	118621	118626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583125
2004	NC_008758	ACC	2	6	118809	118814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2005	NC_008758	CAC	2	6	118886	118891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2006	NC_008758	CCA	2	6	118900	118905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2007	NC_008758	GTT	2	6	118925	118930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121583125
2008	NC_008758	ACC	2	6	118965	118970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583125
2009	NC_008758	GGC	2	6	118981	118986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583125
2010	NC_008758	GCG	2	6	119002	119007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583125
2011	NC_008758	CAGG	2	8	119041	119048	25 %	0 %	50 %	25 %	121583125
2012	NC_008758	GCAGCC	2	12	119073	119084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583125
2013	NC_008758	CCG	2	6	119086	119091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583125
2014	NC_008758	GCGCCA	2	12	119100	119111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	121583125
2015	NC_008758	TTC	2	6	119122	119127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121583125
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2017	NC_008758	CTG	2	6	119213	119218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2020	NC_008758	CTG	2	6	119292	119297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2022	NC_008758	GCA	2	6	119387	119392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2024	NC_008758	CGT	2	6	119453	119458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2042	NC_008758	CTG	2	6	120072	120077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2049	NC_008758	TGC	2	6	120448	120453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583126
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2055	NC_008758	TTTC	2	8	120735	120742	0 %	75 %	0 %	25 %	121583127
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2057	NC_008758	GGTA	2	8	120770	120777	25 %	25 %	50 %	0 %	121583127
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2120	NC_008758	CCGT	2	8	124182	124189	0 %	25 %	25 %	50 %	121583131
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2122	NC_008758	TGC	2	6	124484	124489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583132
2123	NC_008758	GGC	2	6	124647	124652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583132
2124	NC_008758	CGAG	2	8	124667	124674	25 %	0 %	50 %	25 %	121583132
2125	NC_008758	CCG	2	6	124808	124813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583132
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2142	NC_008758	AGCAA	2	10	126215	126224	60 %	0 %	20 %	20 %	121583134
2143	NC_008758	ATCG	2	8	126338	126345	25 %	25 %	25 %	25 %	121583135
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2145	NC_008758	TGC	2	6	126405	126410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583135
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2152	NC_008758	A	6	6	126944	126949	100 %	0 %	0 %	0 %	121583135
2153	NC_008758	CCGCG	2	10	126984	126993	0 %	0 %	40 %	60 %	121583135
2154	NC_008758	ACA	2	6	127127	127132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121583135
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2240	NC_008758	G	6	6	132605	132610	0 %	0 %	100 %	0 %	121583139
2241	NC_008758	GGC	2	6	132627	132632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583139
2242	NC_008758	CGCT	2	8	132666	132673	0 %	25 %	25 %	50 %	121583139
2243	NC_008758	GGCGC	2	10	132711	132720	0 %	0 %	60 %	40 %	121583139
2244	NC_008758	TCAG	2	8	132721	132728	25 %	25 %	25 %	25 %	121583139
2245	NC_008758	GTG	2	6	132753	132758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121583139
2246	NC_008758	CTG	2	6	132796	132801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583139
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2249	NC_008758	CA	3	6	132950	132955	50 %	0 %	0 %	50 %	121583139
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2351	NC_008758	GCGCG	2	10	137762	137771	0 %	0 %	60 %	40 %	121583143
2352	NC_008758	CAT	2	6	137772	137777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583143
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2354	NC_008758	GTC	2	6	137814	137819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583143
2355	NC_008758	GCC	2	6	137820	137825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583143
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2357	NC_008758	CCA	2	6	137939	137944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121583143
2358	NC_008758	GCA	2	6	137978	137983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121583143
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2360	NC_008758	T	7	7	138017	138023	0 %	100 %	0 %	0 %	121583143
2361	NC_008758	GCCA	2	8	138115	138122	25 %	0 %	25 %	50 %	121583143
2362	NC_008758	CCAGA	2	10	138129	138138	40 %	0 %	20 %	40 %	121583143
2363	NC_008758	CTG	2	6	138144	138149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583143
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2365	NC_008758	TGC	2	6	138477	138482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583144
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2472	NC_008758	GCAA	2	8	148567	148574	50 %	0 %	25 %	25 %	121583153
2473	NC_008758	TGGAC	2	10	148605	148614	20 %	20 %	40 %	20 %	121583153
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2476	NC_008758	CAAG	2	8	148669	148676	50 %	0 %	25 %	25 %	121583153
2477	NC_008758	GGCT	2	8	148755	148762	0 %	25 %	50 %	25 %	121583153
2478	NC_008758	GAA	2	6	148845	148850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121583153
2479	NC_008758	A	9	9	148849	148857	100 %	0 %	0 %	0 %	121583153
2480	NC_008758	ATC	3	9	148926	148934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121583153
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2482	NC_008758	GC	3	6	149019	149024	0 %	0 %	50 %	50 %	121583153
2483	NC_008758	CGG	2	6	149026	149031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121583153
2484	NC_008758	TCG	3	9	149038	149046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121583153
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2486	NC_008758	GCGA	2	8	149157	149164	25 %	0 %	50 %	25 %	121583153
2487	NC_008758	AGT	2	6	149168	149173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121583153
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2489	NC_008758	CGC	2	6	149262	149267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583153
2490	NC_008758	CCG	2	6	149269	149274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121583153
2491	NC_008758	TGCT	2	8	149303	149310	0 %	50 %	25 %	25 %	121583153
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