MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus denitrificans PD1222 chromosome 2

Total Repeats: 39165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008687	GAA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119385558
2	NC_008687	TCG	2	6	448	453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385558
3	NC_008687	CCA	2	6	517	522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385558
4	NC_008687	CTT	2	6	539	544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119385558
5	NC_008687	CGA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385558
6	NC_008687	GGC	2	6	603	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385558
7	NC_008687	CGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385558
8	NC_008687	CG	3	6	691	696	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
9	NC_008687	GGC	2	6	716	721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385558
10	NC_008687	CGC	3	9	785	793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385558
11	NC_008687	CCG	2	6	794	799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385558
12	NC_008687	GGGC	2	8	809	816	0 %	0 %	75 %	25 %	119385558
13	NC_008687	CGG	2	6	845	850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385558
14	NC_008687	AGATCC	2	12	895	906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119385558
15	NC_008687	GC	3	6	918	923	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
16	NC_008687	AGG	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119385558
17	NC_008687	TTC	2	6	1080	1085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119385558
18	NC_008687	CG	3	6	1140	1145	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
19	NC_008687	CCGA	2	8	1218	1225	25 %	0 %	25 %	50 %	119385558
20	NC_008687	CG	3	6	1272	1277	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
21	NC_008687	CTG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385558
22	NC_008687	GC	3	6	1360	1365	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
23	NC_008687	GC	3	6	1448	1453	0 %	0 %	50 %	50 %	119385558
24	NC_008687	TCGA	2	8	1470	1477	25 %	25 %	25 %	25 %	119385558
25	NC_008687	ACA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119385558
26	NC_008687	CGG	2	6	1634	1639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385558
27	NC_008687	CAC	2	6	1649	1654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385558
28	NC_008687	CAT	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119385558
29	NC_008687	GAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119385558
30	NC_008687	GAA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119385558
31	NC_008687	CTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385558
32	NC_008687	CGC	2	6	1731	1736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385558
33	NC_008687	CTG	2	6	1737	1742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385558
34	NC_008687	TCGA	2	8	1852	1859	25 %	25 %	25 %	25 %	119385559
35	NC_008687	CGC	2	6	1909	1914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385559
36	NC_008687	CG	3	6	2008	2013	0 %	0 %	50 %	50 %	119385559
37	NC_008687	CCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385559
38	NC_008687	GC	3	6	2093	2098	0 %	0 %	50 %	50 %	119385559
39	NC_008687	GCC	2	6	2119	2124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385559
40	NC_008687	GGC	2	6	2129	2134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385559
41	NC_008687	CG	3	6	2180	2185	0 %	0 %	50 %	50 %	119385559
42	NC_008687	TCG	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385559
43	NC_008687	CGC	2	6	2238	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385559
44	NC_008687	TGC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385559
45	NC_008687	GGC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385559
46	NC_008687	CGAA	2	8	2285	2292	50 %	0 %	25 %	25 %	119385559
47	NC_008687	TAT	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119385559
48	NC_008687	CTGCG	2	10	2356	2365	0 %	20 %	40 %	40 %	119385559
49	NC_008687	CGAC	2	8	2369	2376	25 %	0 %	25 %	50 %	119385559
50	NC_008687	CGG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385559
51	NC_008687	GCT	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385559
52	NC_008687	CGA	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385559
53	NC_008687	CAG	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385559
54	NC_008687	CG	3	6	2693	2698	0 %	0 %	50 %	50 %	119385559
55	NC_008687	TGA	2	6	2766	2771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119385559
56	NC_008687	CGA	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385559
57	NC_008687	GCCA	2	8	2842	2849	25 %	0 %	25 %	50 %	119385559
58	NC_008687	GCG	2	6	2915	2920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385559
59	NC_008687	GTC	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385559
60	NC_008687	CTG	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385560
61	NC_008687	ACC	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385560
62	NC_008687	CCAT	2	8	3037	3044	25 %	25 %	0 %	50 %	119385560
63	NC_008687	GGGC	2	8	3055	3062	0 %	0 %	75 %	25 %	119385560
64	NC_008687	CCGG	2	8	3100	3107	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
65	NC_008687	GCG	2	6	3115	3120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
66	NC_008687	CG	3	6	3204	3209	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
67	NC_008687	CG	3	6	3223	3228	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
68	NC_008687	GGT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119385560
69	NC_008687	CGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385560
70	NC_008687	CGCC	2	8	3298	3305	0 %	0 %	25 %	75 %	119385560
71	NC_008687	GCG	3	9	3338	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
72	NC_008687	GCT	2	6	3434	3439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385560
73	NC_008687	CGA	2	6	3443	3448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385560
74	NC_008687	CG	3	6	3471	3476	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
75	NC_008687	GCG	2	6	3504	3509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
76	NC_008687	GGC	2	6	3548	3553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
77	NC_008687	AGG	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119385560
78	NC_008687	CGA	2	6	3620	3625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385560
79	NC_008687	CGC	2	6	3644	3649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385560
80	NC_008687	GCCGCG	2	12	3664	3675	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
81	NC_008687	GGC	2	6	3680	3685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
82	NC_008687	CGC	2	6	3752	3757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385560
83	NC_008687	GCT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385560
84	NC_008687	TGC	3	9	3841	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385560
85	NC_008687	CGA	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385560
86	NC_008687	GGC	2	6	3860	3865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385560
87	NC_008687	CCG	2	6	3881	3886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385560
88	NC_008687	ACG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385560
89	NC_008687	GC	3	6	3910	3915	0 %	0 %	50 %	50 %	119385560
90	NC_008687	GGT	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119385560
91	NC_008687	CGAGGC	2	12	4001	4012	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119385560
92	NC_008687	CAT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119385560
93	NC_008687	CCA	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
94	NC_008687	CGA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385561
95	NC_008687	CAC	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
96	NC_008687	CAG	2	6	4155	4160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385561
97	NC_008687	TGC	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
98	NC_008687	GTT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119385561
99	NC_008687	CGG	3	9	4244	4252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385561
100	NC_008687	CGC	3	9	4325	4333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385561
101	NC_008687	GGT	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119385561
102	NC_008687	CGC	4	12	4353	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385561
103	NC_008687	CGGT	2	8	4375	4382	0 %	25 %	50 %	25 %	119385561
104	NC_008687	CGA	3	9	4385	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385561
105	NC_008687	TGG	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119385561
106	NC_008687	CAC	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
107	NC_008687	GCC	2	6	4479	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385561
108	NC_008687	GC	3	6	4574	4579	0 %	0 %	50 %	50 %	119385561
109	NC_008687	GACGCG	2	12	4611	4622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119385561
110	NC_008687	CG	4	8	4619	4626	0 %	0 %	50 %	50 %	119385561
111	NC_008687	CG	3	6	4691	4696	0 %	0 %	50 %	50 %	119385561
112	NC_008687	CAG	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385561
113	NC_008687	ACC	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
114	NC_008687	CCGC	2	8	4820	4827	0 %	0 %	25 %	75 %	119385561
115	NC_008687	TGC	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
116	NC_008687	TGGC	2	8	4870	4877	0 %	25 %	50 %	25 %	119385561
117	NC_008687	TCG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
118	NC_008687	CCA	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
119	NC_008687	CAC	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119385561
120	NC_008687	GTC	2	6	4989	4994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
121	NC_008687	CAT	2	6	5085	5090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119385561
122	NC_008687	GTC	2	6	5148	5153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
123	NC_008687	GCC	2	6	5160	5165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385561
124	NC_008687	GCC	2	6	5214	5219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119385561
125	NC_008687	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385561
126	NC_008687	GGC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385561
127	NC_008687	TCA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119385561
128	NC_008687	GGT	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119385561
129	NC_008687	GC	3	6	5399	5404	0 %	0 %	50 %	50 %	119385561
130	NC_008687	GCA	2	6	5438	5443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119385561
131	NC_008687	TCG	2	6	5516	5521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119385561
132	NC_008687	CGG	2	6	5543	5548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119385561
133	NC_008687	GCCG	2	8	5553	5560	0 %	0 %	50 %	50 %	119385561
134	NC_008687	CCGA	2	8	5653	5660	25 %	0 %	25 %	50 %	119385561
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