MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Paracoccus denitrificans PD1222 chromosome 1

Total Repeats: 63857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008686	CGCT	2	8	186	193	0 %	25 %	25 %	50 %	119382758
2	NC_008686	TGC	2	6	342	347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382758
3	NC_008686	GAT	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
4	NC_008686	TGGAC	2	10	420	429	20 %	20 %	40 %	20 %	119382758
5	NC_008686	GAT	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
6	NC_008686	TGGC	2	8	488	495	0 %	25 %	50 %	25 %	119382758
7	NC_008686	CGGC	2	8	535	542	0 %	0 %	50 %	50 %	119382758
8	NC_008686	ATG	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382758
9	NC_008686	AGA	2	6	615	620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382758
10	NC_008686	GC	3	6	723	728	0 %	0 %	50 %	50 %	119382759
11	NC_008686	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382759
12	NC_008686	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
13	NC_008686	GAG	2	6	811	816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382759
14	NC_008686	GAT	2	6	855	860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382759
15	NC_008686	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382759
16	NC_008686	CGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
17	NC_008686	GAAC	2	8	1074	1081	50 %	0 %	25 %	25 %	119382759
18	NC_008686	CGC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382759
19	NC_008686	CGAA	2	8	1178	1185	50 %	0 %	25 %	25 %	119382759
20	NC_008686	ATC	2	6	1237	1242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382759
21	NC_008686	TGG	2	6	1247	1252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382759
22	NC_008686	CGTT	2	8	1273	1280	0 %	50 %	25 %	25 %	119382759
23	NC_008686	GCC	2	6	1290	1295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382759
24	NC_008686	TGC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
25	NC_008686	TCGA	2	8	1336	1343	25 %	25 %	25 %	25 %	119382759
26	NC_008686	TGC	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
27	NC_008686	CGA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
28	NC_008686	CGA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382759
29	NC_008686	TGT	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119382759
30	NC_008686	TTC	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382759
31	NC_008686	GTG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382759
32	NC_008686	CGG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382759
33	NC_008686	CAT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382759
34	NC_008686	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382759
35	NC_008686	CTG	2	6	1900	1905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382759
36	NC_008686	AGACCA	2	12	1970	1981	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	119382759
37	NC_008686	TTC	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382759
38	NC_008686	CCCG	2	8	2056	2063	0 %	0 %	25 %	75 %	119382760
39	NC_008686	CTGG	2	8	2126	2133	0 %	25 %	50 %	25 %	119382760
40	NC_008686	GGC	2	6	2155	2160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
41	NC_008686	CGA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
42	NC_008686	CG	3	6	2198	2203	0 %	0 %	50 %	50 %	119382760
43	NC_008686	CTGCAT	2	12	2258	2269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119382760
44	NC_008686	GC	3	6	2271	2276	0 %	0 %	50 %	50 %	119382760
45	NC_008686	GCG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
46	NC_008686	GC	3	6	2353	2358	0 %	0 %	50 %	50 %	119382760
47	NC_008686	GCCGAA	2	12	2384	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
48	NC_008686	GCGA	2	8	2449	2456	25 %	0 %	50 %	25 %	119382760
49	NC_008686	CGA	2	6	2482	2487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
50	NC_008686	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382760
51	NC_008686	CCG	2	6	2684	2689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382760
52	NC_008686	GTCG	2	8	2920	2927	0 %	25 %	50 %	25 %	119382760
53	NC_008686	GAA	2	6	2939	2944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382760
54	NC_008686	GTTG	2	8	3094	3101	0 %	50 %	50 %	0 %	119382760
55	NC_008686	GGCA	2	8	3111	3118	25 %	0 %	50 %	25 %	119382760
56	NC_008686	GC	3	6	3130	3135	0 %	0 %	50 %	50 %	119382760
57	NC_008686	GGC	2	6	3139	3144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382760
58	NC_008686	GAC	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382760
59	NC_008686	GGCA	2	8	3195	3202	25 %	0 %	50 %	25 %	119382760
60	NC_008686	GAT	2	6	3217	3222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382760
61	NC_008686	TGG	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382761
62	NC_008686	CGA	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
63	NC_008686	G	6	6	3442	3447	0 %	0 %	100 %	0 %	119382761
64	NC_008686	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
65	NC_008686	GCG	2	6	3610	3615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
66	NC_008686	GTCT	2	8	3638	3645	0 %	50 %	25 %	25 %	119382761
67	NC_008686	GAT	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
68	NC_008686	ATC	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
69	NC_008686	ACC	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382761
70	NC_008686	GCC	2	6	3794	3799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
71	NC_008686	CGCTT	2	10	3840	3849	0 %	40 %	20 %	40 %	119382761
72	NC_008686	CAG	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
73	NC_008686	TGA	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
74	NC_008686	AC	4	8	4034	4041	50 %	0 %	0 %	50 %	119382761
75	NC_008686	AAT	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119382761
76	NC_008686	G	6	6	4081	4086	0 %	0 %	100 %	0 %	119382761
77	NC_008686	GTC	2	6	4135	4140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
78	NC_008686	ACG	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
79	NC_008686	GGC	3	9	4422	4430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
80	NC_008686	TGA	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
81	NC_008686	GAT	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
82	NC_008686	CAC	2	6	4536	4541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382761
83	NC_008686	GCG	2	6	4695	4700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
84	NC_008686	GCG	2	6	4708	4713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382761
85	NC_008686	CTG	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
86	NC_008686	CAG	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
87	NC_008686	GAT	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
88	NC_008686	CAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
89	NC_008686	ATC	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382761
90	NC_008686	GCT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382761
91	NC_008686	ACG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382761
92	NC_008686	GCTG	2	8	5064	5071	0 %	25 %	50 %	25 %	119382761
93	NC_008686	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382761
94	NC_008686	TGA	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382761
95	NC_008686	GCT	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382762
96	NC_008686	TGC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382762
97	NC_008686	GAA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382762
98	NC_008686	TGG	2	6	5401	5406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382762
99	NC_008686	CGCA	2	8	5464	5471	25 %	0 %	25 %	50 %	119382762
100	NC_008686	GCC	2	6	5514	5519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382762
101	NC_008686	TGA	2	6	5605	5610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382762
102	NC_008686	CCA	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119382762
103	NC_008686	AC	3	6	5738	5743	50 %	0 %	0 %	50 %	119382762
104	NC_008686	CAT	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382763
105	NC_008686	CAAT	2	8	5795	5802	50 %	25 %	0 %	25 %	119382763
106	NC_008686	TTGACC	2	12	5846	5857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119382763
107	NC_008686	GAA	2	6	5896	5901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382763
108	NC_008686	CTG	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
109	NC_008686	GC	3	6	5937	5942	0 %	0 %	50 %	50 %	119382763
110	NC_008686	CGT	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
111	NC_008686	CGG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382763
112	NC_008686	CCG	2	6	6112	6117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382763
113	NC_008686	CTT	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382763
114	NC_008686	TGG	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119382763
115	NC_008686	TGA	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382763
116	NC_008686	TGC	2	6	6275	6280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
117	NC_008686	AAC	2	6	6301	6306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119382763
118	NC_008686	GC	3	6	6331	6336	0 %	0 %	50 %	50 %	119382763
119	NC_008686	CATGC	2	10	6406	6415	20 %	20 %	20 %	40 %	119382763
120	NC_008686	TGC	2	6	6419	6424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382763
121	NC_008686	GAG	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382763
122	NC_008686	TTCC	2	8	6590	6597	0 %	50 %	0 %	50 %	119382764
123	NC_008686	CGC	2	6	6661	6666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382764
124	NC_008686	TGC	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
125	NC_008686	CCGA	2	8	6751	6758	25 %	0 %	25 %	50 %	119382764
126	NC_008686	GAG	2	6	6919	6924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382764
127	NC_008686	CTT	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119382764
128	NC_008686	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
129	NC_008686	GCT	2	6	7026	7031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382764
130	NC_008686	AAGG	2	8	7063	7070	50 %	0 %	50 %	0 %	119382764
131	NC_008686	GC	3	6	7129	7134	0 %	0 %	50 %	50 %	119382764
132	NC_008686	GAA	2	6	7146	7151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382764
133	NC_008686	GAA	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119382764
134	NC_008686	GCCA	2	8	7225	7232	25 %	0 %	25 %	50 %	119382764
135	NC_008686	CG	3	6	7252	7257	0 %	0 %	50 %	50 %	119382764
136	NC_008686	GCA	2	6	7567	7572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
137	NC_008686	GTCG	2	8	7573	7580	0 %	25 %	50 %	25 %	119382765
138	NC_008686	GCA	2	6	7582	7587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
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142	NC_008686	GTT	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119382765
143	NC_008686	GCG	4	12	7773	7784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382765
144	NC_008686	GGC	2	6	7799	7804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382765
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146	NC_008686	GCA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382765
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150	NC_008686	CGGC	2	8	8005	8012	0 %	0 %	50 %	50 %	119382765
151	NC_008686	GAT	2	6	8018	8023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119382765
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155	NC_008686	TCGG	2	8	8193	8200	0 %	25 %	50 %	25 %	119382766
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158	NC_008686	A	6	6	8243	8248	100 %	0 %	0 %	0 %	119382766
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160	NC_008686	TCG	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382766
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259	NC_008686	GCC	2	6	13235	13240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119382773
260	NC_008686	CGA	2	6	13348	13353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119382773
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262	NC_008686	CCTG	2	8	13512	13519	0 %	25 %	25 %	50 %	119382773
263	NC_008686	CGGA	2	8	13578	13585	25 %	0 %	50 %	25 %	119382773
264	NC_008686	GCT	2	6	13635	13640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382773
265	NC_008686	TGC	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119382773
266	NC_008686	GCG	2	6	13731	13736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119382773
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270	NC_008686	ATC	2	6	13865	13870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119382773
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375	NC_008686	GAG	2	6	18181	18186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119382777
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