MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pediococcus pentosaceus ATCC 25745

Total Repeats: 34093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008525	AAC	2	6	74	79	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491819
2	NC_008525	GAC	2	6	101	106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491819
3	NC_008525	GCA	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491819
4	NC_008525	A	6	6	341	346	100 %	0 %	0 %	0 %	116491819
5	NC_008525	TAG	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491819
6	NC_008525	TA	3	6	474	479	50 %	50 %	0 %	0 %	116491819
7	NC_008525	GGA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116491819
8	NC_008525	ATGC	2	8	527	534	25 %	25 %	25 %	25 %	116491819
9	NC_008525	TTA	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491819
10	NC_008525	TAG	2	6	681	686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491819
11	NC_008525	ATG	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491819
12	NC_008525	T	6	6	698	703	0 %	100 %	0 %	0 %	116491819
13	NC_008525	AAG	2	6	711	716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491819
14	NC_008525	ACC	2	6	1046	1051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116491819
15	NC_008525	GAAA	2	8	1173	1180	75 %	0 %	25 %	0 %	116491819
16	NC_008525	TATC	2	8	1220	1227	25 %	50 %	0 %	25 %	116491819
17	NC_008525	TGG	2	6	1273	1278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116491819
18	NC_008525	TAC	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491819
19	NC_008525	ATTC	2	8	1298	1305	25 %	50 %	0 %	25 %	116491819
20	NC_008525	A	6	6	1601	1606	100 %	0 %	0 %	0 %	116491820
21	NC_008525	TCT	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116491820
22	NC_008525	AGA	3	9	1678	1686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491820
23	NC_008525	ACC	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116491820
24	NC_008525	GAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491820
25	NC_008525	TTC	2	6	1805	1810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116491820
26	NC_008525	A	6	6	1823	1828	100 %	0 %	0 %	0 %	116491820
27	NC_008525	ACA	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491820
28	NC_008525	TAA	2	6	1924	1929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116491820
29	NC_008525	AAC	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491820
30	NC_008525	GTC	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116491820
31	NC_008525	AAAT	2	8	2077	2084	75 %	25 %	0 %	0 %	116491820
32	NC_008525	TAAT	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	116491820
33	NC_008525	ATC	2	6	2168	2173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491820
34	NC_008525	GAT	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491820
35	NC_008525	ATT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491820
36	NC_008525	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491820
37	NC_008525	TATTC	2	10	2280	2289	20 %	60 %	0 %	20 %	116491820
38	NC_008525	CAAG	2	8	2458	2465	50 %	0 %	25 %	25 %	116491820
39	NC_008525	ATC	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491820
40	NC_008525	AGA	3	9	2503	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491820
41	NC_008525	ACAT	2	8	2596	2603	50 %	25 %	0 %	25 %	116491820
42	NC_008525	TAA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116491820
43	NC_008525	TTA	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491821
44	NC_008525	AGA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491821
45	NC_008525	TAT	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491821
46	NC_008525	TGG	2	6	3005	3010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116491821
47	NC_008525	GAT	2	6	3063	3068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491821
48	NC_008525	A	7	7	3077	3083	100 %	0 %	0 %	0 %	116491821
49	NC_008525	GAT	2	6	3093	3098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491821
50	NC_008525	TTG	2	6	3204	3209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116491822
51	NC_008525	GTTCG	2	10	3214	3223	0 %	40 %	40 %	20 %	116491822
52	NC_008525	TATT	2	8	3280	3287	25 %	75 %	0 %	0 %	116491822
53	NC_008525	AGC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491822
54	NC_008525	AC	3	6	3385	3390	50 %	0 %	0 %	50 %	116491822
55	NC_008525	TTTG	2	8	3496	3503	0 %	75 %	25 %	0 %	116491822
56	NC_008525	CAG	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491822
57	NC_008525	TA	3	6	3594	3599	50 %	50 %	0 %	0 %	116491822
58	NC_008525	TTTA	2	8	3681	3688	25 %	75 %	0 %	0 %	116491822
59	NC_008525	AGC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491822
60	NC_008525	GAA	2	6	3754	3759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491822
61	NC_008525	GAAAA	2	10	3804	3813	80 %	0 %	20 %	0 %	116491822
62	NC_008525	AGT	2	6	3842	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491822
63	NC_008525	TAC	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491822
64	NC_008525	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	116491822
65	NC_008525	GCA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491822
66	NC_008525	CAA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491822
67	NC_008525	CAA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491822
68	NC_008525	TTGAT	2	10	4053	4062	20 %	60 %	20 %	0 %	116491822
69	NC_008525	AGA	2	6	4066	4071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491822
70	NC_008525	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491822
71	NC_008525	GTC	2	6	4128	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116491822
72	NC_008525	AC	3	6	4136	4141	50 %	0 %	0 %	50 %	116491822
73	NC_008525	TCA	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491822
74	NC_008525	ACC	2	6	4184	4189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116491822
75	NC_008525	GTG	2	6	4197	4202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116491822
76	NC_008525	CAA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491822
77	NC_008525	TTAA	2	8	4214	4221	50 %	50 %	0 %	0 %	116491822
78	NC_008525	AGG	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116491822
79	NC_008525	ATG	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
80	NC_008525	TTTGG	2	10	4424	4433	0 %	60 %	40 %	0 %	116491823
81	NC_008525	ATT	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491823
82	NC_008525	TGA	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
83	NC_008525	CGG	2	6	4622	4627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116491823
84	NC_008525	GGA	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116491823
85	NC_008525	GC	3	6	4704	4709	0 %	0 %	50 %	50 %	116491823
86	NC_008525	CTA	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491823
87	NC_008525	TCCAGA	2	12	4829	4840	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116491823
88	NC_008525	GAC	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491823
89	NC_008525	AAG	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491823
90	NC_008525	CTAT	2	8	5044	5051	25 %	50 %	0 %	25 %	116491823
91	NC_008525	AT	3	6	5096	5101	50 %	50 %	0 %	0 %	116491823
92	NC_008525	GAA	2	6	5169	5174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491823
93	NC_008525	TTA	2	6	5200	5205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491823
94	NC_008525	ACA	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491823
95	NC_008525	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
96	NC_008525	TGA	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
97	NC_008525	AGT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
98	NC_008525	TTG	2	6	5437	5442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116491823
99	NC_008525	GCA	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491823
100	NC_008525	AAG	2	6	5505	5510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491823
101	NC_008525	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116491823
102	NC_008525	ATA	2	6	5551	5556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116491823
103	NC_008525	ATT	2	6	5582	5587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491823
104	NC_008525	GGT	2	6	5610	5615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116491823
105	NC_008525	CA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	0 %	50 %	116491823
106	NC_008525	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491823
107	NC_008525	GTAA	2	8	5775	5782	50 %	25 %	25 %	0 %	116491823
108	NC_008525	CCGATG	2	12	5812	5823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116491823
109	NC_008525	TAT	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491823
110	NC_008525	TGAT	2	8	5884	5891	25 %	50 %	25 %	0 %	116491823
111	NC_008525	ACC	2	6	5915	5920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116491823
112	NC_008525	GAT	2	6	5945	5950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
113	NC_008525	AT	3	6	5954	5959	50 %	50 %	0 %	0 %	116491823
114	NC_008525	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491823
115	NC_008525	ATCACC	2	12	5999	6010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116491823
116	NC_008525	AAC	2	6	6071	6076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491823
117	NC_008525	GATGCT	2	12	6120	6131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116491823
118	NC_008525	GTG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116491823
119	NC_008525	CGT	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116491823
120	NC_008525	TGTT	2	8	6205	6212	0 %	75 %	25 %	0 %	116491823
121	NC_008525	AGA	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491824
122	NC_008525	AGT	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
123	NC_008525	CAT	2	6	6337	6342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491824
124	NC_008525	TTG	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116491824
125	NC_008525	TCG	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116491824
126	NC_008525	ATGA	2	8	6435	6442	50 %	25 %	25 %	0 %	116491824
127	NC_008525	AAG	2	6	6471	6476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491824
128	NC_008525	ATC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491824
129	NC_008525	TTG	2	6	6586	6591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116491824
130	NC_008525	GCT	3	9	6630	6638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116491824
131	NC_008525	ATG	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
132	NC_008525	GAACG	2	10	6733	6742	40 %	0 %	40 %	20 %	116491824
133	NC_008525	TTA	2	6	6777	6782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
134	NC_008525	GAC	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491824
135	NC_008525	CCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116491824
136	NC_008525	TCA	2	6	6850	6855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116491824
137	NC_008525	TGA	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
138	NC_008525	CAA	2	6	6889	6894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116491824
139	NC_008525	CCG	2	6	6895	6900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116491824
140	NC_008525	ATT	2	6	6999	7004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
141	NC_008525	A	7	7	7033	7039	100 %	0 %	0 %	0 %	116491824
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148	NC_008525	ATTTG	2	10	7379	7388	20 %	60 %	20 %	0 %	116491824
149	NC_008525	AAG	2	6	7389	7394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491824
150	NC_008525	ATT	2	6	7455	7460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
151	NC_008525	ATT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
152	NC_008525	TGA	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
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155	NC_008525	GCA	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491824
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160	NC_008525	ATG	2	6	7939	7944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
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162	NC_008525	CTTG	2	8	8042	8049	0 %	50 %	25 %	25 %	116491824
163	NC_008525	TAG	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491824
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166	NC_008525	GCA	2	6	8194	8199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116491824
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168	NC_008525	TTA	2	6	8251	8256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
169	NC_008525	ATT	2	6	8274	8279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
170	NC_008525	AAG	2	6	8314	8319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116491824
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172	NC_008525	TTA	2	6	8431	8436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116491824
173	NC_008525	AAAC	2	8	8454	8461	75 %	0 %	0 %	25 %	116491824
174	NC_008525	CGG	2	6	8492	8497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116491824
175	NC_008525	ATGTT	2	10	8575	8584	20 %	60 %	20 %	0 %	116491824
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255	NC_008525	GAG	2	6	12359	12364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116491828
256	NC_008525	TGA	2	6	12371	12376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116491829
257	NC_008525	T	7	7	12383	12389	0 %	100 %	0 %	0 %	116491829
258	NC_008525	TTAA	2	8	12460	12467	50 %	50 %	0 %	0 %	116491829
259	NC_008525	TAAAGC	2	12	12474	12485	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116491829
260	NC_008525	A	7	7	12521	12527	100 %	0 %	0 %	0 %	116491829
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262	NC_008525	TTGAG	2	10	12722	12731	20 %	40 %	40 %	0 %	116491829
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