MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14 chromosome

Total Repeats: 152537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008463	TCCGTG	2	12	480	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053721
2	NC_008463	GCA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
3	NC_008463	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053721
4	NC_008463	CAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053721
5	NC_008463	CGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
6	NC_008463	GT	3	6	598	603	0 %	50 %	50 %	0 %	116053721
7	NC_008463	TCGG	2	8	649	656	0 %	25 %	50 %	25 %	116053721
8	NC_008463	TTA	2	6	708	713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116053721
9	NC_008463	GCA	2	6	718	723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
10	NC_008463	CGC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
11	NC_008463	GC	3	6	740	745	0 %	0 %	50 %	50 %	116053721
12	NC_008463	CCG	3	9	795	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
13	NC_008463	GTG	3	9	834	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053721
14	NC_008463	GCC	2	6	857	862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
15	NC_008463	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
16	NC_008463	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053721
17	NC_008463	GCC	3	9	930	938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
18	NC_008463	GCCG	2	8	941	948	0 %	0 %	50 %	50 %	116053721
19	NC_008463	GC	3	6	994	999	0 %	0 %	50 %	50 %	116053721
20	NC_008463	ACCTTC	2	12	1026	1037	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116053721
21	NC_008463	TCG	2	6	1045	1050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053721
22	NC_008463	GCC	3	9	1077	1085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
23	NC_008463	ATGC	2	8	1167	1174	25 %	25 %	25 %	25 %	116053721
24	NC_008463	ACC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053721
25	NC_008463	GAA	3	9	1193	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053721
26	NC_008463	GGT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053721
27	NC_008463	TCG	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053721
28	NC_008463	CGA	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
29	NC_008463	TTC	2	6	1338	1343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053721
30	NC_008463	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116053721
31	NC_008463	TTC	2	6	1371	1376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053721
32	NC_008463	GGC	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053721
33	NC_008463	CAG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053721
34	NC_008463	GCC	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053721
35	NC_008463	TGA	2	6	1540	1545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053721
36	NC_008463	CTT	2	6	1589	1594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053721
37	NC_008463	CGTG	2	8	1619	1626	0 %	25 %	50 %	25 %	116053721
38	NC_008463	ACA	2	6	1753	1758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053721
39	NC_008463	TAC	2	6	1779	1784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053721
40	NC_008463	TGT	2	6	1804	1809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116053721
41	NC_008463	GCG	2	6	1814	1819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053721
42	NC_008463	GC	3	6	1833	1838	0 %	0 %	50 %	50 %	116053721
43	NC_008463	ACCA	2	8	1875	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	116053721
44	NC_008463	CGG	2	6	1910	1915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053721
45	NC_008463	CAC	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053721
46	NC_008463	CTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053721
47	NC_008463	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053722
48	NC_008463	CGC	2	6	2122	2127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053722
49	NC_008463	TC	3	6	2142	2147	0 %	50 %	0 %	50 %	116053722
50	NC_008463	CTG	2	6	2155	2160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053722
51	NC_008463	TGGT	2	8	2213	2220	0 %	50 %	50 %	0 %	116053722
52	NC_008463	GCC	2	6	2239	2244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053722
53	NC_008463	GC	3	6	2269	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	116053722
54	NC_008463	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053722
55	NC_008463	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053722
56	NC_008463	TAC	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053722
57	NC_008463	TGC	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053722
58	NC_008463	CGG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053722
59	NC_008463	CCA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053722
60	NC_008463	CCA	2	6	2732	2737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053722
61	NC_008463	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053722
62	NC_008463	CG	3	6	2804	2809	0 %	0 %	50 %	50 %	116053722
63	NC_008463	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053722
64	NC_008463	AAC	2	6	2941	2946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053722
65	NC_008463	AGG	3	9	2954	2962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116053722
66	NC_008463	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053722
67	NC_008463	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053722
68	NC_008463	CAG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053722
69	NC_008463	GTC	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053722
70	NC_008463	CTCCCC	2	12	3225	3236	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	116053723
71	NC_008463	CTG	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053723
72	NC_008463	GC	3	6	3331	3336	0 %	0 %	50 %	50 %	116053723
73	NC_008463	CCG	2	6	3564	3569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053723
74	NC_008463	TGACC	2	10	3816	3825	20 %	20 %	20 %	40 %	116053723
75	NC_008463	CTA	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053723
76	NC_008463	CCT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053723
77	NC_008463	CAG	2	6	3898	3903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053723
78	NC_008463	CGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053723
79	NC_008463	TC	3	6	3978	3983	0 %	50 %	0 %	50 %	116053723
80	NC_008463	CAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053723
81	NC_008463	TGG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053723
82	NC_008463	TGG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053723
83	NC_008463	AGC	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053723
84	NC_008463	GCTT	2	8	4127	4134	0 %	50 %	25 %	25 %	116053723
85	NC_008463	TCA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053723
86	NC_008463	TC	3	6	4244	4249	0 %	50 %	0 %	50 %	116053723
87	NC_008463	AAC	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
88	NC_008463	CGA	2	6	4370	4375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
89	NC_008463	CAC	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053724
90	NC_008463	GGT	2	6	4406	4411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053724
91	NC_008463	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
92	NC_008463	CCAT	2	8	4465	4472	25 %	25 %	0 %	50 %	116053724
93	NC_008463	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053724
94	NC_008463	GCG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053724
95	NC_008463	TCC	2	6	4570	4575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053724
96	NC_008463	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053724
97	NC_008463	CGA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
98	NC_008463	CGG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053724
99	NC_008463	GGT	2	6	4643	4648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053724
100	NC_008463	CAA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
101	NC_008463	ACC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053724
102	NC_008463	TCCT	2	8	4860	4867	0 %	50 %	0 %	50 %	116053724
103	NC_008463	CTG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
104	NC_008463	CGA	2	6	4895	4900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
105	NC_008463	AGG	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116053724
106	NC_008463	TCG	2	6	4951	4956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
107	NC_008463	CAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
108	NC_008463	CTGCT	2	10	5076	5085	0 %	40 %	20 %	40 %	116053724
109	NC_008463	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
110	NC_008463	GGC	2	6	5112	5117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053724
111	NC_008463	AAC	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
112	NC_008463	GAA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053724
113	NC_008463	CCA	2	6	5206	5211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053724
114	NC_008463	CGA	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
115	NC_008463	ATC	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053724
116	NC_008463	TCC	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053724
117	NC_008463	CTG	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
118	NC_008463	GAT	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053724
119	NC_008463	CGC	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053724
120	NC_008463	CG	3	6	5432	5437	0 %	0 %	50 %	50 %	116053724
121	NC_008463	GC	3	6	5442	5447	0 %	0 %	50 %	50 %	116053724
122	NC_008463	CGC	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053724
123	NC_008463	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	116053724
124	NC_008463	CTC	2	6	5666	5671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053724
125	NC_008463	AGG	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116053724
126	NC_008463	GAG	2	6	5721	5726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116053724
127	NC_008463	ACA	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116053724
128	NC_008463	CAT	4	12	5756	5767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053724
129	NC_008463	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
130	NC_008463	CTT	3	9	5816	5824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053724
131	NC_008463	CTACAT	2	12	5855	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116053724
132	NC_008463	GAC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
133	NC_008463	GAC	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
134	NC_008463	GC	3	6	6183	6188	0 %	0 %	50 %	50 %	116053724
135	NC_008463	CCG	3	9	6193	6201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053724
136	NC_008463	TGG	2	6	6277	6282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053724
137	NC_008463	CTT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053724
138	NC_008463	GCT	2	6	6353	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
139	NC_008463	CTG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053724
140	NC_008463	AGC	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053724
141	NC_008463	ACC	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053724
142	NC_008463	CGC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053724
143	NC_008463	GCCGC	2	10	6638	6647	0 %	0 %	40 %	60 %	116053724
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145	NC_008463	GCT	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053725
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147	NC_008463	GC	3	6	7127	7132	0 %	0 %	50 %	50 %	116053725
148	NC_008463	GCCTTC	2	12	7135	7146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116053725
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151	NC_008463	TTC	2	6	7355	7360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116053725
152	NC_008463	TCG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053725
153	NC_008463	GGCT	2	8	7406	7413	0 %	25 %	50 %	25 %	116053725
154	NC_008463	CGATGG	2	12	7419	7430	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116053725
155	NC_008463	CAGGGC	2	12	7438	7449	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116053725
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159	NC_008463	GAA	2	6	7522	7527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053725
160	NC_008463	GAA	2	6	7705	7710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116053725
161	NC_008463	CAG	3	9	7744	7752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053725
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163	NC_008463	TCG	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053726
164	NC_008463	CGTA	2	8	7878	7885	25 %	25 %	25 %	25 %	116053726
165	NC_008463	CGC	2	6	7932	7937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053726
166	NC_008463	CGA	2	6	7961	7966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053726
167	NC_008463	GCA	2	6	8012	8017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053726
168	NC_008463	CGGCTT	2	12	8022	8033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053726
169	NC_008463	CGT	2	6	8048	8053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053726
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171	NC_008463	GC	3	6	8121	8126	0 %	0 %	50 %	50 %	116053726
172	NC_008463	TGGT	2	8	8179	8186	0 %	50 %	50 %	0 %	116053726
173	NC_008463	GGCG	2	8	8219	8226	0 %	0 %	75 %	25 %	116053726
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175	NC_008463	TGGGGA	2	12	8243	8254	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116053726
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245	NC_008463	CGG	2	6	11150	11155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
246	NC_008463	CGGCGC	2	12	11180	11191	0 %	0 %	50 %	50 %	116053728
247	NC_008463	CG	3	6	11192	11197	0 %	0 %	50 %	50 %	116053728
248	NC_008463	CGC	2	6	11240	11245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053728
249	NC_008463	GTGG	2	8	11247	11254	0 %	25 %	75 %	0 %	116053728
250	NC_008463	GTA	3	9	11256	11264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053728
251	NC_008463	GC	4	8	11338	11345	0 %	0 %	50 %	50 %	116053728
252	NC_008463	GCC	2	6	11361	11366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053728
253	NC_008463	GGC	2	6	11385	11390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
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256	NC_008463	ACC	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053728
257	NC_008463	TGA	2	6	11597	11602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053728
258	NC_008463	GCA	2	6	11609	11614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053728
259	NC_008463	CAG	2	6	11631	11636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053728
260	NC_008463	TGG	2	6	11663	11668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116053728
261	NC_008463	CTC	2	6	11703	11708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053728
262	NC_008463	TCG	2	6	11755	11760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053728
263	NC_008463	CGG	2	6	11769	11774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
264	NC_008463	CGG	2	6	11798	11803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
265	NC_008463	CGT	2	6	11987	11992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116053728
266	NC_008463	CTC	2	6	12033	12038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116053728
267	NC_008463	GCG	2	6	12039	12044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
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269	NC_008463	CGA	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053728
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277	NC_008463	GCG	2	6	12260	12265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
278	NC_008463	ACGGT	2	10	12280	12289	20 %	20 %	40 %	20 %	116053728
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281	NC_008463	GCG	2	6	12358	12363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
282	NC_008463	GGC	2	6	12439	12444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116053728
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287	NC_008463	GC	3	6	12648	12653	0 %	0 %	50 %	50 %	116053729
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292	NC_008463	CGA	2	6	13078	13083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053729
293	NC_008463	ACC	2	6	13173	13178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116053729
294	NC_008463	GTA	2	6	13187	13192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053729
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381	NC_008463	AGC	2	6	17894	17899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116053736
382	NC_008463	GCAGC	2	10	17965	17974	20 %	0 %	40 %	40 %	116053736
383	NC_008463	GAT	2	6	17986	17991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116053736
384	NC_008463	GCC	3	9	18043	18051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116053736
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