MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008228	GCT	2	6	192	197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896333
2	NC_008228	ATT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896333
3	NC_008228	ATG	2	6	295	300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896333
4	NC_008228	CTG	2	6	331	336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896333
5	NC_008228	ACA	2	6	344	349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896333
6	NC_008228	TCCTGC	2	12	365	376	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	109896333
7	NC_008228	TCA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896333
8	NC_008228	CAG	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896333
9	NC_008228	TAACGT	2	12	443	454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	109896333
10	NC_008228	ATA	2	6	463	468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896333
11	NC_008228	GCG	2	6	489	494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896333
12	NC_008228	AGGCA	2	10	599	608	40 %	0 %	40 %	20 %	109896333
13	NC_008228	ATT	2	6	617	622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896333
14	NC_008228	TGG	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896333
15	NC_008228	AC	3	6	651	656	50 %	0 %	0 %	50 %	109896333
16	NC_008228	TTA	2	6	657	662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896333
17	NC_008228	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	109896333
18	NC_008228	AAC	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896333
19	NC_008228	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896333
20	NC_008228	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896333
21	NC_008228	GAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896333
22	NC_008228	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896333
23	NC_008228	AAG	2	6	856	861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896333
24	NC_008228	T	6	6	864	869	0 %	100 %	0 %	0 %	109896333
25	NC_008228	ATC	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896333
26	NC_008228	TCGGT	2	10	968	977	0 %	40 %	40 %	20 %	109896333
27	NC_008228	CTTT	2	8	1081	1088	0 %	75 %	0 %	25 %	109896333
28	NC_008228	GA	3	6	1115	1120	50 %	0 %	50 %	0 %	109896333
29	NC_008228	GCTAAT	2	12	1149	1160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	109896333
30	NC_008228	GATA	2	8	1241	1248	50 %	25 %	25 %	0 %	109896333
31	NC_008228	A	6	6	1255	1260	100 %	0 %	0 %	0 %	109896333
32	NC_008228	AGAAGT	2	12	1311	1322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109896333
33	NC_008228	TAAC	2	8	1366	1373	50 %	25 %	0 %	25 %	109896333
34	NC_008228	CA	3	6	1416	1421	50 %	0 %	0 %	50 %	109896333
35	NC_008228	TGCA	2	8	1429	1436	25 %	25 %	25 %	25 %	109896333
36	NC_008228	AGAGA	2	10	1458	1467	60 %	0 %	40 %	0 %	109896333
37	NC_008228	AGA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896333
38	NC_008228	A	7	7	1519	1525	100 %	0 %	0 %	0 %	109896333
39	NC_008228	AC	3	6	1612	1617	50 %	0 %	0 %	50 %	109896334
40	NC_008228	GAA	2	6	1730	1735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896334
41	NC_008228	CAA	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896334
42	NC_008228	CT	4	8	1869	1876	0 %	50 %	0 %	50 %	109896334
43	NC_008228	TTGA	2	8	1952	1959	25 %	50 %	25 %	0 %	109896334
44	NC_008228	CAA	2	6	1982	1987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896334
45	NC_008228	TTA	2	6	1996	2001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896334
46	NC_008228	GGCT	2	8	2067	2074	0 %	25 %	50 %	25 %	109896334
47	NC_008228	T	6	6	2217	2222	0 %	100 %	0 %	0 %	109896334
48	NC_008228	ATC	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896334
49	NC_008228	TAA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896334
50	NC_008228	AAG	3	9	2439	2447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896334
51	NC_008228	TGTAGA	2	12	2458	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896334
52	NC_008228	GGT	2	6	2477	2482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896334
53	NC_008228	CCTA	2	8	2508	2515	25 %	25 %	0 %	50 %	109896334
54	NC_008228	GAA	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896334
55	NC_008228	AGT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896334
56	NC_008228	TAT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896335
57	NC_008228	GCA	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896335
58	NC_008228	T	6	6	2875	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	109896335
59	NC_008228	GCA	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896335
60	NC_008228	TAA	2	6	2972	2977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896335
61	NC_008228	TAGT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	109896335
62	NC_008228	CTC	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109896335
63	NC_008228	TTA	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896335
64	NC_008228	CGG	2	6	3060	3065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896335
65	NC_008228	GTTT	2	8	3082	3089	0 %	75 %	25 %	0 %	109896335
66	NC_008228	ACA	2	6	3167	3172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896335
67	NC_008228	GAT	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896335
68	NC_008228	TAT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896335
69	NC_008228	CGG	2	6	3385	3390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896335
70	NC_008228	AGG	2	6	3472	3477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109896335
71	NC_008228	TGT	2	6	3478	3483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896335
72	NC_008228	CA	3	6	3530	3535	50 %	0 %	0 %	50 %	109896335
73	NC_008228	AC	3	6	3550	3555	50 %	0 %	0 %	50 %	109896335
74	NC_008228	TTA	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896335
75	NC_008228	GAT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896335
76	NC_008228	GCA	2	6	3603	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896335
77	NC_008228	CTT	2	6	3633	3638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896335
78	NC_008228	AGA	2	6	3671	3676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896335
79	NC_008228	A	7	7	3711	3717	100 %	0 %	0 %	0 %	109896335
80	NC_008228	GA	3	6	3743	3748	50 %	0 %	50 %	0 %	109896335
81	NC_008228	AGA	2	6	3768	3773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
82	NC_008228	TCG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896336
83	NC_008228	CGTA	2	8	3822	3829	25 %	25 %	25 %	25 %	109896336
84	NC_008228	GTAT	2	8	3839	3846	25 %	50 %	25 %	0 %	109896336
85	NC_008228	TGA	2	6	3912	3917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
86	NC_008228	GAT	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
87	NC_008228	GAA	2	6	4018	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
88	NC_008228	TTA	2	6	4046	4051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896336
89	NC_008228	TTC	2	6	4058	4063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896336
90	NC_008228	GGT	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896336
91	NC_008228	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
92	NC_008228	AAT	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896336
93	NC_008228	CGC	2	6	4171	4176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896336
94	NC_008228	TAC	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896336
95	NC_008228	TCCT	2	8	4348	4355	0 %	50 %	0 %	50 %	109896336
96	NC_008228	CAT	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896336
97	NC_008228	AGA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
98	NC_008228	AAGA	2	8	4399	4406	75 %	0 %	25 %	0 %	109896336
99	NC_008228	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896336
100	NC_008228	CAA	2	6	4477	4482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896336
101	NC_008228	TGA	2	6	4506	4511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
102	NC_008228	ATTC	2	8	4547	4554	25 %	50 %	0 %	25 %	109896336
103	NC_008228	TAA	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896336
104	NC_008228	TGG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896336
105	NC_008228	GTG	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896336
106	NC_008228	GAAG	2	8	4662	4669	50 %	0 %	50 %	0 %	109896336
107	NC_008228	AAG	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
108	NC_008228	TGA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
109	NC_008228	CCG	2	6	4808	4813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896336
110	NC_008228	ATT	2	6	4876	4881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896336
111	NC_008228	GCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896336
112	NC_008228	GCG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896336
113	NC_008228	TA	4	8	5027	5034	50 %	50 %	0 %	0 %	109896336
114	NC_008228	CTG	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896336
115	NC_008228	CAGAAA	2	12	5073	5084	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	109896336
116	NC_008228	AAG	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
117	NC_008228	ATC	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896336
118	NC_008228	CTT	2	6	5304	5309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896336
119	NC_008228	ATT	2	6	5329	5334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896336
120	NC_008228	CCT	2	6	5362	5367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109896336
121	NC_008228	AAAG	2	8	5379	5386	75 %	0 %	25 %	0 %	109896336
122	NC_008228	GAT	3	9	5410	5418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
123	NC_008228	TCAC	2	8	5419	5426	25 %	25 %	0 %	50 %	109896336
124	NC_008228	GAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
125	NC_008228	GAT	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896336
126	NC_008228	TTAT	2	8	5594	5601	25 %	75 %	0 %	0 %	109896336
127	NC_008228	AAT	2	6	5607	5612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896336
128	NC_008228	AAGC	2	8	5636	5643	50 %	0 %	25 %	25 %	109896336
129	NC_008228	GTT	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896336
130	NC_008228	AAC	2	6	5728	5733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896336
131	NC_008228	ACT	2	6	5744	5749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896336
132	NC_008228	ATT	2	6	5761	5766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896336
133	NC_008228	GAA	2	6	5872	5877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
134	NC_008228	GGT	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896336
135	NC_008228	TCA	2	6	5917	5922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896336
136	NC_008228	GCT	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896336
137	NC_008228	GAA	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896336
138	NC_008228	GAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896337
139	NC_008228	TTAA	2	8	6358	6365	50 %	50 %	0 %	0 %	109896337
140	NC_008228	TCG	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896337
141	NC_008228	GGC	2	6	6388	6393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896337
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143	NC_008228	TAT	3	9	6531	6539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896337
144	NC_008228	TGC	3	9	6576	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896337
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150	NC_008228	GTT	2	6	6874	6879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896337
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251	NC_008228	GCTC	2	8	13584	13591	0 %	25 %	25 %	50 %	109896344
252	NC_008228	AGC	2	6	13629	13634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896344
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254	NC_008228	GAA	2	6	13685	13690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896344
255	NC_008228	TCA	2	6	13722	13727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896344
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258	NC_008228	T	7	7	13846	13852	0 %	100 %	0 %	0 %	109896344
259	NC_008228	CTT	2	6	13934	13939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896344
260	NC_008228	T	6	6	13938	13943	0 %	100 %	0 %	0 %	109896344
261	NC_008228	TAA	2	6	14430	14435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896345
262	NC_008228	AT	3	6	14445	14450	50 %	50 %	0 %	0 %	109896345
263	NC_008228	ACA	2	6	14455	14460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896345
264	NC_008228	TCC	2	6	14496	14501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109896345
265	NC_008228	TG	3	6	14570	14575	0 %	50 %	50 %	0 %	109896345
266	NC_008228	TGCA	2	8	14641	14648	25 %	25 %	25 %	25 %	109896345
267	NC_008228	CAC	2	6	14668	14673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896345
268	NC_008228	CTGC	2	8	14688	14695	0 %	25 %	25 %	50 %	109896345
269	NC_008228	GCCAT	2	10	14790	14799	20 %	20 %	20 %	40 %	109896345
270	NC_008228	TCA	2	6	14800	14805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896345
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272	NC_008228	CTT	2	6	14821	14826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896345
273	NC_008228	CAC	2	6	14827	14832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896345
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276	NC_008228	AAG	2	6	14953	14958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896345
277	NC_008228	A	7	7	15018	15024	100 %	0 %	0 %	0 %	109896345
278	NC_008228	CTAA	2	8	15027	15034	50 %	25 %	0 %	25 %	109896345
279	NC_008228	CAT	2	6	15041	15046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896345
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285	NC_008228	AATT	2	8	15442	15449	50 %	50 %	0 %	0 %	109896346
286	NC_008228	TTG	2	6	15589	15594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896346
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290	NC_008228	CT	3	6	15749	15754	0 %	50 %	0 %	50 %	109896346
291	NC_008228	T	6	6	16445	16450	0 %	100 %	0 %	0 %	109896347
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299	NC_008228	GTAT	2	8	16815	16822	25 %	50 %	25 %	0 %	109896347
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