MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008228	ATC	2	6	254053	254058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896541
4002	NC_008228	AGC	2	6	254117	254122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896541
4003	NC_008228	GTT	2	6	254151	254156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896541
4004	NC_008228	AAT	2	6	254171	254176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896541
4005	NC_008228	GAGG	2	8	254230	254237	25 %	0 %	75 %	0 %	109896542
4006	NC_008228	AGC	2	6	254258	254263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896542
4007	NC_008228	CAT	2	6	254352	254357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896542
4008	NC_008228	CGA	2	6	254448	254453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896542
4009	NC_008228	AAT	2	6	254476	254481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896542
4010	NC_008228	GGTACC	2	12	254551	254562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	109896542
4011	NC_008228	CA	3	6	254619	254624	50 %	0 %	0 %	50 %	109896542
4012	NC_008228	GGTTG	2	10	254626	254635	0 %	40 %	60 %	0 %	109896542
4013	NC_008228	CTA	2	6	254640	254645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896542
4014	NC_008228	CGC	2	6	254646	254651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896542
4015	NC_008228	TGTT	2	8	254665	254672	0 %	75 %	25 %	0 %	109896542
4016	NC_008228	G	6	6	254681	254686	0 %	0 %	100 %	0 %	109896542
4017	NC_008228	TGGG	2	8	254699	254706	0 %	25 %	75 %	0 %	109896542
4018	NC_008228	AAGT	2	8	254752	254759	50 %	25 %	25 %	0 %	109896542
4019	NC_008228	T	7	7	254967	254973	0 %	100 %	0 %	0 %	109896542
4020	NC_008228	TTA	2	6	254996	255001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896542
4021	NC_008228	GGT	2	6	255022	255027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896542
4022	NC_008228	CCG	2	6	255167	255172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896542
4023	NC_008228	CGA	2	6	255669	255674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896543
4024	NC_008228	CAC	2	6	255697	255702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896543
4025	NC_008228	CTG	2	6	255756	255761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896543
4026	NC_008228	AAC	2	6	255777	255782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896543
4027	NC_008228	TGG	2	6	255902	255907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896543
4028	NC_008228	GCC	2	6	256027	256032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896543
4029	NC_008228	GTTGG	2	10	256204	256213	0 %	40 %	60 %	0 %	109896543
4030	NC_008228	CGC	2	6	256249	256254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896543
4031	NC_008228	TCG	2	6	256262	256267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896543
4032	NC_008228	CTA	2	6	256322	256327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896543
4033	NC_008228	A	7	7	256327	256333	100 %	0 %	0 %	0 %	109896543
4034	NC_008228	AGC	2	6	256396	256401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896543
4035	NC_008228	CGC	3	9	256528	256536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896543
4036	NC_008228	CAT	2	6	256570	256575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896543
4037	NC_008228	AAT	2	6	256612	256617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896543
4038	NC_008228	CA	3	6	256627	256632	50 %	0 %	0 %	50 %	109896543
4039	NC_008228	A	6	6	256669	256674	100 %	0 %	0 %	0 %	109896543
4040	NC_008228	ATTG	2	8	257100	257107	25 %	50 %	25 %	0 %	109896544
4041	NC_008228	CTG	2	6	257131	257136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896544
4042	NC_008228	T	6	6	257170	257175	0 %	100 %	0 %	0 %	109896544
4043	NC_008228	TTA	2	6	257193	257198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896544
4044	NC_008228	TGG	2	6	257270	257275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896544
4045	NC_008228	G	6	6	257334	257339	0 %	0 %	100 %	0 %	109896544
4046	NC_008228	GGC	2	6	257392	257397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896544
4047	NC_008228	TTTA	2	8	257414	257421	25 %	75 %	0 %	0 %	109896544
4048	NC_008228	TGG	2	6	257459	257464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896544
4049	NC_008228	GAC	2	6	257541	257546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896544
4050	NC_008228	CAA	2	6	257653	257658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896544
4051	NC_008228	TG	3	6	257953	257958	0 %	50 %	50 %	0 %	109896545
4052	NC_008228	TAA	2	6	258024	258029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896545
4053	NC_008228	CCA	2	6	258053	258058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896545
4054	NC_008228	ATA	2	6	258283	258288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896546
4055	NC_008228	TTC	2	6	258399	258404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896546
4056	NC_008228	TGA	2	6	258416	258421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896546
4057	NC_008228	ATC	2	6	258429	258434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896546
4058	NC_008228	AGC	2	6	258435	258440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896546
4059	NC_008228	AACC	2	8	258592	258599	50 %	0 %	0 %	50 %	109896546
4060	NC_008228	CGT	2	6	258708	258713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896546
4061	NC_008228	CCAC	2	8	258781	258788	25 %	0 %	0 %	75 %	109896546
4062	NC_008228	AGT	2	6	258789	258794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896546
4063	NC_008228	CAAG	2	8	258836	258843	50 %	0 %	25 %	25 %	109896546
4064	NC_008228	ACC	2	6	258916	258921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896546
4065	NC_008228	CTT	2	6	259031	259036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896546
4066	NC_008228	ACG	2	6	259089	259094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896546
4067	NC_008228	GTG	2	6	259135	259140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896546
4068	NC_008228	CGC	2	6	259250	259255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896546
4069	NC_008228	CTTT	2	8	259273	259280	0 %	75 %	0 %	25 %	109896546
4070	NC_008228	ACA	2	6	259303	259308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896546
4071	NC_008228	T	6	6	259373	259378	0 %	100 %	0 %	0 %	109896546
4072	NC_008228	AAC	2	6	259428	259433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896546
4073	NC_008228	ACCTT	2	10	259465	259474	20 %	40 %	0 %	40 %	109896546
4074	NC_008228	TCA	2	6	259480	259485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896546
4075	NC_008228	TTG	2	6	259692	259697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896547
4076	NC_008228	ATTT	2	8	259712	259719	25 %	75 %	0 %	0 %	109896547
4077	NC_008228	ACA	2	6	259724	259729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896547
4078	NC_008228	AGC	2	6	259941	259946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896548
4079	NC_008228	CTTG	2	8	260013	260020	0 %	50 %	25 %	25 %	109896548
4080	NC_008228	TTTGC	2	10	260255	260264	0 %	60 %	20 %	20 %	109896548
4081	NC_008228	GCC	2	6	260283	260288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896548
4082	NC_008228	CAT	2	6	260290	260295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896548
4083	NC_008228	ACG	2	6	260540	260545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896548
4084	NC_008228	GTC	2	6	260714	260719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896548
4085	NC_008228	ACC	2	6	260793	260798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896548
4086	NC_008228	CGC	2	6	260866	260871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896548
4087	NC_008228	ATG	2	6	260874	260879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896548
4088	NC_008228	ATC	2	6	260960	260965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896548
4089	NC_008228	GTA	2	6	261089	261094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896548
4090	NC_008228	ATC	2	6	261117	261122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896548
4091	NC_008228	GTCATA	2	12	261149	261160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	109896548
4092	NC_008228	CTT	2	6	261166	261171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896548
4093	NC_008228	CTT	2	6	261232	261237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896548
4094	NC_008228	CCA	2	6	261304	261309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896548
4095	NC_008228	TAA	2	6	261508	261513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896549
4096	NC_008228	TGGC	2	8	261542	261549	0 %	25 %	50 %	25 %	109896549
4097	NC_008228	GAT	2	6	261552	261557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896549
4098	NC_008228	AGT	2	6	261560	261565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896549
4099	NC_008228	T	6	6	261621	261626	0 %	100 %	0 %	0 %	109896549
4100	NC_008228	TCA	2	6	261659	261664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896549
4101	NC_008228	CACG	2	8	261741	261748	25 %	0 %	25 %	50 %	109896549
4102	NC_008228	ATC	2	6	261769	261774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896549
4103	NC_008228	T	6	6	261815	261820	0 %	100 %	0 %	0 %	109896549
4104	NC_008228	ATG	3	9	261830	261838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896549
4105	NC_008228	TCA	2	6	261854	261859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896549
4106	NC_008228	TGA	2	6	261971	261976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896549
4107	NC_008228	GTC	2	6	262033	262038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896549
4108	NC_008228	CAA	2	6	262041	262046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896549
4109	NC_008228	TCA	2	6	262298	262303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896550
4110	NC_008228	TGC	2	6	262351	262356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896550
4111	NC_008228	CAT	2	6	262383	262388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896550
4112	NC_008228	ACCT	2	8	262417	262424	25 %	25 %	0 %	50 %	109896550
4113	NC_008228	CAT	2	6	262464	262469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896550
4114	NC_008228	GAA	2	6	262686	262691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896550
4115	NC_008228	ACTTCA	2	12	262784	262795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896550
4116	NC_008228	CTT	2	6	262803	262808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896550
4117	NC_008228	GTC	2	6	262813	262818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896550
4118	NC_008228	GTTACT	2	12	262911	262922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	109896551
4119	NC_008228	CAAC	2	8	262937	262944	50 %	0 %	0 %	50 %	109896551
4120	NC_008228	GGT	2	6	263082	263087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896551
4121	NC_008228	CAT	2	6	263155	263160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896551
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4488	NC_008228	AT	3	6	285714	285719	50 %	50 %	0 %	0 %	109896574
4489	NC_008228	TCA	2	6	285751	285756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896574
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