MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008228	CAG	2	6	222449	222454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896519
3502	NC_008228	TGA	2	6	222470	222475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896519
3503	NC_008228	TGT	2	6	222539	222544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896519
3504	NC_008228	GCG	2	6	222550	222555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896519
3505	NC_008228	CCAG	2	8	222683	222690	25 %	0 %	25 %	50 %	109896519
3506	NC_008228	CTA	2	6	222747	222752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896519
3507	NC_008228	TAT	2	6	223164	223169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896519
3508	NC_008228	TCT	2	6	223176	223181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896519
3509	NC_008228	CAA	2	6	223229	223234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896519
3510	NC_008228	CAAG	2	8	223367	223374	50 %	0 %	25 %	25 %	109896519
3511	NC_008228	AAGGC	2	10	223468	223477	40 %	0 %	40 %	20 %	109896519
3512	NC_008228	CGC	2	6	223586	223591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896519
3513	NC_008228	GTG	2	6	223651	223656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896519
3514	NC_008228	GTT	2	6	223661	223666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896519
3515	NC_008228	AACCA	2	10	223680	223689	60 %	0 %	0 %	40 %	109896519
3516	NC_008228	GC	3	6	223802	223807	0 %	0 %	50 %	50 %	109896519
3517	NC_008228	GTTTGA	2	12	223811	223822	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	109896519
3518	NC_008228	ATTG	2	8	223845	223852	25 %	50 %	25 %	0 %	109896519
3519	NC_008228	TTG	2	6	223911	223916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896519
3520	NC_008228	CTT	2	6	223976	223981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896519
3521	NC_008228	GGC	2	6	224052	224057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896519
3522	NC_008228	ACA	2	6	224113	224118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896519
3523	NC_008228	TCG	2	6	224158	224163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896519
3524	NC_008228	GAC	2	6	224271	224276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896519
3525	NC_008228	AGA	2	6	224285	224290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896519
3526	NC_008228	AGAT	2	8	224416	224423	50 %	25 %	25 %	0 %	109896519
3527	NC_008228	AAC	2	6	224519	224524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896520
3528	NC_008228	TGG	2	6	224558	224563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896520
3529	NC_008228	GGC	3	9	224590	224598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896520
3530	NC_008228	GC	3	6	224650	224655	0 %	0 %	50 %	50 %	109896520
3531	NC_008228	GT	3	6	224681	224686	0 %	50 %	50 %	0 %	109896520
3532	NC_008228	TGGC	2	8	224693	224700	0 %	25 %	50 %	25 %	109896520
3533	NC_008228	CTTG	2	8	224744	224751	0 %	50 %	25 %	25 %	109896520
3534	NC_008228	ATG	2	6	224759	224764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896520
3535	NC_008228	A	6	6	224789	224794	100 %	0 %	0 %	0 %	109896520
3536	NC_008228	ACA	2	6	224822	224827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896520
3537	NC_008228	GCA	2	6	224864	224869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896520
3538	NC_008228	ACG	2	6	224924	224929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896520
3539	NC_008228	A	6	6	225008	225013	100 %	0 %	0 %	0 %	109896520
3540	NC_008228	AGC	2	6	225078	225083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896520
3541	NC_008228	TAT	2	6	225135	225140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896520
3542	NC_008228	ATA	2	6	225254	225259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896520
3543	NC_008228	GCCA	2	8	225395	225402	25 %	0 %	25 %	50 %	109896521
3544	NC_008228	CAT	2	6	225430	225435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896521
3545	NC_008228	GTGC	2	8	225473	225480	0 %	25 %	50 %	25 %	109896521
3546	NC_008228	A	6	6	225492	225497	100 %	0 %	0 %	0 %	109896521
3547	NC_008228	TGA	2	6	225514	225519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896521
3548	NC_008228	G	6	6	225577	225582	0 %	0 %	100 %	0 %	109896521
3549	NC_008228	GAA	2	6	225665	225670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896521
3550	NC_008228	A	6	6	225669	225674	100 %	0 %	0 %	0 %	109896521
3551	NC_008228	GTG	2	6	225750	225755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896521
3552	NC_008228	GAA	2	6	225761	225766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896521
3553	NC_008228	TGC	2	6	225775	225780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896521
3554	NC_008228	TCG	2	6	225856	225861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896521
3555	NC_008228	GC	3	6	225985	225990	0 %	0 %	50 %	50 %	109896521
3556	NC_008228	GGT	2	6	226018	226023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896521
3557	NC_008228	TGGC	2	8	226033	226040	0 %	25 %	50 %	25 %	109896521
3558	NC_008228	TAT	2	6	226047	226052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896521
3559	NC_008228	CAG	2	6	226143	226148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896521
3560	NC_008228	GTCG	2	8	226198	226205	0 %	25 %	50 %	25 %	109896521
3561	NC_008228	ATG	2	6	226206	226211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896521
3562	NC_008228	TGGG	2	8	226377	226384	0 %	25 %	75 %	0 %	109896521
3563	NC_008228	ATT	2	6	226403	226408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896521
3564	NC_008228	TGG	3	9	226444	226452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896521
3565	NC_008228	TGG	2	6	226590	226595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896521
3566	NC_008228	GT	3	6	226628	226633	0 %	50 %	50 %	0 %	109896521
3567	NC_008228	CAT	2	6	226909	226914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896522
3568	NC_008228	TTTG	2	8	226974	226981	0 %	75 %	25 %	0 %	109896522
3569	NC_008228	ACA	2	6	227010	227015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896522
3570	NC_008228	CGCT	2	8	227026	227033	0 %	25 %	25 %	50 %	109896522
3571	NC_008228	GC	3	6	227042	227047	0 %	0 %	50 %	50 %	109896522
3572	NC_008228	AAC	2	6	227060	227065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896522
3573	NC_008228	CG	3	6	227086	227091	0 %	0 %	50 %	50 %	109896522
3574	NC_008228	CGG	2	6	227137	227142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896522
3575	NC_008228	AAT	2	6	227153	227158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896522
3576	NC_008228	GGCGC	2	10	227198	227207	0 %	0 %	60 %	40 %	109896522
3577	NC_008228	CATG	2	8	227209	227216	25 %	25 %	25 %	25 %	109896522
3578	NC_008228	CTG	2	6	227241	227246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896522
3579	NC_008228	TCA	2	6	227451	227456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896522
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3581	NC_008228	GGT	2	6	227527	227532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896522
3582	NC_008228	TTG	2	6	227655	227660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896522
3583	NC_008228	CTT	2	6	227692	227697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896522
3584	NC_008228	TGA	2	6	227800	227805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896522
3585	NC_008228	CGG	2	6	227833	227838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896522
3586	NC_008228	CG	3	6	227875	227880	0 %	0 %	50 %	50 %	109896522
3587	NC_008228	AG	3	6	227921	227926	50 %	0 %	50 %	0 %	109896522
3588	NC_008228	TTG	2	6	227969	227974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896522
3589	NC_008228	CAA	2	6	228169	228174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896522
3590	NC_008228	ACC	2	6	228371	228376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896522
3591	NC_008228	ATT	2	6	228401	228406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896522
3592	NC_008228	AATA	2	8	228434	228441	75 %	25 %	0 %	0 %	109896522
3593	NC_008228	TCA	2	6	228450	228455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896522
3594	NC_008228	ACG	3	9	228517	228525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896522
3595	NC_008228	GTT	2	6	228617	228622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896522
3596	NC_008228	CCTG	2	8	228741	228748	0 %	25 %	25 %	50 %	109896522
3597	NC_008228	GCT	2	6	228845	228850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896522
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3599	NC_008228	TCAG	2	8	228939	228946	25 %	25 %	25 %	25 %	109896522
3600	NC_008228	TCG	2	6	228949	228954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896522
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3602	NC_008228	TCA	2	6	229089	229094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896522
3603	NC_008228	CGC	2	6	229129	229134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896522
3604	NC_008228	GTC	2	6	229160	229165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896522
3605	NC_008228	CCA	2	6	229188	229193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896522
3606	NC_008228	TAT	2	6	229256	229261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896523
3607	NC_008228	GCC	2	6	229301	229306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896523
3608	NC_008228	TAT	2	6	229317	229322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896523
3609	NC_008228	TTC	2	6	229387	229392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896523
3610	NC_008228	CTT	2	6	229398	229403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896523
3611	NC_008228	T	6	6	229473	229478	0 %	100 %	0 %	0 %	109896523
3612	NC_008228	TGCT	2	8	229504	229511	0 %	50 %	25 %	25 %	109896523
3613	NC_008228	GAC	2	6	229563	229568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896523
3614	NC_008228	CTT	2	6	229575	229580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896523
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3616	NC_008228	TG	3	6	229733	229738	0 %	50 %	50 %	0 %	109896523
3617	NC_008228	TCT	2	6	229739	229744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896523
3618	NC_008228	GCA	3	9	229896	229904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896524
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3620	NC_008228	AAG	2	6	230024	230029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896524
3621	NC_008228	TGG	2	6	230055	230060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896524
3622	NC_008228	TGGCT	2	10	230193	230202	0 %	40 %	40 %	20 %	109896524
3623	NC_008228	ACA	2	6	230411	230416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896524
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3991	NC_008228	GTCAT	2	10	253529	253538	20 %	40 %	20 %	20 %	109896541
3992	NC_008228	T	6	6	253611	253616	0 %	100 %	0 %	0 %	109896541
3993	NC_008228	GAA	2	6	253681	253686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896541
3994	NC_008228	TGA	2	6	253737	253742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896541
3995	NC_008228	AT	3	6	253760	253765	50 %	50 %	0 %	0 %	109896541
3996	NC_008228	AGC	2	6	253799	253804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896541
3997	NC_008228	CAT	2	6	253827	253832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896541
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3999	NC_008228	AGC	2	6	253993	253998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896541
4000	NC_008228	ACGC	2	8	254042	254049	25 %	0 %	25 %	50 %	109896541

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