MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_008228	CAG	2	6	1159482	1159487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897293
18002	NC_008228	TCA	2	6	1159499	1159504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897293
18003	NC_008228	CTT	2	6	1159560	1159565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897293
18004	NC_008228	GA	3	6	1159689	1159694	50 %	0 %	50 %	0 %	109897293
18005	NC_008228	AAC	2	6	1159705	1159710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897293
18006	NC_008228	GTAAA	2	10	1160226	1160235	60 %	20 %	20 %	0 %	109897294
18007	NC_008228	AT	3	6	1160247	1160252	50 %	50 %	0 %	0 %	109897294
18008	NC_008228	CAT	2	6	1160388	1160393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897294
18009	NC_008228	CAA	2	6	1160457	1160462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897294
18010	NC_008228	TTG	2	6	1160549	1160554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897294
18011	NC_008228	CAT	2	6	1160559	1160564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897294
18012	NC_008228	CGAC	2	8	1160568	1160575	25 %	0 %	25 %	50 %	109897294
18013	NC_008228	AAG	2	6	1160594	1160599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897294
18014	NC_008228	T	6	6	1160604	1160609	0 %	100 %	0 %	0 %	109897294
18015	NC_008228	CAA	2	6	1160620	1160625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897294
18016	NC_008228	CAT	2	6	1160727	1160732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897294
18017	NC_008228	CTT	2	6	1160733	1160738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897294
18018	NC_008228	TGC	2	6	1160886	1160891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897294
18019	NC_008228	T	6	6	1160976	1160981	0 %	100 %	0 %	0 %	109897294
18020	NC_008228	CGC	2	6	1161336	1161341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109897295
18021	NC_008228	GAC	2	6	1161420	1161425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897295
18022	NC_008228	TGA	2	6	1161494	1161499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897295
18023	NC_008228	TG	3	6	1161533	1161538	0 %	50 %	50 %	0 %	109897295
18024	NC_008228	CCT	2	6	1161624	1161629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109897295
18025	NC_008228	CGT	2	6	1161692	1161697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897295
18026	NC_008228	TTC	2	6	1161762	1161767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897295
18027	NC_008228	TATCG	2	10	1161783	1161792	20 %	40 %	20 %	20 %	109897295
18028	NC_008228	TTG	2	6	1161984	1161989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897295
18029	NC_008228	ATTG	2	8	1162001	1162008	25 %	50 %	25 %	0 %	109897295
18030	NC_008228	CAA	2	6	1162021	1162026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897295
18031	NC_008228	TCAAC	2	10	1162087	1162096	40 %	20 %	0 %	40 %	109897295
18032	NC_008228	ATCA	2	8	1162101	1162108	50 %	25 %	0 %	25 %	109897295
18033	NC_008228	AT	3	6	1162127	1162132	50 %	50 %	0 %	0 %	109897295
18034	NC_008228	TGG	2	6	1162133	1162138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897295
18035	NC_008228	AAG	2	6	1162153	1162158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897295
18036	NC_008228	TTAT	2	8	1162312	1162319	25 %	75 %	0 %	0 %	109897295
18037	NC_008228	GAT	2	6	1162512	1162517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897295
18038	NC_008228	TGA	2	6	1162589	1162594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897295
18039	NC_008228	AC	3	6	1162643	1162648	50 %	0 %	0 %	50 %	109897295
18040	NC_008228	GCC	2	6	1162655	1162660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109897295
18041	NC_008228	GAAA	2	8	1162750	1162757	75 %	0 %	25 %	0 %	109897295
18042	NC_008228	TCAA	2	8	1162785	1162792	50 %	25 %	0 %	25 %	109897296
18043	NC_008228	TGA	2	6	1162794	1162799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897296
18044	NC_008228	TCG	2	6	1162826	1162831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897296
18045	NC_008228	CGAG	2	8	1162864	1162871	25 %	0 %	50 %	25 %	109897296
18046	NC_008228	GTT	2	6	1162876	1162881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897296
18047	NC_008228	TGG	2	6	1162884	1162889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897296
18048	NC_008228	GTT	2	6	1162905	1162910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897296
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18050	NC_008228	GCA	2	6	1163041	1163046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897296
18051	NC_008228	TTG	2	6	1163057	1163062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897296
18052	NC_008228	CTT	2	6	1163183	1163188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897296
18053	NC_008228	TCAGA	2	10	1163200	1163209	40 %	20 %	20 %	20 %	109897296
18054	NC_008228	CCA	2	6	1163211	1163216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109897296
18055	NC_008228	GC	3	6	1163231	1163236	0 %	0 %	50 %	50 %	109897296
18056	NC_008228	CGTA	2	8	1163239	1163246	25 %	25 %	25 %	25 %	109897296
18057	NC_008228	A	6	6	1163350	1163355	100 %	0 %	0 %	0 %	109897296
18058	NC_008228	CG	3	6	1163407	1163412	0 %	0 %	50 %	50 %	109897296
18059	NC_008228	ATAA	2	8	1163416	1163423	75 %	25 %	0 %	0 %	109897296
18060	NC_008228	TAT	2	6	1163472	1163477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897297
18061	NC_008228	AAG	2	6	1163480	1163485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897297
18062	NC_008228	CAT	2	6	1163496	1163501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897297
18063	NC_008228	GCA	2	6	1163611	1163616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897297
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18065	NC_008228	AAG	2	6	1163737	1163742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897297
18066	NC_008228	TG	3	6	1163795	1163800	0 %	50 %	50 %	0 %	109897297
18067	NC_008228	CGG	2	6	1163870	1163875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109897297
18068	NC_008228	ATT	2	6	1163943	1163948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897297
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18070	NC_008228	GAA	2	6	1164076	1164081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897297
18071	NC_008228	TGG	2	6	1164158	1164163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897297
18072	NC_008228	TCGT	2	8	1164196	1164203	0 %	50 %	25 %	25 %	109897297
18073	NC_008228	TTG	2	6	1164305	1164310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897297
18074	NC_008228	GGC	2	6	1164355	1164360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109897297
18075	NC_008228	GCT	2	6	1164400	1164405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897297
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18077	NC_008228	CTG	3	9	1164506	1164514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897297
18078	NC_008228	ATT	2	6	1164540	1164545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897297
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18084	NC_008228	TGAC	2	8	1164983	1164990	25 %	25 %	25 %	25 %	109897297
18085	NC_008228	ATC	2	6	1165090	1165095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897297
18086	NC_008228	TGAC	2	8	1165169	1165176	25 %	25 %	25 %	25 %	109897297
18087	NC_008228	TCA	2	6	1165185	1165190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897297
18088	NC_008228	TCG	2	6	1165268	1165273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897297
18089	NC_008228	GAT	2	6	1165279	1165284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897297
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18093	NC_008228	GCT	2	6	1165452	1165457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897298
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18101	NC_008228	GCA	2	6	1165926	1165931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897298
18102	NC_008228	GGT	2	6	1166049	1166054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897298
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18114	NC_008228	TTC	2	6	1166651	1166656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897299
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18464	NC_008228	TA	3	6	1188061	1188066	50 %	50 %	0 %	0 %	109897320
18465	NC_008228	CGA	2	6	1188148	1188153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897320
18466	NC_008228	TAA	2	6	1188156	1188161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897320
18467	NC_008228	CTAG	2	8	1188246	1188253	25 %	25 %	25 %	25 %	109897320
18468	NC_008228	GGTA	2	8	1188440	1188447	25 %	25 %	50 %	0 %	109897321
18469	NC_008228	TTC	2	6	1188448	1188453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897321
18470	NC_008228	ATC	2	6	1188510	1188515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897321
18471	NC_008228	T	7	7	1188526	1188532	0 %	100 %	0 %	0 %	109897321
18472	NC_008228	CA	3	6	1188544	1188549	50 %	0 %	0 %	50 %	109897321
18473	NC_008228	T	6	6	1188912	1188917	0 %	100 %	0 %	0 %	109897322
18474	NC_008228	AGC	3	9	1188945	1188953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897322
18475	NC_008228	TGTT	2	8	1188962	1188969	0 %	75 %	25 %	0 %	109897322
18476	NC_008228	GCT	2	6	1188976	1188981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897322
18477	NC_008228	CAGC	2	8	1188984	1188991	25 %	0 %	25 %	50 %	109897322
18478	NC_008228	TCT	2	6	1189010	1189015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897322
18479	NC_008228	TCT	2	6	1189186	1189191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897322
18480	NC_008228	CAA	2	6	1189259	1189264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897322
18481	NC_008228	TTA	2	6	1189270	1189275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897322
18482	NC_008228	AGC	2	6	1189450	1189455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897322
18483	NC_008228	GAT	2	6	1189534	1189539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897322
18484	NC_008228	TAT	2	6	1189551	1189556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897322
18485	NC_008228	GCG	2	6	1189561	1189566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109897322
18486	NC_008228	GGGCA	2	10	1189573	1189582	20 %	0 %	60 %	20 %	109897322
18487	NC_008228	ATT	2	6	1189676	1189681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897322
18488	NC_008228	TGG	2	6	1189682	1189687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897322
18489	NC_008228	ACA	2	6	1189928	1189933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897323
18490	NC_008228	ATG	2	6	1189957	1189962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897323
18491	NC_008228	CGC	2	6	1189982	1189987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109897323
18492	NC_008228	TTA	2	6	1190024	1190029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897323
18493	NC_008228	CGC	2	6	1190062	1190067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109897323
18494	NC_008228	TAT	2	6	1190120	1190125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897323
18495	NC_008228	TAT	2	6	1190163	1190168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897323
18496	NC_008228	AT	3	6	1190180	1190185	50 %	50 %	0 %	0 %	109897323
18497	NC_008228	GCA	2	6	1190242	1190247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897323
18498	NC_008228	GAT	2	6	1190275	1190280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897323
18499	NC_008228	CTG	2	6	1190282	1190287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897323
18500	NC_008228	AGC	2	6	1190295	1190300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897323

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