MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008228	GAT	2	6	821746	821751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897052
13002	NC_008228	GAAA	2	8	821809	821816	75 %	0 %	25 %	0 %	109897052
13003	NC_008228	TTG	2	6	821825	821830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897052
13004	NC_008228	AAG	2	6	821885	821890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897052
13005	NC_008228	AAC	2	6	821915	821920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897052
13006	NC_008228	TAT	2	6	821932	821937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13007	NC_008228	TAA	2	6	821938	821943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897052
13008	NC_008228	TTA	2	6	821949	821954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13009	NC_008228	A	7	7	821984	821990	100 %	0 %	0 %	0 %	109897052
13010	NC_008228	TAA	2	6	822085	822090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897052
13011	NC_008228	ATT	2	6	822177	822182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13012	NC_008228	ACA	2	6	822249	822254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897052
13013	NC_008228	GAA	2	6	822266	822271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897052
13014	NC_008228	GTGA	2	8	822287	822294	25 %	25 %	50 %	0 %	109897052
13015	NC_008228	GAT	2	6	822296	822301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897052
13016	NC_008228	ATT	2	6	822327	822332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13017	NC_008228	A	6	6	822365	822370	100 %	0 %	0 %	0 %	109897052
13018	NC_008228	TAGC	2	8	822387	822394	25 %	25 %	25 %	25 %	109897052
13019	NC_008228	GGC	2	6	822429	822434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109897052
13020	NC_008228	TGA	2	6	822448	822453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897052
13021	NC_008228	TTA	2	6	822468	822473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13022	NC_008228	GAA	2	6	822502	822507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897052
13023	NC_008228	TA	3	6	822526	822531	50 %	50 %	0 %	0 %	109897052
13024	NC_008228	GCG	2	6	822541	822546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109897052
13025	NC_008228	AGA	2	6	822571	822576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897052
13026	NC_008228	AAG	2	6	822581	822586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109897052
13027	NC_008228	TAC	2	6	822605	822610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897052
13028	NC_008228	TCA	2	6	822615	822620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897052
13029	NC_008228	TTA	2	6	822690	822695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897052
13030	NC_008228	CGA	2	6	822727	822732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897052
13031	NC_008228	AGT	2	6	822787	822792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897052
13032	NC_008228	AGGT	2	8	822822	822829	25 %	25 %	50 %	0 %	109897052
13033	NC_008228	ACA	2	6	822910	822915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109897052
13034	NC_008228	TGG	2	6	822967	822972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897052
13035	NC_008228	GTAAT	2	10	822993	823002	40 %	40 %	20 %	0 %	109897052
13036	NC_008228	GCA	2	6	823271	823276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897053
13037	NC_008228	GTA	2	6	823355	823360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897053
13038	NC_008228	ATT	2	6	823376	823381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897053
13039	NC_008228	TGA	2	6	823429	823434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897053
13040	NC_008228	ATT	2	6	823643	823648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897053
13041	NC_008228	T	6	6	823647	823652	0 %	100 %	0 %	0 %	109897053
13042	NC_008228	TCGA	2	8	823722	823729	25 %	25 %	25 %	25 %	109897053
13043	NC_008228	CT	4	8	823744	823751	0 %	50 %	0 %	50 %	109897053
13044	NC_008228	TAT	2	6	823752	823757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897053
13045	NC_008228	ATAG	2	8	823793	823800	50 %	25 %	25 %	0 %	109897053
13046	NC_008228	CAAATA	2	12	823811	823822	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	109897053
13047	NC_008228	AGC	2	6	823834	823839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897053
13048	NC_008228	TTA	2	6	823926	823931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897053
13049	NC_008228	GGA	2	6	824101	824106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109897053
13050	NC_008228	TAT	2	6	824134	824139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897053
13051	NC_008228	AG	3	6	824159	824164	50 %	0 %	50 %	0 %	109897053
13052	NC_008228	CTG	2	6	824386	824391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897054
13053	NC_008228	TTG	2	6	824446	824451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897054
13054	NC_008228	GATTG	2	10	824478	824487	20 %	40 %	40 %	0 %	109897054
13055	NC_008228	CGC	2	6	824555	824560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109897054
13056	NC_008228	T	6	6	824600	824605	0 %	100 %	0 %	0 %	109897054
13057	NC_008228	TCG	2	6	824619	824624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897054
13058	NC_008228	ATG	2	6	824663	824668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897054
13059	NC_008228	ATT	2	6	824693	824698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109897054
13060	NC_008228	T	6	6	824739	824744	0 %	100 %	0 %	0 %	109897054
13061	NC_008228	ACTTTT	2	12	824754	824765	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	109897054
13062	NC_008228	CTT	2	6	824778	824783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897054
13063	NC_008228	T	6	6	824883	824888	0 %	100 %	0 %	0 %	109897054
13064	NC_008228	AAT	2	6	824915	824920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897054
13065	NC_008228	TCTATC	2	12	824921	824932	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	109897054
13066	NC_008228	TTC	2	6	825011	825016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897054
13067	NC_008228	CT	3	6	825023	825028	0 %	50 %	0 %	50 %	109897054
13068	NC_008228	TC	3	6	825130	825135	0 %	50 %	0 %	50 %	109897054
13069	NC_008228	TTC	2	6	825150	825155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897054
13070	NC_008228	CAGGG	2	10	825172	825181	20 %	0 %	60 %	20 %	109897054
13071	NC_008228	CTT	2	6	825211	825216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897054
13072	NC_008228	TTG	2	6	825221	825226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897054
13073	NC_008228	ATTT	2	8	825244	825251	25 %	75 %	0 %	0 %	109897054
13074	NC_008228	CTG	2	6	825258	825263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897054
13075	NC_008228	GAG	2	6	825307	825312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109897054
13076	NC_008228	TTG	2	6	825326	825331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897054
13077	NC_008228	TGA	2	6	825363	825368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897054
13078	NC_008228	T	7	7	825399	825405	0 %	100 %	0 %	0 %	109897054
13079	NC_008228	A	7	7	825436	825442	100 %	0 %	0 %	0 %	109897054
13080	NC_008228	CAT	2	6	825461	825466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897054
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13084	NC_008228	TTACCT	2	12	826374	826385	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	109897055
13085	NC_008228	T	6	6	826482	826487	0 %	100 %	0 %	0 %	109897055
13086	NC_008228	TGC	3	9	826538	826546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897055
13087	NC_008228	GAT	2	6	826600	826605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897055
13088	NC_008228	AGT	2	6	826612	826617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897055
13089	NC_008228	AAT	2	6	826634	826639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897055
13090	NC_008228	TGT	2	6	826650	826655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897055
13091	NC_008228	GGTTG	2	10	826700	826709	0 %	40 %	60 %	0 %	109897056
13092	NC_008228	CT	3	6	826720	826725	0 %	50 %	0 %	50 %	109897056
13093	NC_008228	TGCT	2	8	826743	826750	0 %	50 %	25 %	25 %	109897056
13094	NC_008228	TGT	2	6	826840	826845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897056
13095	NC_008228	GCT	2	6	826997	827002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897056
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13097	NC_008228	TATGT	2	10	827043	827052	20 %	60 %	20 %	0 %	109897056
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13099	NC_008228	TAA	2	6	827103	827108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897056
13100	NC_008228	TGC	2	6	827119	827124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897056
13101	NC_008228	AT	3	6	827138	827143	50 %	50 %	0 %	0 %	109897056
13102	NC_008228	AGC	2	6	827192	827197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897056
13103	NC_008228	TGC	2	6	827221	827226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897056
13104	NC_008228	GTG	2	6	827235	827240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897056
13105	NC_008228	TGT	2	6	827299	827304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109897056
13106	NC_008228	GCA	2	6	827311	827316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897056
13107	NC_008228	CCTTG	2	10	827336	827345	0 %	40 %	20 %	40 %	109897056
13108	NC_008228	GTG	2	6	827396	827401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109897056
13109	NC_008228	TAA	2	6	827406	827411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897056
13110	NC_008228	ACT	2	6	827449	827454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897056
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13112	NC_008228	CTT	2	6	827633	827638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897056
13113	NC_008228	TCAA	2	8	827791	827798	50 %	25 %	0 %	25 %	109897056
13114	NC_008228	CGT	2	6	827879	827884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109897056
13115	NC_008228	TCT	2	6	827890	827895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897056
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13118	NC_008228	CTAT	2	8	828322	828329	25 %	50 %	0 %	25 %	109897056
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13485	NC_008228	AAT	2	6	853633	853638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109897075
13486	NC_008228	GTTA	2	8	853664	853671	25 %	50 %	25 %	0 %	109897075
13487	NC_008228	ATG	2	6	853830	853835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109897075
13488	NC_008228	GGCAA	2	10	853851	853860	40 %	0 %	40 %	20 %	109897075
13489	NC_008228	TAC	2	6	853901	853906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897075
13490	NC_008228	CTT	2	6	853963	853968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109897075
13491	NC_008228	TCA	2	6	854016	854021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109897075
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13493	NC_008228	CAG	2	6	854059	854064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109897075
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