MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_008228	ATG	2	6	29613	29618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896357
503	NC_008228	ATA	2	6	29670	29675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896357
504	NC_008228	GC	3	6	29727	29732	0 %	0 %	50 %	50 %	109896357
505	NC_008228	CGG	2	6	29783	29788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896357
506	NC_008228	ATC	2	6	29825	29830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896357
507	NC_008228	TAT	2	6	29925	29930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896357
508	NC_008228	TAA	2	6	29949	29954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896357
509	NC_008228	TGG	2	6	29970	29975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896357
510	NC_008228	TG	3	6	29978	29983	0 %	50 %	50 %	0 %	109896357
511	NC_008228	CAG	2	6	30035	30040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896357
512	NC_008228	A	6	6	30051	30056	100 %	0 %	0 %	0 %	109896357
513	NC_008228	ATT	2	6	30172	30177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896357
514	NC_008228	GCA	2	6	30203	30208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896357
515	NC_008228	TTCA	2	8	30279	30286	25 %	50 %	0 %	25 %	109896358
516	NC_008228	CGA	2	6	30326	30331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896358
517	NC_008228	GC	3	6	30338	30343	0 %	0 %	50 %	50 %	109896358
518	NC_008228	TCA	2	6	30350	30355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896358
519	NC_008228	CTT	2	6	30445	30450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896358
520	NC_008228	GAA	2	6	30474	30479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896358
521	NC_008228	TAT	2	6	30688	30693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896358
522	NC_008228	GTAT	2	8	31029	31036	25 %	50 %	25 %	0 %	109896359
523	NC_008228	GCA	2	6	31044	31049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896359
524	NC_008228	AATA	2	8	31148	31155	75 %	25 %	0 %	0 %	109896359
525	NC_008228	GAA	2	6	31159	31164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896359
526	NC_008228	A	6	6	31265	31270	100 %	0 %	0 %	0 %	109896359
527	NC_008228	AGC	2	6	31320	31325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896359
528	NC_008228	GAC	2	6	31426	31431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896360
529	NC_008228	T	6	6	31434	31439	0 %	100 %	0 %	0 %	109896360
530	NC_008228	CAA	2	6	31527	31532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896360
531	NC_008228	ACT	2	6	31533	31538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896360
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534	NC_008228	CTG	2	6	31823	31828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896360
535	NC_008228	TGG	2	6	31905	31910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896360
536	NC_008228	AG	3	6	32099	32104	50 %	0 %	50 %	0 %	109896361
537	NC_008228	CG	3	6	32126	32131	0 %	0 %	50 %	50 %	109896361
538	NC_008228	AAG	2	6	32336	32341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896361
539	NC_008228	TGG	2	6	32356	32361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896361
540	NC_008228	GGT	2	6	32368	32373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896361
541	NC_008228	A	6	6	32479	32484	100 %	0 %	0 %	0 %	109896361
542	NC_008228	GAC	2	6	32491	32496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896361
543	NC_008228	G	6	6	32536	32541	0 %	0 %	100 %	0 %	109896361
544	NC_008228	TGA	2	6	32550	32555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896361
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546	NC_008228	T	6	6	32613	32618	0 %	100 %	0 %	0 %	109896361
547	NC_008228	AAG	2	6	32676	32681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896361
548	NC_008228	TA	3	6	32690	32695	50 %	50 %	0 %	0 %	109896361
549	NC_008228	TTTGG	2	10	32721	32730	0 %	60 %	40 %	0 %	109896361
550	NC_008228	GCC	2	6	32793	32798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896361
551	NC_008228	AGA	2	6	32844	32849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896361
552	NC_008228	TAA	2	6	33096	33101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896362
553	NC_008228	CCA	2	6	33144	33149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896362
554	NC_008228	CAT	2	6	33184	33189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896362
555	NC_008228	ACA	3	9	33285	33293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896362
556	NC_008228	ATT	2	6	33346	33351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896362
557	NC_008228	AGC	2	6	33352	33357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896362
558	NC_008228	CA	3	6	33367	33372	50 %	0 %	0 %	50 %	109896362
559	NC_008228	AC	3	6	33390	33395	50 %	0 %	0 %	50 %	109896362
560	NC_008228	TTA	2	6	33469	33474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896362
561	NC_008228	TTC	2	6	33533	33538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896362
562	NC_008228	TAA	2	6	33577	33582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896362
563	NC_008228	TGA	2	6	33592	33597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896362
564	NC_008228	TAA	2	6	33654	33659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896362
565	NC_008228	CAA	2	6	34012	34017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896363
566	NC_008228	CAA	2	6	34036	34041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896363
567	NC_008228	ATG	2	6	34061	34066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896363
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572	NC_008228	GGCT	2	8	34239	34246	0 %	25 %	50 %	25 %	109896363
573	NC_008228	G	6	6	34271	34276	0 %	0 %	100 %	0 %	109896363
574	NC_008228	TTG	2	6	34297	34302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896363
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598	NC_008228	ACAT	2	8	35292	35299	50 %	25 %	0 %	25 %	109896365
599	NC_008228	TCC	2	6	35318	35323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	109896365
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605	NC_008228	CACC	2	8	35487	35494	25 %	0 %	0 %	75 %	109896365
606	NC_008228	TA	3	6	35512	35517	50 %	50 %	0 %	0 %	109896365
607	NC_008228	CT	3	6	35522	35527	0 %	50 %	0 %	50 %	109896365
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611	NC_008228	GCTC	2	8	45416	45423	0 %	25 %	25 %	50 %	109896366
612	NC_008228	CAT	2	6	45462	45467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896366
613	NC_008228	AGCTT	2	10	45473	45482	20 %	40 %	20 %	20 %	109896366
614	NC_008228	CAG	2	6	45607	45612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896366
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618	NC_008228	CAG	2	6	45832	45837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896366
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623	NC_008228	T	7	7	46054	46060	0 %	100 %	0 %	0 %	109896366
624	NC_008228	GCA	2	6	46230	46235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896366
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