MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudoalteromonas atlantica T6c chromosome

Total Repeats: 80859

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008228	AAG	2	6	319232	319237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896603
5002	NC_008228	AAGTAG	2	12	319313	319324	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	109896603
5003	NC_008228	ATT	2	6	319347	319352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896603
5004	NC_008228	TGG	2	6	319367	319372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896603
5005	NC_008228	AATTG	2	10	319407	319416	40 %	40 %	20 %	0 %	109896603
5006	NC_008228	ATT	2	6	319444	319449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896603
5007	NC_008228	GCA	2	6	319455	319460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896603
5008	NC_008228	GAA	2	6	319537	319542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896603
5009	NC_008228	A	6	6	319597	319602	100 %	0 %	0 %	0 %	109896603
5010	NC_008228	TTA	2	6	319683	319688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896603
5011	NC_008228	GAA	2	6	319858	319863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896604
5012	NC_008228	CTA	2	6	319953	319958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896604
5013	NC_008228	CGCA	2	8	320020	320027	25 %	0 %	25 %	50 %	109896604
5014	NC_008228	CAT	2	6	320097	320102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896604
5015	NC_008228	GCT	2	6	320118	320123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896604
5016	NC_008228	GGTG	2	8	320180	320187	0 %	25 %	75 %	0 %	109896604
5017	NC_008228	TTG	2	6	320225	320230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896604
5018	NC_008228	TGC	2	6	320360	320365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896604
5019	NC_008228	CAT	2	6	320475	320480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896604
5020	NC_008228	CGG	2	6	320529	320534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896604
5021	NC_008228	CTA	2	6	320667	320672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896604
5022	NC_008228	CCA	2	6	320927	320932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896605
5023	NC_008228	TCT	2	6	320956	320961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109896605
5024	NC_008228	GTG	2	6	321058	321063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896605
5025	NC_008228	GGT	2	6	321079	321084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896605
5026	NC_008228	GAA	2	6	321121	321126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896605
5027	NC_008228	TGG	2	6	321161	321166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896605
5028	NC_008228	ACTC	2	8	321191	321198	25 %	25 %	0 %	50 %	109896605
5029	NC_008228	ACC	2	6	321199	321204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896605
5030	NC_008228	CAA	2	6	321249	321254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896605
5031	NC_008228	TGA	2	6	321348	321353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896605
5032	NC_008228	TCA	2	6	321386	321391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896605
5033	NC_008228	TTA	2	6	321632	321637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896606
5034	NC_008228	AAG	2	6	321710	321715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896606
5035	NC_008228	AAC	2	6	321720	321725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896606
5036	NC_008228	CAT	2	6	321748	321753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896606
5037	NC_008228	GCG	2	6	321808	321813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896606
5038	NC_008228	ATG	2	6	321817	321822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896606
5039	NC_008228	ACA	2	6	321833	321838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896606
5040	NC_008228	ATT	2	6	322022	322027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896606
5041	NC_008228	AAC	2	6	322100	322105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896606
5042	NC_008228	TGC	2	6	322137	322142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896606
5043	NC_008228	GC	3	6	322198	322203	0 %	0 %	50 %	50 %	109896606
5044	NC_008228	GTT	2	6	322499	322504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896607
5045	NC_008228	GT	3	6	322526	322531	0 %	50 %	50 %	0 %	109896607
5046	NC_008228	TTA	2	6	322532	322537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896607
5047	NC_008228	AC	3	6	322575	322580	50 %	0 %	0 %	50 %	109896607
5048	NC_008228	TATT	2	8	322695	322702	25 %	75 %	0 %	0 %	109896607
5049	NC_008228	TAT	2	6	322739	322744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896607
5050	NC_008228	TCG	2	6	322746	322751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896607
5051	NC_008228	TTG	2	6	322761	322766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896607
5052	NC_008228	CTTG	2	8	322853	322860	0 %	50 %	25 %	25 %	109896607
5053	NC_008228	CAA	2	6	322898	322903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896607
5054	NC_008228	CA	3	6	322932	322937	50 %	0 %	0 %	50 %	109896607
5055	NC_008228	GC	3	6	322941	322946	0 %	0 %	50 %	50 %	109896607
5056	NC_008228	TGA	2	6	322950	322955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896607
5057	NC_008228	TGAC	2	8	322971	322978	25 %	25 %	25 %	25 %	109896607
5058	NC_008228	CA	3	6	323087	323092	50 %	0 %	0 %	50 %	109896607
5059	NC_008228	CGA	2	6	323119	323124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896607
5060	NC_008228	TCAA	2	8	323175	323182	50 %	25 %	0 %	25 %	109896607
5061	NC_008228	ATT	2	6	323266	323271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896607
5062	NC_008228	T	6	6	323327	323332	0 %	100 %	0 %	0 %	109896607
5063	NC_008228	CCA	2	6	323374	323379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109896607
5064	NC_008228	TCA	2	6	323455	323460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896608
5065	NC_008228	TGA	2	6	323563	323568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896608
5066	NC_008228	GCT	2	6	323596	323601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896608
5067	NC_008228	ATT	2	6	323650	323655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896608
5068	NC_008228	T	7	7	323740	323746	0 %	100 %	0 %	0 %	109896608
5069	NC_008228	ATTG	2	8	323774	323781	25 %	50 %	25 %	0 %	109896608
5070	NC_008228	ATG	2	6	323790	323795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896608
5071	NC_008228	ATA	2	6	323865	323870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896608
5072	NC_008228	GTT	2	6	323974	323979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896608
5073	NC_008228	AGC	2	6	323980	323985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896608
5074	NC_008228	TAG	2	6	324000	324005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896608
5075	NC_008228	TGG	2	6	324892	324897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	109896609
5076	NC_008228	TGA	2	6	324919	324924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896609
5077	NC_008228	GCA	2	6	324947	324952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896609
5078	NC_008228	CAG	2	6	324977	324982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896609
5079	NC_008228	CGC	2	6	325051	325056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	109896609
5080	NC_008228	TTA	2	6	325057	325062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896609
5081	NC_008228	ATT	2	6	325483	325488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896610
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5085	NC_008228	AGC	2	6	325565	325570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896610
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5087	NC_008228	CGA	2	6	325677	325682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	109896610
5088	NC_008228	T	6	6	325887	325892	0 %	100 %	0 %	0 %	109896610
5089	NC_008228	AGA	2	6	325896	325901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896610
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5091	NC_008228	AGT	2	6	325912	325917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896610
5092	NC_008228	AT	3	6	325970	325975	50 %	50 %	0 %	0 %	109896610
5093	NC_008228	CAATT	2	10	326085	326094	40 %	40 %	0 %	20 %	109896610
5094	NC_008228	GAA	2	6	326167	326172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109896610
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5097	NC_008228	CTA	2	6	326356	326361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896610
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5101	NC_008228	AT	3	6	326651	326656	50 %	50 %	0 %	0 %	109896611
5102	NC_008228	TGA	2	6	326685	326690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896611
5103	NC_008228	GCT	2	6	326693	326698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896611
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5105	NC_008228	TTA	2	6	327032	327037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896611
5106	NC_008228	CGT	2	6	327039	327044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896611
5107	NC_008228	CGG	2	6	327127	327132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	109896612
5108	NC_008228	TGA	2	6	327182	327187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896612
5109	NC_008228	CTG	2	6	327206	327211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	109896612
5110	NC_008228	TGA	2	6	327223	327228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109896612
5111	NC_008228	A	6	6	327263	327268	100 %	0 %	0 %	0 %	109896612
5112	NC_008228	CAA	2	6	327282	327287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896612
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5117	NC_008228	GTT	2	6	327872	327877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896613
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5119	NC_008228	TAT	2	6	327933	327938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109896613
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5121	NC_008228	CAT	2	6	328052	328057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896613
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5487	NC_008228	TCA	2	6	348957	348962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109896629
5488	NC_008228	CAA	2	6	348969	348974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109896629
5489	NC_008228	AAT	2	6	349292	349297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109896630
5490	NC_008228	A	6	6	349307	349312	100 %	0 %	0 %	0 %	109896630
5491	NC_008228	A	6	6	349366	349371	100 %	0 %	0 %	0 %	109896630
5492	NC_008228	TTG	2	6	349429	349434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109896630
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