MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Psychrobacter cryohalolentis K5 plasmid 1

Total Repeats: 606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007968	TCA	2	6	261	266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004798
2	NC_007968	TTA	2	6	335	340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004798
3	NC_007968	TAA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004798
4	NC_007968	CAA	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004798
5	NC_007968	GCGT	2	8	447	454	0 %	25 %	50 %	25 %	93004798
6	NC_007968	AC	3	6	528	533	50 %	0 %	0 %	50 %	93004798
7	NC_007968	GAA	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004798
8	NC_007968	CAT	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004798
9	NC_007968	AAG	2	6	673	678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004798
10	NC_007968	ATA	2	6	696	701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004798
11	NC_007968	ACC	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004787
12	NC_007968	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004787
13	NC_007968	TGC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004787
14	NC_007968	TGC	2	6	804	809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004787
15	NC_007968	A	7	7	846	852	100 %	0 %	0 %	0 %	93004787
16	NC_007968	TCC	2	6	869	874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	93004787
17	NC_007968	TAA	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004787
18	NC_007968	TTA	2	6	947	952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004787
19	NC_007968	AATT	2	8	997	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	93004787
20	NC_007968	AT	3	6	1011	1016	50 %	50 %	0 %	0 %	93004787
21	NC_007968	T	6	6	1028	1033	0 %	100 %	0 %	0 %	93004787
22	NC_007968	CGT	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004787
23	NC_007968	CAA	2	6	1162	1167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004787
24	NC_007968	TAT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004809
25	NC_007968	A	6	6	1551	1556	100 %	0 %	0 %	0 %	93004809
26	NC_007968	GAA	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004809
27	NC_007968	AGC	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004809
28	NC_007968	CTG	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004809
29	NC_007968	TAA	2	6	1709	1714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004809
30	NC_007968	ATC	2	6	1731	1736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004809
31	NC_007968	CAA	2	6	1799	1804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004809
32	NC_007968	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004809
33	NC_007968	AGA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004809
34	NC_007968	AAGT	2	8	1915	1922	50 %	25 %	25 %	0 %	93004809
35	NC_007968	A	7	7	1937	1943	100 %	0 %	0 %	0 %	93004809
36	NC_007968	CAAAC	2	10	1945	1954	60 %	0 %	0 %	40 %	93004809
37	NC_007968	GTT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	93004809
38	NC_007968	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004809
39	NC_007968	AAT	3	9	2757	2765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004820
40	NC_007968	AAC	2	6	2822	2827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004820
41	NC_007968	ATA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004820
42	NC_007968	AGC	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004820
43	NC_007968	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004820
44	NC_007968	CAC	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004820
45	NC_007968	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004820
46	NC_007968	CTG	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004820
47	NC_007968	GATA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	93004820
48	NC_007968	TTA	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004826
49	NC_007968	ATG	2	6	3421	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004826
50	NC_007968	A	6	6	3428	3433	100 %	0 %	0 %	0 %	93004826
51	NC_007968	CCG	2	6	3455	3460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	93004826
52	NC_007968	TCA	2	6	3504	3509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
53	NC_007968	ATC	2	6	3589	3594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
54	NC_007968	CTA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
55	NC_007968	AAT	2	6	3649	3654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004826
56	NC_007968	CTG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004826
57	NC_007968	GCACC	2	10	3747	3756	20 %	0 %	20 %	60 %	93004826
58	NC_007968	TCA	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
59	NC_007968	TTC	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004826
60	NC_007968	ATGA	2	8	3865	3872	50 %	25 %	25 %	0 %	93004826
61	NC_007968	T	6	6	3873	3878	0 %	100 %	0 %	0 %	93004826
62	NC_007968	ACT	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
63	NC_007968	ATC	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
64	NC_007968	T	7	7	4098	4104	0 %	100 %	0 %	0 %	93004826
65	NC_007968	CAT	2	6	4131	4136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
66	NC_007968	TCA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004826
67	NC_007968	TAA	2	6	4168	4173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004826
68	NC_007968	TG	3	6	4188	4193	0 %	50 %	50 %	0 %	93004826
69	NC_007968	T	6	6	4254	4259	0 %	100 %	0 %	0 %	93004827
70	NC_007968	AAG	2	6	4395	4400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004827
71	NC_007968	CCAT	2	8	4469	4476	25 %	25 %	0 %	50 %	93004827
72	NC_007968	ATG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004827
73	NC_007968	GTC	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004827
74	NC_007968	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	93004827
75	NC_007968	TAA	2	6	4664	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004827
76	NC_007968	ATA	2	6	4670	4675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004827
77	NC_007968	AGC	2	6	4714	4719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004827
78	NC_007968	T	6	6	4739	4744	0 %	100 %	0 %	0 %	93004827
79	NC_007968	TTC	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004827
80	NC_007968	AAGC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	25 %	25 %	93004828
81	NC_007968	CCAA	2	8	4989	4996	50 %	0 %	0 %	50 %	93004828
82	NC_007968	TAA	2	6	5021	5026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004828
83	NC_007968	AAC	2	6	5053	5058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004828
84	NC_007968	ATG	3	9	5059	5067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004828
85	NC_007968	GC	3	6	5090	5095	0 %	0 %	50 %	50 %	93004828
86	NC_007968	TCA	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004828
87	NC_007968	AAG	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004828
88	NC_007968	TGAA	2	8	5246	5253	50 %	25 %	25 %	0 %	93004828
89	NC_007968	ATA	2	6	5284	5289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004828
90	NC_007968	GCA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004828
91	NC_007968	TTC	3	9	5346	5354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004828
92	NC_007968	CAAT	2	8	5423	5430	50 %	25 %	0 %	25 %	93004828
93	NC_007968	GCT	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004828
94	NC_007968	ATC	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004828
95	NC_007968	CTT	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004828
96	NC_007968	ATC	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004828
97	NC_007968	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004828
98	NC_007968	ACC	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004828
99	NC_007968	CAT	2	6	5697	5702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004828
100	NC_007968	CGA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004828
101	NC_007968	ACC	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004828
102	NC_007968	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004828
103	NC_007968	CCA	2	6	5937	5942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004828
104	NC_007968	TAAA	2	8	5982	5989	75 %	25 %	0 %	0 %	93004828
105	NC_007968	GTT	2	6	6475	6480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	93004829
106	NC_007968	TCA	2	6	6510	6515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004829
107	NC_007968	CTT	2	6	6517	6522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004829
108	NC_007968	CAA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004829
109	NC_007968	TCT	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004829
110	NC_007968	AAAG	2	8	6677	6684	75 %	0 %	25 %	0 %	93004829
111	NC_007968	ATC	2	6	6734	6739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004829
112	NC_007968	CGT	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004829
113	NC_007968	AT	3	6	6922	6927	50 %	50 %	0 %	0 %	93004829
114	NC_007968	GAC	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004829
115	NC_007968	TGCT	2	8	6988	6995	0 %	50 %	25 %	25 %	93004829
116	NC_007968	CTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004829
117	NC_007968	GTC	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004829
118	NC_007968	ACCGC	2	10	7194	7203	20 %	0 %	20 %	60 %	93004829
119	NC_007968	TTTAAA	2	12	7241	7252	50 %	50 %	0 %	0 %	93004829
120	NC_007968	GCA	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004829
121	NC_007968	ATA	2	6	7461	7466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004829
122	NC_007968	ATT	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004829
123	NC_007968	CATA	2	8	7555	7562	50 %	25 %	0 %	25 %	93004829
124	NC_007968	TAA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004829
125	NC_007968	TGT	2	6	7644	7649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	93004829
126	NC_007968	TAG	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004829
127	NC_007968	AAG	2	6	7662	7667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004829
128	NC_007968	CTGT	2	8	7675	7682	0 %	50 %	25 %	25 %	93004829
129	NC_007968	GCA	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004829
130	NC_007968	CAG	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004829
131	NC_007968	CCA	2	6	8001	8006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004829
132	NC_007968	GCT	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004829
133	NC_007968	CTT	2	6	8086	8091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004829
134	NC_007968	CGA	2	6	8107	8112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004829
135	NC_007968	A	6	6	8400	8405	100 %	0 %	0 %	0 %	93004818
136	NC_007968	TAT	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004818
137	NC_007968	GCA	2	6	8439	8444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	93004818
138	NC_007968	A	7	7	8484	8490	100 %	0 %	0 %	0 %	93004818
139	NC_007968	A	6	6	8515	8520	100 %	0 %	0 %	0 %	93004818
140	NC_007968	ATTGC	2	10	8529	8538	20 %	40 %	20 %	20 %	93004818
141	NC_007968	A	6	6	8603	8608	100 %	0 %	0 %	0 %	93004818
142	NC_007968	AAT	2	6	8628	8633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	93004818
143	NC_007968	TAC	2	6	8658	8663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004818
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145	NC_007968	TTA	2	6	8730	8735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004818
146	NC_007968	ATT	2	6	9145	9150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004830
147	NC_007968	ACC	2	6	9206	9211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	93004830
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157	NC_007968	ATG	2	6	10141	10146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004789
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164	NC_007968	CA	3	6	10355	10360	50 %	0 %	0 %	50 %	93004789
165	NC_007968	TTA	2	6	10422	10427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	93004789
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256	NC_007968	TTC	2	6	16999	17004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004794
257	NC_007968	TAC	2	6	17086	17091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004794
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260	NC_007968	CAT	2	6	17210	17215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004794
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263	NC_007968	TTCT	2	8	17348	17355	0 %	75 %	0 %	25 %	93004794
264	NC_007968	CTT	2	6	17413	17418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004794
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268	NC_007968	G	6	6	17718	17723	0 %	0 %	100 %	0 %	93004794
269	NC_007968	GTA	2	6	17833	17838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	93004794
270	NC_007968	T	6	6	18234	18239	0 %	100 %	0 %	0 %	93004795
271	NC_007968	TG	3	6	18260	18265	0 %	50 %	50 %	0 %	93004795
272	NC_007968	AATC	2	8	18279	18286	50 %	25 %	0 %	25 %	93004795
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282	NC_007968	TGT	2	6	18755	18760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	93004795
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284	NC_007968	CTG	2	6	18795	18800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	93004795
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300	NC_007968	GTT	2	6	20263	20268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	93004796
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372	NC_007968	TACT	2	8	23510	23517	25 %	50 %	0 %	25 %	93004800
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382	NC_007968	ATTCA	2	10	24723	24732	40 %	40 %	0 %	20 %	93004823
383	NC_007968	TCGC	2	8	24784	24791	0 %	25 %	25 %	50 %	93004823
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388	NC_007968	TTC	2	6	25117	25122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	93004803
389	NC_007968	TG	3	6	25124	25129	0 %	50 %	50 %	0 %	93004803
390	NC_007968	TCA	2	6	25145	25150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004803
391	NC_007968	CAA	2	6	25197	25202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	93004803
392	NC_007968	ACT	2	6	25240	25245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	93004803
393	NC_007968	CAGC	2	8	25383	25390	25 %	0 %	25 %	50 %	93004803
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395	NC_007968	GAA	2	6	26006	26011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	93004804
396	NC_007968	A	6	6	26010	26015	100 %	0 %	0 %	0 %	93004804
397	NC_007968	AG	3	6	26123	26128	50 %	0 %	50 %	0 %	93004804
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399	NC_007968	AG	3	6	26196	26201	50 %	0 %	50 %	0 %	93004804
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