MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Polaromonas sp. JS666 chromosome

Total Repeats: 107353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007948	TGAG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	91785914
2	NC_007948	AGC	2	6	119	124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785914
3	NC_007948	TCCG	2	8	140	147	0 %	25 %	25 %	50 %	91785914
4	NC_007948	CTGGA	2	10	211	220	20 %	20 %	40 %	20 %	91785914
5	NC_007948	A	6	6	260	265	100 %	0 %	0 %	0 %	91785914
6	NC_007948	GCTC	2	8	297	304	0 %	25 %	25 %	50 %	91785914
7	NC_007948	CGC	2	6	315	320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785914
8	NC_007948	GCCG	2	8	369	376	0 %	0 %	50 %	50 %	91785914
9	NC_007948	GAA	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91785914
10	NC_007948	GC	3	6	431	436	0 %	0 %	50 %	50 %	91785914
11	NC_007948	GGGCC	2	10	477	486	0 %	0 %	60 %	40 %	91785914
12	NC_007948	AGC	2	6	505	510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785914
13	NC_007948	CGG	2	6	543	548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785914
14	NC_007948	CAA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785914
15	NC_007948	GCT	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785914
16	NC_007948	CGG	2	6	611	616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785914
17	NC_007948	CACT	2	8	709	716	25 %	25 %	0 %	50 %	91785914
18	NC_007948	TGC	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785914
19	NC_007948	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785914
20	NC_007948	T	6	6	745	750	0 %	100 %	0 %	0 %	91785914
21	NC_007948	CAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785914
22	NC_007948	CGCA	2	8	763	770	25 %	0 %	25 %	50 %	91785914
23	NC_007948	TTC	2	6	778	783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91785914
24	NC_007948	TGA	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91785914
25	NC_007948	GCC	2	6	915	920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785914
26	NC_007948	GGA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91785914
27	NC_007948	TTC	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91785914
28	NC_007948	GC	3	6	1043	1048	0 %	0 %	50 %	50 %	91785914
29	NC_007948	TCCA	2	8	1093	1100	25 %	25 %	0 %	50 %	91785914
30	NC_007948	CTG	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785914
31	NC_007948	AGA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91785914
32	NC_007948	AAG	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91785914
33	NC_007948	A	6	6	1286	1291	100 %	0 %	0 %	0 %	91785914
34	NC_007948	GGC	2	6	1318	1323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785914
35	NC_007948	ACCAC	2	10	1328	1337	40 %	0 %	0 %	60 %	91785914
36	NC_007948	TGC	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785914
37	NC_007948	CAG	2	6	1375	1380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785914
38	NC_007948	GCAGCT	2	12	1845	1856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	91785915
39	NC_007948	CAC	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91785915
40	NC_007948	CAC	3	9	1923	1931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91785915
41	NC_007948	GGTG	2	8	1932	1939	0 %	25 %	75 %	0 %	91785915
42	NC_007948	AAGC	2	8	2007	2014	50 %	0 %	25 %	25 %	91785915
43	NC_007948	GGC	2	6	2026	2031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785915
44	NC_007948	CCG	2	6	2060	2065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785915
45	NC_007948	GCC	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785915
46	NC_007948	GCT	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785915
47	NC_007948	CTA	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785915
48	NC_007948	TTTG	2	8	2202	2209	0 %	75 %	25 %	0 %	91785915
49	NC_007948	AGC	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785915
50	NC_007948	TGG	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91785915
51	NC_007948	TCG	2	6	2266	2271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785915
52	NC_007948	AAGG	2	8	2356	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	91785915
53	NC_007948	GAA	2	6	2475	2480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91785915
54	NC_007948	CAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785915
55	NC_007948	GCT	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785915
56	NC_007948	CAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785915
57	NC_007948	CGG	2	6	2658	2663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785915
58	NC_007948	ACCT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	0 %	50 %	91785915
59	NC_007948	GCT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785915
60	NC_007948	CGA	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785915
61	NC_007948	GTG	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91785915
62	NC_007948	GAA	2	6	2950	2955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91785916
63	NC_007948	ACCA	2	8	3040	3047	50 %	0 %	0 %	50 %	91785916
64	NC_007948	CAC	2	6	3163	3168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91785916
65	NC_007948	GGT	2	6	3180	3185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91785916
66	NC_007948	GGCC	2	8	3210	3217	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
67	NC_007948	CGA	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
68	NC_007948	TCG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
69	NC_007948	GCC	2	6	3334	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
70	NC_007948	CGG	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785916
71	NC_007948	GGCGTG	2	12	3415	3426	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	91785916
72	NC_007948	TGC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
73	NC_007948	CGC	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
74	NC_007948	CG	3	6	3503	3508	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
75	NC_007948	CAT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
76	NC_007948	AAC	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785916
77	NC_007948	T	6	6	3687	3692	0 %	100 %	0 %	0 %	91785916
78	NC_007948	AAC	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785916
79	NC_007948	GAC	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
80	NC_007948	GCCGGC	2	12	3751	3762	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
81	NC_007948	TTG	2	6	3776	3781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91785916
82	NC_007948	TCA	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
83	NC_007948	TGC	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
84	NC_007948	GCC	2	6	3826	3831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
85	NC_007948	CAA	2	6	3927	3932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91785916
86	NC_007948	CGG	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785916
87	NC_007948	CACC	2	8	3954	3961	25 %	0 %	0 %	75 %	91785916
88	NC_007948	GC	3	6	3972	3977	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
89	NC_007948	CG	3	6	3986	3991	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
90	NC_007948	TCA	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
91	NC_007948	CGA	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
92	NC_007948	A	6	6	4027	4032	100 %	0 %	0 %	0 %	91785916
93	NC_007948	CGA	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
94	NC_007948	TGC	2	6	4075	4080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
95	NC_007948	CCAG	2	8	4115	4122	25 %	0 %	25 %	50 %	91785916
96	NC_007948	AGC	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
97	NC_007948	GCC	2	6	4178	4183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
98	NC_007948	ACG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
99	NC_007948	ATC	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
100	NC_007948	GCC	2	6	4249	4254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
101	NC_007948	CG	3	6	4269	4274	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
102	NC_007948	GC	3	6	4279	4284	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
103	NC_007948	CGC	2	6	4294	4299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
104	NC_007948	CCG	2	6	4397	4402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
105	NC_007948	GCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
106	NC_007948	CGG	2	6	4560	4565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785916
107	NC_007948	GGC	2	6	4570	4575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785916
108	NC_007948	GAC	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
109	NC_007948	ACC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91785916
110	NC_007948	CAT	4	12	4623	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
111	NC_007948	CCGACG	2	12	4637	4648	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	91785916
112	NC_007948	GC	3	6	4655	4660	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
113	NC_007948	CTT	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91785916
114	NC_007948	CCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
115	NC_007948	TGC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785916
116	NC_007948	GC	3	6	4968	4973	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
117	NC_007948	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
118	NC_007948	GC	3	6	5072	5077	0 %	0 %	50 %	50 %	91785916
119	NC_007948	GCC	3	9	5135	5143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
120	NC_007948	AGC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
121	NC_007948	GCC	3	9	5218	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91785916
122	NC_007948	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785916
123	NC_007948	GCG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785916
124	NC_007948	GAAG	2	8	5286	5293	50 %	0 %	50 %	0 %	91785916
125	NC_007948	GAC	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
126	NC_007948	GAC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785916
127	NC_007948	TGA	2	6	5499	5504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91785916
128	NC_007948	GCGG	2	8	5544	5551	0 %	0 %	75 %	25 %	91785916
129	NC_007948	CTA	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785917
130	NC_007948	TCG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785917
131	NC_007948	GTC	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785917
132	NC_007948	CGT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785917
133	NC_007948	AGC	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785917
134	NC_007948	TTG	2	6	5965	5970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91785917
135	NC_007948	CGA	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91785917
136	NC_007948	GCG	2	6	5986	5991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785917
137	NC_007948	TGC	3	9	6002	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91785917
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264	NC_007948	CG	4	8	12377	12384	0 %	0 %	50 %	50 %	91785925
265	NC_007948	CG	3	6	12390	12395	0 %	0 %	50 %	50 %	91785925
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399	NC_007948	CGG	2	6	17864	17869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785930
400	NC_007948	CGGC	2	8	17929	17936	0 %	0 %	50 %	50 %	91785930
401	NC_007948	CGG	2	6	18000	18005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785930
402	NC_007948	GGCG	2	8	18011	18018	0 %	0 %	75 %	25 %	91785930
403	NC_007948	CGG	2	6	18023	18028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91785930
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489	NC_007948	TGG	2	6	21914	21919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91785934
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493	NC_007948	CTC	2	6	22207	22212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91785935
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495	NC_007948	GAAA	2	8	22235	22242	75 %	0 %	25 %	0 %	91785935
496	NC_007948	TTGT	2	8	22312	22319	0 %	75 %	25 %	0 %	91785935
497	NC_007948	GAG	2	6	22373	22378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91785935
498	NC_007948	CGAG	2	8	22428	22435	25 %	0 %	50 %	25 %	91785935
499	NC_007948	AGCGC	2	10	22471	22480	20 %	0 %	40 %	40 %	91785935
500	NC_007948	TCA	2	6	22735	22740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91785936

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