MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas fluorescens Pf0-1 chromosome

Total Repeats: 123810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007492	GCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456229
2	NC_007492	CTGC	2	8	613	620	0 %	25 %	25 %	50 %	77456229
3	NC_007492	CAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456229
4	NC_007492	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456229
5	NC_007492	CTG	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456229
6	NC_007492	TTA	2	6	790	795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77456229
7	NC_007492	GCA	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456229
8	NC_007492	CTC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77456229
9	NC_007492	GCT	2	6	847	852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456229
10	NC_007492	AGA	2	6	948	953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456229
11	NC_007492	GC	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	77456229
12	NC_007492	GCG	2	6	1138	1143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456229
13	NC_007492	GGC	2	6	1198	1203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456229
14	NC_007492	ACC	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456229
15	NC_007492	AGA	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456229
16	NC_007492	CTG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456229
17	NC_007492	CGA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456229
18	NC_007492	TTC	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456229
19	NC_007492	CAG	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456229
20	NC_007492	GAAA	2	8	1500	1507	75 %	0 %	25 %	0 %	77456229
21	NC_007492	GCC	2	6	1569	1574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456229
22	NC_007492	TGA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456229
23	NC_007492	GCG	2	6	1645	1650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456229
24	NC_007492	TTC	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456229
25	NC_007492	GC	3	6	1697	1702	0 %	0 %	50 %	50 %	77456229
26	NC_007492	TAC	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456229
27	NC_007492	AAGATC	2	12	1846	1857	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	77456229
28	NC_007492	CGTTCG	2	12	1879	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456229
29	NC_007492	ACCA	2	8	1936	1943	50 %	0 %	0 %	50 %	77456229
30	NC_007492	GGC	2	6	1972	1977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456229
31	NC_007492	CTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456229
32	NC_007492	TGA	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456229
33	NC_007492	CGT	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456230
34	NC_007492	TGC	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456230
35	NC_007492	CAA	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456230
36	NC_007492	GGTC	2	8	2286	2293	0 %	25 %	50 %	25 %	77456230
37	NC_007492	GAG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77456230
38	NC_007492	GC	3	6	2341	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	77456230
39	NC_007492	CGA	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456230
40	NC_007492	TGG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456230
41	NC_007492	GCCG	2	8	2428	2435	0 %	0 %	50 %	50 %	77456230
42	NC_007492	GAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456230
43	NC_007492	CAG	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456230
44	NC_007492	TAC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456230
45	NC_007492	CCGTG	2	10	2628	2637	0 %	20 %	40 %	40 %	77456230
46	NC_007492	CAG	2	6	2689	2694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456230
47	NC_007492	CCA	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456230
48	NC_007492	CAC	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456230
49	NC_007492	ACC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456230
50	NC_007492	TTCACC	2	12	2818	2829	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	77456230
51	NC_007492	CAA	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456230
52	NC_007492	GAA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456230
53	NC_007492	GAA	3	9	3037	3045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456230
54	NC_007492	CGG	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456230
55	NC_007492	CTG	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456230
56	NC_007492	TGA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456230
57	NC_007492	CAG	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456230
58	NC_007492	TCCCCC	2	12	3303	3314	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	77456231
59	NC_007492	CTG	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456231
60	NC_007492	CGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	25 %	25 %	77456231
61	NC_007492	GTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77456231
62	NC_007492	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456231
63	NC_007492	GCCAG	2	10	3796	3805	20 %	0 %	40 %	40 %	77456231
64	NC_007492	CCG	2	6	3824	3829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456231
65	NC_007492	CAG	2	6	3975	3980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456231
66	NC_007492	CA	3	6	4036	4041	50 %	0 %	0 %	50 %	77456231
67	NC_007492	CGC	2	6	4043	4048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456231
68	NC_007492	GCA	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456231
69	NC_007492	TGG	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456231
70	NC_007492	TGG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456231
71	NC_007492	CG	3	6	4191	4196	0 %	0 %	50 %	50 %	77456231
72	NC_007492	GAA	2	6	4361	4366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456232
73	NC_007492	TACG	2	8	4369	4376	25 %	25 %	25 %	25 %	77456232
74	NC_007492	CGA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456232
75	NC_007492	CAC	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456232
76	NC_007492	GGT	2	6	4486	4491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456232
77	NC_007492	TCGA	2	8	4499	4506	25 %	25 %	25 %	25 %	77456232
78	NC_007492	CGA	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456232
79	NC_007492	CAT	3	9	4540	4548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456232
80	NC_007492	CCG	3	9	4626	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456232
81	NC_007492	TCA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456232
82	NC_007492	TCC	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77456232
83	NC_007492	CGG	2	6	4660	4665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456232
84	NC_007492	GAC	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456232
85	NC_007492	GGT	2	6	4697	4702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456232
86	NC_007492	GAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456232
87	NC_007492	GAA	2	6	4994	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456232
88	NC_007492	GGC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456232
89	NC_007492	TGCG	2	8	5022	5029	0 %	25 %	50 %	25 %	77456232
90	NC_007492	CAA	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456232
91	NC_007492	TGT	2	6	5154	5159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77456232
92	NC_007492	CAA	2	6	5167	5172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456232
93	NC_007492	TGG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77456232
94	NC_007492	AAC	2	6	5237	5242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456232
95	NC_007492	GAA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77456232
96	NC_007492	CCA	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456232
97	NC_007492	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456232
98	NC_007492	TTC	2	6	5380	5385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456232
99	NC_007492	CTG	2	6	5438	5443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456232
100	NC_007492	CGAA	2	8	5451	5458	50 %	0 %	25 %	25 %	77456232
101	NC_007492	GTC	2	6	5468	5473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456232
102	NC_007492	GAT	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456232
103	NC_007492	TGCCCG	2	12	5491	5502	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77456232
104	NC_007492	GCG	2	6	5507	5512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456232
105	NC_007492	CGC	2	6	5534	5539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456232
106	NC_007492	GC	3	6	5544	5549	0 %	0 %	50 %	50 %	77456232
107	NC_007492	GGC	2	6	5642	5647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456232
108	NC_007492	GAT	2	6	5737	5742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456232
109	NC_007492	ACA	2	6	5805	5810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77456232
110	NC_007492	CAT	4	12	5833	5844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456232
111	NC_007492	CTG	3	9	5882	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456232
112	NC_007492	CTT	3	9	5893	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456232
113	NC_007492	CTACAT	2	12	5932	5943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77456232
114	NC_007492	GCC	2	6	5950	5955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456232
115	NC_007492	GCAA	2	8	5976	5983	50 %	0 %	25 %	25 %	77456232
116	NC_007492	GAC	3	9	5999	6007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456232
117	NC_007492	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456232
118	NC_007492	GCCG	2	8	6193	6200	0 %	0 %	50 %	50 %	77456232
119	NC_007492	CTGG	2	8	6241	6248	0 %	25 %	50 %	25 %	77456232
120	NC_007492	CTT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456232
121	NC_007492	GCA	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456232
122	NC_007492	CGT	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456232
123	NC_007492	CTT	2	6	6455	6460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456232
124	NC_007492	A	6	6	6494	6499	100 %	0 %	0 %	0 %	77456232
125	NC_007492	ACC	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77456232
126	NC_007492	GCC	2	6	6845	6850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456233
127	NC_007492	ATACCC	2	12	6865	6876	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	77456233
128	NC_007492	CCG	2	6	6906	6911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77456233
129	NC_007492	TTG	2	6	6923	6928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77456233
130	NC_007492	GATA	2	8	6936	6943	50 %	25 %	25 %	0 %	77456233
131	NC_007492	TTC	2	6	6973	6978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77456233
132	NC_007492	TCGT	2	8	6991	6998	0 %	50 %	25 %	25 %	77456233
133	NC_007492	CGT	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456233
134	NC_007492	TCG	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456233
135	NC_007492	ATG	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456233
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137	NC_007492	GCA	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456233
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139	NC_007492	GCA	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456233
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142	NC_007492	CGG	2	6	7518	7523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456233
143	NC_007492	CCAG	2	8	7750	7757	25 %	0 %	25 %	50 %	77456234
144	NC_007492	GTT	2	6	7766	7771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77456234
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151	NC_007492	ATCTG	2	10	8062	8071	20 %	40 %	20 %	20 %	77456234
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157	NC_007492	CTG	2	6	8448	8453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456234
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165	NC_007492	CTG	2	6	8946	8951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456234
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263	NC_007492	CGA	2	6	13468	13473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456238
264	NC_007492	GAC	2	6	13562	13567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456238
265	NC_007492	GTA	2	6	13577	13582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456238
266	NC_007492	TGC	2	6	13584	13589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456238
267	NC_007492	CGG	2	6	13629	13634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456238
268	NC_007492	GGC	2	6	13649	13654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456238
269	NC_007492	GC	3	6	13677	13682	0 %	0 %	50 %	50 %	77456238
270	NC_007492	CA	3	6	13742	13747	50 %	0 %	0 %	50 %	77456238
271	NC_007492	GGCT	2	8	13815	13822	0 %	25 %	50 %	25 %	77456238
272	NC_007492	GCT	2	6	13914	13919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77456239
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293	NC_007492	CGG	2	6	15161	15166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77456240
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332	NC_007492	GAT	2	6	16376	16381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77456242
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386	NC_007492	ACG	2	6	18536	18541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456244
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388	NC_007492	CGA	2	6	18625	18630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77456244
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500	NC_007492	CCGG	2	8	24278	24285	0 %	0 %	50 %	50 %	77456250

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