MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A small plasmid

Total Repeats: 823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007275	TTC	2	6	195	200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725279
2	NC_007275	C	7	7	233	239	0 %	0 %	0 %	100 %	71725279
3	NC_007275	CTG	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725279
4	NC_007275	CCA	2	6	371	376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725293
5	NC_007275	CA	3	6	378	383	50 %	0 %	0 %	50 %	71725293
6	NC_007275	CCG	2	6	388	393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725293
7	NC_007275	T	6	6	399	404	0 %	100 %	0 %	0 %	71725293
8	NC_007275	GAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725293
9	NC_007275	CTGG	2	8	552	559	0 %	25 %	50 %	25 %	71725293
10	NC_007275	TGCCG	2	10	666	675	0 %	20 %	40 %	40 %	71725293
11	NC_007275	TG	3	6	678	683	0 %	50 %	50 %	0 %	71725293
12	NC_007275	CAC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725293
13	NC_007275	GCG	2	6	736	741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725293
14	NC_007275	TGG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725293
15	NC_007275	GAC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725293
16	NC_007275	AGC	2	6	950	955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725293
17	NC_007275	CGCGAG	2	12	985	996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	71725293
18	NC_007275	GTTC	2	8	1001	1008	0 %	50 %	25 %	25 %	71725293
19	NC_007275	GCTC	2	8	1022	1029	0 %	25 %	25 %	50 %	71725293
20	NC_007275	GTC	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725293
21	NC_007275	GGC	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725293
22	NC_007275	CAAGG	2	10	1300	1309	40 %	0 %	40 %	20 %	71725293
23	NC_007275	TGC	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725293
24	NC_007275	CGGC	2	8	1396	1403	0 %	0 %	50 %	50 %	71725293
25	NC_007275	CAG	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725293
26	NC_007275	ACC	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725293
27	NC_007275	AACC	2	8	1474	1481	50 %	0 %	0 %	50 %	71725293
28	NC_007275	CTG	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725293
29	NC_007275	TCGG	2	8	1773	1780	0 %	25 %	50 %	25 %	71725310
30	NC_007275	CAG	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725310
31	NC_007275	TGCG	2	8	1896	1903	0 %	25 %	50 %	25 %	71725310
32	NC_007275	TGG	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725310
33	NC_007275	GCA	2	6	2007	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725310
34	NC_007275	GCG	2	6	2021	2026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725310
35	NC_007275	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725310
36	NC_007275	AAG	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725310
37	NC_007275	GTT	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725273
38	NC_007275	CAA	2	6	2288	2293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725273
39	NC_007275	GC	3	6	2347	2352	0 %	0 %	50 %	50 %	71725273
40	NC_007275	CGGCA	2	10	2382	2391	20 %	0 %	40 %	40 %	71725273
41	NC_007275	AGT	2	6	2403	2408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725273
42	NC_007275	CAT	2	6	2450	2455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725273
43	NC_007275	TGA	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725273
44	NC_007275	TCGAT	2	10	2550	2559	20 %	40 %	20 %	20 %	71725273
45	NC_007275	CGG	2	6	2666	2671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725273
46	NC_007275	TGC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725273
47	NC_007275	TGC	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725273
48	NC_007275	CGCCA	2	10	2911	2920	20 %	0 %	20 %	60 %	71725273
49	NC_007275	GCA	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725273
50	NC_007275	AACTG	2	10	2957	2966	40 %	20 %	20 %	20 %	71725273
51	NC_007275	ATG	2	6	2997	3002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725273
52	NC_007275	TGA	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725273
53	NC_007275	CCA	2	6	3130	3135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725273
54	NC_007275	TGA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725273
55	NC_007275	TGC	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725273
56	NC_007275	GCCA	2	8	3238	3245	25 %	0 %	25 %	50 %	71725273
57	NC_007275	GCT	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725273
58	NC_007275	TCAA	2	8	3318	3325	50 %	25 %	0 %	25 %	71725273
59	NC_007275	ACACG	2	10	3415	3424	40 %	0 %	20 %	40 %	71725273
60	NC_007275	GGTTG	2	10	3936	3945	0 %	40 %	60 %	0 %	71725300
61	NC_007275	GCT	2	6	3971	3976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725300
62	NC_007275	GCTC	2	8	4004	4011	0 %	25 %	25 %	50 %	71725300
63	NC_007275	GCT	3	9	4120	4128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725300
64	NC_007275	GCT	2	6	4211	4216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725278
65	NC_007275	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725278
66	NC_007275	CAG	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725278
67	NC_007275	GCT	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725278
68	NC_007275	CTCA	2	8	4304	4311	25 %	25 %	0 %	50 %	71725278
69	NC_007275	GCCCT	2	10	4313	4322	0 %	20 %	20 %	60 %	71725278
70	NC_007275	GTAG	2	8	4424	4431	25 %	25 %	50 %	0 %	71725278
71	NC_007275	TCG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725278
72	NC_007275	GCC	2	6	4606	4611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725311
73	NC_007275	AACT	2	8	4629	4636	50 %	25 %	0 %	25 %	71725311
74	NC_007275	CAG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725311
75	NC_007275	GCG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725311
76	NC_007275	TGT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725311
77	NC_007275	CAC	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725311
78	NC_007275	CCGT	2	8	4985	4992	0 %	25 %	25 %	50 %	71725289
79	NC_007275	AGCA	2	8	4994	5001	50 %	0 %	25 %	25 %	71725289
80	NC_007275	CGCA	2	8	5114	5121	25 %	0 %	25 %	50 %	71725289
81	NC_007275	TTG	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725289
82	NC_007275	GCGT	2	8	5262	5269	0 %	25 %	50 %	25 %	71725289
83	NC_007275	AAGG	2	8	5287	5294	50 %	0 %	50 %	0 %	71725289
84	NC_007275	CAT	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725289
85	NC_007275	GTCA	2	8	5776	5783	25 %	25 %	25 %	25 %	71725321
86	NC_007275	GGT	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725321
87	NC_007275	CTA	2	6	5820	5825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725321
88	NC_007275	TGC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725321
89	NC_007275	TCATCC	2	12	5897	5908	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	71725321
90	NC_007275	TCG	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725321
91	NC_007275	TGC	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725321
92	NC_007275	TGG	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725321
93	NC_007275	ACG	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725321
94	NC_007275	CAT	3	9	6025	6033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725321
95	NC_007275	GCGG	2	8	6038	6045	0 %	0 %	75 %	25 %	71725321
96	NC_007275	AGC	2	6	6053	6058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725321
97	NC_007275	GAT	3	9	6073	6081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725321
98	NC_007275	ATC	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725321
99	NC_007275	GTG	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725321
100	NC_007275	A	7	7	6229	6235	100 %	0 %	0 %	0 %	71725321
101	NC_007275	ACA	2	6	6246	6251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725321
102	NC_007275	CAGT	2	8	6354	6361	25 %	25 %	25 %	25 %	71725321
103	NC_007275	CCGA	2	8	6553	6560	25 %	0 %	25 %	50 %	71725312
104	NC_007275	AGTCA	2	10	6562	6571	40 %	20 %	20 %	20 %	71725312
105	NC_007275	GAA	3	9	6614	6622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725312
106	NC_007275	GA	3	6	6637	6642	50 %	0 %	50 %	0 %	71725312
107	NC_007275	TGC	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725312
108	NC_007275	GGC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725312
109	NC_007275	GTA	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725312
110	NC_007275	GCCT	2	8	7124	7131	0 %	25 %	25 %	50 %	71725282
111	NC_007275	GAC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725282
112	NC_007275	TGA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725282
113	NC_007275	CG	3	6	7325	7330	0 %	0 %	50 %	50 %	71725282
114	NC_007275	GCT	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725282
115	NC_007275	GAT	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725282
116	NC_007275	CAGAG	2	10	7615	7624	40 %	0 %	40 %	20 %	71725282
117	NC_007275	CTT	2	6	8659	8664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725301
118	NC_007275	AT	3	6	8694	8699	50 %	50 %	0 %	0 %	71725301
119	NC_007275	AAGCA	2	10	8810	8819	60 %	0 %	20 %	20 %	71725301
120	NC_007275	GGC	2	6	8878	8883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725301
121	NC_007275	GAC	2	6	9025	9030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725327
122	NC_007275	AT	3	6	9099	9104	50 %	50 %	0 %	0 %	71725327
123	NC_007275	GCCC	2	8	9226	9233	0 %	0 %	25 %	75 %	71725327
124	NC_007275	GAA	2	6	9355	9360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725327
125	NC_007275	ACC	2	6	9398	9403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725327
126	NC_007275	ATC	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725327
127	NC_007275	CTCC	2	8	9547	9554	0 %	25 %	0 %	75 %	71725327
128	NC_007275	C	7	7	9553	9559	0 %	0 %	0 %	100 %	71725327
129	NC_007275	CTTC	2	8	9567	9574	0 %	50 %	0 %	50 %	71725327
130	NC_007275	GAC	2	6	9647	9652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725327
131	NC_007275	GTA	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725327
132	NC_007275	AGC	2	6	9690	9695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725327
133	NC_007275	TCC	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725327
134	NC_007275	C	6	6	9711	9716	0 %	0 %	0 %	100 %	71725327
135	NC_007275	ACC	2	6	9779	9784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725327
136	NC_007275	CA	3	6	9798	9803	50 %	0 %	0 %	50 %	71725327
137	NC_007275	GAT	2	6	9880	9885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725327
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252	NC_007275	AATTA	2	10	18540	18549	60 %	40 %	0 %	0 %	71725276
253	NC_007275	CGTATT	2	12	18557	18568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71725276
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260	NC_007275	AGA	2	6	19019	19024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725324
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262	NC_007275	TTC	2	6	19244	19249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725324
263	NC_007275	TTA	2	6	19264	19269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71725324
264	NC_007275	TCGA	2	8	19272	19279	25 %	25 %	25 %	25 %	71725324
265	NC_007275	TACC	2	8	19316	19323	25 %	25 %	0 %	50 %	71725324
266	NC_007275	GTTT	2	8	19366	19373	0 %	75 %	25 %	0 %	71725324
267	NC_007275	CTG	3	9	19383	19391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725324
268	NC_007275	CAC	3	9	19415	19423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725324
269	NC_007275	CGG	2	6	19463	19468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725324
270	NC_007275	CGG	2	6	19484	19489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725324
271	NC_007275	GTTC	2	8	19545	19552	0 %	50 %	25 %	25 %	71725324
272	NC_007275	A	6	6	19603	19608	100 %	0 %	0 %	0 %	71725324
273	NC_007275	TGC	2	6	19640	19645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725324
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275	NC_007275	GCC	2	6	19740	19745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725324
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381	NC_007275	G	6	6	25403	25408	0 %	0 %	100 %	0 %	71725288
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393	NC_007275	AGCA	2	8	25894	25901	50 %	0 %	25 %	25 %	71725288
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395	NC_007275	GCA	2	6	25965	25970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725288
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