MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A large plasmid

Total Repeats: 1547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007274	TTC	2	6	195	200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725177
2	NC_007274	C	7	7	233	239	0 %	0 %	0 %	100 %	71725177
3	NC_007274	CTG	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725177
4	NC_007274	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725266
5	NC_007274	CG	3	6	453	458	0 %	0 %	50 %	50 %	71725266
6	NC_007274	CGA	2	6	465	470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725266
7	NC_007274	CTGG	2	8	552	559	0 %	25 %	50 %	25 %	71725266
8	NC_007274	TGCCG	2	10	666	675	0 %	20 %	40 %	40 %	71725266
9	NC_007274	CAC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725266
10	NC_007274	TGC	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
11	NC_007274	TGG	2	6	811	816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725266
12	NC_007274	GAC	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725266
13	NC_007274	GTCA	2	8	919	926	25 %	25 %	25 %	25 %	71725266
14	NC_007274	CGCGAG	2	12	985	996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	71725266
15	NC_007274	GTTC	2	8	1001	1008	0 %	50 %	25 %	25 %	71725266
16	NC_007274	GCTC	2	8	1022	1029	0 %	25 %	25 %	50 %	71725266
17	NC_007274	ATGCGT	2	12	1031	1042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71725266
18	NC_007274	GTC	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
19	NC_007274	GGC	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725266
20	NC_007274	CCGCG	2	10	1272	1281	0 %	0 %	40 %	60 %	71725266
21	NC_007274	GCAG	2	8	1283	1290	25 %	0 %	50 %	25 %	71725266
22	NC_007274	ACC	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725266
23	NC_007274	CTG	2	6	1505	1510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725266
24	NC_007274	ATG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725266
25	NC_007274	ATG	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725266
26	NC_007274	CGC	2	6	2890	2895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725226
27	NC_007274	ATG	2	6	2928	2933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725226
28	NC_007274	GATC	2	8	2959	2966	25 %	25 %	25 %	25 %	71725226
29	NC_007274	TGC	2	6	2996	3001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725263
30	NC_007274	GGT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725263
31	NC_007274	GAT	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725263
32	NC_007274	AGCGC	2	10	3073	3082	20 %	0 %	40 %	40 %	71725263
33	NC_007274	CCT	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725263
34	NC_007274	AGG	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	71725263
35	NC_007274	TGG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725263
36	NC_007274	CAC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725178
37	NC_007274	TTG	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725178
38	NC_007274	TGGGT	2	10	3613	3622	0 %	40 %	60 %	0 %	71725178
39	NC_007274	TGA	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725178
40	NC_007274	GTC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
41	NC_007274	CCG	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
42	NC_007274	GCAT	2	8	3832	3839	25 %	25 %	25 %	25 %	71725178
43	NC_007274	CTG	2	6	3931	3936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
44	NC_007274	CGC	2	6	3964	3969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
45	NC_007274	TAG	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725178
46	NC_007274	GGC	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725178
47	NC_007274	CAG	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725178
48	NC_007274	TG	3	6	4117	4122	0 %	50 %	50 %	0 %	71725178
49	NC_007274	TTC	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725178
50	NC_007274	GTCA	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	71725178
51	NC_007274	C	6	6	4355	4360	0 %	0 %	0 %	100 %	71725178
52	NC_007274	TCT	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725178
53	NC_007274	CCA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725178
54	NC_007274	CGC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
55	NC_007274	ATCA	2	8	4484	4491	50 %	25 %	0 %	25 %	71725178
56	NC_007274	CGC	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
57	NC_007274	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	71725178
58	NC_007274	TCG	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725178
59	NC_007274	CGG	2	6	4738	4743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725178
60	NC_007274	ACT	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725178
61	NC_007274	GCC	2	6	4923	4928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
62	NC_007274	CGC	2	6	5018	5023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725178
63	NC_007274	ATGA	2	8	5092	5099	50 %	25 %	25 %	0 %	71725190
64	NC_007274	GCC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725161
65	NC_007274	AGT	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725161
66	NC_007274	ATGC	2	8	5547	5554	25 %	25 %	25 %	25 %	71725161
67	NC_007274	G	7	7	6415	6421	0 %	0 %	100 %	0 %	71725191
68	NC_007274	TC	3	6	6475	6480	0 %	50 %	0 %	50 %	71725191
69	NC_007274	TGC	2	6	6518	6523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725191
70	NC_007274	GTCC	2	8	6539	6546	0 %	25 %	25 %	50 %	71725191
71	NC_007274	CGC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725191
72	NC_007274	CGA	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725191
73	NC_007274	CTG	2	6	6595	6600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725191
74	NC_007274	CGA	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725191
75	NC_007274	CGG	2	6	6652	6657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725191
76	NC_007274	GAAT	2	8	6658	6665	50 %	25 %	25 %	0 %	71725191
77	NC_007274	CAACA	2	10	7168	7177	60 %	0 %	0 %	40 %	71725170
78	NC_007274	ATTTCA	2	12	7368	7379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71725170
79	NC_007274	TCTG	2	8	7418	7425	0 %	50 %	25 %	25 %	71725170
80	NC_007274	TAA	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725170
81	NC_007274	C	6	6	7572	7577	0 %	0 %	0 %	100 %	71725170
82	NC_007274	TCT	2	6	7597	7602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725170
83	NC_007274	TC	3	6	7641	7646	0 %	50 %	0 %	50 %	71725170
84	NC_007274	GGTC	2	8	7742	7749	0 %	25 %	50 %	25 %	71725170
85	NC_007274	CCA	2	6	7831	7836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725170
86	NC_007274	AGCA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	25 %	25 %	71725170
87	NC_007274	TCG	2	6	7960	7965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725170
88	NC_007274	G	6	6	8030	8035	0 %	0 %	100 %	0 %	71725170
89	NC_007274	TTGA	2	8	8059	8066	25 %	50 %	25 %	0 %	71725170
90	NC_007274	GGC	2	6	8077	8082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725170
91	NC_007274	TCA	2	6	8156	8161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725170
92	NC_007274	GAC	2	6	8179	8184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725170
93	NC_007274	TTG	2	6	8215	8220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725170
94	NC_007274	CCA	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	71725170
95	NC_007274	CGG	2	6	8250	8255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	71725170
96	NC_007274	GCA	2	6	8264	8269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725170
97	NC_007274	CAG	2	6	8277	8282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725170
98	NC_007274	CTCGG	2	10	8287	8296	0 %	20 %	40 %	40 %	71725170
99	NC_007274	CCT	2	6	8398	8403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725170
100	NC_007274	TAT	2	6	8406	8411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71725170
101	NC_007274	TCA	3	9	8441	8449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725170
102	NC_007274	AGGC	2	8	8504	8511	25 %	0 %	50 %	25 %	71725170
103	NC_007274	AAT	2	6	8539	8544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71725170
104	NC_007274	AAC	2	6	8601	8606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725170
105	NC_007274	GCC	2	6	8626	8631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725170
106	NC_007274	GGAT	2	8	8729	8736	25 %	25 %	50 %	0 %	71725170
107	NC_007274	GAT	2	6	8835	8840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725170
108	NC_007274	CAG	2	6	8853	8858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725170
109	NC_007274	CAATC	2	10	8916	8925	40 %	20 %	0 %	40 %	71725170
110	NC_007274	GGCG	2	8	8956	8963	0 %	0 %	75 %	25 %	71725170
111	NC_007274	GCCA	2	8	9037	9044	25 %	0 %	25 %	50 %	71725170
112	NC_007274	AGC	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	71725241
113	NC_007274	CAT	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725175
114	NC_007274	ACA	2	6	9501	9506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	71725175
115	NC_007274	TG	3	6	9518	9523	0 %	50 %	50 %	0 %	71725175
116	NC_007274	GCC	2	6	9552	9557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725175
117	NC_007274	CT	3	6	9636	9641	0 %	50 %	0 %	50 %	71725175
118	NC_007274	TGC	2	6	9659	9664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725175
119	NC_007274	TC	3	6	9777	9782	0 %	50 %	0 %	50 %	71725175
120	NC_007274	CCG	2	6	9841	9846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725175
121	NC_007274	GCC	2	6	9855	9860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725175
122	NC_007274	GC	3	6	9917	9922	0 %	0 %	50 %	50 %	71725175
123	NC_007274	GTCG	2	8	9932	9939	0 %	25 %	50 %	25 %	71725175
124	NC_007274	TTG	2	6	9942	9947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725175
125	NC_007274	CGC	2	6	10000	10005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	71725175
126	NC_007274	ATG	2	6	10008	10013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725175
127	NC_007274	TCA	2	6	10020	10025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725175
128	NC_007274	TGA	2	6	10057	10062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725175
129	NC_007274	TTG	2	6	10284	10289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725175
130	NC_007274	TTGC	2	8	10388	10395	0 %	50 %	25 %	25 %	71725175
131	NC_007274	CAT	2	6	10414	10419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725175
132	NC_007274	GCT	2	6	10610	10615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725175
133	NC_007274	TGCT	3	12	10618	10629	0 %	50 %	25 %	25 %	71725175
134	NC_007274	GGT	2	6	10706	10711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725175
135	NC_007274	TCG	2	6	12359	12364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725144
136	NC_007274	TCGG	2	8	12373	12380	0 %	25 %	50 %	25 %	71725144
137	NC_007274	TGA	2	6	12398	12403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71725144
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267	NC_007274	TGT	2	6	24347	24352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71725247
268	NC_007274	GT	3	6	24351	24356	0 %	50 %	50 %	0 %	71725247
269	NC_007274	GAA	2	6	24363	24368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71725247
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389	NC_007274	GC	3	6	36018	36023	0 %	0 %	50 %	50 %	71725176
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393	NC_007274	GC	4	8	36182	36189	0 %	0 %	50 %	50 %	71725176
394	NC_007274	CGAC	2	8	36238	36245	25 %	0 %	25 %	50 %	71725176
395	NC_007274	TCA	2	6	36548	36553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725151
396	NC_007274	ATT	2	6	36925	36930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71725147
397	NC_007274	CGAT	2	8	37005	37012	25 %	25 %	25 %	25 %	71725147
398	NC_007274	CT	3	6	37383	37388	0 %	50 %	0 %	50 %	71725199
399	NC_007274	CTTGGC	2	12	37397	37408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725199
400	NC_007274	CTT	2	6	37417	37422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	71725199
401	NC_007274	TGC	2	6	37425	37430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	71725199
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403	NC_007274	TGCA	2	8	37467	37474	25 %	25 %	25 %	25 %	71725199
404	NC_007274	CAT	2	6	37492	37497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725199
405	NC_007274	TCA	2	6	37533	37538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725199
406	NC_007274	CTC	2	6	37565	37570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	71725199
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408	NC_007274	ATC	2	6	39119	39124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	71725186
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410	NC_007274	AATG	2	8	39229	39236	50 %	25 %	25 %	0 %	71725186
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428	NC_007274	TGG	2	6	40193	40198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	71725268
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