MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Photobacterium profundum SS9 plasmid pPBPR1

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005871	TTG	2	6	317	322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47104026
2	NC_005871	AT	3	6	331	336	50 %	50 %	0 %	0 %	47104026
3	NC_005871	AAAATC	2	12	340	351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	47104026
4	NC_005871	T	6	6	382	387	0 %	100 %	0 %	0 %	47104026
5	NC_005871	TCT	2	6	389	394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	47104026
6	NC_005871	AAAT	2	8	400	407	75 %	25 %	0 %	0 %	47104026
7	NC_005871	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104026
8	NC_005871	A	10	10	442	451	100 %	0 %	0 %	0 %	47104026
9	NC_005871	CAT	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104026
10	NC_005871	T	6	6	562	567	0 %	100 %	0 %	0 %	47104026
11	NC_005871	A	7	7	622	628	100 %	0 %	0 %	0 %	47104026
12	NC_005871	GCA	2	6	635	640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104026
13	NC_005871	GCC	2	6	912	917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104027
14	NC_005871	GAAAA	2	10	930	939	80 %	0 %	20 %	0 %	47104027
15	NC_005871	A	6	6	936	941	100 %	0 %	0 %	0 %	47104027
16	NC_005871	TA	4	8	1029	1036	50 %	50 %	0 %	0 %	47104027
17	NC_005871	TAA	2	6	1055	1060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	47104027
18	NC_005871	ACG	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104027
19	NC_005871	CA	3	6	1131	1136	50 %	0 %	0 %	50 %	47104027
20	NC_005871	TCA	2	6	1137	1142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104027
21	NC_005871	GAAT	2	8	1185	1192	50 %	25 %	25 %	0 %	47104027
22	NC_005871	TCA	2	6	1525	1530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104028
23	NC_005871	TCA	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104028
24	NC_005871	GGGGC	2	10	1702	1711	0 %	0 %	80 %	20 %	47104028
25	NC_005871	CGG	2	6	1715	1720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47104028
26	NC_005871	GAT	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104028
27	NC_005871	AAC	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104029
28	NC_005871	GTT	2	6	2144	2149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47104029
29	NC_005871	G	6	6	2192	2197	0 %	0 %	100 %	0 %	47104029
30	NC_005871	ATC	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104029
31	NC_005871	CAG	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104029
32	NC_005871	ACTT	2	8	2322	2329	25 %	50 %	0 %	25 %	47104029
33	NC_005871	ATC	2	6	2445	2450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104029
34	NC_005871	CAG	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104029
35	NC_005871	TCGAT	2	10	2468	2477	20 %	40 %	20 %	20 %	47104029
36	NC_005871	ATC	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104030
37	NC_005871	GT	3	6	2689	2694	0 %	50 %	50 %	0 %	47104030
38	NC_005871	CAC	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104030
39	NC_005871	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	47104030
40	NC_005871	GTC	2	6	2849	2854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104030
41	NC_005871	ACTCAA	2	12	2890	2901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	47104030
42	NC_005871	TCG	2	6	2916	2921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104030
43	NC_005871	C	6	6	2967	2972	0 %	0 %	0 %	100 %	47104030
44	NC_005871	A	6	6	3044	3049	100 %	0 %	0 %	0 %	47104030
45	NC_005871	ACC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104030
46	NC_005871	ATG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104030
47	NC_005871	TCG	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104030
48	NC_005871	ACC	2	6	3260	3265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104030
49	NC_005871	GGT	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	47104030
50	NC_005871	AGC	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104031
51	NC_005871	CTT	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	47104031
52	NC_005871	GCG	2	6	3520	3525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47104031
53	NC_005871	ACA	2	6	3533	3538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104031
54	NC_005871	TGC	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104031
55	NC_005871	GATT	2	8	3582	3589	25 %	50 %	25 %	0 %	47104031
56	NC_005871	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	47104031
57	NC_005871	GAC	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104031
58	NC_005871	GAC	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104031
59	NC_005871	ACC	2	6	3907	3912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104031
60	NC_005871	GACG	2	8	3952	3959	25 %	0 %	50 %	25 %	47104031
61	NC_005871	TCA	2	6	4097	4102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104031
62	NC_005871	CGG	2	6	4104	4109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47104031
63	NC_005871	TAC	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104031
64	NC_005871	A	7	7	4197	4203	100 %	0 %	0 %	0 %	47104031
65	NC_005871	CAA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104031
66	NC_005871	CCG	3	9	4229	4237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104031
67	NC_005871	CGA	2	6	4302	4307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104031
68	NC_005871	ATC	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104031
69	NC_005871	G	7	7	4540	4546	0 %	0 %	100 %	0 %	47104031
70	NC_005871	TAC	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104031
71	NC_005871	CAT	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104031
72	NC_005871	GAA	2	6	4681	4686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104031
73	NC_005871	CAA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104031
74	NC_005871	CGG	2	6	4730	4735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	47104031
75	NC_005871	CGAC	2	8	4792	4799	25 %	0 %	25 %	50 %	47104031
76	NC_005871	CTG	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104032
77	NC_005871	GCT	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104032
78	NC_005871	A	6	6	4939	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	47104032
79	NC_005871	CA	3	6	5117	5122	50 %	0 %	0 %	50 %	47104032
80	NC_005871	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	47104032
81	NC_005871	ACC	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104032
82	NC_005871	ACC	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104032
83	NC_005871	GAT	2	6	5205	5210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104032
84	NC_005871	GCC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104032
85	NC_005871	ATG	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
86	NC_005871	TCA	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104033
87	NC_005871	CAT	2	6	5456	5461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104033
88	NC_005871	G	6	6	5568	5573	0 %	0 %	100 %	0 %	47104033
89	NC_005871	CCA	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104033
90	NC_005871	CAG	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104033
91	NC_005871	TAA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	47104033
92	NC_005871	TTGT	2	8	5691	5698	0 %	75 %	25 %	0 %	47104033
93	NC_005871	ACC	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104033
94	NC_005871	GCC	2	6	5748	5753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104033
95	NC_005871	TGA	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
96	NC_005871	CTGC	2	8	5856	5863	0 %	25 %	25 %	50 %	47104033
97	NC_005871	CTG	2	6	5922	5927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104033
98	NC_005871	TGA	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
99	NC_005871	GGCT	2	8	6004	6011	0 %	25 %	50 %	25 %	47104033
100	NC_005871	A	6	6	6146	6151	100 %	0 %	0 %	0 %	47104033
101	NC_005871	AATCC	2	10	6161	6170	40 %	20 %	0 %	40 %	47104033
102	NC_005871	CCA	2	6	6283	6288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104033
103	NC_005871	ACC	2	6	6312	6317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104033
104	NC_005871	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104033
105	NC_005871	TGC	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104033
106	NC_005871	CGCACC	2	12	6477	6488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	47104033
107	NC_005871	CGT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104033
108	NC_005871	ACA	2	6	6622	6627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104033
109	NC_005871	CGGG	2	8	6637	6644	0 %	0 %	75 %	25 %	47104033
110	NC_005871	GAA	2	6	6825	6830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104033
111	NC_005871	TTG	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47104033
112	NC_005871	ACA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104033
113	NC_005871	C	6	6	6940	6945	0 %	0 %	0 %	100 %	47104033
114	NC_005871	AGG	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	47104033
115	NC_005871	A	7	7	7005	7011	100 %	0 %	0 %	0 %	47104033
116	NC_005871	TGA	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
117	NC_005871	A	7	7	7069	7075	100 %	0 %	0 %	0 %	47104033
118	NC_005871	TGA	2	6	7076	7081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
119	NC_005871	CGT	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104033
120	NC_005871	AATA	2	8	7113	7120	75 %	25 %	0 %	0 %	47104033
121	NC_005871	CAC	2	6	7187	7192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104033
122	NC_005871	CAG	2	6	7263	7268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104033
123	NC_005871	CAT	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104033
124	NC_005871	GAA	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104033
125	NC_005871	ATG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104033
126	NC_005871	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	47104033
127	NC_005871	GAA	2	6	7449	7454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47104033
128	NC_005871	CGC	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104033
129	NC_005871	AAC	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104033
130	NC_005871	TCA	2	6	7522	7527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104033
131	NC_005871	A	6	6	7756	7761	100 %	0 %	0 %	0 %	47104033
132	NC_005871	CGC	2	6	7799	7804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47104033
133	NC_005871	CAA	2	6	7997	8002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104034
134	NC_005871	CAA	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104034
135	NC_005871	GCA	2	6	8051	8056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104034
136	NC_005871	TGC	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104034
137	NC_005871	TTG	2	6	8103	8108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47104034
138	NC_005871	CAT	2	6	8119	8124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104034
139	NC_005871	TGG	2	6	8125	8130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	47104034
140	NC_005871	A	8	8	8203	8210	100 %	0 %	0 %	0 %	47104034
141	NC_005871	TA	3	6	8260	8265	50 %	50 %	0 %	0 %	47104034
142	NC_005871	TGA	2	6	8277	8282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104034
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144	NC_005871	TTGGA	2	10	8544	8553	20 %	40 %	40 %	0 %	47104035
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172	NC_005871	GCA	2	6	10431	10436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104037
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259	NC_005871	ACC	2	6	16560	16565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	47104041
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267	NC_005871	CAA	2	6	16868	16873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104041
268	NC_005871	AC	3	6	16899	16904	50 %	0 %	0 %	50 %	47104041
269	NC_005871	G	6	6	16928	16933	0 %	0 %	100 %	0 %	47104041
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273	NC_005871	ACA	2	6	17257	17262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104041
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278	NC_005871	ATGA	2	8	17799	17806	50 %	25 %	25 %	0 %	47104041
279	NC_005871	CAA	2	6	17889	17894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104041
280	NC_005871	CAA	2	6	17934	17939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	47104041
281	NC_005871	ATG	2	6	17968	17973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104041
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288	NC_005871	TGAT	2	8	18412	18419	25 %	50 %	25 %	0 %	47104042
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295	NC_005871	TCCA	2	8	18845	18852	25 %	25 %	0 %	50 %	47104043
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302	NC_005871	GAT	2	6	19093	19098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	47104043
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