MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 34524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005042	TTGT	2	8	181	188	0 %	75 %	25 %	0 %	33239453
2	NC_005042	TAGT	2	8	220	227	25 %	50 %	25 %	0 %	33239453
3	NC_005042	CTG	2	6	280	285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239453
4	NC_005042	AGT	2	6	366	371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239453
5	NC_005042	ATA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239453
6	NC_005042	TCT	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239453
7	NC_005042	GAT	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239453
8	NC_005042	TGA	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239453
9	NC_005042	T	6	6	560	565	0 %	100 %	0 %	0 %	33239453
10	NC_005042	TAG	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239453
11	NC_005042	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239453
12	NC_005042	TAA	2	6	764	769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239453
13	NC_005042	AG	3	6	813	818	50 %	0 %	50 %	0 %	33239453
14	NC_005042	GTT	2	6	862	867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239453
15	NC_005042	TCT	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239453
16	NC_005042	AATT	2	8	955	962	50 %	50 %	0 %	0 %	33239453
17	NC_005042	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	33239453
18	NC_005042	AGC	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239453
19	NC_005042	TAA	2	6	1073	1078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239453
20	NC_005042	CTG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239453
21	NC_005042	TTA	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239453
22	NC_005042	TTA	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239453
23	NC_005042	ATG	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239453
24	NC_005042	GTA	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239454
25	NC_005042	AAC	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239454
26	NC_005042	TCC	2	6	1434	1439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239454
27	NC_005042	ATTT	2	8	1538	1545	25 %	75 %	0 %	0 %	33239454
28	NC_005042	CAG	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239454
29	NC_005042	ATCAG	2	10	1566	1575	40 %	20 %	20 %	20 %	33239454
30	NC_005042	CTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239454
31	NC_005042	A	6	6	1634	1639	100 %	0 %	0 %	0 %	33239454
32	NC_005042	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239454
33	NC_005042	TAT	2	6	1690	1695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239454
34	NC_005042	GTA	2	6	1706	1711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239454
35	NC_005042	ATT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239454
36	NC_005042	T	6	6	1784	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	33239454
37	NC_005042	AGT	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239454
38	NC_005042	T	6	6	1845	1850	0 %	100 %	0 %	0 %	33239454
39	NC_005042	AAG	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239454
40	NC_005042	TGA	2	6	1974	1979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239454
41	NC_005042	TAA	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239454
42	NC_005042	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239454
43	NC_005042	TCA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239454
44	NC_005042	GA	3	6	2032	2037	50 %	0 %	50 %	0 %	33239454
45	NC_005042	TAA	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239454
46	NC_005042	TGAT	2	8	2083	2090	25 %	50 %	25 %	0 %	33239455
47	NC_005042	GATT	2	8	2104	2111	25 %	50 %	25 %	0 %	33239455
48	NC_005042	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239455
49	NC_005042	A	6	6	2156	2161	100 %	0 %	0 %	0 %	33239455
50	NC_005042	TTG	2	6	2264	2269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
51	NC_005042	CAA	2	6	2305	2310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239455
52	NC_005042	A	6	6	2315	2320	100 %	0 %	0 %	0 %	33239455
53	NC_005042	GTT	2	6	2352	2357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
54	NC_005042	ATC	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239455
55	NC_005042	AGC	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239455
56	NC_005042	GTT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
57	NC_005042	TTGT	2	8	2698	2705	0 %	75 %	25 %	0 %	33239455
58	NC_005042	TTAT	2	8	2734	2741	25 %	75 %	0 %	0 %	33239455
59	NC_005042	GAG	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239455
60	NC_005042	GAT	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239455
61	NC_005042	CTG	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239455
62	NC_005042	TGT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
63	NC_005042	GTT	2	6	2947	2952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
64	NC_005042	GGT	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239455
65	NC_005042	A	7	7	3016	3022	100 %	0 %	0 %	0 %	33239455
66	NC_005042	TGT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
67	NC_005042	AGA	2	6	3092	3097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239455
68	NC_005042	GGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239455
69	NC_005042	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239455
70	NC_005042	TTG	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
71	NC_005042	CCT	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239455
72	NC_005042	ATT	2	6	3389	3394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239455
73	NC_005042	GAT	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239455
74	NC_005042	ATA	2	6	3457	3462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
75	NC_005042	ATT	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239455
76	NC_005042	AATCAA	2	12	3519	3530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	33239455
77	NC_005042	TGC	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239455
78	NC_005042	AGT	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239455
79	NC_005042	GTG	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239455
80	NC_005042	TGC	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239455
81	NC_005042	TTC	2	6	3686	3691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239455
82	NC_005042	AGG	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239455
83	NC_005042	TC	3	6	3790	3795	0 %	50 %	0 %	50 %	33239455
84	NC_005042	TA	3	6	3796	3801	50 %	50 %	0 %	0 %	33239455
85	NC_005042	CAAC	2	8	3840	3847	50 %	0 %	0 %	50 %	33239455
86	NC_005042	GTT	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239455
87	NC_005042	CGACA	2	10	3892	3901	40 %	0 %	20 %	40 %	33239455
88	NC_005042	ATTT	2	8	3927	3934	25 %	75 %	0 %	0 %	33239455
89	NC_005042	AAT	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
90	NC_005042	CTTA	2	8	3997	4004	25 %	50 %	0 %	25 %	33239455
91	NC_005042	CCT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239455
92	NC_005042	ATT	2	6	4073	4078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239455
93	NC_005042	TAA	2	6	4097	4102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
94	NC_005042	TAA	2	6	4105	4110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
95	NC_005042	TGG	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239455
96	NC_005042	TTTG	2	8	4229	4236	0 %	75 %	25 %	0 %	33239455
97	NC_005042	AGG	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33239455
98	NC_005042	AAT	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
99	NC_005042	ATT	2	6	4345	4350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239455
100	NC_005042	ATA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239455
101	NC_005042	AAAT	2	8	4433	4440	75 %	25 %	0 %	0 %	33239455
102	NC_005042	AAG	2	6	4457	4462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239455
103	NC_005042	CTA	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239455
104	NC_005042	TG	3	6	4531	4536	0 %	50 %	50 %	0 %	33239456
105	NC_005042	TAG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239456
106	NC_005042	TAA	2	6	4556	4561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239456
107	NC_005042	TTA	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239456
108	NC_005042	GGAA	2	8	4640	4647	50 %	0 %	50 %	0 %	33239456
109	NC_005042	AAG	2	6	4684	4689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239456
110	NC_005042	ATT	2	6	4818	4823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239456
111	NC_005042	AGA	2	6	4887	4892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239456
112	NC_005042	T	6	6	4990	4995	0 %	100 %	0 %	0 %	33239456
113	NC_005042	ATC	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239456
114	NC_005042	TTG	2	6	5149	5154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239456
115	NC_005042	AAT	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239456
116	NC_005042	GTA	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239456
117	NC_005042	TGT	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239456
118	NC_005042	AATG	2	8	5330	5337	50 %	25 %	25 %	0 %	33239456
119	NC_005042	TTC	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239456
120	NC_005042	T	6	6	5505	5510	0 %	100 %	0 %	0 %	33239456
121	NC_005042	AGGA	2	8	5525	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	33239456
122	NC_005042	TAT	2	6	5537	5542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239456
123	NC_005042	AAAG	2	8	5557	5564	75 %	0 %	25 %	0 %	33239456
124	NC_005042	AGT	2	6	5595	5600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239456
125	NC_005042	A	6	6	5612	5617	100 %	0 %	0 %	0 %	33239456
126	NC_005042	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239456
127	NC_005042	GAT	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239456
128	NC_005042	GA	3	6	5662	5667	50 %	0 %	50 %	0 %	33239456
129	NC_005042	TAA	2	6	5696	5701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239456
130	NC_005042	GCG	2	6	5718	5723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33239456
131	NC_005042	A	6	6	5845	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	33239456
132	NC_005042	GAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239456
133	NC_005042	TTC	2	6	5978	5983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239456
134	NC_005042	TCAA	2	8	6011	6018	50 %	25 %	0 %	25 %	33239457
135	NC_005042	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239457
136	NC_005042	T	6	6	6027	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	33239457
137	NC_005042	T	7	7	6044	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	33239457
138	NC_005042	T	8	8	6064	6071	0 %	100 %	0 %	0 %	33239457
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404	NC_005042	GGC	2	6	16813	16818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33239465
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