MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 34524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005042	CGG	2	6	158731	158736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33239609
3502	NC_005042	GAA	2	6	158801	158806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239609
3503	NC_005042	A	6	6	158844	158849	100 %	0 %	0 %	0 %	33239609
3504	NC_005042	ATT	2	6	158957	158962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239609
3505	NC_005042	GTTTTA	2	12	158988	158999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	33239609
3506	NC_005042	ATT	2	6	159050	159055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239609
3507	NC_005042	TCT	2	6	159107	159112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239609
3508	NC_005042	GAA	3	9	159123	159131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239609
3509	NC_005042	TCTT	2	8	159146	159153	0 %	75 %	0 %	25 %	33239609
3510	NC_005042	AGA	3	9	159176	159184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239609
3511	NC_005042	GAGGG	2	10	159210	159219	20 %	0 %	80 %	0 %	33239609
3512	NC_005042	TGT	3	9	159242	159250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239609
3513	NC_005042	TTA	2	6	159309	159314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239609
3514	NC_005042	AAT	2	6	159378	159383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239609
3515	NC_005042	A	6	6	159396	159401	100 %	0 %	0 %	0 %	33239609
3516	NC_005042	TG	3	6	159456	159461	0 %	50 %	50 %	0 %	33239609
3517	NC_005042	GCA	2	6	159522	159527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239609
3518	NC_005042	GAT	2	6	159543	159548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239609
3519	NC_005042	GGCAGT	2	12	159683	159694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33239610
3520	NC_005042	GCTT	2	8	159727	159734	0 %	50 %	25 %	25 %	33239610
3521	NC_005042	ATG	2	6	159750	159755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239610
3522	NC_005042	AGA	2	6	159788	159793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239610
3523	NC_005042	ATA	2	6	159794	159799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239610
3524	NC_005042	TGC	2	6	159832	159837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239610
3525	NC_005042	AGC	2	6	159844	159849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239610
3526	NC_005042	GAT	2	6	159914	159919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239610
3527	NC_005042	GCT	2	6	159989	159994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239610
3528	NC_005042	GTTTG	2	10	160009	160018	0 %	60 %	40 %	0 %	33239610
3529	NC_005042	GCA	2	6	160025	160030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239610
3530	NC_005042	AG	3	6	160056	160061	50 %	0 %	50 %	0 %	33239610
3531	NC_005042	GTG	2	6	160064	160069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239610
3532	NC_005042	GGTTG	2	10	160091	160100	0 %	40 %	60 %	0 %	33239610
3533	NC_005042	AGA	3	9	160171	160179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239610
3534	NC_005042	CTTCT	2	10	160353	160362	0 %	60 %	0 %	40 %	33239610
3535	NC_005042	ATTGG	2	10	160402	160411	20 %	40 %	40 %	0 %	33239610
3536	NC_005042	CTT	2	6	160415	160420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239610
3537	NC_005042	TCA	2	6	160474	160479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239610
3538	NC_005042	CAG	2	6	160518	160523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239610
3539	NC_005042	TGA	2	6	160543	160548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239610
3540	NC_005042	TAG	2	6	160591	160596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239610
3541	NC_005042	G	6	6	160620	160625	0 %	0 %	100 %	0 %	33239610
3542	NC_005042	GTT	2	6	160630	160635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239610
3543	NC_005042	TGA	2	6	160738	160743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239611
3544	NC_005042	AG	3	6	160768	160773	50 %	0 %	50 %	0 %	33239611
3545	NC_005042	AGGG	2	8	160798	160805	25 %	0 %	75 %	0 %	33239611
3546	NC_005042	CAGC	2	8	160880	160887	25 %	0 %	25 %	50 %	33239611
3547	NC_005042	TTG	2	6	160907	160912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239611
3548	NC_005042	GAT	2	6	160916	160921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239611
3549	NC_005042	GAAG	2	8	160935	160942	50 %	0 %	50 %	0 %	33239611
3550	NC_005042	GCA	2	6	160991	160996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239611
3551	NC_005042	CAG	2	6	161055	161060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239611
3552	NC_005042	G	7	7	161066	161072	0 %	0 %	100 %	0 %	33239611
3553	NC_005042	AAC	2	6	161103	161108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239611
3554	NC_005042	TTGG	2	8	161117	161124	0 %	50 %	50 %	0 %	33239611
3555	NC_005042	AGT	2	6	161137	161142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239611
3556	NC_005042	ACA	2	6	161154	161159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33239611
3557	NC_005042	GTT	2	6	161171	161176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239611
3558	NC_005042	AGC	3	9	161281	161289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239611
3559	NC_005042	GAT	2	6	161312	161317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239611
3560	NC_005042	TTTA	2	8	161320	161327	25 %	75 %	0 %	0 %	33239611
3561	NC_005042	GAAA	2	8	161392	161399	75 %	0 %	25 %	0 %	33239611
3562	NC_005042	TCT	2	6	161555	161560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239611
3563	NC_005042	T	6	6	161646	161651	0 %	100 %	0 %	0 %	33239612
3564	NC_005042	GTTG	2	8	161724	161731	0 %	50 %	50 %	0 %	33239612
3565	NC_005042	T	6	6	161766	161771	0 %	100 %	0 %	0 %	33239612
3566	NC_005042	TA	3	6	161824	161829	50 %	50 %	0 %	0 %	33239612
3567	NC_005042	CCTTT	2	10	161830	161839	0 %	60 %	0 %	40 %	33239612
3568	NC_005042	TAG	2	6	161874	161879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239612
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3571	NC_005042	GCT	2	6	162004	162009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239612
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3573	NC_005042	TAAT	2	8	162053	162060	50 %	50 %	0 %	0 %	33239612
3574	NC_005042	GTTT	2	8	162083	162090	0 %	75 %	25 %	0 %	33239612
3575	NC_005042	AAT	2	6	162132	162137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239612
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3577	NC_005042	CAAT	2	8	162197	162204	50 %	25 %	0 %	25 %	33239612
3578	NC_005042	TGA	2	6	162213	162218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239612
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3582	NC_005042	TC	3	6	162558	162563	0 %	50 %	0 %	50 %	33239613
3583	NC_005042	CTT	2	6	162586	162591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239613
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3585	NC_005042	TAAT	2	8	162634	162641	50 %	50 %	0 %	0 %	33239613
3586	NC_005042	TAT	2	6	162677	162682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239613
3587	NC_005042	TCC	2	6	162698	162703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33239613
3588	NC_005042	ATT	2	6	162728	162733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239613
3589	NC_005042	A	6	6	162789	162794	100 %	0 %	0 %	0 %	33239613
3590	NC_005042	ATT	2	6	162801	162806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239613
3591	NC_005042	TTA	2	6	162820	162825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239613
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3593	NC_005042	GAA	2	6	162867	162872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239614
3594	NC_005042	TTC	2	6	162874	162879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33239614
3595	NC_005042	ATT	2	6	162895	162900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239614
3596	NC_005042	AG	3	6	162927	162932	50 %	0 %	50 %	0 %	33239614
3597	NC_005042	ATT	2	6	163033	163038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239614
3598	NC_005042	TCA	2	6	163046	163051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239614
3599	NC_005042	T	6	6	163120	163125	0 %	100 %	0 %	0 %	33239614
3600	NC_005042	GCT	2	6	163180	163185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33239614
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3602	NC_005042	GTA	2	6	163317	163322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239614
3603	NC_005042	ATT	2	6	163402	163407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239614
3604	NC_005042	CAT	2	6	163550	163555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33239615
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3606	NC_005042	TTTC	2	8	163757	163764	0 %	75 %	0 %	25 %	33239615
3607	NC_005042	GTGG	2	8	163888	163895	0 %	25 %	75 %	0 %	33239616
3608	NC_005042	AGAT	2	8	163905	163912	50 %	25 %	25 %	0 %	33239616
3609	NC_005042	AAT	2	6	163918	163923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33239616
3610	NC_005042	TGT	2	6	163950	163955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33239616
3611	NC_005042	CATT	2	8	164168	164175	25 %	50 %	0 %	25 %	33239616
3612	NC_005042	GGT	2	6	164185	164190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33239616
3613	NC_005042	TGA	2	6	164193	164198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239616
3614	NC_005042	A	6	6	164209	164214	100 %	0 %	0 %	0 %	33239616
3615	NC_005042	CAGAA	2	10	164228	164237	60 %	0 %	20 %	20 %	33239616
3616	NC_005042	GAC	2	6	164245	164250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33239616
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3618	NC_005042	A	8	8	164329	164336	100 %	0 %	0 %	0 %	33239616
3619	NC_005042	TTA	2	6	164344	164349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33239616
3620	NC_005042	AGAA	2	8	164364	164371	75 %	0 %	25 %	0 %	33239616
3621	NC_005042	ATG	2	6	164414	164419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33239616
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3623	NC_005042	GAA	2	6	164476	164481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33239616
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3625	NC_005042	A	6	6	164502	164507	100 %	0 %	0 %	0 %	33239616
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