MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 34524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_005042	GCT	2	6	1654936	1654941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241250
32503	NC_005042	TC	3	6	1654962	1654967	0 %	50 %	0 %	50 %	33241250
32504	NC_005042	TCA	2	6	1655002	1655007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241250
32505	NC_005042	TCA	2	6	1655026	1655031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241250
32506	NC_005042	AAT	2	6	1655096	1655101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241250
32507	NC_005042	TTG	2	6	1655178	1655183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241250
32508	NC_005042	CCAT	2	8	1655225	1655232	25 %	25 %	0 %	50 %	33241250
32509	NC_005042	AAT	2	6	1655252	1655257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241250
32510	NC_005042	TTTCA	2	10	1655346	1655355	20 %	60 %	0 %	20 %	33241250
32511	NC_005042	TCC	2	6	1655382	1655387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241250
32512	NC_005042	ATC	2	6	1655469	1655474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241250
32513	NC_005042	AGA	2	6	1655490	1655495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241250
32514	NC_005042	TCA	3	9	1655548	1655556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241250
32515	NC_005042	TGA	2	6	1655912	1655917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241251
32516	NC_005042	A	6	6	1655958	1655963	100 %	0 %	0 %	0 %	33241251
32517	NC_005042	TGT	2	6	1655981	1655986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241251
32518	NC_005042	TGA	2	6	1656080	1656085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241251
32519	NC_005042	A	7	7	1656107	1656113	100 %	0 %	0 %	0 %	33241251
32520	NC_005042	TCTA	2	8	1656128	1656135	25 %	50 %	0 %	25 %	33241251
32521	NC_005042	ATTT	2	8	1656162	1656169	25 %	75 %	0 %	0 %	33241251
32522	NC_005042	ACA	2	6	1656174	1656179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241251
32523	NC_005042	TCA	3	9	1656221	1656229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241251
32524	NC_005042	ATCAA	2	10	1656240	1656249	60 %	20 %	0 %	20 %	33241251
32525	NC_005042	ATT	2	6	1656510	1656515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241252
32526	NC_005042	T	6	6	1656514	1656519	0 %	100 %	0 %	0 %	33241252
32527	NC_005042	TTG	2	6	1656540	1656545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241252
32528	NC_005042	AGT	2	6	1656555	1656560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241252
32529	NC_005042	ATA	2	6	1656574	1656579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241252
32530	NC_005042	AAC	2	6	1656633	1656638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241252
32531	NC_005042	GAG	2	6	1656647	1656652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241252
32532	NC_005042	CAAT	2	8	1656811	1656818	50 %	25 %	0 %	25 %	33241252
32533	NC_005042	AGC	2	6	1656861	1656866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241252
32534	NC_005042	TC	3	6	1657058	1657063	0 %	50 %	0 %	50 %	33241253
32535	NC_005042	CGA	2	6	1657069	1657074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241253
32536	NC_005042	CAA	2	6	1657115	1657120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241253
32537	NC_005042	TAA	2	6	1657122	1657127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241253
32538	NC_005042	GAA	2	6	1657387	1657392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32539	NC_005042	AGAA	2	8	1657495	1657502	75 %	0 %	25 %	0 %	33241254
32540	NC_005042	TTC	2	6	1657508	1657513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241254
32541	NC_005042	ATG	2	6	1657553	1657558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241254
32542	NC_005042	TCA	2	6	1657575	1657580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241254
32543	NC_005042	CAAA	2	8	1657635	1657642	75 %	0 %	0 %	25 %	33241254
32544	NC_005042	T	7	7	1657680	1657686	0 %	100 %	0 %	0 %	33241254
32545	NC_005042	T	6	6	1657693	1657698	0 %	100 %	0 %	0 %	33241254
32546	NC_005042	ATT	2	6	1657722	1657727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241254
32547	NC_005042	ACTG	2	8	1657737	1657744	25 %	25 %	25 %	25 %	33241254
32548	NC_005042	AAG	2	6	1657748	1657753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32549	NC_005042	A	8	8	1657758	1657765	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32550	NC_005042	GCA	2	6	1657801	1657806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241254
32551	NC_005042	AAG	2	6	1657883	1657888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32552	NC_005042	AG	3	6	1657901	1657906	50 %	0 %	50 %	0 %	33241254
32553	NC_005042	GAA	2	6	1657942	1657947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32554	NC_005042	AAT	2	6	1657969	1657974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241254
32555	NC_005042	AGC	2	6	1657980	1657985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241254
32556	NC_005042	CAAT	2	8	1658013	1658020	50 %	25 %	0 %	25 %	33241254
32557	NC_005042	AAG	2	6	1658072	1658077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32558	NC_005042	TTA	2	6	1658107	1658112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241254
32559	NC_005042	A	7	7	1658163	1658169	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32560	NC_005042	CAATC	2	10	1658173	1658182	40 %	20 %	0 %	40 %	33241254
32561	NC_005042	CAA	2	6	1658197	1658202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241254
32562	NC_005042	A	6	6	1658244	1658249	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32563	NC_005042	GCT	2	6	1658311	1658316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241254
32564	NC_005042	TAT	2	6	1658324	1658329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241254
32565	NC_005042	AACC	2	8	1658343	1658350	50 %	0 %	0 %	50 %	33241254
32566	NC_005042	AAT	2	6	1658410	1658415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241254
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32569	NC_005042	ATCG	2	8	1658518	1658525	25 %	25 %	25 %	25 %	33241254
32570	NC_005042	GGA	2	6	1658542	1658547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241254
32571	NC_005042	ACG	2	6	1658556	1658561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241254
32572	NC_005042	TAAT	2	8	1658579	1658586	50 %	50 %	0 %	0 %	33241254
32573	NC_005042	AATT	2	8	1658591	1658598	50 %	50 %	0 %	0 %	33241254
32574	NC_005042	CAAAGA	2	12	1658602	1658613	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33241254
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32583	NC_005042	A	8	8	1659005	1659012	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32584	NC_005042	TAA	3	9	1659030	1659038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241254
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32586	NC_005042	GTAA	2	8	1659082	1659089	50 %	25 %	25 %	0 %	33241254
32587	NC_005042	AGA	2	6	1659124	1659129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
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32592	NC_005042	TTGG	2	8	1659253	1659260	0 %	50 %	50 %	0 %	33241254
32593	NC_005042	AAT	2	6	1659273	1659278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241254
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32601	NC_005042	GAT	2	6	1659655	1659660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241254
32602	NC_005042	AGC	2	6	1659663	1659668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241254
32603	NC_005042	TCAA	2	8	1659672	1659679	50 %	25 %	0 %	25 %	33241254
32604	NC_005042	TTA	2	6	1659745	1659750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241254
32605	NC_005042	GTCA	2	8	1659801	1659808	25 %	25 %	25 %	25 %	33241254
32606	NC_005042	A	8	8	1659882	1659889	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32607	NC_005042	TCA	2	6	1659951	1659956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241254
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32610	NC_005042	TAAT	2	8	1660028	1660035	50 %	50 %	0 %	0 %	33241254
32611	NC_005042	AGA	2	6	1660062	1660067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241254
32612	NC_005042	A	7	7	1660067	1660073	100 %	0 %	0 %	0 %	33241254
32613	NC_005042	T	6	6	1660103	1660108	0 %	100 %	0 %	0 %	33241255
32614	NC_005042	AAG	2	6	1660129	1660134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241255
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32619	NC_005042	AAT	2	6	1660271	1660276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241255
32620	NC_005042	TAA	2	6	1660313	1660318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241255
32621	NC_005042	CAAA	2	8	1660345	1660352	75 %	0 %	0 %	25 %	33241255
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32977	NC_005042	TAAC	2	8	1676866	1676873	50 %	25 %	0 %	25 %	33241267
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