MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 34524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_005042	AAGT	2	8	1532617	1532624	50 %	25 %	25 %	0 %	33241117
30002	NC_005042	AGTT	2	8	1532629	1532636	25 %	50 %	25 %	0 %	33241117
30003	NC_005042	TGC	2	6	1532660	1532665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241117
30004	NC_005042	AGCAAA	2	12	1532672	1532683	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	33241117
30005	NC_005042	ATG	2	6	1532710	1532715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241117
30006	NC_005042	CCTCT	2	10	1532728	1532737	0 %	40 %	0 %	60 %	33241117
30007	NC_005042	GGATG	2	10	1532859	1532868	20 %	20 %	60 %	0 %	33241117
30008	NC_005042	GGC	2	6	1532876	1532881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241117
30009	NC_005042	CCT	2	6	1532882	1532887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241117
30010	NC_005042	AGA	2	6	1532894	1532899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241117
30011	NC_005042	GC	3	6	1532946	1532951	0 %	0 %	50 %	50 %	33241117
30012	NC_005042	CAA	2	6	1532991	1532996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241117
30013	NC_005042	T	7	7	1533044	1533050	0 %	100 %	0 %	0 %	33241117
30014	NC_005042	AAT	2	6	1533077	1533082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241117
30015	NC_005042	GAA	2	6	1533108	1533113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241117
30016	NC_005042	ATT	2	6	1533114	1533119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241117
30017	NC_005042	TGC	2	6	1533133	1533138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241117
30018	NC_005042	GAAG	2	8	1533167	1533174	50 %	0 %	50 %	0 %	33241117
30019	NC_005042	TGCAA	2	10	1533300	1533309	40 %	20 %	20 %	20 %	33241117
30020	NC_005042	TAAT	2	8	1533310	1533317	50 %	50 %	0 %	0 %	33241117
30021	NC_005042	ATT	2	6	1533336	1533341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241117
30022	NC_005042	TAA	2	6	1533407	1533412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241117
30023	NC_005042	TTA	2	6	1533477	1533482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241117
30024	NC_005042	CGG	2	6	1533542	1533547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241117
30025	NC_005042	C	7	7	1533563	1533569	0 %	0 %	0 %	100 %	33241117
30026	NC_005042	ATT	2	6	1533641	1533646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241117
30027	NC_005042	TGG	2	6	1533743	1533748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241117
30028	NC_005042	GGA	2	6	1533801	1533806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241117
30029	NC_005042	T	6	6	1533812	1533817	0 %	100 %	0 %	0 %	33241117
30030	NC_005042	AAT	2	6	1533840	1533845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241117
30031	NC_005042	AAC	2	6	1533884	1533889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241117
30032	NC_005042	AAG	2	6	1533895	1533900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241117
30033	NC_005042	TAA	2	6	1533916	1533921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241117
30034	NC_005042	A	6	6	1533934	1533939	100 %	0 %	0 %	0 %	33241117
30035	NC_005042	A	6	6	1533958	1533963	100 %	0 %	0 %	0 %	33241117
30036	NC_005042	TAAT	2	8	1533964	1533971	50 %	50 %	0 %	0 %	33241117
30037	NC_005042	TAT	2	6	1533981	1533986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241117
30038	NC_005042	ACC	2	6	1534010	1534015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241117
30039	NC_005042	GTT	2	6	1534037	1534042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241117
30040	NC_005042	TTTA	2	8	1534072	1534079	25 %	75 %	0 %	0 %	33241118
30041	NC_005042	A	7	7	1534081	1534087	100 %	0 %	0 %	0 %	33241118
30042	NC_005042	ATT	2	6	1534114	1534119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241118
30043	NC_005042	A	7	7	1534129	1534135	100 %	0 %	0 %	0 %	33241118
30044	NC_005042	TTC	2	6	1534195	1534200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241118
30045	NC_005042	TGGAGG	2	12	1534231	1534242	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	33241118
30046	NC_005042	AACT	2	8	1534261	1534268	50 %	25 %	0 %	25 %	33241118
30047	NC_005042	GAA	2	6	1534271	1534276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241118
30048	NC_005042	ATT	2	6	1534286	1534291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241118
30049	NC_005042	TTA	2	6	1534364	1534369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241118
30050	NC_005042	ACT	2	6	1534425	1534430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241119
30051	NC_005042	AACT	2	8	1534445	1534452	50 %	25 %	0 %	25 %	33241119
30052	NC_005042	TCCT	2	8	1534479	1534486	0 %	50 %	0 %	50 %	33241119
30053	NC_005042	ATCT	2	8	1534520	1534527	25 %	50 %	0 %	25 %	33241119
30054	NC_005042	ATT	2	6	1534584	1534589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241119
30055	NC_005042	TCA	2	6	1534621	1534626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241119
30056	NC_005042	TA	3	6	1534718	1534723	50 %	50 %	0 %	0 %	33241119
30057	NC_005042	TA	3	6	1534745	1534750	50 %	50 %	0 %	0 %	33241119
30058	NC_005042	CTC	2	6	1534913	1534918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241119
30059	NC_005042	TCT	2	6	1534921	1534926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241119
30060	NC_005042	TAC	2	6	1534953	1534958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241119
30061	NC_005042	CTT	2	6	1535141	1535146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241119
30062	NC_005042	ATTTAA	2	12	1535157	1535168	50 %	50 %	0 %	0 %	33241119
30063	NC_005042	ATA	2	6	1535174	1535179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241119
30064	NC_005042	GAG	2	6	1535210	1535215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241119
30065	NC_005042	TAA	2	6	1535301	1535306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241120
30066	NC_005042	GAG	2	6	1535311	1535316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241120
30067	NC_005042	CTAT	2	8	1535385	1535392	25 %	50 %	0 %	25 %	33241120
30068	NC_005042	TCA	2	6	1535427	1535432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241120
30069	NC_005042	AGAT	2	8	1535566	1535573	50 %	25 %	25 %	0 %	33241120
30070	NC_005042	GCT	2	6	1535574	1535579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241120
30071	NC_005042	TTC	2	6	1535588	1535593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241120
30072	NC_005042	GCA	3	9	1535670	1535678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241120
30073	NC_005042	TCT	2	6	1535724	1535729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241120
30074	NC_005042	CCAA	2	8	1535740	1535747	50 %	0 %	0 %	50 %	33241120
30075	NC_005042	AGA	2	6	1535792	1535797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241120
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30078	NC_005042	CAAG	2	8	1535911	1535918	50 %	0 %	25 %	25 %	33241120
30079	NC_005042	CTT	2	6	1535952	1535957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241120
30080	NC_005042	A	6	6	1535985	1535990	100 %	0 %	0 %	0 %	33241120
30081	NC_005042	TTTG	2	8	1536095	1536102	0 %	75 %	25 %	0 %	33241120
30082	NC_005042	CAG	2	6	1536145	1536150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241120
30083	NC_005042	TA	3	6	1536250	1536255	50 %	50 %	0 %	0 %	33241120
30084	NC_005042	GAA	2	6	1536266	1536271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241120
30085	NC_005042	TCA	2	6	1536303	1536308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241120
30086	NC_005042	CCAGC	2	10	1536328	1536337	20 %	0 %	20 %	60 %	33241120
30087	NC_005042	TGC	2	6	1536371	1536376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241120
30088	NC_005042	TTTC	2	8	1536411	1536418	0 %	75 %	0 %	25 %	33241120
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30090	NC_005042	TCA	2	6	1536487	1536492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241120
30091	NC_005042	TATT	2	8	1536538	1536545	25 %	75 %	0 %	0 %	33241120
30092	NC_005042	AG	3	6	1536570	1536575	50 %	0 %	50 %	0 %	33241120
30093	NC_005042	TTC	2	6	1536630	1536635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241120
30094	NC_005042	AT	3	6	1536643	1536648	50 %	50 %	0 %	0 %	33241120
30095	NC_005042	TTC	2	6	1536701	1536706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241120
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30098	NC_005042	TCA	2	6	1536771	1536776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241120
30099	NC_005042	TGA	2	6	1536786	1536791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241120
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30102	NC_005042	CT	3	6	1536852	1536857	0 %	50 %	0 %	50 %	33241120
30103	NC_005042	ACA	2	6	1536909	1536914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241120
30104	NC_005042	GCT	2	6	1536921	1536926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241120
30105	NC_005042	GCA	2	6	1537002	1537007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241120
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30107	NC_005042	GCA	2	6	1537536	1537541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
30108	NC_005042	CCAG	2	8	1537556	1537563	25 %	0 %	25 %	50 %	33241121
30109	NC_005042	CAA	2	6	1537601	1537606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241121
30110	NC_005042	AGA	2	6	1537712	1537717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241121
30111	NC_005042	GTC	2	6	1537761	1537766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
30112	NC_005042	TGC	2	6	1537781	1537786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
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30114	NC_005042	GC	3	6	1537800	1537805	0 %	0 %	50 %	50 %	33241121
30115	NC_005042	AGT	2	6	1537874	1537879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
30116	NC_005042	AGG	2	6	1537907	1537912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241121
30117	NC_005042	GGT	2	6	1538007	1538012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
30118	NC_005042	TGG	2	6	1538039	1538044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
30119	NC_005042	GCT	2	6	1538064	1538069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
30120	NC_005042	CAT	2	6	1538112	1538117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
30121	NC_005042	GCA	2	6	1538187	1538192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
30122	NC_005042	GTA	2	6	1538226	1538231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241121
30123	NC_005042	GCA	2	6	1538253	1538258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
30124	NC_005042	CTT	2	6	1538345	1538350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241121
30125	NC_005042	TGG	2	6	1538361	1538366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
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30127	NC_005042	CAC	2	6	1538442	1538447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241121
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30129	NC_005042	CGG	2	6	1538477	1538482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241121
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30132	NC_005042	TCA	2	6	1538582	1538587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
30133	NC_005042	TCA	2	6	1538747	1538752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241121
30134	NC_005042	GGT	2	6	1538763	1538768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241121
30135	NC_005042	TGC	2	6	1538783	1538788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241121
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30140	NC_005042	CAG	2	6	1539042	1539047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241121
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30185	NC_005042	TCA	2	6	1541919	1541924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241122
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30212	NC_005042	ATA	3	9	1543124	1543132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241124
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30214	NC_005042	GGAA	2	8	1543186	1543193	50 %	0 %	50 %	0 %	33241124
30215	NC_005042	ATA	2	6	1543201	1543206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241124
30216	NC_005042	CCTC	2	8	1543228	1543235	0 %	25 %	0 %	75 %	33241124
30217	NC_005042	AAAG	2	8	1543240	1543247	75 %	0 %	25 %	0 %	33241124
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30224	NC_005042	TAA	2	6	1543557	1543562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241124
30225	NC_005042	ATT	2	6	1543579	1543584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241124
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30228	NC_005042	A	6	6	1543615	1543620	100 %	0 %	0 %	0 %	33241124
30229	NC_005042	CAAAGG	2	12	1543641	1543652	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	33241124
30230	NC_005042	ATT	2	6	1543655	1543660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241124
30231	NC_005042	A	6	6	1543677	1543682	100 %	0 %	0 %	0 %	33241124
30232	NC_005042	CATA	2	8	1543719	1543726	50 %	25 %	0 %	25 %	33241124
30233	NC_005042	TTA	2	6	1543743	1543748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241124
30234	NC_005042	ATG	2	6	1543790	1543795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241124
30235	NC_005042	AATC	2	8	1543811	1543818	50 %	25 %	0 %	25 %	33241124
30236	NC_005042	ATCA	2	8	1543845	1543852	50 %	25 %	0 %	25 %	33241125
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30238	NC_005042	GAA	2	6	1543890	1543895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241125
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30399	NC_005042	CT	3	6	1552223	1552228	0 %	50 %	0 %	50 %	33241138
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30477	NC_005042	TAC	2	6	1556721	1556726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241145
30478	NC_005042	ACC	2	6	1556785	1556790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241145
30479	NC_005042	AGC	2	6	1556812	1556817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241145
30480	NC_005042	GCG	2	6	1556837	1556842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241145
30481	NC_005042	TCCC	2	8	1556846	1556853	0 %	25 %	0 %	75 %	33241145
30482	NC_005042	TGCCT	2	10	1556956	1556965	0 %	40 %	20 %	40 %	33241145
30483	NC_005042	ACACCT	2	12	1556966	1556977	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	33241145
30484	NC_005042	CAACTA	2	12	1556997	1557008	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	33241145
30485	NC_005042	ACC	2	6	1557031	1557036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241145
30486	NC_005042	CT	4	8	1557072	1557079	0 %	50 %	0 %	50 %	33241145
30487	NC_005042	ACG	2	6	1557118	1557123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241145
30488	NC_005042	TCG	2	6	1557127	1557132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241145
30489	NC_005042	CTC	2	6	1557135	1557140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241145
30490	NC_005042	T	6	6	1557156	1557161	0 %	100 %	0 %	0 %	33241145
30491	NC_005042	TGT	2	6	1557167	1557172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241145
30492	NC_005042	CAG	3	9	1557180	1557188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241145
30493	NC_005042	AGC	2	6	1557287	1557292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241146
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30496	NC_005042	AGC	2	6	1557407	1557412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241146
30497	NC_005042	GA	3	6	1557441	1557446	50 %	0 %	50 %	0 %	33241146
30498	NC_005042	CAT	2	6	1557493	1557498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241146
30499	NC_005042	ATT	2	6	1557521	1557526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241146
30500	NC_005042	ACG	2	6	1557575	1557580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241146

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