MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Prochlorococcus marinus subsp. marinus str. CCMP1375 chromosome

Total Repeats: 34524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_005042	AAAG	2	8	559012	559019	75 %	0 %	25 %	0 %	33240047
11502	NC_005042	TTG	2	6	559045	559050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240047
11503	NC_005042	TTC	2	6	559105	559110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240047
11504	NC_005042	TGT	2	6	559208	559213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240047
11505	NC_005042	ACC	2	6	559216	559221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240047
11506	NC_005042	TTCA	2	8	559240	559247	25 %	50 %	0 %	25 %	33240047
11507	NC_005042	GCT	2	6	559274	559279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240047
11508	NC_005042	CTA	2	6	559296	559301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
11509	NC_005042	TCA	2	6	559304	559309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
11510	NC_005042	GCT	2	6	559383	559388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240047
11511	NC_005042	TCC	2	6	559407	559412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240047
11512	NC_005042	AAATA	2	10	559459	559468	80 %	20 %	0 %	0 %	33240047
11513	NC_005042	CTA	2	6	559487	559492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240047
11514	NC_005042	ATTT	3	12	559720	559731	25 %	75 %	0 %	0 %	33240048
11515	NC_005042	ATA	2	6	559766	559771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
11516	NC_005042	AGT	2	6	559783	559788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240048
11517	NC_005042	TGC	2	6	559809	559814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
11518	NC_005042	TAA	2	6	559918	559923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
11519	NC_005042	GA	3	6	559925	559930	50 %	0 %	50 %	0 %	33240048
11520	NC_005042	TGC	2	6	560013	560018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
11521	NC_005042	TGT	2	6	560040	560045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240048
11522	NC_005042	ATAA	2	8	560220	560227	75 %	25 %	0 %	0 %	33240048
11523	NC_005042	CCT	2	6	560299	560304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240048
11524	NC_005042	TCC	3	9	560328	560336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240048
11525	NC_005042	ATT	2	6	560356	560361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240048
11526	NC_005042	ATA	2	6	560377	560382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
11527	NC_005042	AAT	2	6	560391	560396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
11528	NC_005042	CTG	2	6	560414	560419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
11529	NC_005042	ACA	2	6	560420	560425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240048
11530	NC_005042	TCG	2	6	560428	560433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240048
11531	NC_005042	AGG	2	6	560436	560441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33240048
11532	NC_005042	ACC	2	6	560481	560486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240048
11533	NC_005042	AT	3	6	560497	560502	50 %	50 %	0 %	0 %	33240048
11534	NC_005042	AAT	2	6	560532	560537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240048
11535	NC_005042	A	6	6	560540	560545	100 %	0 %	0 %	0 %	33240048
11536	NC_005042	TA	3	6	560602	560607	50 %	50 %	0 %	0 %	33240048
11537	NC_005042	AT	3	6	560691	560696	50 %	50 %	0 %	0 %	33240049
11538	NC_005042	ACT	2	6	560699	560704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240049
11539	NC_005042	TAA	2	6	560710	560715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240049
11540	NC_005042	GCA	2	6	560729	560734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240049
11541	NC_005042	GAA	2	6	560744	560749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240049
11542	NC_005042	AGCA	2	8	560782	560789	50 %	0 %	25 %	25 %	33240049
11543	NC_005042	AAT	2	6	560848	560853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240049
11544	NC_005042	ACC	2	6	560905	560910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33240049
11545	NC_005042	GAA	2	6	560934	560939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240049
11546	NC_005042	ATA	2	6	561041	561046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240049
11547	NC_005042	ACA	2	6	561059	561064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240049
11548	NC_005042	ATCC	2	8	561122	561129	25 %	25 %	0 %	50 %	33240049
11549	NC_005042	AGA	2	6	561143	561148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240049
11550	NC_005042	GCT	2	6	561218	561223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240049
11551	NC_005042	T	8	8	561258	561265	0 %	100 %	0 %	0 %	33240049
11552	NC_005042	TCT	2	6	561275	561280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240049
11553	NC_005042	TGA	2	6	561282	561287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240049
11554	NC_005042	AAG	2	6	561327	561332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240049
11555	NC_005042	ATG	2	6	561336	561341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240049
11556	NC_005042	ATAG	2	8	561355	561362	50 %	25 %	25 %	0 %	33240049
11557	NC_005042	AGT	2	6	561406	561411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240049
11558	NC_005042	CTAT	2	8	561431	561438	25 %	50 %	0 %	25 %	33240049
11559	NC_005042	A	6	6	561456	561461	100 %	0 %	0 %	0 %	33240049
11560	NC_005042	AAC	2	6	561463	561468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240049
11561	NC_005042	AAT	2	6	561518	561523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240049
11562	NC_005042	TCA	2	6	561587	561592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240049
11563	NC_005042	GAA	2	6	561807	561812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240050
11564	NC_005042	ATT	2	6	561843	561848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240050
11565	NC_005042	T	6	6	561847	561852	0 %	100 %	0 %	0 %	33240050
11566	NC_005042	CT	3	6	561860	561865	0 %	50 %	0 %	50 %	33240050
11567	NC_005042	TGT	2	6	561912	561917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240050
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11570	NC_005042	GTTG	2	8	562786	562793	0 %	50 %	50 %	0 %	33240052
11571	NC_005042	TGC	2	6	562800	562805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240052
11572	NC_005042	TCT	2	6	562902	562907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240052
11573	NC_005042	AAG	2	6	562937	562942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240052
11574	NC_005042	GAT	2	6	563020	563025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240052
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11576	NC_005042	AGA	2	6	563115	563120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240052
11577	NC_005042	AGA	2	6	563126	563131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240052
11578	NC_005042	CTT	2	6	563623	563628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240053
11579	NC_005042	TTCA	2	8	563641	563648	25 %	50 %	0 %	25 %	33240053
11580	NC_005042	A	6	6	564323	564328	100 %	0 %	0 %	0 %	33240054
11581	NC_005042	AT	3	6	564363	564368	50 %	50 %	0 %	0 %	33240054
11582	NC_005042	ATC	2	6	564381	564386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240054
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11584	NC_005042	TACA	2	8	564479	564486	50 %	25 %	0 %	25 %	33240054
11585	NC_005042	A	6	6	564542	564547	100 %	0 %	0 %	0 %	33240054
11586	NC_005042	CTT	5	15	564566	564580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240054
11587	NC_005042	CCTT	2	8	564625	564632	0 %	50 %	0 %	50 %	33240054
11588	NC_005042	ATT	2	6	564720	564725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240054
11589	NC_005042	TCC	2	6	564745	564750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240054
11590	NC_005042	TCA	2	6	564907	564912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33240054
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11592	NC_005042	AAG	2	6	565492	565497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240056
11593	NC_005042	TTG	2	6	565499	565504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240056
11594	NC_005042	TGT	2	6	565530	565535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33240056
11595	NC_005042	CAA	2	6	565540	565545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33240056
11596	NC_005042	GAT	2	6	565599	565604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240056
11597	NC_005042	GCT	2	6	565609	565614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33240056
11598	NC_005042	GGT	2	6	565651	565656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240056
11599	NC_005042	A	7	7	565674	565680	100 %	0 %	0 %	0 %	33240056
11600	NC_005042	A	7	7	565693	565699	100 %	0 %	0 %	0 %	33240056
11601	NC_005042	TGA	2	6	565791	565796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240056
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11603	NC_005042	A	6	6	565937	565942	100 %	0 %	0 %	0 %	33240056
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11605	NC_005042	ATT	2	6	566062	566067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240057
11606	NC_005042	TAG	2	6	566068	566073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240057
11607	NC_005042	TGG	2	6	566093	566098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33240057
11608	NC_005042	TAAA	2	8	566106	566113	75 %	25 %	0 %	0 %	33240057
11609	NC_005042	AG	3	6	566122	566127	50 %	0 %	50 %	0 %	33240057
11610	NC_005042	ATT	2	6	566161	566166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33240057
11611	NC_005042	A	6	6	566190	566195	100 %	0 %	0 %	0 %	33240057
11612	NC_005042	GAT	2	6	566306	566311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240057
11613	NC_005042	TA	4	8	566312	566319	50 %	50 %	0 %	0 %	33240057
11614	NC_005042	ATG	2	6	566337	566342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240057
11615	NC_005042	TA	3	6	566408	566413	50 %	50 %	0 %	0 %	33240057
11616	NC_005042	CT	3	6	566429	566434	0 %	50 %	0 %	50 %	33240057
11617	NC_005042	TATT	2	8	566449	566456	25 %	75 %	0 %	0 %	33240057
11618	NC_005042	TTTA	2	8	566526	566533	25 %	75 %	0 %	0 %	33240057
11619	NC_005042	GAAA	2	8	566538	566545	75 %	0 %	25 %	0 %	33240057
11620	NC_005042	TAA	2	6	566644	566649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33240057
11621	NC_005042	TCT	2	6	566687	566692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240057
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11623	NC_005042	GAA	2	6	566713	566718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33240057
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11992	NC_005042	AG	3	6	584556	584561	50 %	0 %	50 %	0 %	33240068
11993	NC_005042	TGATT	2	10	584684	584693	20 %	60 %	20 %	0 %	33240069
11994	NC_005042	CTC	2	6	584734	584739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33240069
11995	NC_005042	GCA	2	6	584784	584789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33240069
11996	NC_005042	AGTTC	2	10	584849	584858	20 %	40 %	20 %	20 %	33240069
11997	NC_005042	GA	3	6	584891	584896	50 %	0 %	50 %	0 %	33240069
11998	NC_005042	TGA	2	6	585054	585059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33240070
11999	NC_005042	TCT	2	6	585069	585074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33240070
12000	NC_005042	TGGTT	2	10	585122	585131	0 %	60 %	40 %	0 %	33240070

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