MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000A

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004633	CAG	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171479
2	NC_004633	CACC	2	8	425	432	25 %	0 %	0 %	75 %	29171479
3	NC_004633	GCC	2	6	434	439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171479
4	NC_004633	TTC	2	6	447	452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171479
5	NC_004633	GAC	2	6	513	518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171479
6	NC_004633	CGTC	2	8	533	540	0 %	25 %	25 %	50 %	29171479
7	NC_004633	TCGACC	2	12	610	621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29171479
8	NC_004633	CTTGG	2	10	632	641	0 %	40 %	40 %	20 %	29171479
9	NC_004633	GTT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171479
10	NC_004633	TGCCG	2	10	713	722	0 %	20 %	40 %	40 %	29171479
11	NC_004633	TGG	2	6	858	863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171479
12	NC_004633	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171479
13	NC_004633	AGC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171479
14	NC_004633	CGCGAG	2	12	1032	1043	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29171479
15	NC_004633	GCTC	2	8	1069	1076	0 %	25 %	25 %	50 %	29171479
16	NC_004633	GTC	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171479
17	NC_004633	TCG	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171479
18	NC_004633	GGC	2	6	1268	1273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171479
19	NC_004633	CGC	2	6	1322	1327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171479
20	NC_004633	CTG	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171479
21	NC_004633	ATG	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171479
22	NC_004633	TCGG	2	8	1819	1826	0 %	25 %	50 %	25 %	29171480
23	NC_004633	GC	3	6	1943	1948	0 %	0 %	50 %	50 %	29171480
24	NC_004633	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171480
25	NC_004633	GCA	2	6	2053	2058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171480
26	NC_004633	AAT	2	6	2076	2081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29171480
27	NC_004633	TGGC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	50 %	25 %	29171481
28	NC_004633	GCT	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171481
29	NC_004633	ACC	2	6	2813	2818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171481
30	NC_004633	GCC	2	6	2870	2875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171481
31	NC_004633	GTC	2	6	2991	2996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171481
32	NC_004633	CGT	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171481
33	NC_004633	TGG	2	6	3056	3061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171481
34	NC_004633	GC	3	6	3108	3113	0 %	0 %	50 %	50 %	29171481
35	NC_004633	CGTGT	2	10	3139	3148	0 %	40 %	40 %	20 %	29171481
36	NC_004633	GAG	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171481
37	NC_004633	AC	4	8	3334	3341	50 %	0 %	0 %	50 %	29171481
38	NC_004633	ACC	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171481
39	NC_004633	TCG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98985776
40	NC_004633	TAG	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98985776
41	NC_004633	TTGGTC	2	12	3803	3814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	98985776
42	NC_004633	CTC	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	98985776
43	NC_004633	CAT	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98985776
44	NC_004633	AGGCCA	2	12	4127	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
45	NC_004633	GTC	2	6	4288	4293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98985776
46	NC_004633	CG	3	6	4375	4380	0 %	0 %	50 %	50 %	98985776
47	NC_004633	AGC	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
48	NC_004633	AGCG	2	8	4537	4544	25 %	0 %	50 %	25 %	98985776
49	NC_004633	T	6	6	4565	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	98985776
50	NC_004633	CGA	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
51	NC_004633	GGC	3	9	4775	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98985776
52	NC_004633	TGTGG	2	10	4784	4793	0 %	40 %	60 %	0 %	98985776
53	NC_004633	AC	4	8	4794	4801	50 %	0 %	0 %	50 %	98985776
54	NC_004633	GGT	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98985776
55	NC_004633	CCA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	98985776
56	NC_004633	CCAG	2	8	4923	4930	25 %	0 %	25 %	50 %	98985776
57	NC_004633	GGT	3	9	4964	4972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98985776
58	NC_004633	AAAG	2	8	4998	5005	75 %	0 %	25 %	0 %	98985776
59	NC_004633	CAC	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	98985776
60	NC_004633	GAAC	2	8	5034	5041	50 %	0 %	25 %	25 %	98985776
61	NC_004633	TCA	2	6	5098	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98985776
62	NC_004633	GAC	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
63	NC_004633	GC	3	6	5186	5191	0 %	0 %	50 %	50 %	98985776
64	NC_004633	CATCCG	2	12	5291	5302	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	98985776
65	NC_004633	GCTG	2	8	5312	5319	0 %	25 %	50 %	25 %	98985776
66	NC_004633	CAT	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98985776
67	NC_004633	ACG	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
68	NC_004633	ACG	2	6	5387	5392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98985776
69	NC_004633	GCTG	2	8	5481	5488	0 %	25 %	50 %	25 %	98985776
70	NC_004633	TTG	2	6	5596	5601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98985776
71	NC_004633	GAT	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98985776
72	NC_004633	A	6	6	5691	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	98985776
73	NC_004633	T	6	6	5727	5732	0 %	100 %	0 %	0 %	29171482
74	NC_004633	ATT	2	6	5746	5751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171482
75	NC_004633	TAA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29171482
76	NC_004633	ATT	2	6	5821	5826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171482
77	NC_004633	CAT	2	6	5854	5859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171482
78	NC_004633	T	6	6	5963	5968	0 %	100 %	0 %	0 %	29171482
79	NC_004633	GAA	2	6	6031	6036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171482
80	NC_004633	T	8	8	6042	6049	0 %	100 %	0 %	0 %	29171482
81	NC_004633	TGT	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171482
82	NC_004633	TTTG	2	8	6142	6149	0 %	75 %	25 %	0 %	29171482
83	NC_004633	GCG	2	6	6192	6197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171482
84	NC_004633	CCT	2	6	6260	6265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171482
85	NC_004633	CAT	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171482
86	NC_004633	CCA	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171482
87	NC_004633	GTCT	2	8	6417	6424	0 %	50 %	25 %	25 %	29171482
88	NC_004633	TTC	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171482
89	NC_004633	GTG	2	6	6461	6466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171482
90	NC_004633	TGGC	2	8	6491	6498	0 %	25 %	50 %	25 %	29171482
91	NC_004633	CCG	2	6	7819	7824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171483
92	NC_004633	CCA	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171483
93	NC_004633	AGGC	2	8	7896	7903	25 %	0 %	50 %	25 %	29171483
94	NC_004633	TGGC	2	8	7940	7947	0 %	25 %	50 %	25 %	29171483
95	NC_004633	AG	3	6	7961	7966	50 %	0 %	50 %	0 %	29171483
96	NC_004633	GCTC	2	8	8018	8025	0 %	25 %	25 %	50 %	29171483
97	NC_004633	C	6	6	8079	8084	0 %	0 %	0 %	100 %	29171483
98	NC_004633	CAA	2	6	8126	8131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171483
99	NC_004633	TCA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171484
100	NC_004633	T	8	8	8419	8426	0 %	100 %	0 %	0 %	29171484
101	NC_004633	TGCTT	2	10	8430	8439	0 %	60 %	20 %	20 %	29171484
102	NC_004633	CTT	2	6	8488	8493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171484
103	NC_004633	T	6	6	8515	8520	0 %	100 %	0 %	0 %	29171484
104	NC_004633	TAC	2	6	8531	8536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171484
105	NC_004633	TGTC	2	8	8785	8792	0 %	50 %	25 %	25 %	29171484
106	NC_004633	ATC	2	6	8813	8818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171484
107	NC_004633	GGC	2	6	9360	9365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171485
108	NC_004633	TCT	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171485
109	NC_004633	CAT	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171485
110	NC_004633	AAT	2	6	9479	9484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29171485
111	NC_004633	T	6	6	9500	9505	0 %	100 %	0 %	0 %	29171485
112	NC_004633	AAC	2	6	9556	9561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171485
113	NC_004633	GC	3	6	9565	9570	0 %	0 %	50 %	50 %	29171485
114	NC_004633	CAC	2	6	9640	9645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171485
115	NC_004633	CAA	2	6	9699	9704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171485
116	NC_004633	CAG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171485
117	NC_004633	AAT	2	6	9762	9767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29171485
118	NC_004633	GATGA	2	10	9906	9915	40 %	20 %	40 %	0 %	29171485
119	NC_004633	T	6	6	9936	9941	0 %	100 %	0 %	0 %	29171485
120	NC_004633	TCCA	2	8	10014	10021	25 %	25 %	0 %	50 %	29171485
121	NC_004633	CGA	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171485
122	NC_004633	ATC	2	6	10056	10061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171485
123	NC_004633	GAC	2	6	10229	10234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171485
124	NC_004633	CGAC	2	8	10257	10264	25 %	0 %	25 %	50 %	29171485
125	NC_004633	GCG	2	6	10270	10275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171485
126	NC_004633	GAC	2	6	10315	10320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171485
127	NC_004633	TTC	3	9	10353	10361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171485
128	NC_004633	AGC	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171485
129	NC_004633	GCG	2	6	10402	10407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171485
130	NC_004633	CTG	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171485
131	NC_004633	GTC	2	6	11238	11243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171486
132	NC_004633	TCC	2	6	11260	11265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171486
133	NC_004633	TGC	2	6	11280	11285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171486
134	NC_004633	CCCAG	2	10	11319	11328	20 %	0 %	20 %	60 %	29171486
135	NC_004633	GCA	2	6	11343	11348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171486
136	NC_004633	GCA	2	6	11429	11434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171486
137	NC_004633	AGA	2	6	11511	11516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171486
138	NC_004633	GC	3	6	11536	11541	0 %	0 %	50 %	50 %	29171486
139	NC_004633	ACG	2	6	11569	11574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171486
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141	NC_004633	CTC	2	6	11947	11952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171486
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152	NC_004633	TGA	2	6	12561	12566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171486
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154	NC_004633	GTA	2	6	12823	12828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171486
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158	NC_004633	GC	3	6	12935	12940	0 %	0 %	50 %	50 %	29171486
159	NC_004633	GCG	2	6	13021	13026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171486
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250	NC_004633	CGA	2	6	18431	18436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171491
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252	NC_004633	GGCAA	2	10	19818	19827	40 %	0 %	40 %	20 %	29171492
253	NC_004633	AAGC	2	8	19832	19839	50 %	0 %	25 %	25 %	29171492
254	NC_004633	TCT	2	6	19843	19848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171492
255	NC_004633	ACG	2	6	19914	19919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171492
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257	NC_004633	TTGCA	2	10	19935	19944	20 %	40 %	20 %	20 %	29171492
258	NC_004633	TTGC	2	8	20060	20067	0 %	50 %	25 %	25 %	29171492
259	NC_004633	GATA	2	8	20142	20149	50 %	25 %	25 %	0 %	29171492
260	NC_004633	TTTA	2	8	20392	20399	25 %	75 %	0 %	0 %	29171493
261	NC_004633	TC	3	6	20513	20518	0 %	50 %	0 %	50 %	29171493
262	NC_004633	TGA	2	6	20619	20624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171493
263	NC_004633	CA	3	6	20647	20652	50 %	0 %	0 %	50 %	29171493
264	NC_004633	TGA	2	6	20734	20739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171493
265	NC_004633	CAT	2	6	20831	20836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171493
266	NC_004633	ATG	2	6	20856	20861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171493
267	NC_004633	TGT	2	6	20869	20874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171493
268	NC_004633	GATG	2	8	20962	20969	25 %	25 %	50 %	0 %	29171493
269	NC_004633	TGA	2	6	21013	21018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171493
270	NC_004633	AGA	2	6	21055	21060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171493
271	NC_004633	TCA	2	6	21095	21100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171493
272	NC_004633	A	6	6	21124	21129	100 %	0 %	0 %	0 %	29171493
273	NC_004633	AG	3	6	21232	21237	50 %	0 %	50 %	0 %	29171493
274	NC_004633	ATG	2	6	21256	21261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171494
275	NC_004633	TCG	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171494
276	NC_004633	ACC	2	6	21407	21412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171494
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279	NC_004633	GTTG	2	8	21586	21593	0 %	50 %	50 %	0 %	29171494
280	NC_004633	CCA	2	6	21614	21619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171494
281	NC_004633	GA	3	6	21638	21643	50 %	0 %	50 %	0 %	29171494
282	NC_004633	AAC	2	6	21676	21681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171494
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285	NC_004633	ATC	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171494
286	NC_004633	ATCTG	2	10	21975	21984	20 %	40 %	20 %	20 %	29171494
287	NC_004633	GCA	2	6	22004	22009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171494
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290	NC_004633	GAC	2	6	22285	22290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171494
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293	NC_004633	TCG	2	6	23307	23312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171495
294	NC_004633	CAGC	2	8	23380	23387	25 %	0 %	25 %	50 %	29171495
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296	NC_004633	TCCT	2	8	23499	23506	0 %	50 %	0 %	50 %	29171495
297	NC_004633	CAT	2	6	23519	23524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171495
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300	NC_004633	CGGT	2	8	23559	23566	0 %	25 %	50 %	25 %	29171495
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380	NC_004633	GAT	2	6	29236	29241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171503
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384	NC_004633	TGA	2	6	29451	29456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171503
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388	NC_004633	CCGTC	2	10	29602	29611	0 %	20 %	20 %	60 %	29171503
389	NC_004633	GAT	2	6	29641	29646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171503
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393	NC_004633	AT	3	6	30431	30436	50 %	50 %	0 %	0 %	29171504
394	NC_004633	T	6	6	30460	30465	0 %	100 %	0 %	0 %	29171504
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397	NC_004633	ACTA	2	8	30599	30606	50 %	25 %	0 %	25 %	29171504
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