MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000A

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004633	GAA	2	6	66610	66615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171539
1002	NC_004633	TGG	2	6	66663	66668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171539
1003	NC_004633	GAC	2	6	66680	66685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171539
1004	NC_004633	AAGCAG	2	12	66815	66826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	29171539
1005	NC_004633	ACC	2	6	66864	66869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171539
1006	NC_004633	TGT	2	6	67088	67093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171540
1007	NC_004633	TTC	2	6	67102	67107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171540
1008	NC_004633	ACC	2	6	67126	67131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171540
1009	NC_004633	TGG	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171540
1010	NC_004633	CTG	2	6	67204	67209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1011	NC_004633	TGA	2	6	67262	67267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171540
1012	NC_004633	CTG	3	9	67285	67293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1013	NC_004633	GCA	2	6	67335	67340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1014	NC_004633	GCA	2	6	67358	67363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1015	NC_004633	GCCTG	2	10	67389	67398	0 %	20 %	40 %	40 %	29171540
1016	NC_004633	TGA	2	6	67457	67462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171540
1017	NC_004633	GAG	2	6	67501	67506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171540
1018	NC_004633	GCT	2	6	67555	67560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1019	NC_004633	GAG	2	6	67573	67578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171540
1020	NC_004633	GTT	2	6	67728	67733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171540
1021	NC_004633	GCG	2	6	67734	67739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171540
1022	NC_004633	CGC	2	6	67757	67762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171540
1023	NC_004633	AGTG	2	8	67816	67823	25 %	25 %	50 %	0 %	29171540
1024	NC_004633	TGG	2	6	67856	67861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171540
1025	NC_004633	GC	3	6	67894	67899	0 %	0 %	50 %	50 %	29171540
1026	NC_004633	TCAGGC	2	12	67989	68000	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29171540
1027	NC_004633	TCA	2	6	68120	68125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171540
1028	NC_004633	CGG	2	6	68165	68170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171540
1029	NC_004633	AGCC	2	8	68201	68208	25 %	0 %	25 %	50 %	29171540
1030	NC_004633	GC	3	6	68314	68319	0 %	0 %	50 %	50 %	29171541
1031	NC_004633	TTG	2	6	68352	68357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171541
1032	NC_004633	GAA	2	6	68375	68380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171541
1033	NC_004633	TC	3	6	68484	68489	0 %	50 %	0 %	50 %	29171541
1034	NC_004633	TGC	2	6	68547	68552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171541
1035	NC_004633	GAC	2	6	68559	68564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171541
1036	NC_004633	GCG	2	6	68575	68580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171541
1037	NC_004633	GTTG	2	8	68602	68609	0 %	50 %	50 %	0 %	29171541
1038	NC_004633	TGT	2	6	68656	68661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171541
1039	NC_004633	CGG	2	6	68667	68672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171541
1040	NC_004633	TCA	2	6	68679	68684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171541
1041	NC_004633	C	9	9	68699	68707	0 %	0 %	0 %	100 %	29171541
1042	NC_004633	AGCGC	2	10	68724	68733	20 %	0 %	40 %	40 %	29171541
1043	NC_004633	CG	3	6	68890	68895	0 %	0 %	50 %	50 %	29171541
1044	NC_004633	GTC	2	6	68947	68952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171541
1045	NC_004633	GTG	3	9	68981	68989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171541
1046	NC_004633	TGCC	2	8	69047	69054	0 %	25 %	25 %	50 %	29171541
1047	NC_004633	GCG	2	6	69164	69169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171541
1048	NC_004633	CAG	2	6	69174	69179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171541
1049	NC_004633	CGA	2	6	69268	69273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171541
1050	NC_004633	GTT	2	6	69295	69300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171541
1051	NC_004633	AGG	2	6	69357	69362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171541
1052	NC_004633	CGG	2	6	69411	69416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171542
1053	NC_004633	TGG	2	6	69487	69492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171542
1054	NC_004633	TGC	2	6	69559	69564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1055	NC_004633	GCT	2	6	69647	69652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1056	NC_004633	ATGAC	2	10	69766	69775	40 %	20 %	20 %	20 %	29171542
1057	NC_004633	CTG	2	6	69825	69830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1058	NC_004633	ATG	2	6	69895	69900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171542
1059	NC_004633	GCC	2	6	69903	69908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171542
1060	NC_004633	GAC	2	6	69945	69950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1061	NC_004633	GAT	2	6	69956	69961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171542
1062	NC_004633	CTG	2	6	69999	70004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1063	NC_004633	ACA	2	6	70009	70014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171542
1064	NC_004633	CAT	2	6	70070	70075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171542
1065	NC_004633	CCT	2	6	70098	70103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171542
1066	NC_004633	GGA	2	6	70358	70363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171542
1067	NC_004633	GTG	2	6	70491	70496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171542
1068	NC_004633	TGG	2	6	70513	70518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171542
1069	NC_004633	CGA	2	6	70694	70699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1070	NC_004633	CTA	2	6	70709	70714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171542
1071	NC_004633	GCCA	2	8	70776	70783	25 %	0 %	25 %	50 %	29171542
1072	NC_004633	CGG	2	6	70804	70809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171542
1073	NC_004633	TGA	2	6	70930	70935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171542
1074	NC_004633	GGA	2	6	70976	70981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171542
1075	NC_004633	AC	3	6	70987	70992	50 %	0 %	0 %	50 %	29171542
1076	NC_004633	GAA	2	6	71009	71014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171542
1077	NC_004633	GCA	2	6	71033	71038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1078	NC_004633	AGG	2	6	71044	71049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171542
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1080	NC_004633	CG	4	8	71224	71231	0 %	0 %	50 %	50 %	29171542
1081	NC_004633	GCA	2	6	71240	71245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1082	NC_004633	ACC	2	6	71254	71259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171542
1083	NC_004633	GTC	2	6	71319	71324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1084	NC_004633	GGC	2	6	71347	71352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171542
1085	NC_004633	GCA	2	6	71386	71391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1086	NC_004633	CA	3	6	71403	71408	50 %	0 %	0 %	50 %	29171542
1087	NC_004633	GCA	2	6	71482	71487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1088	NC_004633	GCA	2	6	71510	71515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1089	NC_004633	CCA	2	6	71583	71588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171542
1090	NC_004633	CGA	2	6	71615	71620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171542
1091	NC_004633	AAGG	2	8	71720	71727	50 %	0 %	50 %	0 %	29171543
1092	NC_004633	GCTTG	2	10	71783	71792	0 %	40 %	40 %	20 %	29171543
1093	NC_004633	CCAC	2	8	71802	71809	25 %	0 %	0 %	75 %	29171543
1094	NC_004633	GAT	2	6	71838	71843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171543
1095	NC_004633	CTGG	2	8	71873	71880	0 %	25 %	50 %	25 %	29171543
1096	NC_004633	GAC	2	6	72024	72029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171543
1097	NC_004633	ACA	2	6	72046	72051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171543
1098	NC_004633	ACG	2	6	72097	72102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171543
1099	NC_004633	CGC	2	6	72181	72186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171544
1100	NC_004633	TGG	2	6	72266	72271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171544
1101	NC_004633	GCA	2	6	72298	72303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171544
1102	NC_004633	GGTC	2	8	72327	72334	0 %	25 %	50 %	25 %	29171544
1103	NC_004633	CCA	2	6	72340	72345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171544
1104	NC_004633	ACC	2	6	72381	72386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171544
1105	NC_004633	ATC	2	6	72404	72409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171544
1106	NC_004633	GGGT	2	8	72415	72422	0 %	25 %	75 %	0 %	29171544
1107	NC_004633	TGATCA	2	12	72438	72449	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29171544
1108	NC_004633	TCA	2	6	72567	72572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171544
1109	NC_004633	CAG	2	6	72667	72672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171544
1110	NC_004633	A	6	6	72898	72903	100 %	0 %	0 %	0 %	29171545
1111	NC_004633	CAG	2	6	72912	72917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171545
1112	NC_004633	GAA	2	6	72978	72983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171545
1113	NC_004633	CAT	2	6	72998	73003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171545
1114	NC_004633	GAC	2	6	73009	73014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171545
1115	NC_004633	GCA	2	6	73037	73042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171545
1116	NC_004633	CCTG	2	8	73184	73191	0 %	25 %	25 %	50 %	29171545

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