MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 plasmid pDC3000A

Total Repeats: 1116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004633	TG	3	6	38219	38224	0 %	50 %	50 %	0 %	29171510
502	NC_004633	GCT	2	6	38263	38268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171510
503	NC_004633	TTA	2	6	38368	38373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171510
504	NC_004633	GC	4	8	38403	38410	0 %	0 %	50 %	50 %	29171510
505	NC_004633	TGG	2	6	38475	38480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171510
506	NC_004633	GCAAA	2	10	38531	38540	60 %	0 %	20 %	20 %	29171510
507	NC_004633	CGG	2	6	38579	38584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171510
508	NC_004633	GTT	2	6	38614	38619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171510
509	NC_004633	ATC	2	6	38678	38683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171510
510	NC_004633	GTC	2	6	38717	38722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171510
511	NC_004633	AGA	2	6	38728	38733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171510
512	NC_004633	TCG	2	6	38768	38773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171510
513	NC_004633	A	7	7	38782	38788	100 %	0 %	0 %	0 %	29171510
514	NC_004633	TGG	2	6	38790	38795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171510
515	NC_004633	TAT	2	6	38879	38884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171510
516	NC_004633	AT	3	6	38924	38929	50 %	50 %	0 %	0 %	29171510
517	NC_004633	CATA	2	8	38962	38969	50 %	25 %	0 %	25 %	29171510
518	NC_004633	T	6	6	39067	39072	0 %	100 %	0 %	0 %	29171510
519	NC_004633	GGA	2	6	39208	39213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171510
520	NC_004633	AGGC	2	8	39228	39235	25 %	0 %	50 %	25 %	29171510
521	NC_004633	GAC	2	6	39275	39280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171510
522	NC_004633	ACAG	2	8	39292	39299	50 %	0 %	25 %	25 %	29171510
523	NC_004633	TG	3	6	39313	39318	0 %	50 %	50 %	0 %	29171510
524	NC_004633	CAG	2	6	39333	39338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171510
525	NC_004633	ATT	2	6	39365	39370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171510
526	NC_004633	GAA	2	6	39385	39390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171510
527	NC_004633	ATA	2	6	39433	39438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29171511
528	NC_004633	CAA	2	6	39514	39519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29171511
529	NC_004633	ATG	2	6	39564	39569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171511
530	NC_004633	T	8	8	39592	39599	0 %	100 %	0 %	0 %	29171511
531	NC_004633	TGG	2	6	39674	39679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171511
532	NC_004633	CTG	2	6	39816	39821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171511
533	NC_004633	TGC	3	9	39866	39874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171511
534	NC_004633	GAA	2	6	39900	39905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171511
535	NC_004633	TC	3	6	39962	39967	0 %	50 %	0 %	50 %	29171511
536	NC_004633	GAGG	2	8	40017	40024	25 %	0 %	75 %	0 %	29171511
537	NC_004633	GCA	2	6	40045	40050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171511
538	NC_004633	TGGT	2	8	40063	40070	0 %	50 %	50 %	0 %	29171511
539	NC_004633	AAGC	2	8	40128	40135	50 %	0 %	25 %	25 %	29171511
540	NC_004633	GAA	2	6	40187	40192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171511
541	NC_004633	TAG	2	6	40207	40212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171511
542	NC_004633	CTT	2	6	40218	40223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171511
543	NC_004633	TA	3	6	40251	40256	50 %	50 %	0 %	0 %	29171511
544	NC_004633	GT	3	6	40297	40302	0 %	50 %	50 %	0 %	29171511
545	NC_004633	TG	3	6	40378	40383	0 %	50 %	50 %	0 %	29171511
546	NC_004633	AGC	2	6	40392	40397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171511
547	NC_004633	CTT	2	6	40458	40463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171511
548	NC_004633	GAT	2	6	40526	40531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171511
549	NC_004633	GTC	2	6	40558	40563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171511
550	NC_004633	TGG	2	6	40628	40633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171511
551	NC_004633	CGT	2	6	40694	40699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171511
552	NC_004633	CTTG	2	8	40724	40731	0 %	50 %	25 %	25 %	29171511
553	NC_004633	ATTG	2	8	40866	40873	25 %	50 %	25 %	0 %	29171512
554	NC_004633	GCT	2	6	40909	40914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171512
555	NC_004633	CAT	2	6	41030	41035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171513
556	NC_004633	TAT	2	6	41046	41051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29171513
557	NC_004633	TTC	2	6	41086	41091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171513
558	NC_004633	AGC	2	6	41150	41155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171513
559	NC_004633	CCA	2	6	41177	41182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171513
560	NC_004633	TTC	2	6	41660	41665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171514
561	NC_004633	TCGA	2	8	41688	41695	25 %	25 %	25 %	25 %	29171514
562	NC_004633	TACC	2	8	41732	41739	25 %	25 %	0 %	50 %	29171514
563	NC_004633	GGT	2	6	41774	41779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171514
564	NC_004633	GTTT	2	8	41782	41789	0 %	75 %	25 %	0 %	29171514
565	NC_004633	CTG	3	9	41799	41807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171514
566	NC_004633	CAC	3	9	41831	41839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171514
567	NC_004633	CGG	2	6	41900	41905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171514
568	NC_004633	GT	3	6	41912	41917	0 %	50 %	50 %	0 %	29171514
569	NC_004633	GTTC	2	8	41961	41968	0 %	50 %	25 %	25 %	29171514
570	NC_004633	A	6	6	42019	42024	100 %	0 %	0 %	0 %	29171514
571	NC_004633	ATC	2	6	42036	42041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171514
572	NC_004633	GCC	2	6	42156	42161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171514
573	NC_004633	T	6	6	42496	42501	0 %	100 %	0 %	0 %	29171515
574	NC_004633	TGC	2	6	42505	42510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171515
575	NC_004633	TC	3	6	42514	42519	0 %	50 %	0 %	50 %	29171515
576	NC_004633	CAGC	2	8	42530	42537	25 %	0 %	25 %	50 %	29171515
577	NC_004633	CGG	2	6	42562	42567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171515
578	NC_004633	CTT	2	6	42601	42606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29171515
579	NC_004633	ACCAG	2	10	42634	42643	40 %	0 %	20 %	40 %	29171515
580	NC_004633	TTCC	2	8	42649	42656	0 %	50 %	0 %	50 %	29171515
581	NC_004633	ACCG	2	8	42683	42690	25 %	0 %	25 %	50 %	29171515
582	NC_004633	GCCTGT	2	12	42728	42739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171515
583	NC_004633	AGG	2	6	42819	42824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171516
584	NC_004633	GGA	2	6	43015	43020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29171516
585	NC_004633	GT	3	6	43083	43088	0 %	50 %	50 %	0 %	29171516
586	NC_004633	GCA	2	6	43174	43179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171516
587	NC_004633	CGG	3	9	43308	43316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171517
588	NC_004633	TGC	2	6	43320	43325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171517
589	NC_004633	GCC	2	6	43354	43359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171517
590	NC_004633	GGC	2	6	43360	43365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171517
591	NC_004633	TGGA	2	8	43430	43437	25 %	25 %	50 %	0 %	29171517
592	NC_004633	CCGA	2	8	43466	43473	25 %	0 %	25 %	50 %	29171517
593	NC_004633	GCT	2	6	43531	43536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171517
594	NC_004633	AAG	2	6	43733	43738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29171517
595	NC_004633	A	6	6	43756	43761	100 %	0 %	0 %	0 %	29171517
596	NC_004633	CCG	2	6	43826	43831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29171518
597	NC_004633	CAG	2	6	43880	43885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171518
598	NC_004633	CTG	2	6	43909	43914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171518
599	NC_004633	GGCT	2	8	44047	44054	0 %	25 %	50 %	25 %	29171518
600	NC_004633	CGA	2	6	44067	44072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171518
601	NC_004633	CGT	2	6	44168	44173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171518
602	NC_004633	TCG	2	6	44203	44208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171518
603	NC_004633	TGA	2	6	44214	44219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171518
604	NC_004633	GCG	2	6	44269	44274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171518
605	NC_004633	GGC	2	6	44297	44302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171518
606	NC_004633	TCA	2	6	44396	44401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171518
607	NC_004633	CAG	2	6	44425	44430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29171518
608	NC_004633	ACC	2	6	44458	44463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171518
609	NC_004633	T	6	6	44627	44632	0 %	100 %	0 %	0 %	29171519
610	NC_004633	CAGC	2	8	44653	44660	25 %	0 %	25 %	50 %	29171519
611	NC_004633	ACC	2	6	44683	44688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171519
612	NC_004633	TGG	2	6	44689	44694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171519
613	NC_004633	GCCAG	2	10	44716	44725	20 %	0 %	40 %	40 %	29171519
614	NC_004633	GCTG	2	8	44735	44742	0 %	25 %	50 %	25 %	29171519
615	NC_004633	CTC	2	6	44760	44765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29171519
616	NC_004633	GAT	2	6	44766	44771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171519
617	NC_004633	GGT	2	6	44805	44810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171519
618	NC_004633	GCGA	2	8	44875	44882	25 %	0 %	50 %	25 %	29171519
619	NC_004633	CTG	2	6	44914	44919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29171519
620	NC_004633	ACC	2	6	44931	44936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171519
621	NC_004633	GTT	2	6	45017	45022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29171519
622	NC_004633	TGG	2	6	45047	45052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29171519
623	NC_004633	GGC	2	6	45080	45085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171519
624	NC_004633	ATTC	2	8	45155	45162	25 %	50 %	0 %	25 %	29171519
625	NC_004633	CG	3	6	45164	45169	0 %	0 %	50 %	50 %	29171519
626	NC_004633	ATC	2	6	45267	45272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171519
627	NC_004633	GGGT	2	8	45274	45281	0 %	25 %	75 %	0 %	29171519
628	NC_004633	GGC	2	6	45308	45313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29171519
629	NC_004633	CAT	2	6	45458	45463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29171519
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631	NC_004633	CAC	2	6	45482	45487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171519
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752	NC_004633	CTGC	2	8	52047	52054	0 %	25 %	25 %	50 %	29171524
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755	NC_004633	CAC	2	6	52209	52214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29171524
756	NC_004633	TGA	2	6	52253	52258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29171524
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759	NC_004633	TGAC	2	8	52357	52364	25 %	25 %	25 %	25 %	29171524
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